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广西三个猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5及nsp2基因的克隆与分析

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广西畜牧兽医 2022年第5期38卷 214-218页

作者：唐紫燕高跃美张红云梁晶晶罗廷荣李晓宁广西大学动物科学技术学院广西南宁530005

本研究对从广西某猪场采集3份疑似感染猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的病料进行RT-PCR鉴定、GP5基因及nsp2部分基因测序分析。结果显示,从3份病例样品中扩增得到PRRSV GP5全基因和nsp2部分基因片段,并对其进行测序分析,3株PRRSV毒株均... 详细信息

本研究对从广西某猪场采集3份疑似感染猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的病料进行RT-PCR鉴定、GP5基因及nsp2部分基因测序分析。结果显示,从3份病例样品中扩增得到PRRSV GP5全基因和nsp2部分基因片段,并对其进行测序分析,3株PRRSV毒株均与参考毒株JXA1存在高度的亲缘关系,与PRRSV美洲经典VR-2 332株不同,其nsp2蛋白不连续缺失30个氨基酸为HP-PRRSV毒株的典型特征,这与国内其他变异株的缺失情况一致。从遗传进化角度分析,本研究得到的毒株与JXA1及TJ毒株具有相似来源。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 nsp2基因 GP5基因遗传进化分析

2006～2008年重庆部分区县PRRSV分离株ORF5和nsp2基因的遗传变异分析

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中国兽医科学 2009年第7期39卷 580-586页

作者：高君冉智光谭世君汤明曾政杨泽林米自由熊仲良西南大学动物科技学院重庆400716 重庆市动物疫病预防控制中心重庆401147

为了解重庆市PRRSV流行毒株的遗传变异情况和分子流行病学背景,对2006-2008年分离到的14株重庆市内的PRRSV流行毒株进行了nsp2和ORF5基因序列的测定和分析。结果显示,与2006年以来国内流行的变异毒株相比,nsp2与ORF5基因的核苷酸同源性... 详细信息

为了解重庆市PRRSV流行毒株的遗传变异情况和分子流行病学背景,对2006-2008年分离到的14株重庆市内的PRRSV流行毒株进行了nsp2和ORF5基因序列的测定和分析。结果显示,与2006年以来国内流行的变异毒株相比,nsp2与ORF5基因的核苷酸同源性分别达到97.3%-99.5%和98.2%-99.7%,这2个基因推导的氨基酸序列同源性分别达到95.7%-99.2%和98.0%-99.5%。与传统毒株相比,nsp2和ORF5基因及其推导的氨基酸都存在点突变,并在nsp2基因内部存在编码30个氨基酸的碱基对的不连续缺失,ORF5基因未存在缺失。从遗传进化以及变异情况看,重庆市流行的PRRSV主要为变异毒株,属于美洲型中的亚群Ⅱ。

关键词：猪生殖与呼吸综合征病毒 nsp2基因 ORF5基因遗传变异

两株PRRSV分离株ORF5与nsp2基因部分序列分析

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免疫学杂志 2011年第7期27卷 562-566,571页

作者：祝秀梅吕志慧牟克斌中农威特生物科技股份有限公司兰州730046

目的分析沈阳和甘肃发病猪场的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的ORF5基因和nsp2基因变异情况。方法采用RT-PCR方法,对ORF5基因序列和nsp2基因部分序列进行扩增、克隆并测序。并用DNAStar软件将测序结果与国内外发表的10株参考毒株进... 详细信息

目的分析沈阳和甘肃发病猪场的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的ORF5基因和nsp2基因变异情况。方法采用RT-PCR方法,对ORF5基因序列和nsp2基因部分序列进行扩增、克隆并测序。并用DNAStar软件将测序结果与国内外发表的10株参考毒株进行比对分析。结果 2株分离株ORF5基因与国内外其它美洲型分离株核苷酸的同源性为88.6%～98.7%,推导的氨基酸的同源性为86.6%～98.0%;nsp2基因的核苷酸同源性为73.4%～99.8%,推导的氨基酸的同源性为68.6%～99.5%,且该基因与国内其他变异株有完全一致的缺失特征。结论这两株分离株均属于PRRSV美洲型变异株,为该病的防治及疫苗的设计奠定理论基础。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 nsp2基因遗传变异

PRRSV LN/0901株的分离鉴定及其nsp2基因遗传变异分析

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中国兽医学报 2012年第12期32卷 1758-1762页

作者：周铁忠王占林刘丽颖高慎阳苗玉和舒秀伟辽宁医学院畜牧兽医学院辽宁锦州121001 朝阳市动物疫病预防控制中心辽宁朝阳122000 营口市动物疫病预防控制中心辽宁营口115000 辽宁益康生物制品有限公司辽宁辽阳111000

采集可疑为猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)阳性的猪肺脏病料,通过Marc-145细胞培养、电镜观察、中和试验、RT-PCR检测等方法鉴定,确认从辽宁省分离到1株PRRSV,暂命名为PRRSV LN/0901株。进一步经nsp2基因克隆测序及同源性比较及系统发... 详细信息

采集可疑为猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)阳性的猪肺脏病料,通过Marc-145细胞培养、电镜观察、中和试验、RT-PCR检测等方法鉴定,确认从辽宁省分离到1株PRRSV,暂命名为PRRSV LN/0901株。进一步经nsp2基因克隆测序及同源性比较及系统发育进化树等分析,结果证明该毒株属北美洲型,与2006年以来国内的多数流行变异株遗传关系相近且独立分支,说明导致辽宁地区流行的猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)病原属于北美洲型PRRSV,而且存在不断变异的趋势。

关键词： PRRSV nsp2基因分离鉴定变异分析

2007-2009年部分猪群PRRSV ORF5和nsp2基因的克隆与序列分析

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2010年第10期38卷 7-14页

作者：邹敏吴发兴王福军李金积冯阳刘蕾李明义陈克正范根成李晓成青岛易邦生物工程有限公司山东青岛266032 青岛科技大学材料科学与工程学院山东青岛266061 中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266032

【目的】了解2007-2009年部分猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)株的遗传演化规律。【方法】按常规方法,从2007-2009年收集的疑似蓝耳病猪群组织样品中分离PRRSV,应用RT-PCR方法,对分离的10株PRRSV的ORF5和nsp2基因进行扩增,测序后... 详细信息

【目的】了解2007-2009年部分猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)株的遗传演化规律。【方法】按常规方法,从2007-2009年收集的疑似蓝耳病猪群组织样品中分离PRRSV,应用RT-PCR方法,对分离的10株PRRSV的ORF5和nsp2基因进行扩增,测序后与19个PRRSV参考毒株的ORF5、nsp2基因进行核苷酸、氨基酸序列比较及遗传进化分析。【结果】分离到的SDWF5、SDCX1、LN3、LN8、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB1、ZB2共10株PRRSV均属于美洲型PRRSV变异株,其ORF5基因全长均为603bp,编码约200个氨基酸,其推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;SDWF5、SDCX1、LN3、LN12、SD2、SD5、SD14、ZB2等8个分离株的nsp2基因全长为2845bp,编码950个氨基酸,与代表毒株VR-2332相比,8个分离株在nsp2基因推导氨基酸序列的480和532～560位发生了不连续的30个氨基酸缺失。与19个PRRSV参考毒株的ORF5、nsp2序列进行比较后发现,10个分离株的ORF5、nsp2基因核苷酸序列及其推导氨基酸序列均发生了较大变异。遗传进化分析发现,10个分离株与以CH-1a为代表的国内流行毒株处于同一分支,与JXA1等变异毒株的遗传距离较近。【结论】来源于不同猪群的10个PRRSV分离株的遗传关系存在交叉,没有明显的地域特征,但可能具有相同的始祖Ch-1a。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株 ORF5基因 nsp2基因遗传变异

中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和nsp2基因遗传变异分析

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中国农业科学 2009年第5期42卷 1805-1812页

作者：薛青红张彦明刘湘涛郎洪武邹敏高金源邓永西北农林科技大学动物医学院中国兽医药品监察所中国农业科学院兰州兽医研究所青岛易邦生物工程有限公司

【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病... 详细信息

【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒,应用RT-PCR方法对36株PRRSV现地分离株的ORF5基因和nsp2基因进行扩增和序列分析。【结果】36株现地分离株均属于美洲型PRRSV,ORF5基因全长均为603bp,未发现有基因缺失或插入,编码约200个氨基酸,分离株推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;36个分离株中有15株PRRSVnsp2基因全长为2940bp,21株PRRSVnsp2基因全长为2850bp;发生nsp2缺失的PRRSV在nsp2基因第481位、532～560位发生了不连续缺失,共缺失30个氨基酸。与GeneBank中收录的14个PRRSVORF5、nsp2基因进行核苷酸及氨基酸序列比较和分析,系统进化关系显示,除B02-2005株可能与疫苗株有关外,多数现地分离株与Ch-1a株遗传距离较近,不同年份分离到的毒株与早期PRRSV分离株的同源性逐年降低。【结论】根据氨基酸变异情况对PRRSV现地分离株进行亚群聚类分析,发现36株现地分离株分别归属于以VR-2332为代表的4亚群,以BJ-4为代表的1亚群和以Ch-1a为代表的2亚群。进化关系表明PRRSVORF5、nsp2基因及其推导的氨基酸序列均发生了较大变异,不同地区PRRSV分离株的遗传关系存在交叉现象,地域特征不明显。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒病毒分离 ORF5基因 nsp2基因遗传变异

广西区2008-2011年猪繁殖与呼吸综合征病毒nsp2基因的遗传变异分析

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中国兽医科学 2012年第8期42卷 784-790页

作者：赵日浪施开创林昌华赵国明何贻坚刘棋广西大学动物科学技术学院广西南宁530005 广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为了解广西壮族自治区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示,获得的49个毒株均为美洲型,其中46株具有高致病性变异毒株的序列... 详细信息

为了解广西壮族自治区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示,获得的49个毒株均为美洲型,其中46株具有高致病性变异毒株的序列特征,即其nsp2蛋白缺失第481位和第533～561位aa,其余3株不具有上述缺失,属于PRRSV传统毒株。广西区49个毒株nsp2基因间核苷酸序列的同源性介于84.8%～99.7%,与VR-2332、CH-1a、HB-1及JXA1株核苷酸序列的同源性分别为80.5%～83.7%、89.7%～92.6%、92.4%～96.3%、92.8%～99.3%,而与LV株核苷酸序列同源性仅为51.0%～53.9%。基于nsp2基因核苷酸序列所绘制的遗传进化树,可将所有美洲型PRRSV毒株分为4个亚群,广西区的49个毒株有3株分布在以HB-1株为代表的Ⅲ亚群,46株分布在以JXA1株为代表的Ⅳ亚群。表明,当前广西区PRRSV流行毒株均为美洲型毒株,并且以Ⅳ亚群为优势基因亚群,各毒株间的nsp2基因序列存在一定的差异,但没有明显的地域特征。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异 nsp2基因

云南高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒nsp2基因变异分析

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中国预防兽医学报 2008年第12期30卷 934-938页

作者：庞海洋赵焕云张文东张思东吕粤岳亮范泉水张应国张富强云南农业大学云南昆明650203 西北农林科技大学陕西杨凌712100 云南省动物疫病预防控制中心云南昆明650051 成都军区疾病预防控制中心云南昆明650032

采用RT-PCR技术对云南2007年采集的48份猪组织样品中病毒nsp2基因进行检测,获得阳性样品14份,选择5份代表性样品将其PCR产物纯化后,克隆至pMD18-T载体测序,并与已知代表性毒株进行比较及系统发育分析。结果发现云南病毒样品nsp2基因核... 详细信息

采用RT-PCR技术对云南2007年采集的48份猪组织样品中病毒nsp2基因进行检测,获得阳性样品14份,选择5份代表性样品将其PCR产物纯化后,克隆至pMD18-T载体测序,并与已知代表性毒株进行比较及系统发育分析。结果发现云南病毒样品nsp2基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为95.8%～99.0%和92.3%～98.6%。5份样品病毒nsp2蛋白482位、534位～562位氨基酸均存在缺失,其中1份样品(YNMG)486位～489位氨基酸也发生了缺失。云南病毒样品在系统发育树上可划分为4个亚组群,分别与广东、广西、贵州、浙江、江苏、山东毒株遗传关系密切。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒高致病性 nsp2基因变异

PRRSV山西株ORF5和nsp2基因序列分析

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中国兽医学报 2014年第1期34卷 1-5页

作者：姚敬明刘文俊罗甜甜吴忻王娟萍孟帆韩一超樊振华米瑞娟詹海杰山西省农业科学院畜牧兽医研究所山西太原030032 山西省动物疫病预防控制中心山西太原030024

采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省分离的5株猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的ORF5和nsp2（2503～3269nt）基因进行克隆和测序，并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒... 详细信息

采用RT-PCR方法对2009—2011年山西省分离的5株猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的ORF5和nsp2（2503～3269nt）基因进行克隆和测序，并对其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外毒株进行了同源性分析。序列分析结果显示，5株分离株nsp2基因与国内分离的PRRSV变异株（JXA1、HuN、HUN4、HUB1）的序列同源性最高，为96．8％～98．2％，且缺失位置一致，均存在2个位点30个氨基酸缺失；ORF5基因大小为603bp，编码200个氨基酸，第13、151位均为具有强毒特性的精氨酸（R），137位为丝氨酸（S），表明这5株均为野毒株，与国内分离的PRRSV变异株（JXA1、HuN、HUN4、HUB1）毒株的序列同源性最高，为96．5％～98．0％。结果表明，山西省内目前流行的PRRSV为nsp2缺失30个氨基酸的变异毒株。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 nsp2基因变异分析