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Helicase activity and substrate specificity of recq5β

Chinese Physics B 2017年第6期26卷 499-507页

作者：尤菁徐雅楠李辉吕袭明李伟王鹏业窦硕星奚绪光 Beijing National Laboratory for Condensed Matter Physics and CAS Key Laboratory of Soft Matter Physics Institute of Physics Chinese Academy of Sciences (CAS) Beijing 100190 China School of Physical Sciences University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 China College of Life Science Inner Mongolia University for Nationalities Tongliao 028000 China College of Life Sciences Northwest Agriculture and Forestry University Yangling 712100 China LBPA IDA ENS Cachan CNRS Universite Paris-Saclay Cachan F-94235 France

recq5β is an essential DNA helicase in humans, playing important roles in DNA replication, repair, recombination and transcription. The unwinding activity and substrate specificity of recq5β is still elusive. Here, we used stopped-flow kinetic method to measure the unwinding and dissociation kinetics of recq5β with several kinds of DNA substrates, and found that recq5β could well unwind ss/ds DNA, forked DNA and Holiday junction, but was compromised in unwinding blunt DNA and G-quadruplex. Rec5β has the preferred unwinding specificity for certain DNA substrates containing the junction point, which may improve the binding affinity and unwinding activity of recq5β. Moreover, from a comparison with the truncated recq5β～（1-467）, we discovered that the C-terminal domain might strongly influence the unwinding activity and binding affinity of recq5β. These results may shed light on the physiological functions and working mechanisms of recq5β helicase.

关键词： helicase recq5β DNA substrate specificity unwinding kinetics

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recq5β解旋酶DNA退火特性的动力学研究

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科学通报 2012年第8期57卷 618-625页

作者：丁秀艳徐雅楠李伟王鹏业奚绪光窦硕星西北农林科技大学生命科学学院杨凌712100 中国科学院物理研究所软物质物理实验室北京凝聚态物理国家实验室北京100190 Institut Curie-Section de Recherche Centre UniversitaireBatiment 110F-91405 OrsayFrance

recq家族解旋酶对维持基因组完整性起着关键作用.许多recq家族解旋酶不仅可以打开双链及其他更复杂的DNA结构,而且有意思的是,还具有DNA退火活性.本文通过对DNA退火动力学、平衡态下DNA结合以及与单链DNA解离动力学的一系列测量,系统研... 详细信息

recq家族解旋酶对维持基因组完整性起着关键作用.许多recq家族解旋酶不仅可以打开双链及其他更复杂的DNA结构,而且有意思的是,还具有DNA退火活性.本文通过对DNA退火动力学、平衡态下DNA结合以及与单链DNA解离动力学的一系列测量,系统研究了recq5β的DNA退火特性.结果显示,在本研究的反应缓冲液条件下,在没有或存在不同的磷酸核苷因子（AMPPNP,ATPS或ADP）的情况下,当酶分子覆盖约40%~50%DNA单链时,recq5β催化的DNA退火效率最高.通过对recq5β1~662的比较研究证实,recq5β的C末端区域对该酶高的DNA退火活性是必不可少的.本文结果将有助于更好地理解recq家族解旋酶催化DNA退火的机理.

关键词：解旋酶 recq5β DNA退火动力学 DNA结合

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