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nlrp3基因多态性与中国北方东部汉族人群帕金森病相关性研究

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中国神经精神疾病杂志 2020年第5期46卷 257-262页

作者：王慧敏刘贤李珊珊金佳宁白新玲谢安木青岛大学附属医院神经内科青岛266003

目的探讨Nod样受体家族蛋白3(Nod-like receptor protein 3,nlrp3)rs4612666及rs7525979位点多态性与中国北方东部汉族人群帕金森病(Parkinson disease,PD)发病风险的相关性。方法采用病例对照研究,共招募400例PD患者(PD组)及400例健康对照者(对照组),应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法鉴定nlrp3基因SNPs位点rs4612666和rs7525979。结果PD组rs4612666等位基因与对照组具有统计学差异,C等位基因频率低于对照组,降低发病风险(OR=0.794,95%CI:0.653~0.967,P=0.021),隐性遗传模型CC/TT+CT分布在PD组与对照组之间差异具有统计学意义(OR=0.667,95%CI:0.481~0.925,P=0.015)。亚组分析中,与对照组比较,女性PD组与早发型PD组等位基因分布差异具有统计学意义(P=0.003,P=0.018)。rs7525979位点的基因型分布和等位基因频率在PD组与对照组比较均无统计学差异(P>0.05)。结论在中国北方东部汉族人群中,nlrp3 rs4612666的C等位基因是PD的保护性因素。

关键词：帕金森病 nlrp3基因单核苷酸多态性

nlrp3基因单核苷酸多态性与上海地区寻常痤疮患病率的关系分析

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临床皮肤科杂志 2015年第1期44卷 11-13页

作者：申晨沈征宇陈向东徐慧上海交通大学医学院附属第九人民医院皮肤科上海200011

目的：探讨nlrp3基因单核苷酸多态性（SNP）与上海地区寻常痤疮患病率的相关性。方法：收集145例中、重度痤疮患者及158例健康人群的临床资料和血液标本，TaqMan探针法对rs10754558和rs4612666位点进行分型．ABI7900扫描分型结果，荧光... 详细信息

目的：探讨nlrp3基因单核苷酸多态性（SNP）与上海地区寻常痤疮患病率的相关性。方法：收集145例中、重度痤疮患者及158例健康人群的临床资料和血液标本，TaqMan探针法对rs10754558和rs4612666位点进行分型．ABI7900扫描分型结果，荧光定量PCR检测nlrp3基因表达水平。结果：中、重度痤疮患者rs10754558位点CC、CG、GG基因型频率分别为0．168、0．476和0．338，对照组为0．285、0．487和0．228，G等位基因的分布频率差异存在统计学意义（P=***=1．522．95％CI=1．075-2．098）。痤疮患者与健康人群rs4612666位点基因型差异无统计学意义（P=0．708，OR=1．065，95％CI=0．767-1．479）。结论：nlrp3基因rs10754558位点与上海地区痤疮患病率存在相关性，而rs4612666位点与其无相关性。

关键词：痤疮,寻常 nlrp3基因单核苷酸多态性白介素-1β

nlrp3基因非编码区多态性与绵羊肺炎支原体易感性的相关性研究

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NLRP3基因非编码区多态性与绵羊肺炎支原体易感性的相关性研究

作者：崔庆贤石河子大学

学位级别：硕士

目的:(1)通过绵羊肺炎支原体感染的临床表现和病理变化,再结合血清学检测方法分别对新疆伊犁地区哈萨克羊和萨福克羊支原体肺炎的流行情况进行鉴定,计算不同品种的绵羊群体中支原体肺炎的感染率。(2)采用PCR检测方法对nlrp3基因非编码区... 详细信息

目的:(1)通过绵羊肺炎支原体感染的临床表现和病理变化,再结合血清学检测方法分别对新疆伊犁地区哈萨克羊和萨福克羊支原体肺炎的流行情况进行鉴定,计算不同品种的绵羊群体中支原体肺炎的感染率。(2)采用PCR检测方法对nlrp3基因非编码区SNP位点进行筛选,并对不同SNP位点的基因型进行分析,探究nlrp3炎性小体相关基因在不同绵羊品种中的遗传多态性与绵羊肺炎支原体易感性的相关性。方法:(1)本研究采集新疆伊犁地区部分规模化羊场的两个绵羊品种(哈萨克羊与萨福克羊)共计800份血清样本,使用绵羊肺炎支原体酶联免疫吸附实验(ELISA)检测试剂盒,进行绵羊肺炎支原体抗原和抗体血清学检测。(2)以此为基础,采用直接测序法检测候选基因nlrp3基因非编码区单核苷酸变异位点,根据DNAMAN软件和Chromas软件的序列比对结果对哈萨克羊与萨福克羊的遗传多态性进行研究分析,总结基因型分布规律,对相关突变位点进行绵羊肺炎支原体感染性的相关性分析。结果:(1)通过对新疆伊犁地区部分规模化羊场绵羊肺炎支原体血清学调查发现,新疆伊犁地区不同绵羊品种之间均存在不同程度的绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,MO)感染。伊犁地区部分规模化羊场的MO-Ab阳性率为14.88%,MO-Ag阳性率为21.00%,其中哈萨克羊MO-Ab阳性率26.00%,MO-Ag阳性率22.91%;萨福克羊MO-Ab阳性率7.34%,MO-Ag阳性率19.71%。(2)分析nlrp3基因非编码区SNP位点,筛选出C38233659T、C38233866T、T38233881C、A38188131C、G38188003A、T38188153C、A38188237C共7个非编码区SNP位点,其中3′UTR的C38233659T位点检测到碱基突变C→T,两个绵羊品种均检测到CC、CT、TT三种基因型,其中萨福克羊的优势基因型为CC,优势等位基因为C;同样在3′UTR的C38233866T位点检测到碱基突变C→T,两个绵羊品种均检测到CC、CT、TT三种基因型,哈萨克羊与萨福克羊的优势基因型均为CC,优势等位基因均为C;但3′UTR的T38233881C位点只在哈萨克羊群体中发现碱基突变T→C,优势基因型为TT,优势等位基因为T。在5′UTR的A38188131C位点检测到碱基突变A→C,两个绵羊品种均检测到AA、AC、CC三种基因型,哈萨克羊与萨福克羊的优势基因型均为AA,优势等位基因均为A;在5′UTR的G38188003A位点检测到碱基突变G→A,两个绵羊品种均检测到GG、GA、AA三种基因型,哈萨克羊与萨福克羊的优势基因型均为GG,优势等位基因均为G。另外在5′UTR的T38188153C位点检测到碱基突变T→C,优势基因型为TT,优势等位基因为T;在5′UTR的A38188237C位点检测到碱基突变A→C,优势基因型为AA,优势等位基因为A,以上两个位点的突变只出现在萨福克羊群体中,在哈萨克羊群体中并未发现。在nlrp3基因5′UTR的A38188131C位点上哈萨克羊MO-Ag阳性和MO-Ag阴性的基因型频率存在显著性差异(Pnlrp3基因5′UTR的A38188131C位点可能与哈萨克羊MO易感性有相关性,因此可以将该位点作为绵羊肺炎支原体易感性的分子遗传标记位点,这为抗绵羊肺炎支原体新品系的选育提供理论支撑。

关键词：绵羊支原体肺炎绵羊肺炎支原体 nlrp3基因非编码区SNP位点血清学调查

nlrp3基因多态性与中国北方汉族人群帕金森病的相关性研究

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NLRP3基因多态性与中国北方汉族人群帕金森病的相关性研究

作者：王慧敏青岛大学

学位级别：硕士

目的:研究发现先天免疫和炎症反应在帕金森氏病(Parkinson’s disease,PD)发病机制中起着至关重要的作用。核苷酸结合域样受体蛋白3(Nucleotide-binding domainlike receptor protein 3,nlrp3)炎性小体是最常见且研究最多的炎性小体,NL... 详细信息

目的:研究发现先天免疫和炎症反应在帕金森氏病(Parkinson’s disease,PD)发病机制中起着至关重要的作用。核苷酸结合域样受体蛋白3(Nucleotide-binding domainlike receptor protein 3,nlrp3)炎性小体是最常见且研究最多的炎性小体,nlrp3的介导的神经炎症可引起中脑多巴胺神经元变性,对PD的发病起着重要的作用。组织学研究发现nlrp3在帕金森病患者的中脑神经元中表达升高。我们假设nlrp3基因多态性可能与帕金森病的发病风险有关,本文旨在探讨nlrp3(rs10754558,rs4612666及rs7525979)基因多态性与中国北方汉族人群PD发病风险的相关性。方法:采用病例对照研究,将400例PD患者(病例组)及400例健康对照者(对照组)纳入研究,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术检测两组受试者nlrp3基因位点rs10754558、rs4612666和rs7525979的基因型。使用SPSS21.0统计软件进行统计学分析,计量资料采用两独立样本的t检验;计数资料采用卡方检验。基因型与PD的相关性使用Logistic回归分析。用比值比(OR)以及95%的置信区间(CI)表示相对危险度。P小于0.05表示差异具有统计学意义。结果:对于rs4612666位点来说,PD组的等位基因T和C分布与对照组相比,差异具有统计学意义(P=0.021),C等位基因频率在病例组(47%)低于对照组(52.8%),在两组之间差异具有统计学意义,可能降低帕金森病的发病风险(OR 0.794,95%CI0.653-0.967,P=0.021)。Rs4612666 CC基因型携带者比TT基因型携带者患帕金森病的风险降低(p=0.019)。隐性遗传模型CC/TT+CT分布在病例组与对照组之间差异具有统计学意义,与TT+CT基因型携带者相比,CC基因型携带者患帕金森病的风险更低(OR 0.667,95%CI 0.481-0.925,P=0.015)。亚组分析中,校正年龄因素,女性PD组等位基因分布及等位基因频率分布与对照组相比差异具有统计学意义(p=0.003,p=0.018)。此外,女性PD C等位基因频率较对照组显著降低(OR 0.644,95%CI 0.481-0.863,p=0.003)。校正性别因素,早发PD的等位基因频率与对照组相比差异具有统计学意义,早发型PD C等位基因较对照组显著降低(OR 0.636,95%CI 0.437-0.926,p=0.018)。在隐性遗传模式分析下,与对照组相比,女性PD与早发PD均存在显著差异(p=0.002,p=0.013)。然而,rs10754558和rs7525979位点的基因型分布和等位基因频率在PD组与对照组比较均无统计学差异(P>0.05),而且在两种遗传模型分析中未发现统计学意义。本研究发现nlrp3基因三个位点的构建的单倍体模型中无强连锁不平衡,而且在PD组与对照组之间无统计学意义。结论:nlrp3基因多态性可能与PD的发病风险有关,nlrp3 rs4612666的突变型可能是中国北方汉族人群散发PD的保护性性因素。在亚组分析中可以发现,rs4612666与女性PD以及早发PD发病风险有关,rs4612666 C等位基因携带者可能会降低的中国北方汉族女性以及早发人群的发病风险。

关键词：帕金森病 nlrp3基因单核苷酸多态性

nlrp3基因rs10754558和rs2027432位点多态性与中国汉族人群子痫前期遗传易感性的相关性研究

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NLRP3基因rs10754558和rs2027432位点多态性与中国汉族人群子痫前...

作者：李赛青岛大学

学位级别：硕士

目的检测中国汉族人群nlrp3基因rs10754558、rs2027432位点单核苷酸多态性分布情况,探讨两位点多态性与子痫前期(preeclamsia,PE)遗传易感性的相关性。方法运用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测1024例子痫前期患者和1194例正常... 详细信息

目的检测中国汉族人群nlrp3基因rs10754558、rs2027432位点单核苷酸多态性分布情况,探讨两位点多态性与子痫前期(preeclamsia,PE)遗传易感性的相关性。方法运用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测1024例子痫前期患者和1194例正常妊娠孕妇的nlrp3基因rs10754558、rs2027432位点多态性分布。采用χ检验对各个SNP位点在病例组和对照组的基因型及等位基因频率分布进行统计学分析。采用方差分析对病例组进行基因型-表型相关性分析。结果nlrp3基因rs10754558位点的基因型频率在病例组和对照组之间有差别(χ2=9.97,P=0.007)。除此之外,该位点的基因型分布与重度子痫前期以及晚发型子痫前期有关联。(重度子痫前期组:χ2=8.53 P=0.01;晚发型子痫前期组:χ2=9.24,P=0.01)。然而,nlrp3基因rs2027432位点的基因型和等位基因分布在子痫前期组和对照组之间无差别(基因型:χ2=0.17,P=0.92;等位基因:χ2=2.26,P=0.13,OR=0.90,95%CI0.79-1.03)。结论nlrp3基因rs10754558位点多态性与子痫前期的发生有关联。该基因的另一个位点rs2027432多态性与子痫前期无关联。

关键词： nlrp3基因子痫前期单核苷酸多态性基因分型

山羊nlrp3基因的克隆及其在DF-1细胞中的表达

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中国兽医科学 2015年第4期45卷 423-428页

作者：张凯照叶锦辉于梦王晴楠刘健新陶攀亓文宝宁章勇华南农业大学兽医学院广东广州510642

为了解山羊nlrp3基因及其编码蛋白的生物学信息,采用RT-PCR扩增了海南黑山羊nlrp3基因并进行了序列及其编码蛋白的结构分析,构建了pIRES2-EGFP-nlrp3真核表达载体,并将其转染至DF-1细胞中进行了表达。结果表明,nlrp3基因在物种内的同源... 详细信息

为了解山羊nlrp3基因及其编码蛋白的生物学信息,采用RT-PCR扩增了海南黑山羊nlrp3基因并进行了序列及其编码蛋白的结构分析,构建了pIRES2-EGFP-nlrp3真核表达载体,并将其转染至DF-1细胞中进行了表达。结果表明,nlrp3基因在物种内的同源性高,种间同源性低,编码的蛋白由1 031个氨基酸组成,存在3个潜在跨膜区,分别为第401~419、435~453和884~904位氨基酸,不含信号肽;辣根过氧化物酶单层细胞免疫化学检测证实,构建的真核表达载体pIRES2-EGFP-nlrp3在DF-1细胞中成功表达。本研究结果为建立nlrp3专性表达细胞系及深入研究nlrp3在山羊抗感染免疫的机制奠定了基础。

关键词：海南黑山羊 nlrp3基因序列分析真核表达

中国汉族人群nlrp3基因多态性与结肠癌的相关性研究

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中国细胞生物学学报 2014年第1期36卷 81-85页

作者：任晓军赵铭段峰王晓峰张燕宋哲伟上海市闵行区吴泾医院外科上海200241

该实验研究nlrp3基因多态性与中国汉族人群结肠癌之间的相关性。采用TaqMan检测法对中国汉族人群208例结肠癌患者和203名正常对照nlrp3的3个位点(rs4925648、rs10754558、rs10925019)进行关联分析,并使用SPSS软件进行单核苷酸多态性分析... 详细信息

该实验研究nlrp3基因多态性与中国汉族人群结肠癌之间的相关性。采用TaqMan检测法对中国汉族人群208例结肠癌患者和203名正常对照nlrp3的3个位点(rs4925648、rs10754558、rs10925019)进行关联分析,并使用SPSS软件进行单核苷酸多态性分析,比较病例组和对照组等位基因频率、基因型频率及单倍型的差异。结果发现,nlrp3上三个位点基因频率、基因型频率两组间差异不明显(P>0.05)。rs4925648与rs10925019的LD分析其D’值较大(D’=0.798)。但进一步对两位点的单倍型分析发现其各种组合均无统计学差异。该研究结果提示,nlrp3基因的三个位点与中国汉族人群结肠癌的发生相关性无统计学意义。

关键词：结肠癌 nlrp3基因单核苷酸多态性关联分析

miR-22靶向抑制nlrp3基因对冠心病内皮细胞炎症损伤的保护作用

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安徽医科大学学报 2018年第5期53卷 668-675页

作者：胡波张晓刚李德才四川绵阳四0四医院心内科绵阳621000 重庆医科大学附属第一医院心内科渝中630014

目的探讨miR-22靶向nlrp3基因对冠心病内皮细胞炎症损伤的影响。方法构建动脉粥样硬化(AS)大鼠模型,分离大鼠原代冠状动脉内皮细胞,培养并鉴定,用同型半胱氨酸(HCY)对细胞共孵育24 h,进行冠心病应激,细胞分组。双荧光素酶报告基因验证mi... 详细信息

目的探讨miR-22靶向nlrp3基因对冠心病内皮细胞炎症损伤的影响。方法构建动脉粥样硬化(AS)大鼠模型,分离大鼠原代冠状动脉内皮细胞,培养并鉴定,用同型半胱氨酸(HCY)对细胞共孵育24 h,进行冠心病应激,细胞分组。双荧光素酶报告基因验证miR-22和nlrp3的靶向关系。实时荧光定量PCR和Western blot检测心肌组织和各组细胞中miR-22和nlrp3、caspase-1水平。MTT法检测细胞活力。Hochest 33258染色检验细胞凋亡。ELISA检测白介素(IL)-1β、IL-6、IL-10和IL-18炎症因子表达。结果与正常组大鼠相比,AS组大鼠血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)、Ca2+水平均明显升高(Pnlrp3、caspase-1 mRNA及nlrp3、caspase-1蛋白水平显著上调(Pnlrp3证实为miR-22的靶基因。与空白对照组细胞相比,miR-22 mimic组的nlrp3、caspase-1 mRNA及nlrp3、caspase-1蛋白水平下降,细胞活力增强,细胞凋亡率下降,IL-1β、IL-6和IL-18炎症因子表达水平下调,IL-10表达水平上调(Pnlrp3、caspase-1 mRNA及nlrp3、caspase-1蛋白水平上调,细胞活力降低,细胞凋亡率上升,IL-1β、IL-6和IL-18炎症因子表达水平上升,IL-10表达水平下降(Pnlrp3基因,减少冠心病大鼠心肌微血管内皮细胞凋亡及下调促炎症因子的表达,发挥对大鼠心肌微血管内皮细胞的保护作用。

关键词：冠心病 miR-22 nlrp3基因内皮细胞炎症因子

猪nlrp3基因克隆及其在DF-1细胞的表达

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中国兽医学报 2017年第4期37卷 735-740页

作者：陶攀张凯照刘健新王晴楠于梦宁章勇华南农业大学兽医学院广东广州510642

nlrp3蛋白作为nlrp3炎性小体的主要组成蛋白之一,在机体对抗病原微生物和炎症反应中起着重要作用。为了深入研究猪的nlrp3蛋白在炎性疾病发生过程中的作用机制,采用PCR的方法扩增了长白猪nlrp3基因,并对其序列和编码蛋白的结构进行了分... 详细信息

nlrp3蛋白作为nlrp3炎性小体的主要组成蛋白之一,在机体对抗病原微生物和炎症反应中起着重要作用。为了深入研究猪的nlrp3蛋白在炎性疾病发生过程中的作用机制,采用PCR的方法扩增了长白猪nlrp3基因,并对其序列和编码蛋白的结构进行了分析。构建了pIRES2-EGFP-nlrp3真核表达载体,并转染至DF-1细胞中进行表达。结果显示,该基因表现出种属内保守性和种属间差异性,编码蛋白由1 036个氨基酸构成,存在4个潜在跨膜区,分别是第401~419,第721~739,第775~795和第889~910位氨基酸,不含信号肽。单层细胞免疫化学检测结果显示,重组质粒pIRES2-EGFP-nlrp3成功转染并在细胞中表达。本研究为深入探讨炎症小体在猪炎症性疾病的作用机制提供了基础数据。

关键词：猪 nlrp3基因真核表达单层细胞免疫化学