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rapd分析山西主要地方山羊品种的遗传多态性

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畜牧兽医学报 2005年第2期36卷 202-204页

作者：杜美红李步高周忠孝中国农业大学生物学院北京100094 山西农业大学动物科技学院太谷030801

Random Amplified Polymorphic DNA (rapd) analysis was used with 10 primers to assess genetic variability in Shanxi native goats (Yangcheng White,Licheng Daqing,Lüliang Black). The results showed as follows: *** DNA of 3 breeds provided a great number of molecular markers with high polymorphism. 2. According to their rapd fingerprinting map, the genetic distance and average band similarity among 3 breeds were calculated, 0.182 7 between Yangcheng White Goat and Licheng Daqing Goat is the smallest. Cluster analysis also showed that Licheng Daqing Goat and Yangcheng White Goat from alike region had a smaller distance. 3. The genetic diversity and its partition within and between populations of the 3 populations were calculated by using Shannon index. The genetic diversity index of Licheng Daqing,Yangcheng White,Lüliang Black were 0.328 8,0.349 9 and 0.154 5 respectively, Genetic differentiation (Gst) was estimated to be about 68.49 among 3 populations. The results indicated that the genetic variation was mainly among breeds; the genetic character of Lüliang Black Goat was peculiar in native breeds indicating that protection and further selection should be strengthened.

关键词：白山羊 rapd分析品种方山动物育种黑山羊种质资源山西经济地方

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rapd分析用的梨DNA提取方法

遗传 1998年第4期20卷 31-33页

作者：胡春根郝玉邓秀新史永忠华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室

ＲＡＰＤ分析用的梨ＤＮＡ提取方法胡春根郝玉邓秀新史永忠（华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，武汉４３００７０）ＤＮＡＥｘｔｒａｃｔｉｏｎＭｅｔｈｏｄｆｏｒＲＡＰＤＡｎａｌｙｓｉｓｉｎＰｅａｒｓＨＵＣｈｕｎｇｅｎＨ... 详细信息

ＲＡＰＤ分析用的梨ＤＮＡ提取方法胡春根郝玉邓秀新史永忠（华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，武汉４３００７０）ＤＮＡＥｘｔｒａｃｔｉｏｎＭｅｔｈｏｄｆｏｒＲＡＰＤＡｎａｌｙｓｉｓｉｎＰｅａｒｓＨＵＣｈｕｎｇｅｎＨＡＯＹｕＤＥＮＧＸｉｕｘｉｎＳＨＩ...

关键词：梨 DNA 提取方法 rapd分析

栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代杂种优势的rapd分析

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高技术通讯 2005年第6期15卷 97-101页

作者：滕丽莉杨爱国赵峰刘志鸿周丽青王清印中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071上海水产大学生命科学与技术学院上海200090 中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090

应用rapd技术对栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代的杂种优势进行了研究,对栉孔扇贝(C)、虾夷扇贝(P)及其正交F1(C♀×P♂)、反交F1(P♀×C♂)共4个群体的rapd扩增带谱进行了分析.从40个随机引物中筛选出16个扩增带丰富的引物进行扩增,共得到l1... 详细信息

应用rapd技术对栉孔扇贝×虾夷扇贝子一代的杂种优势进行了研究,对栉孔扇贝(C)、虾夷扇贝(P)及其正交F1(C♀×P♂)、反交F1(P♀×C♂)共4个群体的rapd扩增带谱进行了分析.从40个随机引物中筛选出16个扩增带丰富的引物进行扩增,共得到l15条清晰稳定的扩增带,扩增片段大小在200～2000bp之间,其中有82个扩增位点具有多态性,多态性位点比率为71.3%.栉孔扇贝与正反交子代的相对遗传距离分别为0.0852和0.2886;虾夷扇贝与正反交子代的相对遗传距离分别为0.2327和0.0559,杂种子代与两亲本的遗传差异不是对等的,而是偏向各自的母本,系统树、Shannon多样性指数同样证明了这一点.两亲本群体内相似性指数分别为0.8392和0.8451,均大于正交子代的群体内相似性指数,而小于反交子代的群体内相似性指数,表明正交子代群体的遗传多样性水平升高,产生杂种优势;反交降低,未产生明显的杂种优势,与4个群体Shannon遗传多样性指数计算分析结果一致.

关键词：杂种优势虾夷扇贝栉孔扇贝 rapd分析子一代 Shannon多样性指数相似性指数 rapd技术 rapd扩增遗传距离多态性位点遗传多样性随机引物扩增片段扩增位点遗传差异分析结果正反交子代正交群体系统树体内亲本

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芸薹属多倍体植物基因组进化的rapd分析

植物分类学报 2003年第6期41卷 520-530页

作者：刘爱华王建波朱英国武汉大学植物发育生物学教育部重点实验室武汉430072

多倍化是促进高等植物发生进化的重要力量。为了更清楚地了解多倍体在形成之后其基因组是如何进化的 ,利用 38个随机引物对芸薹属BrassicaL .禹氏三角 (U’Triangle)中的多倍体物种及其祖先二倍体物种进行了研究。根据扩增出的 2 73条... 详细信息

多倍化是促进高等植物发生进化的重要力量。为了更清楚地了解多倍体在形成之后其基因组是如何进化的 ,利用 38个随机引物对芸薹属BrassicaL .禹氏三角 (U’Triangle)中的多倍体物种及其祖先二倍体物种进行了研究。根据扩增出的 2 73条带计算了遗传距离 ,并用UPGMA法进行了聚类分析。结果发现 ,二倍体物种B .campestris (AA)与B .oleracea (CC)的亲缘关系比与B .nigra (BB)的要近 ;异源多倍体B .napus (AACC)比起其二倍体祖先之一B .campestris(AA)与另一个祖先种B .oleracea(CC)的关系更近 ,异源多倍体B .juncea (AABB)和B .carinata(BBCC)都只与其二倍体祖先种之一B .nigra (BB)的关系更为接近。结合统计分析的结果表明 ,比较而言 ,异源多倍体B .napus (AACC)形成后其祖先基因组A和C变化不大 ;B .juncea(AABB)和B .carinata (BBCC)形成后各自都是其一个祖先基因组 ,即B基因组变化较小。

关键词：芸薹属多倍体植物基因组进化 rapd分析十字花科

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石蒜属种间亲缘关系rapd分析

Acta Genetica Sinica 2002年第10期29卷 915-921页

作者：张露蔡友铭诸葛强楼炉焕邹惠渝黄敏仁王明庥南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室浙江林学院临安311300

采用rapd标记构建了石蒜属Lycoris植物 13个种的指纹图谱。从 5 2 0个随机引物中筛选出清晰且多态性高的 4 1个引物 ,共产生了 35 0条DNA片段 ,分子量在 0 3～ 3 0kb之间 ,其中 2 5 3条谱带具有遗传多态性 ,约占 72 3% ,平均每个引物... 详细信息

采用rapd标记构建了石蒜属Lycoris植物 13个种的指纹图谱。从 5 2 0个随机引物中筛选出清晰且多态性高的 4 1个引物 ,共产生了 35 0条DNA片段 ,分子量在 0 3～ 3 0kb之间 ,其中 2 5 3条谱带具有遗传多态性 ,约占 72 3% ,平均每个引物扩增的DNA片段数为 6 2条。采用TFPGA数据分析软件 ,计算Nei氏相似性系数和遗传距离 ,建立了UPGMA聚类图。结果表明 :石蒜属 13个种明显聚为两大类 ,即具有单型核型结构 (Ⅰ型 )、染色体基数为x =11的 5个物种 :玫瑰石蒜L rosea、红蓝石蒜L haywardii、稻草石蒜L straminea、换锦花L sprengeri和石蒜L radiata聚为一类 ;具有两型核型结构 (V型和Ⅰ型 ) 8个物种即江苏石蒜L houdyshelii、乳白石蒜L albiflora、中国石蒜L chinensis、长筒石蒜L longituba、安徽石蒜L anhuiensis、夏水仙L squmigera、短蕊石蒜L caldwellii和忽地笑L aurea聚为一类。其中玫瑰石蒜和红蓝石蒜的亲缘关系最近 ,石蒜和忽地笑的亲缘关系较远 ,与细胞学的研究结果相吻合。通过rapd分析 ,对玫瑰石蒜、红蓝石蒜和稻草石蒜是否天然杂交起源以及乳白石蒜、稻草石蒜和江苏石蒜的分类地位进行了探讨。

关键词：石蒜属种间亲缘关系 rapd分析聚类分析石蒜科植物

花粉管通道法转柱头外露棉DNA及转化体rapd分析

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湖南师范大学自然科学学报 2004年第4期27卷 81-86页

作者：周平兰梁满中高健陈良碧湖南师范大学生命科学学院植物学系中国长沙410081 湖南科技大学生命科学学院生物系中国湘潭411201

提取"异9-3"柱头外露棉总基因组DNA,通过花粉管通道法经微量注射导入抗虫棉707 1的胚囊内,D1代田间筛选到柱头外露的转化植株.遗传分析结果表明转化株柱头外露性状由一对隐性基因控制.50个随机引物进行PCR扩增,33个引物扩增出的DNA在供... 详细信息

提取"异9-3"柱头外露棉总基因组DNA,通过花粉管通道法经微量注射导入抗虫棉707 1的胚囊内,D1代田间筛选到柱头外露的转化植株.遗传分析结果表明转化株柱头外露性状由一对隐性基因控制.50个随机引物进行PCR扩增,33个引物扩增出的DNA在供体、受体和转化体之间呈现出多态性,其中引物S462(TCGGCACGCA)在供体和转化体之间出现相同产物而受体没有出现扩增产物,该引物有可能作为柱头外露系的分子标记.rapd分析结果表明转化体与受体有较多相同基因位点,而与供体相同基因位点较少.转化体还有供体和受体都不具有的基因位点,这可能是外源DNA导入时引起碱基突变所致.

关键词：柱头外露花粉管通道法 rapd分析基因位点引物供体转化受体 DNA CGC

中国特有植物大血藤的rapd分析──植物地带性分化的分子差异标准初探

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中山大学学报（自然科学版） 1999年第1期38卷 64-69页

作者：廖文波邓嫣容陈月琴屈良鹄张宏达中山大学生命科学学院

采用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对中国特有科特有属植物大血藤（Ｓａｒｇｅｎｔｏｄｏｘａｃｕｎｅａｔａ）进行分析，探讨植物地带性分化的分子差异．从１００个随机引物中筛选出１１个有效的１０碱基对寡聚核糖核苷酸作引物，用于对... 详细信息

采用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对中国特有科特有属植物大血藤（Ｓａｒｇｅｎｔｏｄｏｘａｃｕｎｅａｔａ）进行分析，探讨植物地带性分化的分子差异．从１００个随机引物中筛选出１１个有效的１０碱基对寡聚核糖核苷酸作引物，用于对取自５省区的大血藤植物基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增；用ＵＰＧＭＡ法对各居群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．ＲＡＰＤ分析结果表明：分布于各省区（地区）的大血藤居群，尽管其形态特征的变异尺度较为一致，但在分子水平上存在明显差异，这种差异与地理范围的变化相关，表现出一定的地带性分化规律．

关键词：大血藤属居群 rapd分析地带性分化分子标准

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西藏白菜型油菜遗传多样性的rapd分析

Acta Genetica Sinica 2002年第11期29卷 1021-1027页

作者：王建林旦巴胡书银涂金星栾运芳孟霞卓嘎尼玛卓玛唐琳西藏农牧学院农学系林芝860000 华中农业大学农学系武汉430070 西藏自治区农科所拉萨850002

通过利用 2 2个 10bp随机引物对来自西藏高原地区 10 7份白菜型油菜种质资源材料的PAPD分析 ,探讨了西藏白菜型油菜品种之间的遗传分化关系。结果表明 :(1)供试的 10 7份材料共产生 2 36条谱带 ,其中 2 10条谱带有多态性 ,占 88.98% ,... 详细信息

通过利用 2 2个 10bp随机引物对来自西藏高原地区 10 7份白菜型油菜种质资源材料的PAPD分析 ,探讨了西藏白菜型油菜品种之间的遗传分化关系。结果表明 :(1)供试的 10 7份材料共产生 2 36条谱带 ,其中 2 10条谱带有多态性 ,占 88.98% ,说明白菜型油菜在西藏高原地区具有较丰富的遗传多样性 ;(2 )根据引物扩增出的DNA指纹图谱 ,运用UPGMA分析法 ,在遗传距离为 0 .0 78处 ,可将供试的 10 7份白菜型油菜划分为 11个类群 ,发现来自于同一地区或气候相似区的品种往往聚在一起 ,表明西藏高原白菜型油菜品种的相似性与其原产地的地理、气候背景密切相关。并在此基础上 ,结合西藏高原农业发展历史、气候背景以及地形地貌特点和植物地理学、植物区系学、植物进化论等方面的综合分析 ,提出西藏高原是世界白菜型油菜起源地的观点。

关键词：西藏白菜型油菜遗传多样性 rapd分析

核质互作型水稻线粒体不育基因的rapd分析

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Acta Genetica Sinica 2003年第4期30卷 357-363页

作者：裴得胜向跃武李名扬蔡平钟张志雄阎文昭侯磊裴炎四川省农业科学院生物技术核技术研究所成都610066 西南农业大学生物技术中心重庆400716

采用rapd对水稻Ⅱ 32A、Ⅱ 32B、Ⅱ优 94 9的mtDNA进行分析 ,得到两个特异的扩增片段OPJ18 10 0 0、OPJ18 14 0 0。序列测定两个特异片段全长分别为 10 6 8bp和 14 81bp。Southern杂交结果证明了差异片段的真实性。用OPJ18 10 0 0作... 详细信息

采用rapd对水稻Ⅱ 32A、Ⅱ 32B、Ⅱ优 94 9的mtDNA进行分析 ,得到两个特异的扩增片段OPJ18 10 0 0、OPJ18 14 0 0。序列测定两个特异片段全长分别为 10 6 8bp和 14 81bp。Southern杂交结果证明了差异片段的真实性。用OPJ18 10 0 0作探针与Ⅱ 32A、Ⅱ 32B、Ⅱ 优 94 9的mtRNA斑点杂交结果表明 ,除Ⅱ 32B外 ,都在转录水平上对水稻雄性不育有一定影响。虽然OPJ18 14 0 0对应的RNA斑点杂交呈阴性 ,但其DNA序列中存在一个七碱基 5′ TTC CCTC 3′的保守系列。据报道它是atp6基因中同源重组热点区 ,可促使线粒体基因重组形成嵌合基因 ,从而对水稻雄性不育的形成起着重要作用。经同源性比较和DNA、RNA杂交证实获得的两个片段是新的与水稻细胞质雄性不育相关的mtDNA序列。

关键词：水稻雄性不育 mtDNA rapd分析 Southern杂交 RNA斑点杂交