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基因芯片技术检测10种烈性rna病毒

解放军医学杂志 2006年第3期31卷 203-206页

作者：杨银辉杨瑞馥常国辉司炳银翟俊辉吕富双周东生韩伟国祝庆余军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的利用基因芯片技术检测包括披膜病毒科甲病毒属、黄病毒科黄病毒属、布尼亚病毒科汉坦病毒属及SARS病毒等10种烈性rna病毒。方法设计了甲病毒属的属保守区通用引物和黄病毒属的通用引物,与布尼亚病毒及SARS病毒的引物一起用于扩增靶... 详细信息

目的利用基因芯片技术检测包括披膜病毒科甲病毒属、黄病毒科黄病毒属、布尼亚病毒科汉坦病毒属及SARS病毒等10种烈性rna病毒。方法设计了甲病毒属的属保守区通用引物和黄病毒属的通用引物,与布尼亚病毒及SARS病毒的引物一起用于扩增靶核酸。另外,在通用引物所能扩增的区域内设计每种病毒的特异引物,利用该引物通过PCR反应制备cDNA克隆探针,在判定其特异性后,制备氨基化探针。对探针浓度、杂交温度、杂交时间、不同杂交液及杂交后芯片的洗涤方法进行了优化。结果核酸探针浓度为0·3μg/μl时,可获得杂交信号;在杂交液终浓度含20%甲酰胺、杂交60℃、1·5h的条件下,可分别获得以上10种病毒的特异杂交信号。利用多重PCR扩增靶序列时,可获得2种或4种混合病原体的特异性杂交信号。结论利用基因芯片技术检测病毒性病原体是可行的,关键在于设计合适的引物及探针序列。

关键词：寡核苷酸序列分析 rna,病毒检测

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HCV-rna病毒载量和肝脏病理的关系

实用医学杂志 2006年第13期22卷 1513-1514页

作者：王敏乐晓华韩红星蒋小玲陆坚广东省深圳市肝病研究所 518020 广东省深圳市东湖医院 518020

目的:研究丙肝患者血清HCV-rna含量和丙氨酸氨基转移酶(ALT)浓度及肝脏病理之间的关系。方法:采用荧光定量PCR法检测306例疑似HCV感染患者的血清HCV-rna,ELISA法检测抗-HCV,全自动生化分析仪测定ALT,对部分患者行肝穿刺检查。结果:306... 详细信息

目的:研究丙肝患者血清HCV-rna含量和丙氨酸氨基转移酶(ALT)浓度及肝脏病理之间的关系。方法:采用荧光定量PCR法检测306例疑似HCV感染患者的血清HCV-rna,ELISA法检测抗-HCV,全自动生化分析仪测定ALT,对部分患者行肝穿刺检查。结果:306例血清标本中,HCV-rna和抗-HCV均阳性155例,HCV-rna阳性而抗-HCV阴性36例,HCV-rna阴性而抗-HCV阳性45例。在排除了甲型、乙型和戊型肝炎病毒感染后,23例丙肝患者在HCV-rna检测前后10d内,曾进行过肝脏病理检查,HCV-rna含量和ALT浓度水平与肝组织病理分级相关性不显著。结论:HCV-rna和抗-HCV的检测是诊断HCV-rna感染的重要指标。但HCV-rna含量和ALT浓度水平与肝组织炎症及纤维化无明显相关。

关键词：肝炎,丙型 rna,病毒肝脏病理

HCV rna对HIV合并HCV感染者高效抗逆转录病毒治疗的影响

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中华检验医学杂志 2009年第4期32卷 372-376页

作者：刘静张旻朱谦何昌宇胡清海赵连爽代娣丁海波楚振兴徐俊杰姜拥军尚红中国医科大学附属第一医院卫生部艾滋病免疫学重点实验室沈阳110001 河南省疾病预防控制中心河南省唐河县疾病预防控制中心

目的探讨HCV rna对HIV和HCV合并感染者接受高效抗反转录病毒治疗（highly active antiretroviral therapy，HAART）后疗效、肝脏功能和血脂的影响。方法招募我国河南既往有偿供血人群中接受HAART治疗的HIV／HCV合并感染者275例，每6个... 详细信息

目的探讨HCV rna对HIV和HCV合并感染者接受高效抗反转录病毒治疗（highly active antiretroviral therapy，HAART）后疗效、肝脏功能和血脂的影响。方法招募我国河南既往有偿供血人群中接受HAART治疗的HIV／HCV合并感染者275例，每6个月随访一次，定期检测HCV rna、HIV rna、CD4T淋巴细胞计数、肝脏功能指标和血脂等实验室指标，采用卡方检验、成组设计秩和检验比较HCV rna阳性组和HCV rna阴性组HAART治疗后HIV病毒抑制率、免疫学应答、肝损伤和血脂的差异。结果HAART治疗6月以上患者中，HCV rna阳性组和HCV rna阴性组HIV完全抑制率差异无统计学意义（45．6％vs．38．5％，Х^2=1．150，P〉0．05）；HAART治疗前（286个／μl vs．209个／μl，Z=0．734，P=0．463）、治疗后6个月（310个／μl vs．362个／μl，Z=0．562，P=0．574）、12个月（378个／μl vs．289个／μl，Z=1．091，P=0．275）、18个月（363个／μl vs．288个／μl，Z=1．435，P=0．151）、24个月（413个／μl vs．348个／μl，Z=0．939，P=0．348）CD4^＋T淋巴细胞计数在HCV rna阳性组和HCV rna阴性组间差异无统计学意义。HCV rna阳性组血清ALT（55．0U／L vs．29．5U／L，Z=6．789，P〈0．01）、AST（46．0U／L vs．33．0U／L，Z=4．890，P〈0．01）、TBIL（9．3mmol／L vs．7．2mmol／L，Z=3．748，P〈0．01）水平显著高于HCV rna阴性组；HCV rna阳性组HAART治疗后发生肝损伤的风险显著高于HCV rna阴性组（调整后优势比aOR=3．8，P〈0．01）。HIV／HCV合并感染者HCV rna阳性组TG水平显著低于HCV rna阴性组（1．2mmol／L vs．1．4mmol／L，Z=1．936，P=0．043）、而HDL-C水平显著高于HCV rna阴性组（1．5mmol／L vs．1．3mmol／L，Z=2．251，P=0．024）。结论HCV rna对HIV／HCV合并感染者HAART治疗后HIV病毒抑制率无影响，亦不影响HAART治疗后CD4^＋T淋巴细胞的恢复；HCV rna是HIV／HCV合并感染者HAART治疗后肝损伤的独立危险因素，但可能减轻HAART治疗引起的血脂异常。

关键词： HIV感染肝炎,丙型抗逆转录病毒治疗,高效 rna,病毒

肿瘤患者丙肝病毒抗体结果在HCV现症感染诊断中的临床价值

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中华检验医学杂志 2018年第6期41卷 442-445页

作者：王慜杰韩彬彬孙麟坤李学祥韩晓红崔巍国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院检验科 100021

目的探讨肿瘤患者丙型肝炎病毒抗体S/CO值在HCV现症感染诊断中的临床价值。方法回顾性分析2013年1月至2015年4月间在中国医科院肿瘤医院住院并经病理学诊断的肿瘤患者，男240例，女150例，年龄25至83岁，应用雅培i2000免疫分析仪和罗氏... 详细信息

目的探讨肿瘤患者丙型肝炎病毒抗体S/CO值在HCV现症感染诊断中的临床价值。方法回顾性分析2013年1月至2015年4月间在中国医科院肿瘤医院住院并经病理学诊断的肿瘤患者，男240例，女150例，年龄25至83岁，应用雅培i2000免疫分析仪和罗氏实时荧光定量PCR分别检测HCV抗体和rna水平，在肝癌组和非肝癌组分别观察HCV抗体S/CO值与rna检测的相关性。结果肝癌组与非肝癌组在年龄、性别和HCV抗体水平的分布上有明显统计学差异（P＝0.004，P〈0.001和P〈0.001），两组患者在HCV rna阳性率的分布上无统计学差异（P＝0.528），随着S/CO值的增大两组患者HCV rna阳性率都升高。使用ROC曲线分析，感染HCV的肿瘤患者诊断现症感染的最佳界值为10.0，此时敏感度为97.6%，特异度为81.3%；根据ROC曲线结果，肝癌组和非肝癌组的最佳界值差别不大，分别为11.4和10.4。结论感染HCV的肿瘤患者诊断HCV现症感染的最佳界值为10.0时，诊断效率较高。

关键词：肝肿瘤丙型肝炎抗体 rna,病毒 ROC曲线

国内外肝炎病毒核酸定量和定性检测试剂的差异及质量控制

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中华检验医学杂志 2010年第10期33卷 905-908页

作者：吴星周诚梁争论中国药品生物制品检定所北京100050

肝炎病毒核酸检测试剂在临床广泛应用,国内外相关试剂质量存在较大差异.本文从试剂的生产工艺、检测原理、操作过程等方面分析了国内外试剂质量存在差异的主要原因,同时阐述了国内外相关试剂质量控制的现状.提出为提高国产试剂质量,应... 详细信息

肝炎病毒核酸检测试剂在临床广泛应用,国内外相关试剂质量存在较大差异.本文从试剂的生产工艺、检测原理、操作过程等方面分析了国内外试剂质量存在差异的主要原因,同时阐述了国内外相关试剂质量控制的现状.提出为提高国产试剂质量,应加强上市后监管和实验室内部质量控制.

关键词：肝炎病毒 rna,病毒 DNA,病毒指示剂和试剂质量控制

贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因遗传特征分析

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中国基层医药 2023年第5期30卷 692-698页

作者：郑勤妮任丽娟庄丽付成忠万永虎贵州省疾病预防控制中心实验中心病毒科贵阳550004

目的分析贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因特征,了解变异规律。方法由贵州省10家网络实验室分离的H3N2亚型流感毒株中随机选取20株提取rna,进行逆转录酶聚合酶链反应和测序,采用生物信息软件分析。结果20株毒株HA基因核苷酸同... 详细信息

目的分析贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因特征,了解变异规律。方法由贵州省10家网络实验室分离的H3N2亚型流感毒株中随机选取20株提取rna,进行逆转录酶聚合酶链反应和测序,采用生物信息软件分析。结果20株毒株HA基因核苷酸同源性为97.7%~100.0%,与世界卫生组织推荐的疫苗株A/Hong-Kong/4801/2014(2017年)和A/Singapore-INFIMH/16-0019/2016(2018年)同源性高,而与2019年世界卫生组织推荐的疫苗株A/Kansas/14/2017(2019年)差异较大。遗传分析显示,20株病毒株主要分为2个分支,2019年流行的毒株处于不同的分支,遗传差距较大。关键位点分析显示,抗原决定族A、B、C和E存在突变;受体结合位点前壁和后壁存在突变;与当年度疫苗株相比,存在糖基化位点的增加。2017-2018年毒株在遗传距离、抗原位点和糖基化位点变异情况与2019年毒株略有不同。结论贵州省2017-2019年H3N2亚型流感病毒HA基因发生基因突变,2019年的毒株变异最为严重,应密切监测H3N2亚型流感病毒遗传进化的变化情况。

关键词：流感病毒A型,H3N2亚型 rna,病毒逆转录聚合酶链反应多位点测序分型序列同源性,核酸遗传序列标记位点血凝素类,病毒

男男性接触人群急性人类免疫缺陷病毒感染者临床特征及其与疾病进展的关系

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中华传染病杂志 2014年第2期32卷 116-119页

作者：胡文静张欣李伟华夏炜魏飞力闫惠平首都医科大学附属北京佑安医院感染与免疫研究中心 100069 首都医科大学附属北京佑安医院感染科 100069 首都医科大学附属北京佑安医院艾滋病实验室 100069

目的了解MSM人群急性HIV感染者的临床特征、CD4＋、CD8＋ T淋巴细胞计数、HIVrna水平及其与疾病进展的相关性。方法定期随访观察100例急性HIV感染者，采用核酸依赖性扩增法（NASBA）检测血浆HIVrna；流式细胞术检测CD4＋、CD8＋T淋巴细... 详细信息

目的了解MSM人群急性HIV感染者的临床特征、CD4＋、CD8＋ T淋巴细胞计数、HIVrna水平及其与疾病进展的相关性。方法定期随访观察100例急性HIV感染者，采用核酸依赖性扩增法（NASBA）检测血浆HIVrna；流式细胞术检测CD4＋、CD8＋T淋巴细胞计数；ELISA法检测HBsAg和抗一HCV；快速血清反应素环状卡片试验法初筛梅毒螺旋体，对阳性梅毒螺旋体以明胶凝集试验方法确证。结果100例患者中年龄20～50岁96例。HBsAg阳性9例，抗-HCV阳性4例，合并梅毒感染40例。感染HIV后第1、3个月CD4＋ T淋巴细胞计数分别为510、499／μL；感染第1、3、6、24个月时，H1Vrna分别为4．37、4．00、4．3l和4．43 lg拷贝／mL。各随访时间点CD8＋T淋巴细胞计数基本无变化。38例快速进展者的初始CD4＋T淋巴细胞计数为（358．0±134．6）／μL，非快速进展者的CD4＋-T淋巴细胞计数为（559．2±203．4）／μL；快速进展者初始HIVrna为4．71lg拷贝／mL，非快速进展者的HIVrna为4．18lg拷贝／mL。快速进展者与非快速进展者初始CD8＋T淋巴细胞计数分别为1250．1、1247．2／μL。结论MSM人群HIV感染者呈年轻化，急性期的初始CD4＋T淋巴细胞计数、HIVrna水平可以预测疾病进展。

关键词： HIV感染同性恋,男性 CD4淋巴细胞计数 rna,病毒病毒载量预测

甲状腺自身免疫性抗体与丙型肝炎病毒感染的相关性分析

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中华传染病杂志 2009年第3期27卷 138-141页

作者：杨榕单忠艳李玉姝范晨玲李晨阳滕卫平中国医科大学附属第一医院内分泌科中国医科大学内分泌研究所沈阳110001

目的探讨自身免疫性甲状腺病、甲状腺自身抗体与HCV感染的相关性。方法选取甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和（或）甲状腺球蛋白抗体（TgAb）阳性者462例，分别选取年龄和性别匹配的TPOAb和TgAb阴性者380例作为对照，检测血清抗一HCV，... 详细信息

目的探讨自身免疫性甲状腺病、甲状腺自身抗体与HCV感染的相关性。方法选取甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和（或）甲状腺球蛋白抗体（TgAb）阳性者462例，分别选取年龄和性别匹配的TPOAb和TgAb阴性者380例作为对照，检测血清抗一HCV，阳性者进一步作HCVrna定性检测。同时，选取临床诊断的195例丙型肝炎患者作病例组，并选取年龄和性别匹配的150名健康人和150例乙型肝炎患者作对照组，行甲状腺相关指标的测定。采用独立样本t检验和χ^2检验。结果甲状腺自身抗体阳性组462例患者中，HCV感染阳性率为1．30％，阴性组380例中HCV感染阳性率为0．53％，差异无统计学意义（χ^2=1．322，P〉0．05）。丙型肝炎患者的TPOAb阳性率为30．8％，TgAb阳性率为30．8％，均显著高于乙型肝炎患者和健康人（χ^2=21．496，χ^2=30．454；P〈0．01）。结论甲状腺自身免疫异常者未见HCV感染率增高，而丙型肝炎患者甲状腺自身抗体阳性率增高，提示丙型肝炎患者应注意检测甲状腺相关指标。

关键词：自身免疫疾病甲状腺疾病自身抗体肝炎,丙型肝炎抗体,丙型 rna,病毒

在兰州地区儿童粪便中检测Aichi virus

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中华实验和临床病毒学杂志 2010年第1期24卷 11-13页

作者：李博文梁莎谢金鑫李杰兰蓓李永清李慧莹程卫霞李丹地金玉段招军兰州大学第一临床医学院 730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

目的从兰州腹泻和正常儿童粪便标本中检测 Aichi virus,同时探讨 Aichi virus 与婴幼儿腹泻之间的联系.方法根据文献发表资料,采用RT-PCR方法扩增 Aichi virus 3CD 片段,阳性产物经测序确定,并与已发表的该病毒序列进行比对分析.结果 ... 详细信息

目的从兰州腹泻和正常儿童粪便标本中检测 Aichi virus,同时探讨 Aichi virus 与婴幼儿腹泻之间的联系.方法根据文献发表资料,采用RT-PCR方法扩增 Aichi virus 3CD 片段,阳性产物经测序确定,并与已发表的该病毒序列进行比对分析.结果在46份腹泻住院患儿粪便标本和299份腹泻门诊就诊患儿标本中各检出1例 Aichi virus,总检出率为0.06%,正常对照儿童中未检测到 Aichi virus.2株病毒3CD区基因与已知参考株核苷酸序列同源性均为97%,系统进化分析显示这2株病毒属于B基因型.结论我国存在B基因型的 Aichi virus,但要明确我国 Aichi virus 的病原学及流行病学特点需要更多研究.

关键词： rna,病毒腹泻,婴儿流行病学