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上海地区猪戊型肝炎流行病学调查和基因型分析

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上海地区猪戊型肝炎流行病学调查和基因型分析

作者：于水生南京农业大学

学位级别：硕士

戊型肝炎(Hepatitis E,HE)属于人畜共患病,是由戊型肝炎病毒(Hepatitis Evirus,HEV)引起,该病对人类健康具有很大的危害。HEV在动物宿主中以猪的感染率最高,病毒载量最大,而且从中分离到的病毒和人源毒株也有较高的同源性。因此,摸清猪... 详细信息

戊型肝炎(Hepatitis E,HE)属于人畜共患病,是由戊型肝炎病毒(Hepatitis Evirus,HEV)引起,该病对人类健康具有很大的危害。HEV在动物宿主中以猪的感染率最高,病毒载量最大,而且从中分离到的病毒和人源毒株也有较高的同源性。因此,摸清猪群中该病的存在状况,对防控人戊型肝炎的发生具有重要的公共卫生学意义。为了能够准确的了解上海地区戊型肝炎在猪群中的流行情况,从上海市10个辖区的40个猪场中采集918份粪便样品,其中444份为首次采集,474份为追踪调查采集。通过nested-PCR的方法,扩增HEV ORF 2的部分片断,通过测序和系统进化分析来研究病毒的存在状况。实验结果表明,918份份样品中的220份样品为HEVRNA阳性,阳性率24%。全过程分析显示各个猪场阳性率在0.0%～75%之间,在36号猪场中同时发现基因3型和基因4型存在,并进行连续追踪调查,结果显示该猪场基因4型在感染中占主导优势。选择部分阳性样品PCR产物,扩增的片断克隆T载体,进行测序。系统进化分析表明,基因4型HEV共有28株,和上海地区从人体内分离到的两株戊肝病毒有很高的同源性。基因3型HEV共有14株,在进化树中,这些病毒株形成一个新的分支,但是和一株日本离株较高的同源性。这说明基因3型在上海分布已经较为广泛,但在以前的研究显示,中国境内猪群中只存在基因4型,因而其来源还需进一步研究。用北京万泰生物药业有限公司提供的动物用HEV总抗体检测试剂盒,采用双抗原夹心法,检测来自上海某猪场的4周龄、8周龄、16周龄和经常母猪血清样品118份,以了解该猪场HEV抗体的存在情况。同时用rt-npcrA方法检测血清中HEV RNA.结果显示:抗体总阳性率为90.7%(107/118),其中4周龄、8周龄、16周龄和经常母猪抗体阳性率分别为:85.7%(30/35)、88%(32/35)、94%(33/35)、92.3%(12/13)。血清中HEV RNA阳性率为10.2%(12/118)。结果表明该猪场HEV抗体阳性率高,而血清中HEV RNA阳性率较低,并且在较高抗体水平血清中可以检测出HEV RNA阳性。为了进一步了解,HEV不同基因型是否存在混合感染,参照中国流行基因型,设计两套型特异性引物进行扩增,基因4型目的片段为440bp,位于ORFI和ORF2结合处,基因3型目的片段为ORF2内的164bp,发现同一个体内同时存在基因4型和基因3型HEV。其中4型分离株SW-CSH4与中国分离株T21同源性高达94.5%,而与其他基因型HEV-序列比较同源性均在81%以下,属于4a亚型。基因3型分离株SW-CSH3与美国分离株US2同源性高达95.7%,与其他基因3型参考序列同源性均在85%以上,属于3a亚型。

关键词：戊型肝炎基因型 rt-npcr ELISA 阳性率系统进化分析

新疆地区羊戊型肝炎的血清学调查及病毒的检测

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新疆地区羊戊型肝炎的血清学调查及病毒的检测

作者：曲立春新疆农业大学

学位级别：硕士

为了了解新疆地区HEV的流行情况和HEV的基因型，我们实验对此进行了调查与研究。采集新疆6个地区4个品种的826份羊血清（南疆348份、北疆478份），应用双抗原夹心酶联免疫法（DS-ELISA）检测抗-HEV IgG抗体，并用X检验比较不同地域、不... 详细信息

为了了解新疆地区HEV的流行情况和HEV的基因型，我们实验对此进行了调查与研究。采集新疆6个地区4个品种的826份羊血清（南疆348份、北疆478份），应用双抗原夹心酶联免疫法（DS-ELISA）检测抗-HEV IgG抗体，并用X检验比较不同地域、不同年龄以及不同品种羊HEV感染率的差异。结果显示，所检测的羊血清中抗-HEV抗体阳性率为19.13％（158／826），南、北疆羊抗-HEV抗体阳性率分别为21.26％（74／348）和17.58％（84／478），差异显著（P＜0.05）。新疆卡拉库尔羊、小尾寒羊抗-HEV抗体阳性率分别为23.94％（79／330）和17.33％（65／375），差异显著（P＜0.05）。3岁以上、2-3岁和1岁以内羊抗-HEV抗体阳性率差异不显著（P＞0.05）。说明新疆地区羊中普遍存在着HEV感染。收集南疆阿克苏新疆卡拉库尔羊血清50份，北疆两个地区小尾寒羊血清70份，参照文献，根据戊型肝炎病毒（HEV）编码结构蛋白基因保守区设计引物，应用逆转录套式聚合酶链反应方法（rt-npcr），进行戊型肝炎病毒检测。结果显示，在所检测的血清样本中未检测到HEV RNA。

关键词：戊型肝炎病毒 DS-ELISA 新疆羊血清 rt-npcr

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甲状腺癌中ret/ptc癌基因表达的研究

广东药学院学报 2005年第3期21卷 323-326页

作者：周晓明张国昌李锋赵瑾李洪安蒋金芳广东药学院病理教研室广东广州510240 新疆石河子医学院病理教研室新疆石河子832000

目的探讨ret原癌基因活化形式ret/ptc癌基因在甲状腺癌发病机制中的作用和判断其生物学行为。方法应用rtnpcr方法检测了37例甲状腺癌ret/ptc癌基因的表达,包括乳头状癌为26例,滤泡癌8例,髓样癌2例,未分化癌1例。结果26例甲状腺乳状癌中... 详细信息

目的探讨ret原癌基因活化形式ret/ptc癌基因在甲状腺癌发病机制中的作用和判断其生物学行为。方法应用rtnpcr方法检测了37例甲状腺癌ret/ptc癌基因的表达,包括乳头状癌为26例,滤泡癌8例,髓样癌2例,未分化癌1例。结果26例甲状腺乳状癌中有11例表达为阳性,阳性率为42.3%,8例滤泡癌、2例髓样癌和1例未分化癌均表达为阴性。组织学观察显示,ret/ptc阳性组病例多伴有淋巴细胞浸润(63.6%),显著高于阴性组病例(20.0%,P<0.05),临床病理资料显示,患者发病年龄平均为28.9岁,显著低于阴性组病例的45.9岁(P<0.05),而与患者性别,肿瘤大小,淋巴结转移无显著相关性,随访结果表明在复发病例中无ret/ptc阳性表达病例。结论我们认为ret原癌基因的活化与甲状腺乳头状癌的发生有关,具有ret/ptc癌基因阳性表达的患者一般发病年龄较小,肿瘤恶性程度不高,患者预后相对较好,可作为临床上诊断及判断其生物学行为的参考指标。

关键词：甲状腺肿瘤 rt-npcr ret/ptc癌基因

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安徽省戊型肝炎基因分型及临床特征研究

中华疾病控制杂志 2009年第5期13卷 541-544页

作者：吴金菊马尔健苏虹张文艳刘怀珠合肥市疾病预防控制中心急性传染病科安徽合肥230061 安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系安徽合肥230032

目的研究安徽省戊型病毒性肝炎的基因型及其分布特点,为预防和控制戊型病毒性肝炎和疫苗的研制提供科学依据。方法按照戊型病毒性肝炎诊断标准及处理原则(GB17011-1997)于2006年12月～2007年12月从安徽省的4家综合性三甲医院收集戊型病... 详细信息

目的研究安徽省戊型病毒性肝炎的基因型及其分布特点,为预防和控制戊型病毒性肝炎和疫苗的研制提供科学依据。方法按照戊型病毒性肝炎诊断标准及处理原则(GB17011-1997)于2006年12月～2007年12月从安徽省的4家综合性三甲医院收集戊型病毒性肝炎132例,分析临床特征,其中采集血清50份,用rt-npcr法检测戊型肝炎病毒基因型。结果HEV RNA阳性率为22%(11/50),经测序证实为戊型肝炎病毒(Hepatitis Evirus,HEV)的基因序列;用DNA STAR软件分析,11例的病毒株中2例为HEVⅠ型,9例为HEVⅣ型。Ⅳ型中又有ⅣA型3例和ⅣD型6例。结论安徽省急性散发性戊型肝炎的病毒基因型以HEVⅣ型为主,Ⅰ型次之,而Ⅳ型又有不同的亚型,主要为ⅣA和ⅣD型。

关键词：肝炎,戊型基因型 rt-npcr

上海地区猪戊型肝炎病毒部分序列的克隆与分析

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西南农业学报 2007年第5期20卷 1105-1108页

作者：宁海强李震于瑞嵩张佩华牛钟相山东农业大学动物科技学院山东泰安271018 上海市农业科学院畜牧兽医研究所

对上海地区几个猪场的戊型肝炎感染情况进行了调查,共采集粪便样品36份,通过rt-npcr的方法应用通用引物对病毒基因组的ORF2部分片断进行扩增,36份样品中有5份rt-npcr阳性,HEV RNA阳性率为13.9%,去除相同的序列,得到2株HEV的ORF2部分序... 详细信息

对上海地区几个猪场的戊型肝炎感染情况进行了调查,共采集粪便样品36份,通过rt-npcr的方法应用通用引物对病毒基因组的ORF2部分片断进行扩增,36份样品中有5份rt-npcr阳性,HEV RNA阳性率为13.9%,去除相同的序列,得到2株HEV的ORF2部分序列。序列分析表明,这两段序列与基因I、II、III、IV的遗传距离分别为0.183、0.207、0.230、0.102和0.177、0.226、0.240、0.108。系统进化分析显示,这两株病毒都属于基因Ⅳ型。

关键词：猪戊型肝炎病毒 rt-npcr 序列分析基因型

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HGV与HBV,HCA重叠感染病例的研究

西安医科大学学报 2000年第4期21卷 320-322页

作者：柴宁莉张树林陕西省人民医院西安西安交通大学第一医院肝炎研究室

目的探讨庚肝病毒（ＨＧＶ）与ＨＢＶ，ＨＣＶ重叠感染状况。方法采用套式逆转录聚合酶链反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）技术检测了２２例乙肝病毒感染者及４８例丙肝病毒感染者血清ＨＧＶＲＮＡ。结果ＨＧＶ与ＨＢＶ、ＨＣＶ重叠感染... 详细信息

目的探讨庚肝病毒（ＨＧＶ）与ＨＢＶ，ＨＣＶ重叠感染状况。方法采用套式逆转录聚合酶链反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）技术检测了２２例乙肝病毒感染者及４８例丙肝病毒感染者血清ＨＧＶＲＮＡ。结果ＨＧＶ与ＨＢＶ、ＨＣＶ重叠感染率分别为３１．８％（３１．８％（７／２２）、３１．３％（１５／４８），重叠感染病例与单纯ＨＢＶ，ＨＣＶ感染者在ＡＬＴ、ＳＢＩＬ水平及疾病的临床分型上无统计学差异。结论ＨＧＶ与ＨＢＶ、

关键词：病毒性肝炎 rt-npcr 重叠感染

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猪戊型肝炎病毒的分离及鉴定

猪戊型肝炎病毒的分离及鉴定

第六届全国会员代表大学暨第11次学术研讨会

作者：金扩世夏志平朱光泽田明尧屈勇刚孙中锋金宁一解放军军事医学科学院11所全军基因工程重点实验室

本研究采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测猪抗HEV IgM抗体,对IgM抗体阳性猪的胆汁通过逆转录-套式-聚合酶链反应(rt-Nested-PCR,rt-npcr)检测病毒核酸,采取核酸阳性的胆汁用于HEV的分离。结果分离到一株HEV,扩增并克隆了分离株HEV的OFR-... 详细信息

本研究采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测猪抗HEV IgM抗体,对IgM抗体阳性猪的胆汁通过逆转录-套式-聚合酶链反应(rt-Nested-PCR,rt-npcr)检测病毒核酸,采取核酸阳性的胆汁用于HEV的分离。结果分离到一株HEV,扩增并克隆了分离株HEV的OFR-2部分片段,经与Genebank中著录的HEV序列比较,表明该分离株HEV属于基因Ⅳ型。

关键词：戊型肝炎病毒病毒分离 rt-npcr

来源： cnki会议评论

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猪戊型肝炎病毒的分离及鉴定

猪戊型肝炎病毒的分离及鉴定

中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届全国会员代表大会暨第11次学术研讨会

作者：金扩世夏志平朱光泽田明尧屈勇刚孙中锋金宁一解放军军事医学科学院11所全军基因工程重点实验室

本研究采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测猪抗HEVIgM抗体,对IgM抗体阳性猪的胆汁通过逆转录—套式—聚合酶链反应(rt—Nested—PCR,rt-npcr)检测病毒核酸,采取核酸阳性的胆汁用于HEV的分离。结果分离到一株HEV,扩增并克隆了分离株HEV的OF... 详细信息

本研究采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测猪抗HEVIgM抗体,对IgM抗体阳性猪的胆汁通过逆转录—套式—聚合酶链反应(rt—Nested—PCR,rt-npcr)检测病毒核酸,采取核酸阳性的胆汁用于HEV的分离。结果分离到一株HEV,扩增并克隆了分离株HEV的OFR-2部分片段,经与Genebank中著录的HEV序列比较,表明该分离株HEV属于基因Ⅳ型。

关键词：戊型肝炎病毒病毒分离 rt-npcr

来源： cnki会议评论

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反转录PCR检测猪水泡病病毒RNA

反转录PCR检测猪水泡病病毒RNA