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Development and transferability of two multiplexes nssr in Scots pine(Pinus sylvestris L.)

Journal of Forestry Research 2015年第2期26卷 361-368页

作者： Stefana Ganea Sonali S.Ranade David Hall Sara Abrahamsson Maria Rosario Garcia-Gil Department of Forest Genetics and Plant Physiology SLU901 83 UmeaSweden Department of Genetics and Plant Breeding USAMV400372 Cluj-NapocaRomania

Single sequence repeat（ssr） multiplexing is a semi high-throughput PCR methodology for the analysis of multiple *** developed two ssr multiplexes selected from ssr loci previously reported in the pine literature and tested the transferability of both ssr multiplexes in nine other pine *** tested 234 nuclear ssr loci（n ssrs） previously described in the pine literature and selected ten n ssrs following the simple criteria of interpretability and *** nuclear loci were divided into two n ssrs multiplex sets and their amplification was optimized for three different multiplex PCR methods based on：（a） a custom PCR protocol,（b） a custom protocol with hotstart taq polymerase,and（c） a commercially available kit for ssr *** validate their performance,the level of genetic diversity was assessed in three Scots pine natural populations（Hungary,northern Sweden and southern Sweden）.In addition,we also tested the transferability of these multiplexes in nine other pine *** have developed two n ssrs multiplexes of five loci each that will contribute to reduce the costs of n ssr scoring,while increasing the capacity of n ssr loci *** was successful in all three populations（94 % success） and the level of polymorphism（7.1 alleles/marker） was similar to that previously reported for other Scots pine natural *** of both multiplexes was successful for those pine species closely related to Scots pine.

关键词： Genetic diversity nuclear ssr ssr multiplex Scots pine

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