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SpiC/ssam蛋白复合物和IpaB/Mad2B蛋白复合物的表达、纯化与结晶

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SpiC/SsaM蛋白复合物和IpaB/Mad2B蛋白复合物的表达、纯化与结晶

作者：张弛中国协和医科大学

学位级别：硕士

第一部分编码于沙门氏菌(Salmonella)毒力岛2的SpiC蛋白在沙门氏菌得以存活于宿主吞噬性细胞内起到必要性的作用。沙门氏菌侵入宿主细胞后并不滞留于胞质中,而是形成一个沙门氏菌内含小泡(SCV),并通过三型分泌系统分泌大量的效应蛋白... 详细信息

第一部分编码于沙门氏菌(Salmonella)毒力岛2的SpiC蛋白在沙门氏菌得以存活于宿主吞噬性细胞内起到必要性的作用。沙门氏菌侵入宿主细胞后并不滞留于胞质中,而是形成一个沙门氏菌内含小泡(SCV),并通过三型分泌系统分泌大量的效应蛋白改变宿主生物学行为。沙门氏菌在吞噬性细胞内得以存活并复制是靠其自身的避免SCV与溶酶体融合这一机制,而SpiC在这一机制中的功用是不可或缺的。虽然使用基因序列比对和蛋白质一级序列比对无法得到任何有关SpiC功能作用的信息,但是SpiC与同位于一个操纵子下的ssam之间的显著并且特异的结合,暗示了一个围绕着SpiC和ssam的蛋白质复合物作用于转运元的形成进而控制其它效应蛋白的分泌顺序。为了从蛋白质结构层面上研究SpiC的生物学功能,我们共纯化了SpiC和ssam。因为在***表达体系中单独表达ssam并不可以得到可溶性的蛋白,所以采取了将携带有His标签的SpiC和不携带任何标签的ssam共同转化入感受态细胞并协同表达的手段。ssam因为与SpiC的结合变得可溶,蛋白质复合物利用亲和层析技术得以纯化。在胰蛋白酶限制性酶切实验中发现SpiC与ssam的复合物较SpiC单独存在于溶液中时稳定很多。之后便利用离子交换层析和凝胶过滤层析手段大量纯化了胰蛋白酶限制性酶切后的SpiC、ssam复合物,并进行了结晶实验。第二部分福氏志贺氏菌(Shigella flexneri)通过三型分泌系统分泌自身编码的效应蛋白IpaB,该蛋白在福氏志贺氏菌入侵宿主细胞、宿主细胞内定殖以及对抗宿主细胞固有免疫机制方面都起到关键作用。IpaB被分泌到胞质中后,特异性的与宿主胞内Mad2B蛋白结合。Mad2B负责与参与细胞周期调控的E3泛素化连接酶APC(Anaphase-promoting Complex)竞争性的结合底物特异性激活因子Cdc20和Cdh1。Cdc20和Cdh1是APC活性状态中不可或缺的,Mad2B与二者的结合抑制了APC的激活过程。而IpaB与Mad2B的结合释放了Cdc20和Cdh1,从而持续性的激活了APC。APC活性时间表的扰乱使得宿主细胞周期停滞在有丝分裂期。小肠原始上皮细胞分生的抑制,使得小肠上皮细胞快速更新机制受到影响,可以说由IpaB引起的小肠上皮细胞自我更新机制失调,对于福氏志贺氏菌能够得以逃避被宿主免疫机制清除来说尤为重要。为了从蛋白质结构学层面上研究IpaB与Mad2B相互作用的机制,其中牵涉到的构象的变化,以及IpaB如何与Cdc20和Cdh1竞争Mad2B,我们共纯化了IpaB片段1-246和Mad2B,同时进行了初步结晶实验,并得到了晶体。

关键词： SpiC ssam 沙门氏菌毒力岛2 复合物 IpaB Mad2B APC 细胞周期

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ssam与CEM的研究与比较

信息安全与通信保密 2006年第10期28卷 11-13页

作者：谭良四川师范大学四川省软件重点实验室四川成都610066

信息安全评估标准和评估方法是一个整体,评估标准是评估的依据,评估方法是评估的实施。论文分别介绍了CC标准的评估方法CEM(Common Evaluation Methodology)和SSE-CMM的评估方法ssam(SSE-CMM Appraisal Method)的评估模型,并对CEM和SSA... 详细信息

信息安全评估标准和评估方法是一个整体,评估标准是评估的依据,评估方法是评估的实施。论文分别介绍了CC标准的评估方法CEM(Common Evaluation Methodology)和SSE-CMM的评估方法ssam(SSE-CMM Appraisal Method)的评估模型,并对CEM和ssam进行比较分析后指出:CEM和ssam评估在针对的问题和具体目的、评估方式和特点以及评估结果反映的实质等方面均存在差异。

关键词：安全评估标准安全评估方法 CEM ssam

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集成化自动显微镜ssam

国际生物医学工程杂志 1983年第4期 237-242页

作者： I.T.Young 谢正祥

一、设计考虑根据前人的工作,对于适合于一般工作的自动显微镜系统,应有不低于2象元/秒的采样密度,不低于8比特（2;=256级）的亮度分辨率,不低于2×10;象元/秒的数据获取率。另外,为解决视场的边缘效应产生的视场损失,我们采用有2mm视... 详细信息

一、设计考虑根据前人的工作,对于适合于一般工作的自动显微镜系统,应有不低于2象元/秒的采样密度,不低于8比特（2;=256级）的亮度分辨率,不低于2×10;象元/秒的数据获取率。另外,为解决视场的边缘效应产生的视场损失,我们采用有2mm视场的广视野透视。广视野透镜对细胞图象获取率的影响不于图1中。我们假定象元扫描率为5×10;象元/秒,采样密度接近2象元/μ。

关键词：视场宽度采样密度 ssam 电流计透镜电荷图象获取扫描器自动显微镜光敏二极管象元

Pedestrian Facilities Capacity and Level of Service at Intersections in a Connected and Autonomous Vehicle Environment

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Journal of Transportation Technologies 2019年第4期9卷 423-438页

作者： Yifan Wang Ardeshir Faghri Dian Yuan Michael L. Vaughan Mingxin Li Department of Civil & Environmental Engineering University of Delaware Newark USA College of Engineering University of Delaware Newark USA.

It is inevitable that Connected and Autonomous Vehicles (CAVs) will be a major focus of transportation and the automotive industry with increased use in future traffic system analysis. Numerous studies have focused on the evaluation and potential development of CAVs technology;however, pedestrians and bicyclists, as two essential and important modes of the road users have seen little to no coverage. In response to the need for analyzing the impact of CAVs on non-motorized transportation, this paper develops a new model for the evaluation of the Level of Service (LOS) for pedestrians in a CAVs environment based on the Highway Capacity Manual (HCM). The HCM provides a methodology to assess the level of service for pedestrians and bicyclists on various types of intersections in urban areas. Five scenarios were created for simulation via VISSIM (a software) that corresponds to the different proportions of the CAVs and different signal systems in a typical traffic environment. Alternatively, the Surrogate Safety Assessment Model (ssam) was selected for analyzing the safety performance of the five scenarios. Through computing and analyzing the results of simulation and ssam, the latter portion of this paper focuses on the development of a new model for evaluating pedestrian LOS in urban areas which are based upon HCM standards which are suitable for CAVs environments. The results of this study are intended to inform the future efforts of engineers and/or policymakers and to provide them with a tool to conduct a comparison of capacity and LOS related to the impact of CAVs on pedestrians during the process of a transportation system transition to CAVs.

关键词： Connected and Autonomous Vehicles Pedestrians VISSIM Level of Service ssam

基于效率-安全评价的近距离错位交叉口信控优化

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交通信息与安全 2018年第1期36卷 65-73页

作者：罗慧敏郑亮中南大学交通运输工程学院长沙410075

在城市中2个近距离错位交叉口之间的交织路段,来自不同方向的车流相互干扰严重,尤其是在交织长度限制下的连续换道操作,对交通效率和安全水平造成不良影响。因此,基于效率-安全综合考虑,研究了一种安全协调信号控制方案。即在上游交叉... 详细信息

在城市中2个近距离错位交叉口之间的交织路段,来自不同方向的车流相互干扰严重,尤其是在交织长度限制下的连续换道操作,对交通效率和安全水平造成不良影响。因此,基于效率-安全综合考虑,研究了一种安全协调信号控制方案。即在上游交叉口的支路处设置右转信号灯,将交织路段内主、次路的车流冲突点进行时间和空间上的分离,并对近距离错位交叉口进行系统的相位和配时优化设计,从而达到降低车辆运行延误、提高行车安全性的目的。以福州市浦上大道-金州南路-金港路交叉口为例,运用Vissim微观仿真软件和ssam替代安全评价模型,从效率-安全2个方面综合比较安全协调信控方案与信控现状、单点优化方案的优劣。实验结果表明,相对于信控现状,单点优化方案和安全协调信控方案的效率-安全水平分别提升了36.17%和57.17%,验证了安全协调信控方案的优越性。此外,通过Vissim调整2个交叉口之间的距离,比较安全协调信控方案和单点优化方案相对于信控现状的效率-安全综合优化程度。研究表明,近距离错位交叉口的间距越小,安全协调信控方案的优越性越明显。

关键词：交通规划与管理近距离错位交叉口信控优化 Vissim ssam

缓解城市快速路交通拥堵的瓶颈几何设计与控制策略评价

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缓解城市快速路交通拥堵的瓶颈几何设计与控制策略评价

作者： Al-hakimi Gamil Gamal A 东南大学

学位级别：硕士

近年来,拥堵已经成为大多数城市快速路的主要交通问题,瓶颈被认为是诱发拥堵的主要成因。瓶颈对交通系统乃至经济发展产生了很多负面影响,增加了旅行时间,增加了个人和整个社会的出行延误等。瓶颈交通拥堵的改善和消除可以从道路设计以... 详细信息

近年来,拥堵已经成为大多数城市快速路的主要交通问题,瓶颈被认为是诱发拥堵的主要成因。瓶颈对交通系统乃至经济发展产生了很多负面影响,增加了旅行时间,增加了个人和整个社会的出行延误等。瓶颈交通拥堵的改善和消除可以从道路设计以及交通流控制两个方面开展,如何提出消除瓶颈影响并缓解瓶颈拥堵的策略,在过去20年中吸引了全世界学者的广泛关注。本研究目标为提出城市快速路道路设计改善以及交通流控制策略,减少旅行时间和延迟来改善和减轻城市快速路瓶颈区域的交通拥堵情况。同时,通过交通安全风险评价方法来评估道路设计改善以及交通流控制策略对交通安全的提升效果。研究提出了四种道路几何和交通流控制策略来实现本研究的目标。通过百度地图路况观测和实地调查的连续监测真实道路交通情况确定了瓶颈地点。通过无人机航拍获取道路当前设计因素以及交通流运行参数。之后,采用VISSIM微观交通仿真软件构建了虚拟环境,对各策略对于系统通行延误和交通安全（采用ssam模型评价）的影响进行了分析。研究结果表明江东中路、吉村路、应天路、龙井路和东环路的改善后旅行时间分别减少了44%,43%,29%,38%和46%。此外,这五个部分的交叉冲突、追尾冲突、车道变换冲突和总冲突数量分别减少了100%,58%,42%和66%。得出结论,研究提出的道路设计和交通流控制策略有效减少了城市快速路瓶颈区域的旅行时间及延误,并有效提升了交通安全水平。

关键词：拥挤瓶颈合并区发散区编织区策略 VISSIM ssam 安全微观仿真模型

基于交通冲突技术的城市交叉口交通安全评价方法研究

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基于交通冲突技术的城市交叉口交通安全评价方法研究

作者：孙林长安大学

学位级别：硕士

城市交叉口交通安全评价过程中运用微观仿真技术和交通冲突技术,不仅可以提高评价过程的效率和科学性,同时可以微观分析交叉口交通安全状况,对提升城市交叉口交通安全性具有重要的意义。本文首先回顾了运用交通冲突技术进行城市交叉口... 详细信息

城市交叉口交通安全评价过程中运用微观仿真技术和交通冲突技术,不仅可以提高评价过程的效率和科学性,同时可以微观分析交叉口交通安全状况,对提升城市交叉口交通安全性具有重要的意义。本文首先回顾了运用交通冲突技术进行城市交叉口交通安全评价的现状,从交通冲突数据获取方法和交通安全评价方法两方面分析了现有方法的不足。在此基础上,建立了交叉口交通安全评价模型,以交叉口危险度作为评价指标,运用微观仿真技术获取交通冲突数据。交叉口交通安全评价模型由机动车-机动车冲突危险度、机动车-非机动车冲突危险度、机动车-行人冲突危险度构成。通过叠加每一起交通冲突危险程度计算出各类型冲突的危险程度。每一起交通冲突危险程度通过交通冲突危险度模型计算,利用冲突时间、冲突速度、冲突角度建立了交通冲突危险度模型。交通冲突数据获取过程考虑了车辆性能、驾驶人行为、交通环境、交叉口几何特征、交通流特征等因素,在此基础上微观仿真获得车辆轨迹。运用冲突时间(TTC)作为冲突识别参数对车辆轨迹进行冲突识别分析,计算出冲突类型、冲突数、冲突时间、冲突速度、冲突角度等数据。然后研究了各因素对模型的影响,进行了影响因子分析和参数敏感性分析。分析了车辆起步延迟对交通冲突的影响,并通过实验观测确定了车辆起步延迟时长;对交通流特性参数进行了敏感性分析,分析了其对城市交叉口交通冲突和评价结果的影响。最终实地调研获得西安市两个交叉口的数据,应用城市交叉口交通安全评价方法分析确定出危险交叉口。基于交通安全评价和分析结果,对危险交叉口提出了交通安全改善措施,对比分析了改善前后交叉口交通安全状况。研究表明:文中提出的城市交叉口交通安全评价方法能够用于交叉口交通安全评价,评价结果与实际情况一致,并且分析和评价结果可以作为交通安全改善的依据。

关键词：交通冲突技术城市交叉口交通安全评价车辆轨迹 ssam

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服从率影响下高速公路施工区限速安全研究

交通科学与工程 2018年第1期34卷 85-92页

作者：吴昊朱彤王长帅长安大学汽车学院陕西西安710064

为评价不同驾驶员限速服从率下高速公路施工区的限速效果,以高速公路施工区路段冲突率和速度标准差系数表征交通安全水平,建立高速公路单向行车道封闭施工区三级限速模型。在充分考虑不同服从率水平的基础上,基于替代安全仿真ssam,建立... 详细信息

为评价不同驾驶员限速服从率下高速公路施工区的限速效果,以高速公路施工区路段冲突率和速度标准差系数表征交通安全水平,建立高速公路单向行车道封闭施工区三级限速模型。在充分考虑不同服从率水平的基础上,基于替代安全仿真ssam,建立了仿真平台,并采集数据,对仿真数据进行处理分析。研究结果表明:施工区路段冲突率、驾驶员服从率及交通量显著相关,且驾驶员服从率和交通量对路段在限速标志2,3处的断面速度标准差系数亦有显著影响。高速公路施工区限速标志对施工区的交通安全具有重要意义,且当驾驶员服从率低于70%时,高速公路施工区的限速标志将会损失全部减速效果。建议配合电子警察或其他方法进行施工区路段车辆的速度控制。

关键词：施工区交通安全交通冲突服从率 ssam

基于安全-效率的城市道路交叉口信号优化评价

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智能计算机与应用 2020年第4期10卷 225-230页

作者：胡荣陈相宇陈昀喆上海理工大学管理学院上海200093 浙江海洋大学港航与交通运输工程学院浙江316022

交通安全已成为城市道路交通亟待解决的重要问题之一。针对以往信号交叉口优化评价指标存在的问题,本文兼顾交叉口的交通安全和通行效率,利用交通冲突技术和Webster优化方法,结合多种微观交通仿真软件,提出了一种安全-效率多目标的交叉... 详细信息

交通安全已成为城市道路交通亟待解决的重要问题之一。针对以往信号交叉口优化评价指标存在的问题,本文兼顾交叉口的交通安全和通行效率,利用交通冲突技术和Webster优化方法,结合多种微观交通仿真软件,提出了一种安全-效率多目标的交叉口信号控制优化方法。运用VISSIM微观仿真和ssam软件,从通行效率和安全性等级角度进行交叉口信号评价与优化。实验结果表明,该优化方法使交叉口通行效率提高26.4%,安全性提高22.3%。

关键词：交通安全道路交叉口微观仿真 ssam 评价与优化