检索结果-南通市图书馆

华中农业大学学报 2014年第4期33卷 1-6页

作者：李旭凯彭良才王令强华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室华中农业大学生物质与生物能源中心华中农业大学植物科学技术学院武汉430070

用perl语言编写了一个pep_***脚本，可从一组相关序列中搜索非常相似的序列片段，通过匹配所有可能的氨基酸片段的排列，统计每个匹配模体在序列中的出现频率和位置，搜索蛋白质序列中的2～4个多肽的模体。

关键词： pep—pattern pl perl脚本蛋白质序列模体排列

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perl脚本在试验数据解析中的应用

遥测遥控 2016年第3期37卷 54-56页

作者：武明孙垒高磊陆远上海航天电子技术研究所上海201109

数据解析是型号试验的重要环节。简介perl语言,设计用于解析试验数据的perl脚本。

关键词： perl脚本试验数据解析

Enrich＿***,差异表达基因富集分析的perl脚本

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生物信息学 2018年第3期16卷 178-183页

作者：李旭凯王钇杰王俊杰山西农业大学生命科学学院山西太谷030801 特色杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室山西晋中030801 农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室太原030031 山西农业大学农学院山西晋中030801

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用perl语言写了一个脚本——Enrich_***,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利... 详细信息

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用perl语言写了一个脚本——Enrich_***,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。

关键词： Enrich_analysis.pl perl脚本富集分析 Fisher-s Exact Test 检验

基于perl脚本在NCBI网站自动或批量获取物种信息

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生物信息学 2018年第3期16卷 170-177页

作者：李元丰磊吴玲惠舒青龙江西中医药大学生命科学学院南昌330004

根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动... 详细信息

根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动或批量获取物种信息。通过解析NCBI在线BLAST结果及其网页源程序特点,利用perl语言编写自动化脚本,以达到批量获取查询或比对结果的物种分类信息。本研究编写的perl语言脚本可解决序列在NCBI在线比对后自动或批量获取物种的分类信息问题,适用于细菌、真菌、动物、植物等物种学名、分类号、核酸或蛋白质的任意序列,可以为同行生物数据分析提供参考。

关键词： perl脚本基因序列物种分类信息 NCBI

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***,控制变量挑选实验材料的perl脚本

生物信息学 2013年第3期11卷 186-191页

作者：李旭凯郭凯彭良才王令强华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室华中农业大学植物科学技术学院华中农业大学生物质与生物能源中心湖北武汉430070

用perl语言编写了一个脚本—***,通过计算两个材料特定某几列数据之间增加或减少的百分数水平,达到控制变量突出关键因子的作用,方便生物学工作者选取材料,做进一步的实验或分析。

关键词： ChooseMaterials pl perl脚本挑选实验材料控制变量

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***,转换片段大小表为0/1矩阵的perl脚本

生物信息学 2006年第2期4卷 69-71,91页

作者：艾华水黄路生江西农业大学农业部江西省动物生物技术重点实验室南昌330045

用perl语言编写了一个脚本———***来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题。

关键词： FS2M01.pl perl脚本片段大小数据表 0/1矩阵

基于perl脚本的自动化测试系统的设计与实现

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电子制作 2013年第19期21卷 83-83页

作者：易争鸣陈西伟兰州大学信息科学与工程学院兰州730030

近些年来,软件重写越来越普遍。但是如何高效的测试重写软件使其具备原软件的效率与准确率是测试所面临的一项挑战。传统的手工测试法既耗费人力,又浪费时间,还可能存在人为疏忽所引起的错误。为了能良好的解决上述问题,本文提出了基于P... 详细信息

近些年来,软件重写越来越普遍。但是如何高效的测试重写软件使其具备原软件的效率与准确率是测试所面临的一项挑战。传统的手工测试法既耗费人力,又浪费时间,还可能存在人为疏忽所引起的错误。为了能良好的解决上述问题,本文提出了基于perl脚本的自动化测试系统的设计与现实,从而有效地提高了测试工作的效率。

关键词：自动化测试单元测试重写软件 perl脚本

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基于开源工具的海洋元数据网络发布

基于开源工具的海洋元数据网络发布

作者：叶小燕山东科技大学

学位级别：硕士

本文利用GLOBEC/JGOFS数据管理软件和MySQL数据库管理系统来分别存储和管理海洋数据和海洋元数据。为了实现海洋元数据的网络发布,本文设计并创建了用来支持MapServer地图显示的元数据数据库的三个数据库表,以及编写了MapServer地图显... 详细信息

本文利用GLOBEC/JGOFS数据管理软件和MySQL数据库管理系统来分别存储和管理海洋数据和海洋元数据。为了实现海洋元数据的网络发布,本文设计并创建了用来支持MapServer地图显示的元数据数据库的三个数据库表,以及编写了MapServer地图显示的数据驱动。本文利用了perl脚本语言的CGI和DBI模块来动态显示BCO-DMO元数据库系统中的元数据信息,改进了GLOBEC/JGOFS数据管理软件的info应用程序,对实现海洋元数据的搜索及可视化作准备及改善了元数据的共享服务。由于GLOBEC/JGOFS数据管理软件发布的海洋数据是以列表形式显示数据集,很难对数据集进行查询检索,并且用户无法直观的获取海洋数据的位置信息,因此在本论文中利用perl脚本与MySQL数据库实现了海洋元数据的查询检索功能,并且使用MapServer地图服务系统将查询到的数据结果在地图中进行显示。最后实现了对海洋剖面数据的2D/3D网络可视化。本论文利用perl脚本语言,MySQL数据库和MapSever地图发布服务软件以及Gnuplot绘图工具设计和实现了海洋数据的网络发布系统。

关键词：海洋元数据网络发布 MapServer perl脚本 MySQL数据库可视化

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SoC设计平台中若干IP模块的设计

SoC设计平台中若干IP模块的设计

作者：包日辉杭州电子科技大学

学位级别：硕士

半导体技术的飞速发展,使得集成电路的电路规模越来越大,与此带来功能上的全面提升。单一功能的简单芯片已经无法满足用户在复杂多样的应用场景下的需求,SoC(System-on-Chip)的设计方法正是在这种背景下提出来的。SoC已经成为当前IC技... 详细信息

半导体技术的飞速发展,使得集成电路的电路规模越来越大,与此带来功能上的全面提升。单一功能的简单芯片已经无法满足用户在复杂多样的应用场景下的需求,SoC(System-on-Chip)的设计方法正是在这种背景下提出来的。SoC已经成为当前IC技术及产业发展的主流和方向,基于平台的SoC设计方法具有设计复用率高、设计周期短和可靠性高等优点,越来越成为SoC设计技术的主流,因此开发基于设计重用技术的SoC设计平台具有重要的研究意义。SoC设计平台主要依托IP复用技术,本论文即为SoC设计平台设计研发若干IP(IntellectualProperty)模块,主要涵盖AHB/APB总线、存储器控制器、通用的系统功能设备以及通用的通信接口等。论文设计了 AHB/APB总线,SRAM控制器、Flash控制器和SD控制器等三种存储器控制器,中断控制器、DMA控制器和定时器等三种系统功能设备以及UART接口、SPI接口、nc接口和GPIO接口等四种通信接口,分别给提出了这些IP模块的结构设计和模块划分方案,并完成各组成模块的详细设计。在SRAM控制器设计中,开发了一个设计的自动化配置脚本,可自动生成与用户指定SRAM配置相匹配的SRAM控制器RTL代码。论文结合Makefile脚本、perl脚本以及UVM验证方法学,构建了一个电路模块功能仿真的自动化验证平台,对前文所设计的IP模块进行了功能仿真。仿真结果表明,论文设计的IP模块满足各项功能要求。

关键词： AMBA总线 SoC设计平台 IP模块功能验证 perl脚本

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时钟控制单元代码自动生成技术的实现及验证

时钟控制单元代码自动生成技术的实现及验证

作者：毕萍萍西安电子科技大学

学位级别：硕士

随着数字集成电路复杂度的提高，集成电路设计的工作量成倍增加。然而结构化、模块化设计程度的提高，使得设计代码自动化成为可能，从而能够很大程度上减少工作量。本文针对时钟控制单元实现了一个代码自动生成的工具并完成自动生成代... 详细信息

随着数字集成电路复杂度的提高，集成电路设计的工作量成倍增加。然而结构化、模块化设计程度的提高，使得设计代码自动化成为可能，从而能够很大程度上减少工作量。本文针对时钟控制单元实现了一个代码自动生成的工具并完成自动生成代码的验证。本文针对时钟控制单元的时钟门控技术、多电压技术进行了研究。根据手机基带芯片系统的需求，应用上述技术设计了时钟控制单元的总体架构。该单元提供了配置时钟源、送出时钟和降低功耗的功能。它主要由三级时钟门控模块、时钟源控制模块、3G时钟握手模块、4G时钟握手模块、寄存器、多时钟域选择器、多电压模块、分频模块构成。根据时钟控制单元整体架构和功能实现特点，本文基于perl脚本设计了一个根据配置文件自动生成时钟控制单元VHDL代码的工具，实现了特定应用时钟控制单元代码设计自动化。该工具的实现包括三部分：数据存储模块的建立、功能模块代码的生成、工具接口的完成。该工具已应用于两个手机基带芯片项目生成时钟控制单元代码，能够保证设计文档与VHDL代码的一致性。采用直接验证法对时钟控制单元进行验证。并利用自动生成代码的数据存储模块实现验证用例的自动产生。验证结果表明利用工具自动生成的代码正确，并节约了设计的时间和减少了验证的工作量。

关键词：时钟控制单元 perl脚本自动化门控时钟多电压