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seldi-tof-ms技术及其在妇产科疾病研究中的应用

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中国妇幼保健 2009年第2期24卷 281-283页

作者：索明莉杨海澜山西医科大学第一临床医院妇产科山西太原030001

人类基因组计划(HGP)全基因组测序的完成,并没有象预计的那样彻底解决基因和疾病的关系.相反,它提出了几个令人困惑的问题.第一,人类基因组中的功能基因数大大少于预期;第二,人类基因组和酵母基因组的差异基因数仅占人类基因组的1/5,大... 详细信息

人类基因组计划(HGP)全基因组测序的完成,并没有象预计的那样彻底解决基因和疾病的关系.相反,它提出了几个令人困惑的问题.第一,人类基因组中的功能基因数大大少于预期;第二,人类基因组和酵母基因组的差异基因数仅占人类基因组的1/5,大大少于人类基因组和小鼠基因组的差异基因数.造成这一现象的一个主要原因是蛋白质的高度分化以及蛋白质的转录后修饰.蛋白质的表达及最终体现的功能在从转录到翻译后的多点受到调节,因此不能通过核酸来预测.但蛋白质能直接反映基因给予的信息,它的表达一旦出现异常就可引发疾病.因此,研究其组成及性质是揭示基因和疾病连接链条中的关键一环.现就蛋白质组学SEIJDI-FOF-ms技术及其在妇产科疾病研究中的应用作一综述.

关键词： seldi-tof-ms技术妇产科疾病人类基因组计划全基因组测序蛋白质组学转录后修饰小鼠基因组高度分化

seldi-tof-ms技术寻找肿瘤转移相关的标志蛋白研究进展

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中国细胞生物学学报 2011年第1期33卷 86-92页

作者：刘玮许沈华毛伟敏温州医学院第一临床学院肿瘤学系温州325000 浙江省肿瘤医院浙江省肿瘤研究所杭州310022

由于seldi-tof-ms技术简便、快速、灵敏度高、重复性好等优点,目前大量应用于肿瘤相关的研究,不但为肿瘤早期诊断相关标志蛋白的寻找提供了有效的手段,而且它在寻找肿瘤转移相关的标志蛋白中的作用越来越受到人们的关注。因为对于肿瘤... 详细信息

由于seldi-tof-ms技术简便、快速、灵敏度高、重复性好等优点,目前大量应用于肿瘤相关的研究,不但为肿瘤早期诊断相关标志蛋白的寻找提供了有效的手段,而且它在寻找肿瘤转移相关的标志蛋白中的作用越来越受到人们的关注。因为对于肿瘤转移相关标志蛋白的检测有利于人们更清楚地认识肿瘤转移的机制,更重要的是为临床医生提供对病人情况的更全面的判断,制定更适合病人自身的个体化的治疗方案。本文对国内外发表的利用seldi-tof-ms技术寻找在大肠癌、胃癌、肺癌、乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、肝细胞肝癌、头颈部癌等转移相关标志蛋白的研究文献作一综述。

关键词：癌症血清转移标志蛋白 seldi-tof-ms技术

seldi-tof-ms技术对大肠癌裸鼠动物模型早期蛋白组学研究

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SELDI-TOF-MS技术对大肠癌裸鼠动物模型早期蛋白组学研究

作者：李亚峰泸州医学院

学位级别：硕士

目的：利用结肠癌细胞悬液皮下接种BALB/C裸小鼠,构建HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型,观测时间与移植瘤大小变化,检测分析接种后不同时间裸鼠体内微量蛋白谱的变化,寻找肿瘤相关的差异蛋白,探索大肠癌的早期诊断指标。方法：复苏培养HCT-... 详细信息

目的：利用结肠癌细胞悬液皮下接种BALB/C裸小鼠,构建HCT-116人结肠癌裸鼠动物模型,观测时间与移植瘤大小变化,检测分析接种后不同时间裸鼠体内微量蛋白谱的变化,寻找肿瘤相关的差异蛋白,探索大肠癌的早期诊断指标。方法：复苏培养HCT-116大肠癌细胞,收集第3-5代对数生长期细胞,将细胞悬液调至密度1×107/ml,皮下接种于10只3-4周龄裸鼠背部皮下,接种剂量为0.1ml/只,每隔15天测量瘤体大小并记录.对照组同时用无血清培养基接种(0.1ml/只)。实验组和对照组裸鼠分别在接种后20d、40d和60d取血,前两次采用断尾法取血0.1ml/只,最后一次采用摘眼球取血0.5ml/只后处死裸鼠并剥离瘤体,测量瘤体体积,剥离的瘤体立即送病理科进行病理切片检查。所取血液标本立即4℃3000rpm离心5min,将分离的血清分装3管,30μL/管并进行编号,利用seldi-tof-ms技术对裸鼠血清进行微量蛋白分析,将获得的微量蛋白质谱图用Ciphergen ProteinChip3.0和Ciphergen Biomaker Wizard3.1软件进行数据的采集、校正和分析,筛选与大肠癌相关的微量差异蛋白,并对筛选出的差异蛋白在蛋白数据库中进行比对。结果：裸鼠皮下接种后15天长出肿瘤,成瘤率100%。筛选出与肿瘤相关的具有规律性变化的5个差异蛋白(pseldi-tof-ms技术对结肠癌裸鼠移植瘤模型差异蛋白的检测是有效的,能发现早期大肠癌的标志蛋白。3癌细胞体外培养发现的新物质证明了癌细胞的疾病进程并不是孤立的而是和外界紧密关联的。

关键词：动物模型大肠癌 seldi-tof-ms技术蛋白组学

seldi-tof-ms技术对肝癌裸鼠移植瘤模型体内微量蛋白谱分析

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SELDI-TOF-MS技术对肝癌裸鼠移植瘤模型体内微量蛋白谱分析

作者：于卉泸州医学院

学位级别：硕士

目的：采用Bel-7402人肝癌细胞悬液接种于3周龄BALB/C裸鼠的左肩背部皮下，构建人肝癌裸鼠移植瘤模型，观察肿瘤大小与生长时间的相关性，利用seldi-tof-ms技术对造模成功后不同时段的裸鼠体内差异蛋白的表达进行检测，分析这些微量蛋... 详细信息

目的：采用Bel-7402人肝癌细胞悬液接种于3周龄BALB/C裸鼠的左肩背部皮下，构建人肝癌裸鼠移植瘤模型，观察肿瘤大小与生长时间的相关性，利用seldi-tof-ms技术对造模成功后不同时段的裸鼠体内差异蛋白的表达进行检测，分析这些微量蛋白的表达规律，旨在寻找新的原发性肝癌早期诊断标志物。方法：将Bel-7402人肝癌细胞复苏，传代培养3-5次后选择对数生长期细胞配置成浓度为1×107个/ml的癌细胞悬液，皮下接种于3组实验组裸鼠左肩背部，剂量为0.1ml/只，对照组裸鼠左肩背部皮下接种相同剂量无血清培养基。密切观察实验动物的肿瘤生长情况，每两周测量并记录裸鼠肿块的体积。所有裸鼠均采用摘眼球取血法，对照组和3组实验组分别在造模成功后20d、40d、60d取血0.5ml/只，然后处死裸鼠，并分离肿瘤组织送病理科进行组织切片检查。裸鼠血液标本应立即于4℃离心5min，转速为3000rpm，分离样本血清并分装编号，冻存于-80℃备用。应用seldi-tof-ms技术检测分析裸鼠血清标本中的微量蛋白，利用Ciphergen ProteinChip3.0和Ciphergen Biomaker Wizard3.1软件对得到的蛋白质谱图进行数据采集和分析，筛选出与肝癌相关的差异表达蛋白，并在蛋白数据库中进行检索比对。结果：裸鼠接种癌细胞悬液15-20天长出肿块，成瘤率100%。分析筛选出与肝癌相关并呈规律性变化的差异表达蛋白（Pseldi-tof-ms技术检测和筛选肝癌裸鼠移植瘤模型血清中的差异表达蛋白，可能发现新的肝癌诊断的血清标志物，为肝癌早期诊断研究开辟了新的途径。

关键词： seldi-tof-ms技术原发性肝癌蛋白质组学裸鼠移植瘤模型

seldi-tof-ms技术在肺癌化疗个体敏感性中的研究

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SELDI-TOF-MS技术在肺癌化疗个体敏感性中的研究

作者：谢艳茹浙江大学

学位级别：硕士

目的:seldi-tof-ms技术在晚期肺癌化疗敏感性相关蛋白质因子的研究。方法:选取浙江大学附属第二医院化疗科2005年4月～2008年11月化疗初治晚期肺癌病例28例,在化疗开始前及两疗程化疗结束后分别收集患者血清标本,采用CM10芯片(阳离子交... 详细信息

目的:seldi-tof-ms技术在晚期肺癌化疗敏感性相关蛋白质因子的研究。方法:选取浙江大学附属第二医院化疗科2005年4月～2008年11月化疗初治晚期肺癌病例28例,在化疗开始前及两疗程化疗结束后分别收集患者血清标本,采用CM10芯片(阳离子交换蛋白芯片)为检测介质,经表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(seldi-tof-ms)测定,检测蛋白质质谱,并运用浙江大学蛋白质谱数据分析系统软件(ZJU-PDAS)分析比较,应用支持向量机进行训练和交叉验证,结合生物信息学方法,筛选出各化疗方案所达CR、PR、SD、PD的患者血清中蛋白表达的肽链指纹图谱,寻找与各类型肺癌患者化疗敏感相关的差异蛋白峰,确定一种或一组蛋白标志物。联合这些标志物用人工神经网络或支持向量机训练并建立肺癌血清蛋白质指纹图谱化疗敏感相关模型,并做交叉验证评估其诊断的灵敏度和特异度。结果:1.通过非小细胞肺癌组与小细胞肺癌组比较,得到12个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测模型,其敏感性100%,特异性100%,验证结果敏感性为94.28%,特异性80%。2.通过化疗敏感组与化疗抗拒组比较,得到7个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测模型,其敏感性为92.31%,特异性为100%。验证结果敏感性为76.92%,特异性为87.50%。3.通过预后好组与预后不好组比较,得到4个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测预后模型,其敏感性为100%,特异性为100%。验证结果敏感性为85.71%,特异性为83.87%。4.m/z(质量/电荷,质荷比)为4969的蛋白质峰在小细胞肺癌组中明显表达高于非小细胞肺癌组,在化疗敏感组中表达明显高于化疗抗拒组,提示m/z为4969的蛋白质峰与小细胞肺癌及化疗敏感相关;m/z为4140的蛋白质峰在化疗抗拒组中表达明显高于化疗敏感组,在预后不好组中表达高于预后好组,提示m/z为4140的蛋白质峰与化疗抗拒及预后不好相关;m/z为5482的蛋白质峰在化疗敏感组中表达明显高于化疗抗拒组,在预后好组中表达高于预后不好组,提示m/z为5482的蛋白质峰与化疗敏感及预后好相关。结论:1.运用seldi-tof-ms技术所建立的肺癌血清蛋白质化疗敏感性指纹图谱模型在预测肺癌分型、化疗敏感性、预后中具有非常高的敏感性与特异性,可望成为很好的预测工具。2.通过进一步的分离和鉴定,m/z=4969的的蛋白质峰很可能为预测小细胞肺癌及化疗敏感的肿瘤标志物,m/z=4140的蛋白质峰可能为预测化疗抗拒及预后不好的肿瘤标志物,m/z为5482的蛋白质峰可能为预测化疗敏感及预后好的肿瘤标志物,使进一步开发临床诊断试剂盒成为可能。3.预测肺癌分型血清蛋白指纹模型对于临床上只获取细胞学依据而无法进行病理分型的患者,在治疗上具有较强的指导意义;预测肺癌化疗敏感性血清蛋白指纹模型在化疗受益人群评估具有重要的临床意义,为探索肺癌个体化治疗提供新思路,有可能为以后术前新辅助化疗治疗提供平台。

关键词：肺癌化疗敏感性个体化治疗蛋白芯片 seldi-tof-ms技术

seldi-tof-ms技术预测癌痛发生的研究之一——采用seldi-tof-ms技术捕获癌痛的指纹标记

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临床医药实践 2016年第6期25卷 406-409页

作者：吉利娜魏亮裴毅山西大医院山西太原030032 山西医科大学第一医院山西太原030001

目的:借助表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(seldi-tof-ms)技术捕获晚期恶性肿瘤癌痛发生时的指纹标记。方法:选择24例经病理学或细胞学确诊的晚期恶性肿瘤患者,清晨采集空腹末梢静脉血,采血后观察3个月。将3个月内发生癌痛的患者的血... 详细信息

目的:借助表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(seldi-tof-ms)技术捕获晚期恶性肿瘤癌痛发生时的指纹标记。方法:选择24例经病理学或细胞学确诊的晚期恶性肿瘤患者,清晨采集空腹末梢静脉血,采血后观察3个月。将3个月内发生癌痛的患者的血清样本归为癌痛组(9例),3个月内未发生癌痛的血清样本归为无痛组(15例),应用CM10弱阳离子芯片结合seldi-tof-ms技术检测两组患者血清样本的蛋白质谱。结果:无痛组与癌痛组相比有6个蛋白质峰的差异有统计学意义(P<0.05),蛋白质质荷比(M/Z)分别为2 755,8 678,8 813,11 361,11 447,11 605。其中与无痛组相比,癌痛组上调的峰M/Z为2 755,11 361,11 447,11 605,下调的峰M/Z为8 678和8 813。进一步对所有患者的蛋白质指纹图谱进行分析,得出:M/Z为2 755,8 678,8 813的蛋白质组在两组之间都存在,癌痛组其丰度中位值分别为6,2,3,无痛组中其丰度中位值分别为2,6,10,而M/Z为11 361,11 447,11 605在癌痛组中呈阳性表达,无痛组则呈阴性表达。结论:蛋白质M/Z 2 755高表达,M/Z 8 678,8 813低表达,M/Z 11 361,11447,11 605呈阳性表达,可以作为癌痛发生的特异指纹标记。

关键词： seldi-tof-ms技术癌痛晚期恶性肿瘤

seldi—tof—ms技术在非小细胞肺癌中的应用

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世界肿瘤杂志 2007年第1期6卷 55-57页

作者：黄维华（综述）赵健（综述）王远东（审校）广州医学院附属肿瘤医院胸外科广东广州510095

表面增强激光解析离子化飞行时间质谱（seldi-tof-ms）技术是一种使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子，然后经激光解析离子化．飞行时间质谱测定被捕获的蛋白质的相对分子量、丰度的新兴技术。目前该项技术已经成功应用... 详细信息

表面增强激光解析离子化飞行时间质谱（seldi-tof-ms）技术是一种使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子，然后经激光解析离子化．飞行时间质谱测定被捕获的蛋白质的相对分子量、丰度的新兴技术。目前该项技术已经成功应用于前列腺癌的诊断、子宫良恶性肿瘤的鉴别等方面。seldi-tof-ms技术通过寻找肿瘤病人相关的特异性蛋白用于对非小细胞肺癌的早期诊断，指导治疗及预测预后等方面具有很好的应用前景。

关键词：肺肿瘤非小细胞肺癌肿瘤标记物 seldi-tof-ms技术蛋白质组学预后

seldi-tof-ms技术在泌尿肿瘤研究中的应用

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现代泌尿生殖肿瘤杂志 2010年第2期2卷 121-122页

作者：闫亮米振国山西医科大学第二临床医学院肿瘤医院泌尿外科太原030001 山西省肿瘤研究所

恶性肿瘤严重威胁着人类的健康和生命,早期发现、早期诊断、早期治疗是提高大多数恶性肿瘤患者治疗效果的关键.恶性肿瘤发现、确诊得越早,治疗成功的可能性就越大,患者的生存率也会越高.随着影像医学的发展,如PET、MR、msCT等可以发现0.... 详细信息

恶性肿瘤严重威胁着人类的健康和生命,早期发现、早期诊断、早期治疗是提高大多数恶性肿瘤患者治疗效果的关键.恶性肿瘤发现、确诊得越早,治疗成功的可能性就越大,患者的生存率也会越高.随着影像医学的发展,如PET、MR、msCT等可以发现0.3 cm左右的肿瘤,而基因检测及蛋白芯片等的应用,更能早期发现0.2 cm以下的肿瘤,甚至早在肿瘤血管增生前将其发现[1].只有从细胞生物学角度认识恶性肿瘤,才能将肿瘤杀灭在细胞萌芽期.而表面加强激光解析电离飞行时间质谱(seldi-tof-ms)技术正是适用于识别与判断各种疾病的特异性蛋白指纹图谱.目前,seldi-tof-ms技术在临床肿瘤蛋白质组学研究中已经得到了普遍应用,研究的范围几乎覆盖所有的常见肿瘤,为临床肿瘤的蛋白质组学研究奠定了良好的基础.本文概要介绍seldi-tof-ms技术在泌尿肿瘤研究中的应用.

关键词： seldi-tof-ms技术泌尿肿瘤应用恶性肿瘤患者早期诊断治疗效果早期治疗影像医学

seldi-tof-ms技术在消化道肿瘤诊断中的应用

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胃肠病学和肝病学杂志 2006年第4期15卷 431-432,438页

作者：卜淑蕊钱家鸣中国医学科学院中国协和医科大学北京协和医院消化内科北京100073

蛋白质组学(proteomics)是一门以全部蛋白质性质研究为基础,从蛋白质水平进一步认识生命活动的机理和疾病发生的机制,蛋白质组研究是对生物体在蛋白质水平定量、动态、整体性的研究,是继基因组学后一个重要的研究热点[1].

关键词：消化道肿瘤蛋白质芯片 seldi-tof-ms技术