检索结果-南通市图书馆

食品工业科技 2022年第18期43卷 145-151页

作者：丁淑金杨彦萍邓茹友马福仙尹拓张汉尧西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224

目的:从转录组分析数据中得到葡萄汁酵母not5基因,并对其进行生物学信息分析,为后期研究该基因的作用打下基础。方法:使用在线分析工具COILS Server、SOPMA、Alpha Fold等分析预测not5基因编码蛋白质的一级结构、二级结构、三级结构及... 详细信息

目的:从转录组分析数据中得到葡萄汁酵母not5基因,并对其进行生物学信息分析,为后期研究该基因的作用打下基础。方法:使用在线分析工具COILS Server、SOPMA、Alpha Fold等分析预测not5基因编码蛋白质的一级结构、二级结构、三级结构及其结构域。结果:葡萄汁酵母not5基因核苷酸序列的开放阅读框为1446 bp,可编码481个氨基酸,位于XVI染色体690107~691789,在系统发育树中与真贝酵母(Saccharomyces eubayanus not5 like protein XP018219088.1)not5基因的亲缘关系最近;其编码的蛋白质是不稳定的亲水蛋白,分子式为CHNOS,分子质量为56311.02,不含信号肽,无跨膜区域,存在卷曲螺旋区域,亚细胞定位于细胞质中的线粒体上;蛋白质的二级结构以随机卷曲为主;预测存在Pfam Not3和Pfam NOT2_3_5结构域;以Yeast Not1-Not2-not5 (4by6.1.C)为模板构建not5蛋白的三级结构,两者的序列一致性可以达到89.88%。结论:葡萄汁酵母not5基因编码的蛋白结构不稳定,可能在细胞中互连翻译和转录。

关键词：葡萄汁酵母 not5基因生物信息学分析转录组在线分析工具

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