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Genome-wide identification and transcriptional profiling analysis of PIN/pils auxin transporter gene families in Panax ginseng

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Chinese Herbal Medicines 2022年第1期14卷 48-57页

作者： Shuiming Xiao Yang Chu Yanjun Chen Qinghe Zhao Baosheng Liao Jingjing Zhang Yuan Gao Jiang Xu Shilin Chen Institute of Chinese Materia Medica China Academy of Chinese Medical SciencesBeijing 100700China College of Pharmacy Hubei University of Chinese MedicineWuhan 430065China Institute of Medicinal Plant Development Chinese Academy of Medical SciencesBeijing 100193China

Objective:Plant hormones act as chemical messengers in the regulation of plant development and *** production of ginsenosides in Panax hybrid is promoted by auxins that are transported and accumulated by PIN-FORMED(PIN)and PIN-LIKES(pils)auxin ***,genome-wide studies of PIN/pils of ginseng are still *** current study,identification and transcriptional profiling of PIN/pils gene families,as well as their potential relationship with ginsenoside biosynthesis in Panax ginseng were ***:PIN/pils genes in *** was identified via in silico genome-wide analysis,followed by phylogenetic relationships,gene structure,and protein profiles ***,previously reported RNA-sequence data from various tissues and roots after infection were utilized for PIN/pils genes expression pattern *** Pearson’s correlation analysis of specific PIN/pils genes expression level and main ginsenoside contents were taken to reveal the potential relationship between auxin transports and ginsenoside biosynthesis in ***:A genome-wide search of *** genome for homologous auxin transporter genes identified a total of 17 PIN and 11 pils *** alignment,putative motif organization,and sub-cellular localization indicated redundant and complementary biological functions of these PIN/pils *** PIN/pils genes were differentially expressed in a tissue-specific manner,and showed significant correlations with ginsenoside content *** auxin transporter genes,including both PIN and pils subfamily members,were positively correlated with ginsenoside content(cor>0.60;P-value<0.05).The expression levels of eleven auxin transporter genes were increased dramatically in the early stage(0–0.5 DPI)after Cylindrocarpon destructans infection,accompanied with various overall expression patterns,implying the dynamic auxin transport in response to biotic ***:Based on the results,we specul

关键词： auxin genome-wide ginsenoside pils PIN transcriptome

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灵芝中pils家族转运蛋白的克隆

灵芝中PILS家族转运蛋白的克隆

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：季爱加胡鸢雷徐江徐志超孙伟汪波孙超宋经元郭红卫陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京大学生命科学学院

转运蛋白是生物体内负责物质输送的蛋白质,对生物体的生长、发育和次生代谢有重要作用。通过对灵芝基因组的搜索和TCDB比对,我们在灵芝基因组内鉴定了1063个转运蛋白,分属134个家族。其中pils转运蛋白家族是拟南芥中新近鉴定的一类与生... 详细信息

转运蛋白是生物体内负责物质输送的蛋白质,对生物体的生长、发育和次生代谢有重要作用。通过对灵芝基因组的搜索和TCDB比对,我们在灵芝基因组内鉴定了1063个转运蛋白,分属134个家族。其中pils转运蛋白家族是拟南芥中新近鉴定的一类与生长素转运相关的膜蛋白家族,参与拟南芥中生长素极性的调节。不同于经典PIN家族转运蛋白,pils不仅存在于植物中,而且在真核生物中广泛存在。我们通过结构域搜索和同源比对鉴定出灵芝pils蛋白家族包括5个成员,通过RNA-seq数据发现不同蛋白在灵芝不同发育阶段有不同的表达,暗示这5个pils蛋白功能可能存在差异。进一步,我们通过生长素诱导实验验证灵芝在不同生长素浓度处理下具有不同的表型。目前,我们已经从灵芝cDNA文库中成功克隆了这5个蛋白中的3个,我们也成功建立了基于绿色荧光蛋白为报告系统的灵芝转化系统,下一步实验中,我们将观察了pils家族在不同浓度IAA处理下表达和分布的变化,并希望研究灵芝中激素和次生代谢产物的关系。

关键词：转运蛋白 pils 生长素灵芝

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Protic ionic liquids/poly(vinylidene fluoride) composite membranes for fuel cell application

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Journal of Energy Chemistry 2021年第2期30卷 197-207,I0008页

作者： Isabel Vazquez-Fernandez Mohamed Raghibi Adnane Bouzina Laure Timperman Janick Bigarre Meriem Anouti Laboratoire KM2E Parc de GrandmontUniversite de Tours37200ToursFrance CEA-DAM Le Ripault BP16F-37260MontsFrance

Poly(vinylidene fluoride), PVDF, membranes have attracted considerable attention as polymer electrolytes for fuel cells. This study explores the effect of solvent on the spherulite size and the crystallinity of the polymeric membranes. Based on Hansen solubility parameters theory, the mixture of DMC and DMSO was selected among a dozen of solvents for the preparation of PVDF membranes by thermally induced phase separation. The addition of two protic ionic liquids(pils), bis(2-ethyl hexyl) ammonium hydrogen phosphate [EHNH_2][H_2PO_4], and imidazolium hexanoate [Im][Hex] to PVDF membranes at concentrations(10% < wP IL< 50%) has been investigated by SEM, FTIR, DSC, TGA, EIS, and DMA. The inclusion of ionic liquids into the polymer matrix influences structural parameters(degree of crystallinity and electroactive phases), thermal stability, proton conductivity and mechanical properties of the membranes. The membranes become transparent regardless type of ionic liquid employed. A small amount of ionic liquids increases the degree of crystallinity and facilitates the production of polar β and γ crystals. The proton conductivity mechanism(Grotthuss) is dependent on the ionic liquid structure(due to its selforganization in water) and the content in the PVDF membrane, as well as the membrane water *** behavior has been observed for the two ionic liquids, which stresses the challenge on selecting an appropriate cation and anion combination. The obtained composite membranes exhibited excellent mechanical performance and reduced elastic modulus, with respect to the pure polymer matrix. These results indicate that PVDF/IL composite membranes have a high potential for PEMFC applications.

关键词： PVDF Hansen solubility parameters pils Proton conductivity

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Zn-季铵盐交联型Mpils催化剂的制备及其在CO2环加成反应中的应用

Zn-季铵盐交联型MPILs催化剂的制备及其在CO2环加成反应中的应用

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作者：扶雅文厦门大学

学位级别：硕士

聚离子液体(Polymeric Ionic Liquids,pils)由重复ILs单元与聚合物骨架组成,应用广泛。介孔聚离子液体(Mesoporous Poly(Ionic Liquid)s,Mpils)因其独特的介孔优势,在CO2环加成反应中表现出优异的催化性能。但是,通常Mpils中只有一个催... 详细信息

聚离子液体(Polymeric Ionic Liquids,pils)由重复ILs单元与聚合物骨架组成,应用广泛。介孔聚离子液体(Mesoporous Poly(Ionic Liquid)s,Mpils)因其独特的介孔优势,在CO2环加成反应中表现出优异的催化性能。但是,通常Mpils中只有一个催化活性中心,而多催化活性中心可以提高Mpils的催化性能。其中金属盐,供氢基团均可以作为新的活性中心。本研究将Zn2+引入Mpils中,并将所制备的双功能催化剂应用于CO2的环加成反应。论文主要研究内容如下:IL单体C2DBA(N,N’-二(亚甲基)双(N,N-二甲基-1-(4-乙烯基苯基)甲基氯化铵))与DVPy(5,5’-二乙烯基-2,2-联吡啶,交联剂)共聚得到凝胶,利用DVPy与ZnCl2的强相互作用负载Zn2+后再利用超临界CO2干燥技术(SCD),得到了一系列Zn2+含量不同的Zn-季铵盐交联型Mpils催化剂。系统研究催化剂中Zn2+含量对CO2环加成反应的影响,结果显示:负载Zn2+后催化剂表现出更好的催化效果;合适的Zn2+负载量是提高催化效果的关键;其中Zn-3催化剂(Zn@聚(5,5’-二乙烯基-2,2-联吡啶)&(N,N’-二(亚甲基)双(N,N-二甲基-1-(4-乙烯基苯基)甲基氯化铵)))表现出最佳的催化活性(80℃),且比本课题组之前发现的PDBA-Cl-SCD催化剂反应效果更好。此外,Zn-3催化剂底物普适性好,且重复使用5次后性能未见明显下降。高阴离子密度的ILs单体4BrBQA(1,2,4,5-四(溴甲基)苯与N-(4-乙烯基苯基)-N,N-二甲胺反应得到)与DVPy共聚反应得到凝胶,利用DVPy与ZnBr2的强相互作用负载Zn2+后再利用SCD技术,得到了一种Zn-高阴离子密度季铵盐交联型Mpils催化剂。系统研究Mpils中是否负载Zn2+对CO2环加成反应的影响,结果表明:负载Zn2+后催化剂表现出更好的催化效果;同样负载Zn2+,季铵盐型Mpils表现优于咪唑盐型Mpils;另外催化剂P2DVPy(DVPy与4BrBQA共聚摩尔比为2)-4BrBQA-Zn表现出最优的催化活性(50℃),比Zn-3催化剂反应温度(80℃)更低且优于本课题组已发现的PDVIm-4催化剂。此外,催化剂P2DVPy-4BrBQA-Zn底物普适性好,且重复使用5次后性能未见明显下降。

关键词： pils Zn2+ 超临界CO2干燥 CO2环加成

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甘蔗PIN-LIKES基因家族的鉴定与表达分析

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作物学报 2023年第2期49卷 414-425页

作者：潘洁明田绍锐梁艳兰朱宇林周定港阙友雄凌辉黄宁玉林师范学院农学院广西玉林537000 福建农林大学/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室福建福州350002 西南大学植物保护学院重庆400700 湖南科技大学生命科学学院/经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室湖南湘潭411201

pils(PIN-LIKES)是一类新发现的生长素输出载体,协助生长素的极性运输。本研究立足甘蔗割手密基因组和栽培品种转录组数据,利用生物信息学分析技术,分别在割手密和栽培品种中鉴定到11个pils(Saccharum spontaneum PIN-LIKES,Sspils)基因... 详细信息

pils(PIN-LIKES)是一类新发现的生长素输出载体,协助生长素的极性运输。本研究立足甘蔗割手密基因组和栽培品种转录组数据,利用生物信息学分析技术,分别在割手密和栽培品种中鉴定到11个pils(Saccharum spontaneum PIN-LIKES,Sspils)基因和4个pils(Saccharum *** PIN-LIKES,Scpils)基因。结果表明,11个Sspils基因家族成员分布于6条染色体上,基因内含子数量介于5~11个。系统进化树分析发现,割手密pils与水稻pils有较高同源性,归属于3个不同的系统发育分支。转录组数据分析显示,Sspils1c的同源基因Scpils1c在受高粱花叶病毒和黑穗病菌胁迫甘蔗栽培种中差异表达。通过RT-PCR扩增技术,克隆获得Scpils1c基因序列(NCBI accession number:OM258732)。该基因全长cDNA为1332 bp,包含一个1233 bp的完整开放阅读框,编码410个氨基酸,理论等电点(pI)为6.17,不稳定系数为39.31,平均疏水性值为0.689,预测Scpils1c为稳定酸性疏水蛋白。其编码蛋白的二级结构主要包括α-螺旋(48.54%)和无规则卷曲(35.37%),这与三级结构预测结果相符。qRT-PCR表达分析揭示,Scpils1c基因在甘蔗中的表达具有组织特异性,在蔗髓中表达量最低、皮中的表达量最高,同时该基因的表达受H2O2及黑穗病菌的显著性诱导。亚细胞定位表明,Scpils1c基因的编码蛋白主要定位于细胞膜。以上结果为深入研究甘蔗PIN-LIKES基因的结构和功能积累了基础资料。

关键词：甘蔗 pils 生物信息学实时荧光定量PCR 基因家族

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大气细粒子中水溶性有机碳(WSOC)的在线监测

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中国环境监测 2007年第4期23卷 33-36页

作者：刘君峰宋之光李胤南中国科学院广州地球化学研究所有机地球化学国家重点实验室美国布鲁克文国家实验室

基于一种新型的大气颗粒物在线水萃取采样装置(pils),通过该装置与快速有机碳分析仪的连接,建立了大气细粒子水溶性有机碳(WSOC)的在线监测系统(pils-WSOC)。实际运行结果表明,该系统能够快速稳定地获得大气细粒子中WSOC的实时变化数据... 详细信息

基于一种新型的大气颗粒物在线水萃取采样装置(pils),通过该装置与快速有机碳分析仪的连接,建立了大气细粒子水溶性有机碳(WSOC)的在线监测系统(pils-WSOC)。实际运行结果表明,该系统能够快速稳定地获得大气细粒子中WSOC的实时变化数据。与滤膜法的平行实验结果相比,pils装置对大气颗粒物中WSOC的采样效率远高于滤膜法。

关键词：气溶胶 PM2.5 大气细粒子 pils 水溶性有机碳(WSOC) 在线监测

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经济全球化与国际物流的发展趋势

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开放导报 2003年第7期 40-41页

作者：王国文综合开发研究院

经济全球化成为物流国际化的推动力量

关键词：经济全球化国际物流全球综合物流系统 pils

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