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Detection, Biochemical and Molecular Characterization of Clostridium sporogens in nono: A Nigerian Traditionally Fermented Yoghurt Drink

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Open Journal of Medical Microbiology 2023年第1期13卷 91-100页

作者： Nofisat Olaide Oyedokun Gbadebo Barnabas Olukotun Uchenna Iman Igwegbe Binta Buba Adamu Roseline Rumi Ideh Olaitan Comfort Shekoni Amin Oderaa Igwegbe Department of Food and Industrial Biotechnology National Biotechnology Development Agency Musa Yar’adua Express Way Abuja Nigeria Department of Medical Microbiology University of Maiduguri Teaching Hospital (UMTH) Maiduguri Nigeria Department of Veterinary Medicine College of Food Agricultural and Environmental Science (CFAES) The Ohio State University Colombos USA Department of Food Science and Technology University of Maiduguri Maiduguri Nigeria

nono is a traditionally fermented milk drink commonly consumed in the Northern parts of Nigeria. It is produced through the spontaneous fermentation of raw cow milk by Lactic Acid Bacteria (LAB), a process that could result to the contamination of the product with such pathogenic organisms as Clostridia spp. The aim of this research was therefore to determine the incidence of Clostridia species in thirty-two (32) ready-to-drink nono samples collected directly from a number of Fulani vendors in randomly selected locations within the Federal Capital Territory (FCT), Abuja, Nigeria. Isolated organisms were further subjected to some morphological and biochemical characterizations using standard microbiological procedures. The results obtained indicate that fourteen (14) isolates were putatively identified to be Clostridium sp., out of which five (5) isolates were confirmed to be Clostridium sporogens by a BLAST analysis of their respective 16SrRNA nucleotide sequence. It was concluded that, the detection of these pathogenic strains in frequently consumed product like nono could pose a public health risk and proactive measures to prevent an outbreak of food borne illness from nono consumption, were recommended.

关键词： Fermentation nono Clostridium sporogens Pathogenic Food Borne Illness

nono对卵巢癌生物学行为的影响及机制的初步探讨

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NONO对卵巢癌生物学行为的影响及机制的初步探讨

作者：贾涵中国医科大学

学位级别：硕士

目的:卵巢癌（Ovarian cancer,OC）是致死率最高的妇科恶性肿瘤,多年来,患者的5年生存率没有明显提高。广泛的盆腹腔转移是造成患者预后较差的主要原因之一。因此,深入探索卵巢癌腹腔转移的机制并寻找新的治疗靶点,对改善卵巢癌患者的... 详细信息

目的:卵巢癌（Ovarian cancer,OC）是致死率最高的妇科恶性肿瘤,多年来,患者的5年生存率没有明显提高。广泛的盆腹腔转移是造成患者预后较差的主要原因之一。因此,深入探索卵巢癌腹腔转移的机制并寻找新的治疗靶点,对改善卵巢癌患者的预后具有重要意义。人源p54nrb/不含POU结构域的八聚核苷酸结合蛋白（Non-POU-domain-containing octamer binding protein,nono）是一种RNA结合蛋白,参与前列腺癌、膀胱癌、结肠癌和恶性黑色素瘤等多种肿瘤的发生发展,并与乳腺癌、肺癌等部分肿瘤患者的不良预后相关,但其在卵巢癌中的研究较少。本研究的目的是探索nono蛋白在卵巢癌组织中的表达情况及其与卵巢癌患者临床病理因素的关系,进而明确nono对卵巢癌生物学功能的影响,并初步探究其可能的作用机制。方法:采用免疫组化方法检测nono在19例正常卵巢组织、106例浆液性卵巢癌原发灶组织及69例与卵巢癌原发灶配对的转移灶组织的表达情况,分析nono的表达水平与卵巢癌患者临床病理因素间的关系。我们利用nono敲减质粒构建抑制nono表达的卵巢癌细胞模型,通过Real-time PCR和Western Blot实验分别检测转染前后nono的m RNA水平和蛋白水平,确认转染效率。采用CCK8实验和EDU实验检测nono表达水平对卵巢癌细胞增殖能力的影响,细胞划痕实验检测nono表达水平对卵巢癌细胞迁移能力的影响,并用Transwell实验检测nono对卵巢癌细胞迁移及侵袭能力的影响。然后,通过生物信息学方法预测nono在卵巢癌细胞中可能参与调控的信号通路。结果:1.我们对正常卵巢组织、卵巢癌原发灶和卵巢癌转移灶组织行免疫组化实验,结果显示nono蛋白在各组卵巢组织中呈现出不同程度表达,以细胞核着色为主。nono在卵巢癌原发灶中的表达水平显著高于正常卵巢组织（P＜0.05）,且nono在卵巢癌转移灶中的表达水平明显高于卵巢癌原发灶（P＜0.05）。接着我们分析nono的表达水平与卵巢癌患者临床病理因素的关系,结果发现,nono高表达与卵巢癌的FIGO分期（P＜0.001）、腹膜转移（P＜0.05）和大网膜转移（P＜0.001）显著相关。Kaplan-Meier法检测nono在卵巢癌组织中的表达情况与患者总生存时间的关系,结果表明,高表达组的中位生存时间低于表达组的中位生存时间,但是Log Rank的分析结果表明nono的表达水平与卵巢癌患者的预后关系无统计学意义。这些结果提示nono可能是预测卵巢癌分期及转移情况的重要标志物。2.我们通过CCK-8增殖实验、EDU增殖实验、Transwell实验和细胞划痕实验探索nono的表达对卵巢癌细胞生物学行为的影响。CCK-8增殖实验和EDU增值实验结果显示,下调nono的表达水平能显著抑制卵巢癌细胞的增殖能力（P＜0.05）。通过Transwell实验,证实下调nono的表达能明显抑制卵巢癌细胞的迁移和侵袭能力（P＜0.05）。此外,细胞划痕实验结果显示抑制nono的表达水平后,卵巢癌细胞的划痕愈合程度较对照组明显减弱,提示细胞的迁移能力受到抑制（P＜0.05）。3.生物信息学分析结果提示nono可能参与调控卵巢癌细胞的细胞周期、微管结合和染色体分离等信号通路。结论:nono在卵巢癌原发灶组织中的表达水平高于卵巢正常组织,且在卵巢癌转移灶组织的表达水平高于卵巢癌原发灶组织,同时nono高表达与卵巢癌临床分期和转移情况相关。下调nono的表达可显著抑制卵巢癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。此外,基于生物信息学分析发现nono可能通过调控细胞周期和微管结合等信号通路参与卵巢癌的发生发展。

关键词：卵巢癌 nono 增殖迁移侵袭

旁粒组分nono在小鼠胚胎干细胞中的转录调控机制

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生命科学 2017年第10期29卷 1040-1045页

作者：胡昊麟叶宣伽蓝斐复旦大学生物医学研究院表观遗传实验室医学表观遗传与分子代谢国际科技合作基地上海200032

旁粒及其组分在肿瘤发生和诸多正常的生物学功能中都扮演了重要的角色,但对于其具体的作用机制仍然缺乏了解。在人和小鼠的胚胎干细胞中,旁粒的关键结构组分长链非编码RNA NEAT1_v2并不表达,只表达其短变体NEAT1_v1和3种旁粒蛋白组分—... 详细信息

旁粒及其组分在肿瘤发生和诸多正常的生物学功能中都扮演了重要的角色,但对于其具体的作用机制仍然缺乏了解。在人和小鼠的胚胎干细胞中,旁粒的关键结构组分长链非编码RNA NEAT1_v2并不表达,只表达其短变体NEAT1_v1和3种旁粒蛋白组分——nono、SFPQ和PSPC1,提示这些组分可能具有独立于经典旁粒结构之外的功能。蓝斐课题组依托国家基金委"细胞编程和重编程的表观遗传机制"重大研究计划,在此方向上开展了系统性的研究,并获得了进展:首次发现旁粒蛋白组分nono和Erk相互作用,共同结合在小鼠胚胎干细胞的双价结构域基因(bivalent genes)的启动子区,并参与Mek/Erk信号途径调控靶基因的待激活状态;研究还发现,nono缺失的m ESC具有更强的自我更新能力,对于胚胎干细胞的体外培养有重要的参考价值。对本领域的最新进展以及复旦大学蓝斐课题组的相关原创性工作进行综述。

关键词：旁粒 nono 胚胎干细胞双价结构域基因自我更新

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恐龙nono的新奇之旅

幼儿教育 2007年第8期 20-21页

作者：丫丫

PBDC1和nono蛋白在红系分化过程中的功能研究及UPF0538蛋白的抗体制备

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PBDC1和NonO蛋白在红系分化过程中的功能研究及UPF0538蛋白的抗体...

作者：胡江江浙江理工大学

学位级别：硕士

细胞分化与去分化是生命科学领域中的一个研究热点,对其机制的研究为肿瘤的发生及防治提供重要依据。哺乳类红系细胞的分化具有明显的时序性变化,当细胞进入终末分化时出现:停止分裂、细胞体积逐渐减小、细胞核固缩、排核和特异蛋白-血... 详细信息

细胞分化与去分化是生命科学领域中的一个研究热点,对其机制的研究为肿瘤的发生及防治提供重要依据。哺乳类红系细胞的分化具有明显的时序性变化,当细胞进入终末分化时出现:停止分裂、细胞体积逐渐减小、细胞核固缩、排核和特异蛋白-血红蛋白的表达等变化。小鼠胎肝是小鼠早期的主要造血器官,红系细胞在胎肝E10.517.5造血过程中发生并完成终末造血过程,已成为研究体内红系分化的良好模型。此外,现已证实多种诱导剂能诱导红白血病细胞重新进入分化阶段,表达血红蛋白,这也是红系分化与癌变的另一个模型。在本实验室的前期工作中,利用差异蛋白质组学技术鉴定出丁酸钠诱导小鼠红白血病(Murine eryt hroleukemia,MEL)细胞向红系细胞分化过程和小鼠胎肝造血过程中有许多差异表达的蛋白质。其中既有一些已经有一定功能研究基础的蛋白质,例如:NPM1、P irin、RbAp48、nono等;也有一些功能和高级结构未知的蛋白质,例如:PBDC1、UPF0538等。本文用细胞与分子生物学技术和方法研究PBDC1和nono蛋白在红系分化过程中的功能,以及UPF0538蛋白的抗体制备。结果表明PBDC 1在MEL细胞和小鼠胎肝细胞中主要定位于细胞质,也有少量定位于细胞核。GS T沉降实验鉴定出159个PBDC1的潜在相互作用蛋白,其中有很大一部分肽酶和氧化还原酶,还有一些GTP结合蛋白、电子转移蛋白、铁离子结合蛋白,猜测PBDC1可能参与细胞内的氧化还原反应,电子转移,铁离子结合等过程,但需后续实验验证。此前,我们发现在SB诱导MEL分化过程中,nono蛋白表达呈上调趋势,并且与红系负调控因子PU.1共定位,这说明nono可能参与红系分化的调控。本文中为进一步研究nono蛋白在MEL细胞分化中的作用,通过shRNA干扰方式构建了低表达nono稳定细胞株。MTT比色法结果表明,nono的低表达会抑制MEL细胞的增殖活力。Western blot鉴定结果表明低表达nono蛋白会引起c-myc蛋白表达下调,而c-myc在调控红系分化方面有重要作用。由此可推测,nono通过c-myc和P U.1调控红系分化过程。UPF0538是一个功能和高级结构未知的蛋白质,目前还没有商品化的抗体。为研究UPF0538在分化过程中的功能,我们利用原核表达系统获得大量的UPF0538融合蛋白,并以此免疫新西兰大白兔,制备了其多克隆抗体,为研究UPF0538的功能提供了基础。

关键词：红系分化 nono PBDC 1 UPF0538 丁酸钠小鼠白血病细胞抗体制备

山羊中Lncnono-AS可通过介导nono调控AR的表达

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山羊中LncNONO-AS可通过介导NONO调控AR的表达

作者：代子诺西南大学

学位级别：硕士

山羊是人类重要的经济家畜,主要提供肉、奶、羊绒、皮等多种产品。与其他山羊相比,大足黑山羊具有较高的繁殖率。大足黑山羊公羊具有性成熟早、生长发育快、抗病性强、遗传稳定等特点。在山羊生产中,山羊睾丸的发育以及精子的正常发生... 详细信息

山羊是人类重要的经济家畜,主要提供肉、奶、羊绒、皮等多种产品。与其他山羊相比,大足黑山羊具有较高的繁殖率。大足黑山羊公羊具有性成熟早、生长发育快、抗病性强、遗传稳定等特点。在山羊生产中,山羊睾丸的发育以及精子的正常发生是影响雄性繁殖性能的关键因素。之前的研究已经证实,lncRNAs在睾丸发育和精子发生中起着重要的调节作用。尽管lncRNAs几乎参与基因调控的每个步骤,调控机制也很复杂多样,但在山羊睾丸中鲜有人对其进行测序发掘。为了探讨lncRNAs在大足黑山羊睾丸中的作用,采用高通量测序方法筛选出了可能与精子发生和睾丸发育相关的lncRNA Lncnono-AS,其靶基因为nono。之前有研究发现,雄激素受体(AR)在睾丸中可能受到nono的调控,猜想Lncnono-AS可能通过介导nono的表达对AR进行调控。为了验证这个猜想,本文在体外培养睾丸支持细胞基础上,过表达、干扰、荧光定量、western blot等技术对lncRNA Lncnono-AS的功能以及可能存在的调控关系进行验证,得到如下结果:1.通过测序发现了一条新的且组间存在差异的lncRNA LTCONS2868,其靶基因为nono,通过生物信息学分析我们发现LTCONS2868与nono存在结合能,且BLAST比对发现lncRNA与其靶基因nono 99%的序列存在互补。因此,初步推测这条新发现的lncRNA为nono的反义lncRNA,命名为Lncnono-AS。2.对Lncnono-AS进行过表达处理后其靶基因nono发生了显著的变化。nono在过表达组的基因表达量是无处理对照组的1.74倍,差异极显著(Pnono过表达组的蛋白表达量是无处理对照组的1.53倍,差异显著(Pnono-AS对nono具有调控作用,且可能是正调控作用。3.对Lncnono-AS以及nono进行RNA pull down实验,结果发现两者之间确实存在结合。表明Lncnono-AS可能是以直接结合的方式调控nono。4.对Lncnono-AS直接过表达处理后,AR的基因表达量也发生了显著的变化。过表达组AR的基因表达量是无处理对照组的3.48倍,差异极显著(Pnono-AS对AR同样存在调控作用。5.直接干扰nono发现AR的表达量发生了显著的变化。构建nono慢病毒干扰载体,分别设置三个干扰组HBLV-nono shRNA1-GFP-PURO,HBLV-nono shRNA2-GFP-PURO,HBLV-nono shRNA3-GFP-PURO。经鉴定HBLV-nono shRNA1-GFP-PURO干扰组效率最高,可以作为nono基因的干扰靶点。无处理对照组与HBLV-nono shRNA1-GFP-PURO干扰组相比,AR的基因表达量由1.01下降为0.34,差异极显著(Pnono可以介导AR的表达,且可能是通过正调控作用影响AR的表达量。综合以上结果得出结论,lncRNA Lncnono-AS可通过介导nono的表达,对AR的表达产生调控作用。这些数据有助于深入了解睾丸发育过程以及生殖过程,为进一步了解lncRNAs的功能提供了许多有价值的信息。

关键词：反义lncRNA nono 雄激素受体山羊睾丸精子发生

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nono蛋白

生命的化学 2013年第6期33卷 662-667页

作者：桑婷婷薛建有张世馥浙江理工大学生命科学学院杭州310018

nono蛋白能与DNA、RNA以及多种蛋白质相互作用,参与多种生物学事件:DNA的损伤修复、pre-mRNA的剪接、转录调控、核RNA滞留和cAMP调节途径等,并且该蛋白与恶性黑色素瘤、乳突状肾细胞癌、前列腺癌以及结肠癌等多种癌症的发生密切相关,因... 详细信息

nono蛋白能与DNA、RNA以及多种蛋白质相互作用,参与多种生物学事件:DNA的损伤修复、pre-mRNA的剪接、转录调控、核RNA滞留和cAMP调节途径等,并且该蛋白与恶性黑色素瘤、乳突状肾细胞癌、前列腺癌以及结肠癌等多种癌症的发生密切相关,因此对该蛋白的研究具有非常重要的生物学意义。本文对nono蛋白的结构、功能及其与癌症的关系等方面的研究现状进行简要的概述。

关键词： nono p54nrb PSF 肿瘤转录调控

nono——长征空间／11个艺术家／无主题／无策展人的一场展览事件

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东方艺术 2007年第9期 54-57页

作者：小不

　　关于nono非策展阐释　　nono是重复的拒绝和反对,还是对拒绝的反对?到底是说不还是不说不?真实地呈现了当代艺术的小题大做和大题小做的矛盾.虽然无策展人,无主题,但还是从各自的角度紧密地和对现实的态度有所联系.……

关键词：艺术家当代艺术策展人 nono 长征

nono城——青年就业者创业街区住宅设计——城市住宅设计

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住区 2014年第2期 113-114页

作者：龙灏重庆大学

学生姓名：祝乐指导教师：黄海静、黄颖作业张数：3张作业时间：本科三年级作业时间长：9周总用地面积：17819m2总建筑面积：33625.8m2容积率：1.8绿地率：31%建筑密度：34%nono族是青年人时下流行的生活方式,他们属于涉入社会不久的夹... 详细信息

学生姓名：祝乐指导教师：黄海静、黄颖作业张数：3张作业时间：本科三年级作业时间长：9周总用地面积：17819m2总建筑面积：33625.8m2容积率：1.8绿地率：31%建筑密度：34%nono族是青年人时下流行的生活方式,他们属于涉入社会不久的夹心层人群,没有经济积累,但却又有别于普通低收入人群。这类人群追求简单生活,喜欢独立思考,节俭但有品味,渴望社区交流。因此,适宜青年就业者的住宅空间及居住模式研究成为设计的主题。设计选地位于城市中心旧城街区之中,旧有建筑中大多为青年就业者暂时租住房,租金低廉,但条件差。

关键词：就业者 nono 城市住宅设计旧有建筑住宅空间夹心层学生姓名低收入人群居住模式建筑密度