检索结果-南通市图书馆

检索条件"主题词=PS-V2N"

共 1 条记录，以下是1-10 订阅

全选清除本页清除全部题录导出标记到"检索档案"

详细简洁

排序：

基于网络分析的多发性硬化症药靶及候选药物发现

基于网络分析的多发性硬化症药靶及候选药物发现

引用

作者：杨季苏州大学

学位级别：硕士

多发性硬化症（multiple sclerosis,MS）是中枢神经系统中最常见的慢性炎症性脱髓鞘疾病。虽然目前市场上存在可用于缓解MS病程的药物,但尚无有效的治疗方法。大规模多组学数据和网络分析方法的出现为MS的药靶识别提供了新的机遇,同时... 详细信息

多发性硬化症（multiple sclerosis,MS）是中枢神经系统中最常见的慢性炎症性脱髓鞘疾病。虽然目前市场上存在可用于缓解MS病程的药物,但尚无有效的治疗方法。大规模多组学数据和网络分析方法的出现为MS的药靶识别提供了新的机遇,同时也为新药的早期研发提供了有前景的策略。在本论文中,我们提出了一个结合分子生物网络分析和结构动力学模拟的计算框架,并借助可药性评估和药物虚拟筛选来帮助发现MS潜在新药靶和药物。首先,从基因表达谱芯片分析得到MS差异表达基因,以及从疾病基因关联数据库中收集了 MS相关基因,并构建了MS的疾病特异性蛋白相互作用网络。针对该网络的拓扑结构和功能分析显示该网络与MS密切相关且显著富集在炎症相关通路,表明了该网络的疾病特异性。拓扑结构分析得到的核心节点大多是MS相关基因,挖掘差异基因需要设计新的方法。随后,我们开发了一种基于网络最短路径的ps-v2n算法,该算法利用蛋白质相互作用网络的拓扑和功能属性,通过计算网络中差异表达基因与已知疾病基因的接近程度来衡量基因与疾病的相关性。接着,结合口袋可药性分析以及差异基因的通路分析,我们发现TnFAIP3和nF-kappa B信号通路可能是MS的潜在药靶,且TnFAIP3位于nF-kappaB信号通路模块中的中枢节点。nF-kappa B信号通路已被证明与MS相关,因此TnFAIP3被确定为MS的潜在药靶。最后是基于该药靶的候选药物发现,我们选择了 TnFAIP3同源二聚体进行可药性模拟分析、可药性口袋评估以及突变富集分析,结果显示了其包含两个可药性位点分别位于pocket5和pocket28。基于这两个位点分别构建药效团模型以及进行高通量虚拟筛选,共确定了 30个能量得分较低的苗头化合物。我们对其进行了化学空间分析和药物相似性分析,发现两组通过不同位点筛选得到的化合物具有位点特异性,为针对MS的药物开发提供了更多可能性。综上所述,本论文的研究从组学大数据出发,利用网络分析方法找到了多发性硬化症的潜在药靶,并根据进一步的可药性模拟分析得到了可能用于MS治疗的小分子化合物。该方法是一种可以揭示疾病机制并将其与化学空间联系起来以开发治疗方案的系统生物学方法,可以应用到其它复杂疾病。

关键词：多发性硬化症生物网络分析 ps-v2n 药物靶标可药性分析

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

全选清除本页清除全部题录导出标记到“检索档案”

共1页 << < 1 > >>

回到顶部

执行限定条件

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：