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Application of Density Functional Theoretic Descriptors to Quantitative Structure-Activity Relationships with Temperature Constrained Cascade Correlation Network Models of nitrobenzene derivatives

引用

Chemical Research in Chinese Universities 2006年第4期22卷 439-442页

作者： CUI Xiu-jun ZHANG Zhuo-yong YUAN Xing ZHANG Jing-ping LIU Si-dong GUO Li-ping Peter de B. HARRINGTON Faculty of Chemistry Northeast Normal University Changchun 130024 P. R. China Department of Chemistry Capital Normal University Beijing 100037 P. R. China College of Urban and Environmental Science Northeast Normal University Changchun 130024 P. R. China Center for Intelligent Chemical Instrumentation Clippinger Laboratories Department of Chemistry and Biochemistry Ohio University Athens OH 45701-2979 USA

A temperature-constrained cascade correlation network （TCCCN）, a back-propagation neural network （BP）, and multiple linear regression（MLR） models were applied to quantitative structure-activity relationship（QSAR） modeling, on the basis of a set of 35 nitrobenzene derivatives and their acute toxicities. These structural quantum-chemical descriptors were obtained from the density functional theory（DFT）. Stepwise multiple regression analysis was performed and the model was obtained. The value of the calibration correlation coefficient R is 0. 925, and the value of cross-validation correlation coefficient R is 0. 87. The standard error S = 0. 308 and the cross-validated （ leave-one- out） standard error Scv =0. 381. Principal component analysis（PCA） was carried out for parameter selection. RMS errors for training set via TCCCN and BP are 0. 067 and 0. 095, respectively, and RMS errors for testing set via TCCCN and BP are 0. 090 and 0. 111, respectively. The results show that TCCCN performs better than BP and MLR.

关键词： DFT MLR PCA BP TCCCN QSAR nitrobenzene derivative

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