检索结果-南通市图书馆

浙江大学学报（理学版） 2005年第3期32卷 314-319页

作者：向太和杭州师范学院生命科学学院浙江杭州310036

根据国际核酸数据库中不同植物的Ru BPCase小亚基基因(rbc S)保守序列设计PCR引物,首先扩增出约35 0 bp的c DNA短片段,以此作为分子杂交探针对构建的水稻c DNA文库进行杂交筛选,同时结合PCR分析确定阳性克隆中c DNA片段的大小,选取插入... 详细信息

根据国际核酸数据库中不同植物的Ru BPCase小亚基基因(rbc S)保守序列设计PCR引物,首先扩增出约35 0 bp的c DNA短片段,以此作为分子杂交探针对构建的水稻c DNA文库进行杂交筛选,同时结合PCR分析确定阳性克隆中c DNA片段的大小,选取插入的c DNA片段最长的阳性克隆进行测序分析验证,从而克隆了水稻中编码Ru BPCase小亚基的全长c DNA(Gen Bank登记号:AY4 4 5 6 2 7) .该c DNA片段从第5 2 bp开始至5 79bp含有编码175个氨基酸的开放阅读框(ORF,Gen Bank登记号:AAR192 6 8.1)和一个终止密码子.AY 4 4 5 6 2 7在3′端有一个长2 6 4 bp的非编码区,而在3′末段有poly(T) 1 7.经Compute p I /Mw软件预测,AAR192 6 8.1的等电点p I和分子量Mw 分别为9.0 3和196 30 .6 6 Da.通过与国际核酸和蛋白质数据库的blast比较分析,AY4 4 5 6 2 7序列与Gen Bank登记号D0 0 6 4 4 .1(水稻rbc S)、U 4 3493.1(大麦rbc S)、AF10 4 2 5 0 .1(燕麦rbc S)和M374 77.1(小麦rbc S)的序列相似性分别为99% (6 5 0 /6 5 5 )、84 % (436 /5 15 )、84 % (42 7/5 0 6 )和84 % (386 /4 5 6 ) .而AAR192 6 8.1氨基酸序列与Gen Bank登记号P185 6 6 (水稻rbc S)、AAF0 794 7.1(燕麦rbc S)、BAA35 16 2 .1(大麦rbc S)和BAB19812 .1(小麦rbc S)的氨基酸序列相似性分别为98% (173/175 )、84 % (14 3/16 9)、84 % (14 0 /16 6 )和83% (14 4 /173) .生物信息学的分析还表明rbc S基因不仅在水稻不同品种基因型之间非常保守,而且在水稻、小麦、大麦和燕麦等禾本科不同物种之间也高度同源.

关键词：水稻 rubpcase小亚基基因克隆分析

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香蕉rubpcase小亚基基因全长cDNA的克隆和分析

引用

热带作物学报 2007年第3期28卷 57-61页

作者：刘德兵魏军亚李绍鹏彭明华南热带农业大学园艺学院海南儋州571737 中国热带农业科学院热带生物技术研究所海口571101

利用RACE和RT-PCR技术,从香蕉中克隆出编码rubpcase小亚基的全长cDNA,并与GenBank中已经报道的其他部分香蕉rbcS基因的核苷酸和推导的氨基酸序列进行同源性分析,为进一步研究香蕉rubpcase的功能与结构提供依据。

关键词：香蕉 rubpcase小亚基基因克隆分析

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