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Comparative Analysis of Pathogenicity Assays and PCR for <i>Listeria monocytogenes</i>Isolated from Animal, Raw Food and Environmental Sources in Korea

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Advances in Microbiology 2013年第2期3卷 191-199页

作者： Sanghun Park Jihun Jung Younghee Oh Jibho Lee Seunghee Ryu Hyowon Jung Sunhee Park Miok Song Gunyong Park Sungmin Choi Sangmi Lee Junghun Kim YoungZoo Chae Byungyeol Jung Myunghun Lee Hyunsoo Kim Seoul Metropolitan Government Research Institute of Public Health and Environment Yangjae-Dong Seocho-Gu Seoul Korea

Results of PCR with oligonucleotide primers were designed from the assembled panel of four potential virulence genes (two of internalin gene and two of transcriptional regulator gene). Most of the isolates including reference strains were reactive by PCR, whereas the other strains (No.80, 81, and 83) isolated from pork, were non-reactive by PCR. In particular, all pork isolates were PCR-negative for two primers (lmo2672 and 2821) sets tested. However, No.82 was positive for lmo1134 primer, and No.84 was positive for lmo2470 of pork isolates. It was observed that all Listeria monocytogenes (L. monocytogenes) penetrate Vero cells, although the invasion efficiency of each strain varied (between 0.5 and 18.9%). When compared in cell assay with pfge, the results were shown that the mean invasion efficiency for lineage II isolate (2.6%) was significantly lower (ANOVA-test,

关键词： pfge Vero Cell Listeria monocytogenes in Vitro Assay

重庆某三甲医院耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌感染危险因素分析及分子流行病学调查

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第三军医大学学报 2018年第24期40卷 2278-2283页

作者：林美芳张利军向丹王云英重庆医科大学附属第二医院检验科重庆400010

目的分析耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌(Carbapenem resistant Citrobacter freundii,CRCF)感染危险因素及分子流行病学特征。方法收集来自重庆医科大学附属第二医院2013年1月-2018年3月138例弗劳地枸橼酸杆菌感染患者临床资料,按照是... 详细信息

目的分析耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌(Carbapenem resistant Citrobacter freundii,CRCF)感染危险因素及分子流行病学特征。方法收集来自重庆医科大学附属第二医院2013年1月-2018年3月138例弗劳地枸橼酸杆菌感染患者临床资料,按照是否对碳青霉烯类抗生素耐药分为两组,CRCF组32例,非CRCF(Non-CRCF,NCRCF)组106例;用卡方检验及多因素logistic回归分析方法分析CRCF感染的危险因素;多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(pfge)分析细菌同源性。结果 138株弗劳地枸橼酸杆菌中CRCF检出率为23. 2%;多因素logistic回归分析显示肿瘤(OR=4. 057,95%CI=1. 574～10. 458,P=0. 004)和手术(OR=2. 938,95%CI=1. 160～7. 441,P=0. 023)是CRCF感染的独立危险因素;共有7个MLST克隆型,以ST22(n=9)和ST115(n=9)型多见,两个新的ST型已被PubMlst数据库收录并分别命名为ST115和ST116; pfge与MLST分型结果基本保持一致。结论肿瘤和手术是CRCF感染的独立危险因素; ST22和ST115是CRCF感染的优势克隆型;应加强对CRCF的监测和控制,预防CRCF的播散流行。

关键词：耐碳青霉烯类弗劳地枸橼酸杆菌危险因素 MLST pfge

Identification of the Bacterial Gene in Patients Who Repeatedly Develop Streptococcal Pharyngitis

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International Journal of Clinical Medicine 2012年第7期3卷 680-684页

作者： Yuichiro Tsuji Ichihashi Izumi Department of Pediatrics Sempos Tokyo Takanawa Hospital Tokyo Japan

Background: We aimed at determining whether the pathogenic bacteria at the onset of disease are genetically different and whether this affects future choice of the therapeutic methods against group A β-hemolytic streptococcal acute pharyngitis/tonsillitis. Methods: A pharynx swab was collected from pediatric patients who visited our hospital. The swab was cultured, and hemolytic streptococcus was detected 230 times. We isolated pathogenic bacteria of patients infected more than once and examined the bacteria using pulse-field gel electrophoresis. Results: Based on gene search results, we found that if the period of developing relapse was within 1 month from the first infection, all patients had the same gene. However, all patients in whom reinfection occurred after 6 months or later had different pertinent genes. Conclusions: The number of relapse/reinfection is significant for this disease, and considerably caution is essential for its treatment. No changes to antibacterial drug administration may be necessary for the second administration unless more than 6 months have passed since the first infection.

关键词： Bacterial Gene Cefcapene Pivoxil pfge (Pulse-Field Gel Electrophoresis) Reinfection Streptococcal Pharyngitis

血流感染中分离的耐甲氧西林溶血葡萄球菌的药物敏感性、SCCmec基因分型及同源性分析

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中国抗生素杂志 2021年第4期46卷 332-338页

作者：姜斌彭娜周海健付陈超欧阳鹏文谢良伊湖南省人民医院(湖南师范大学附属第一医院)检验科长沙410005 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102200 中南大学湘雅医院感染控制中心长沙410008

目的调查分析本地区血流感染中分离耐甲氧西林溶血葡萄球菌(MRSH)的药物敏感性、葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型及分子流行病学特征。方法收集2013年1月1日—2014年12月31日湖南省20家三甲医院血流感染患者的MRSH 78株,采用微量肉汤... 详细信息

目的调查分析本地区血流感染中分离耐甲氧西林溶血葡萄球菌(MRSH)的药物敏感性、葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型及分子流行病学特征。方法收集2013年1月1日—2014年12月31日湖南省20家三甲医院血流感染患者的MRSH 78株,采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验;PCR扩增mecA基因及SCCmec基因;脉冲场凝胶电泳(pfge)检测MRSH的同源性。结果78株MRSH中,96.1%的菌株存在mecA基因,MRSH对红霉素、左氧氟沙星和克林霉素的耐药率分别为94.9%、80.7%和53.8%,2株对利奈唑胺耐药,1株对替考拉宁耐药,没有菌株对万古霉素耐药。SCCmec可分型为50%(39/78),不可分型为50%(39/78)。39株可分型菌株中,单个SCCmec类型以Ⅰ型为主(18/39,46.1%),混合型SCCmec类型以Ⅰ+Ⅱ型为主(12/39,30.8%)。pfge带型整体较为分散,但有6组菌株间存在100%同源性。结论本地区血流感染中MRSH的耐药形势严峻;在SCCmec可分型的菌株中,以Ⅰ型SCCmec为主,SCCmec多样且不同SCCmec型别之间的耐药性存在差异;本地区MRSH以散发为主,但存在院间及院内交叉感染的可能性,应加强对其监测,减少MRSH的进一步传播。

关键词：溶血葡萄球菌血流感染耐药性 SCCmec pfge

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广东省鸡源弯曲菌耐药性及pfge分型研究

广东省鸡源弯曲菌耐药性及PFGE分型研究

作者：张宗尧华南农业大学

学位级别：硕士

弯曲菌(Campylobacter),特别是空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)和结肠弯曲菌(Campylobacter coli,C.coli),常引起人的腹泻、胃肠炎等疾病,是危害人和动物健康的重要人兽共患病原菌之一。弯曲菌可通过动物、食品、水等多种途... 详细信息

弯曲菌(Campylobacter),特别是空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)和结肠弯曲菌(Campylobacter coli,C.coli),常引起人的腹泻、胃肠炎等疾病,是危害人和动物健康的重要人兽共患病原菌之一。弯曲菌可通过动物、食品、水等多种途径进行传播,禽类是弯曲菌最重要的“存储库”,在家禽业生产及禽类食品安全中具有重要意义。本研究通过对广东省鸡源样品分离的空肠弯曲菌和结肠弯曲菌进行耐药性和耐药基因的检测,并对其进行pfge分型,旨在了解广东省不同来源弯曲菌的耐药情况,主要耐药机制和基因型特点,为进行弯曲菌耐药性监测、耐药机制、及分子流行病学的研究提供科学依据。本研究通过琼脂稀释法检测了从广东省鸡源样品所分离的114株空肠弯曲菌和58株结肠弯曲菌对12种常用抗菌药物的耐药性。结果发现上述菌株对喹诺酮类药物(萘啶酸、环丙沙星、左氧氟沙星、红霉素)的耐药率为86.2100%,对四环素类药物的耐药率在79%以上。空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的耐药性有一定差异,空肠弯曲菌对大环内酯类(红霉素和阿奇霉素)、氨基糖苷类(庆大霉素和卡那霉素)和克林霉素的耐药性都较低,耐药率均在10%以下,而结肠弯曲菌对红霉素和阿奇霉素的耐药率都为81.03%,对庆大霉素和克林霉素的耐药率都为79.31%,远高于空肠弯曲菌;两者对氟苯尼考的耐药率基本相似,分别为29.82%和29.31%。在多重耐药方面,空肠弯曲菌最主要的多重耐药模式为Q-T-F(21.93%),结肠弯曲菌优势的多重耐药模式为Q-M-T-A-L(55.17%),有2株空肠弯曲菌和12株结肠弯曲菌达到Q-M-T-A-L-F模式的六重耐药。在耐药性检测的基础上,用PCR及测序的方法检测了上述弯曲菌对喹诺酮类、大环内酯类、氨基糖苷类和四环素类的主要耐药基因。结果发现169株喹诺酮类耐药弯曲菌gyrA基因的喹诺酮耐药决定区(QRDR)均发生了C257T的突变,导致氨基酸Thr-86-Ile突变,突变率为100%,可能是导致喹诺酮类药物耐药的主要机制。gyr B基因QRDR上碱基突变较多,但都为同义突变,没有导致氨基酸的突变。52株大环内酯类耐药弯曲菌的23S rRNA基因都发生了A2075G的突变,并且有1株空肠弯曲菌和8株结肠弯曲菌,携带大环内酯类耐药甲基化酶erm B。在57株氨基糖苷类耐药弯曲菌中,发现有64.91%的菌株携带aph(2")-If基因,12.28%的菌株携带aac(6’)-Ie/aph(2")-Ia基因,这可能是介导弯曲菌氨基糖苷类药物耐药的主要原因。151株四环素或多西环素耐药的弯曲菌中,有135株携带四环素类耐药基因tet(O),携带率为89.40%。同时,用脉冲场凝胶电泳(pfge)分型法分析了2016年从广东省鸡源样品分离的43株空肠弯曲菌和39株结肠弯曲菌。结果表明,空肠弯曲菌可分为27个不同的pfge型,包含5个pfge簇;结肠弯曲菌可以分为32个不同的pfge型,包含6个pfge簇。弯曲菌的基因型呈多态性特点,结肠弯曲菌比空肠弯曲菌基因型多样性更高;基因型与菌株来源有一定的关系,大部分pfge型或pfge簇对应单一来源的菌株,但同一来源的菌株存在多个不同pfge型;弯曲菌基因型与耐药性存在一定关系,同一个簇或者是关系相近的几个簇中,大部分弯曲菌的耐药模式是相似的。

关键词：弯曲菌耐药性耐药基因 pfge

Clinical isolates of Acinetobacter baumannii from bloodstream infections:pfge characterization and virulence-associated factors

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China Medical Abstracts (Internal Medicine) 2017年第2期 82-83页

作者：蔡鲜 Dept Clin Lab Tianjin Med Univ General Hosp

Objective The epidemiology of Acinetobacter baumannii isolates from bloodstream infections,their antibiotic resistance profiles and virulence-associated factors were studied.Methods A total of 90 isolates from 17hospi... 详细信息

关键词： from pfge Clinical isolates of Acinetobacter baumannii from bloodstream infections:pfge characterization and virulence-associated factors of

深圳市龙岗区鼠伤寒沙门菌耐药性和分子分型研究

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中国病原生物学杂志 2014年第4期9卷 343-346页

作者：陈应坚金玉娟林文娟刘渠甘莉萍杨慧深圳市龙岗区疾病预防控制中心广东深圳518172

目的研究深圳市龙岗区2010~2012年腹泻病人分离株鼠伤寒沙门菌的耐药性和分子分型。方法按国标GB 4789.4-2010对腹泻标本进行分离培养和生化及血清学鉴定,确定为鼠伤寒沙门菌的菌株采用纸片扩散法（K-B法）检测对22种抗生素的敏感性,通... 详细信息

目的研究深圳市龙岗区2010~2012年腹泻病人分离株鼠伤寒沙门菌的耐药性和分子分型。方法按国标GB 4789.4-2010对腹泻标本进行分离培养和生化及血清学鉴定,确定为鼠伤寒沙门菌的菌株采用纸片扩散法（K-B法）检测对22种抗生素的敏感性,通过脉冲场凝胶电泳（pfge）对菌株进行分子分型,限制性内切酶XbaI为首选酶,AvrⅡ为次选酶,利用BioNumerics软件对酶切电泳图谱进行同源性分析。结果共分离出48株鼠伤寒沙门菌,50%的菌株来自7岁以下儿童患者。60.0%以上的鼠伤寒沙门菌对四环素和氨苄西林耐药。有34株菌株（占70.8%）耐3种及以上药物,耐8~10种药物有11株（占22.9%）,所有菌株对头孢西丁、美罗培南、亚胺培南和左氧氟沙星均敏感,多重耐药株在该区域普遍存在。XbaⅠ酶切分成40个带型,有6个型别,各含2~3株,AvrⅡ二次酶切将其重新分成12个型,其中XAP2、XAP3型2株。结论深圳市龙岗区鼠伤寒沙门菌分离株多重耐药较为严重,婴幼儿是重点防治人群。经pfge分型鼠伤寒沙门菌菌型较多,说明本地区存在多个不同克隆株。

关键词：鼠伤寒沙门菌 pfge 分子分型药敏试验多重耐药

河南省26例甲型副伤寒沙门菌聚集性病例的病原学研究及溯源分析

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中国人兽共患病学报 2016年第12期32卷 1122-1125页

作者：赵嘉咏张白帆穆玉姣苏佳黄学勇夏胜利谢志强许汴利河南省疾病预防控制中心郑州450016

目的分析2015年3-7月份河南省登封市分离自临床诊断为副伤寒聚集性病例的甲型副伤寒（S.Paratyphi A）沙门菌病原学特征及分子流行病学关联。方法采集副伤寒病例患者的静脉血8~10mL,双相血培养瓶37℃培养4~7d,沙门菌科玛嘉选择性培养基... 详细信息

目的分析2015年3-7月份河南省登封市分离自临床诊断为副伤寒聚集性病例的甲型副伤寒（S.Paratyphi A）沙门菌病原学特征及分子流行病学关联。方法采集副伤寒病例患者的静脉血8~10mL,双相血培养瓶37℃培养4~7d,沙门菌科玛嘉选择性培养基分离培养,系统生化鉴定,丹麦SSI分型血清进行沙门菌O抗原及H1/2相鞭毛诱导血清凝集试验。根据PulseNet China病原体分子分型网络实验室公布的沙门菌脉冲场凝胶电泳（pfge）操作指南与美国临床实验室标准化协会（CLSI）沙门菌K-B法药敏测试方案对其进行XbaI/BlnI双酶切pfge分子分型与聚类分析及8类13种抗生素药敏测试。结果从29例病人血培养物中共分离到26株甲型副伤寒沙门菌,其经XbaI与BlnI限制性双酶切和pfge电泳后带型完全一致（PTYA1）;药敏测试结果显示24株甲型副伤寒沙门菌耐药表型一致。结论病原学诊断及pfge分子分型结果证实了26例甲型副伤寒沙门菌感染病例间可能存在高度的聚集性与分子流行病学关联,为进一步的追踪溯源和调查取证提供了技术支撑。

关键词：甲型副伤寒沙门菌聚集性病例药敏测试 pfge

河南省出血性大肠埃希菌O157病原学特征与分子分型研究

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中国病原生物学杂志 2016年第9期11卷 812-814,828页

作者：赵嘉咏张白帆穆玉姣苏佳夏胜利黄学勇许汴利河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南郑州450016

目的了解2012-2015年河南省出血性大肠埃希菌EHEC：O157病原学与pfge脉冲场凝胶电泳指纹图谱特征,为相应食源性疾病的监测、预测预警、暴发溯源调查提供基线数据。方法对河南省2012-2015年采自腹泻病人及动物粪便和食品标本进行mEC肉汤... 详细信息

目的了解2012-2015年河南省出血性大肠埃希菌EHEC：O157病原学与pfge脉冲场凝胶电泳指纹图谱特征,为相应食源性疾病的监测、预测预警、暴发溯源调查提供基线数据。方法对河南省2012-2015年采自腹泻病人及动物粪便和食品标本进行mEC肉汤增菌,经免疫磁珠富集后采用ChromagarO157平板分离培养;采用系统生化鉴定大肠埃希菌,并进行EHEC：O157单抗血清玻片凝集试验;采用多重PCR鉴定出血性大肠埃希菌O157及携带的毒力基因。根据＂PulseNet China＂公布的EHEC O157pfge分型技术标准,对阳性菌株进行pfge指纹图谱分析。结果47株出血性大肠埃希菌O157中1株产志贺毒素1（STX1）,2株产志贺毒素2（STX2）;21株携带粘附素（eaeA）和溶血素（hlyA）毒力基因,其余23株为不产毒型;经XbaI酶切后进行脉冲场凝胶电泳,共分为40种不同带型,相似度区间为64.20%-100%,各带型包含菌株数为1～2株不等,人源与食品动物源菌株带型未发现聚集关联性。结论河南省检出的EHEC：O157中既有携带不同毒力基因的菌株,也有非产毒型菌株,其pfge指纹图谱呈现高度分散性与多态性,体现了食源性细菌病原体所具有的多样性与复杂性。

关键词：出血性大肠埃希菌O157 多重PCR 毒力基因 pfge