检索结果-南通市图书馆

Mapping transcriptome-wide protein-rna interactions to elucidate rna regulatory programs

Frontiers of Electrical and Electronic Engineering in China 2018年第3期6卷 228-238页

作者： Molly M.Hannigan Leah L.Zagore Donny D.Licatalosi Center for rna Science and Therapeutics Case Western Reserve University Cleveland OH 44106 USA.

Background： Our understanding of post-transcriptional gene regulation has increased exponentially with the development of robust methods to define protein-rna interactions across the transcriptome. In this review, we highlight the evolution and successful applications of crosslinking and immunoprecipitation （CLIP） methods to interrogate protein-rna interactions in a transcriptome-wide manner. Results： Here, we survey the vast array of in vitro and in vivo approaches used to identify protein-rna interactions, including but not limited to electrophoretic mobility shift assays, systematic evolution of ligands by exponential enrichment （SELEX）, and RIP-seq. We particularly emphasize the advancement of CLIP technologies, and detail protocol improvements and computational tools used to analyze the output data. Importantly, we discuss how profiling protein-rna interactions can delineate biological functions including splicing regulation, alternative polyadenylation, cytoplasmic decay substrates, and mirna targets. Conclusions： In summary, this review summarizes the benefits of characterizing rna-protcin networks to further understand the regulation of gene expression and disease pathogenesis. Our review comments on how future CLIP technologies can be adapted to address outstanding questions related to many aspects of rna metabolism and further advance our understanding of rna biology.

关键词： rna binding proteins CLIP post-transcriptional regulation rna networks

来源：

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：