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耐碳青霉烯类大肠埃希菌分子流行病学研究

热带医学杂志 2024年第3期24卷 350-354页

作者：龚林刘尔男梁建生王一梅陈晓敏刘小丽武汉市疾病预防控制中心消毒与病媒生物防制所湖北武汉430000

目的调查武汉市三家医院耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CREC)耐药基因携带情况及其分子流行病学特点。方法收集2018年7月-2021年5月武汉市第一医院、武汉市中心医院、武汉市黄陂区人民医院共62株临床分离的CREC,采用全自动细菌鉴定及药敏分析... 详细信息

目的调查武汉市三家医院耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CREC)耐药基因携带情况及其分子流行病学特点。方法收集2018年7月-2021年5月武汉市第一医院、武汉市中心医院、武汉市黄陂区人民医院共62株临床分离的CREC,采用全自动细菌鉴定及药敏分析系统测定细菌的药物敏感性,碳青霉烯酶诺德曼-珀尔(Carba NP)试验对碳青霉烯酶型确证,全基因组测序分析菌株耐药基因、质粒携带情况以及多位点序列分型(MLST)情况。结果Carba NP试验结果表明,所有菌株产碳青霉烯酶的比例为32.3%(20/62)。20株Carba NP试验阳性菌株均产新德里金属酶(ndm),其中15株产ndm-5,5株产ndm-1,未检出其他碳青霉烯酶耐药基因;所有菌株同时还携带了超广谱β-内酰胺酶基因(bla_(TEM)或bla_(CTX-M))、氨基糖苷类耐药基因aacA、大环内酯类耐药基因(mph或mdf)、甲氧苄啶耐药基因dfrA以及四环素耐药基因tet;20株细菌检出12种序列分型(ST),主要为ST410(n=4)、ST131(n=3)和ST167(n=3),无明显优势菌株;所有菌株都携带1~6个质粒,大多为3~4个。结论本研究检出产ndm的CREC,bla_(ndm)基因在菌株间可能存在克隆传播和水平传播并存的现象。

关键词：碳青霉烯酶大肠埃希菌 ndm 全基因组测序

The role of wildlife (wild birds)in the global transmission of antimicrobial resistance genes

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Zoological Research 2017年第2期38卷 55-80页

作者： Jing Wang Zhen-Bao Ma Zhen-Ling Zeng Xue-Wen Yang Ying Huang Jian-Hua Liu College of Veterinary Medicine South China Agricultural University Guangzhou 510642 China

Antimicrobial resistance is an urgent global health challenge in human and veterinary medicine. Wild animals are not directly exposed to clinically relevant antibiotics; however, antibacterial resistance in wild animals has been increasingly reported worldwide in parallel to the situation in human and veterinary medicine. This underlies the complexity of bacterial resistance in wild animals and the possible interspecies transmission between humans, domestic animals, the environment, and wildlife. This review summarizes the current data on expanded- spectrum 13-1actamase （ESBL）, AmpC IB-lactamase, carbapenemase, and colistin resistance genes in Enterobacteriaceae isolates of wildlife origin. The aim of this review is to better understand the important role of wild animals as reservoirs and vectors in the global dissemination of crucial clinical antibacterial resistance. In this regard, continued surveillance is urgently needed worldwide.

关键词： AmpC ESBLs IMP, mcr-1 ndm Wild birds

pH effect of· OH radical induced oxidation of phosphoryl- methionine in aqueous solution

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Chinese Science Bulletin 1997年第4期42卷 296-301页

作者： CHUGaosheng, YAO Side, ZHANG Zhicheng, ZHANG Manwei and WANG Wenfeng1.Department of Applied Chemistry, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China 2 Shanghai Institute of Nuclear Research, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 201800, China Department of Applied Chemistry University of Science and Technology of China Hefei China Shanghai Institute of Nudear Research Chinese Academy of Sciences Shanghai China

STUDIES of radiation chemistry on methionine (Met) were very active in previous years because of its actions of radioprotection to biological systems by quenching·OH radicals. On the other hand, people have paid more and more attention to the researches on the phosphorylation of the biological polymolecules. It is wall known that phosphate ester is regarded as the deposi-

关键词： pulse radiolysis ndm a-amino radical pH effect.

2017-2021年某儿科医院耐碳青霉烯类革兰阴性菌综合干预感控措施效果及其耐药基因

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中华医院感染学杂志 2023年 410-415页

作者：殷丽军武娜娜缪瑾杨韦菁何磊燕陆国平曹云王来栓翟晓文王传清复旦大学附属儿科医院院内感染控制与防保科复旦大学附属儿科医院血液科复旦大学附属儿科医院新生儿科复旦大学附属儿科医院儿科重症监护室复旦大学附属儿科医院临床检验中心细菌室复旦大学附属儿科医院新生儿重症监护室

目的评估儿科医院感染高风险部门(新生儿科、新生儿重症监护室、儿科重症监护病房、血液科)耐碳青霉烯类革兰阴性菌(CR-GNB)综合干预措施效果及其耐药基因。方法选取2017-2021年复旦大学附属儿科医院感染高风险部门患儿为研究对象,2017... 详细信息

目的评估儿科医院感染高风险部门(新生儿科、新生儿重症监护室、儿科重症监护病房、血液科)耐碳青霉烯类革兰阴性菌(CR-GNB)综合干预措施效果及其耐药基因。方法选取2017-2021年复旦大学附属儿科医院感染高风险部门患儿为研究对象,2017年开始对上述患儿入院后48h以内以及住院期间每周一次在上呼吸道和肠道进行主动筛查,2018年1月开始对主动筛查及临床送检标本检出CR-GNB阳性患儿实施集中安置,比较CR-GNB主动筛查率、定植率、集中安置率以及医院感染率的变化;同时通过聚合酶链式反应(PCR)检测耐碳青霉烯酶基因对其耐药机制进行研究。结果2017-2021年肛咽拭子CR-GNB主动筛查率均逐年增加(P7d的患儿CR-GNB定植率呈现下降趋势(Pndm-1(52.00%,26/50)、blaKPC-2(42.00%,21/50)和blaDHA-1(26.00%,13/50),耐碳青霉烯类鲍氏不动杆菌均检出blaOXA-23耐药基因,仅有3株耐碳青霉烯的铜绿假单胞菌检出耐药基因,1株为blaBIC,2株为blaVIM-2。结论对感染高风险部门进行CR-GNB主动筛查及A/B等级的隔离安置措施能降低CR-GNB定植及医院感染率。

关键词：主动筛查病人安置耐碳青霉烯类革兰阴性菌定植 KPC ndm OXA-23 综合干预感控措施感染监测

免疫层析法NG-Test CARBA 5对产碳青霉烯酶肠杆菌筛查价值的Meta分析

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中国抗生素杂志 2022年第12期47卷 1331-1335页

作者：蔡淑梅刘伊楚张胜行陈坤陈娟中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院福建省适配体技术重点实验室福州350025

目的评价免疫层析法NG-Test CARBA 5筛查碳青霉烯酶分型KPC、ndm、VIM、IMP和OXA48筛查价值。方法计算机检索PubMed(2008.01-2020.12)数据库、ISI Web of Knowledge(2008.01-2020.12)数据库、中文期刊全文数据库(2008.01-2020.12)、中文科技期刊数据库(2008.01-2020.12)、万方数据库(2008.01-2020.12),利用手工检索,2名评价员严格依据纳入排除标准收集NGTest CARBA 5筛查碳青霉烯酶分型的试验。依据QUADAS质量评价标准评价纳入研究的质量,后用Meta-Disc软件对数据进行Meta分析。结果最后纳入8个研究文献,一共纳入1634例菌株。Meta分析结果显示:NG-Test CARBA 5筛查碳青霉烯酶,包含KPC、ndm、VIM、IMP、OXA48合并敏感性和特异性分别为99.7%和100%、98.6%和100%、97.6%和100%、92.6%和100%、100%和99.8%。结论NG-Test CARBA 5筛查KPC、ndm、VIM、IMP、OXA485种碳青霉烯酶具有高敏感性和特异性,适用于临床。

关键词：碳青霉烯酶测序 NG-Test CARBA 5 Meta分析 KPC ndm VIM IMP OXA48 肠杆菌

某三级医院主要耐碳青霉烯肠杆科细菌临床特征、同源性、耐药机制和耐药传播研究

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某三级医院主要耐碳青霉烯肠杆科细菌临床特征、同源性、耐药机制...

作者：白婧山西医科大学

学位级别：硕士

目的:1.研究某三级医院大肠埃希菌、阴沟肠杆菌和肺炎克雷伯菌三种主要CRE的临床特点、疾病转归、同源性和耐药机制,为我院治疗及控制CRE感染提供理论依据。2.研究新序列型ST1613并且同产KPC及ndm耐碳青霉烯阴沟肠杆菌耐药基因及耐药传... 详细信息

目的:1.研究某三级医院大肠埃希菌、阴沟肠杆菌和肺炎克雷伯菌三种主要CRE的临床特点、疾病转归、同源性和耐药机制,为我院治疗及控制CRE感染提供理论依据。2.研究新序列型ST1613并且同产KPC及ndm耐碳青霉烯阴沟肠杆菌耐药基因及耐药传播情况,为新序列型感控提供理论依据。3.研究4株同产KPC和ndm的CRKP菌株的耐药和毒力特征及耐药传播情况,为控制我院耐药基因水平传播提供依据。方法:1.2019年10月至2021年4月期间,在山西医科大学附属第二医院搜集大肠埃希菌、阴沟肠杆菌和肺炎克雷伯菌三种主要CRE。菌株鉴定使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)。使用微量肉汤稀释法和琼脂倍比稀释法进行药敏试验。使用改良的碳青霉烯酶灭活试验(Modified Carbapenem Inactivation Method,m CIM)检测碳青霉烯酶。使用多位点序列分型(Multi-locus sequence typing,MLST)研究CRE菌株的同源性。使用PCR扩增耐药基因并对扩增序列进行Sanger测序。2.对第一部分同时含有KPC和ndm的新序列型ST1613阴沟肠杆菌使用Nanopore测序对基因组进行测序并进行接合试验。对染色体及质粒绘制基因组圈图,综合分析基因组和耐药基因特征。3.从4名患者中分离出4株同产KPC和ndm的CRKP菌株。通过电子病历收集4例患者的人口统计学、临床特征及疾病转归情况。对4株CRKP菌株进行药敏试验、生物膜形成试验、血清杀菌试验和接合试验。采用全基因测序对4株CRKP的耐药基因、毒力基因以及接合子耐药基因进行检测。结果:1.临床特征共检出51株非重复CRE菌株,大肠埃希菌有17株(17/51,33.3%),阴沟肠杆菌有13株(13/51,25.5%),肺炎克雷伯菌为21株(21/51,41.2%)。标本来源排前三位的是痰液(41%)、粪便(24%)和血液(20%)。感染部位排前三位的是肺部感染(41%)、肠道感染(23%)和血流感染(20%)。其中41例患者好转(41/51,80%),10例患者治疗失败(放弃治疗或死亡)(10/51,20%)。2.药敏结果51株菌株对美罗培南及亚胺培南100%耐药。CRE菌株对头孢哌酮舒巴坦、氨曲南和左氧氟沙星有较高耐药率(98%、82%和98%)。但所有CRE菌株对粘菌素和替加环素敏感。3.改良的碳青霉烯酶灭活试验(m CIM)结果51株CRE菌株中41株产金属酶(41/51,80.4%),5株产丝氨酸酶(5/51,9.8%),5株不产酶(5/51,9.8%)。大肠埃希菌中产金属酶有15株占88.2%,产丝氨酸酶1株占5.9%;所有阴沟肠杆菌都产金属酶;肺炎克雷伯菌产金属酶有13株占62%,产丝氨酸酶有4株占19%。4.多位点序列分型结果17株耐碳青霉烯大肠埃希菌(CREC)有10种ST型,其中ST2占主导;13株耐碳青霉烯阴沟肠杆菌(CRECL)共有6种ST型,其中ST114占主导;21株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)共有12种ST型,其中ST11占主导。阴沟肠杆菌中ST1938和ST1613,肺炎克雷伯菌中ST5647为新的ST型。同源性分析结果显示,大肠埃希菌中ST2与ST1006为起源型ST型;阴沟肠杆菌中ST114为起源型ST型;肺炎克雷伯杆菌中ST11与ST485为起源型ST型。大肠埃希菌、阴沟肠杆菌与肺炎克雷伯菌序列型呈现多样性。5.耐药基因监测结果51株CRE碳青霉烯酶基因分离率为90.2%(46/51)。大肠埃希菌中ndm占93.75%(15/16);阴沟肠杆菌中ndm占100%(13/13);肺炎克雷伯菌中ndm占76.5%(13/17),KPC占47.1%(8/17)。同产KPC和ndm的有11株(21.6%,11/51)。32株含ESBL基因(62.7%,32/51),在CREC,CRECL,CRKP中占比分别为(58.8%,53.8%,52.4%)。6.我们报告了一株新序列型ST1613阴沟肠杆菌的完整基因组序列,染色体上携带多种耐药基因和外排泵基因。7.ST1613阴沟肠杆菌携带五个质粒,其中三个质粒比对成功,p BJ081属于Inc U型,p BJ083属于Inc FII型,p BJ084属于Inc X3型。ST1613阴沟肠杆菌中p BJ081和p BJ084含有耐药基因。p BJ081质粒上含有超广谱β-内酰胺酶基因(TEM-1),大环内酯类耐药基因(Mrx、mph A)、氨基糖苷类耐药基因(aad A12、AAC(3)-IIa、aac(6?)-Ib10)、氟喹诺酮类耐药基因(pat A、Qnsr1)和磺胺类;耐药基因(sul1)。p

关键词：耐碳青霉烯肠杆科细菌全基因组测序 KPC ndm 质粒

替加环素耐药基因tet(X3)和tet(X4)在活禽市场工人肠道微生物及周围环境中的发现

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Science Bulletin 2020年第5期65卷 340-342页

作者：王亚楠刘飞朱宝利高福 College of Animal Science and Veterinary Medicine Henan Agricultural UniversityZhengzhou 450046China CAS Key Laboratory of Pathogenic Microbiology and Immunology Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesBeijing 100101China Chinese Center for Disease Control and Prevention(China CDC) Beijing 102206China

替加环素耐药基因tet(X3)和tet(X4)的出现和传播对公共卫生造成了严重威胁.本文在活禽市场工人的肠道菌群及周围环境样本中检测到tet(X3),tet(X4)和碳青霉烯类基因(如ndm和IMP).研究结果表明,替加环素耐药基因tet(X3)和tet(X4)已经传播... 详细信息

替加环素耐药基因tet(X3)和tet(X4)的出现和传播对公共卫生造成了严重威胁.本文在活禽市场工人的肠道菌群及周围环境样本中检测到tet(X3),tet(X4)和碳青霉烯类基因(如ndm和IMP).研究结果表明,替加环素耐药基因tet(X3)和tet(X4)已经传播至活禽市场环境及健康人的肠道菌群中,很可能从活禽市场进一步传播给消费者、动物及各种生态环境甚至临床相关的病原体.

关键词：耐药基因 ndm 活禽市场 X3 X4 tet 替加环素肠道微生物周围环境

抗菌肽协同抑制大肠杆菌O157:H7的活性研究及其在鲜切蔬菜中的应用

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抗菌肽协同抑制大肠杆菌O157:H7的活性研究及其在鲜切蔬菜中的应用

作者：夏学峰江苏大学

学位级别：硕士

大肠杆菌O157:H7(E.coli O157:H7)是一种常见的食源性病原菌,因其致病性强、易传播的特点,对食品安全构成严重威胁。并且,携带新德里金属β-内酰胺酶(ndm)“超级细菌”的出现使大肠杆菌O157:H7的防控和治疗难度大大增加。抗菌肽(AMPs)... 详细信息

大肠杆菌O157:H7(E.coli O157:H7)是一种常见的食源性病原菌,因其致病性强、易传播的特点,对食品安全构成严重威胁。并且,携带新德里金属β-内酰胺酶(ndm)“超级细菌”的出现使大肠杆菌O157:H7的防控和治疗难度大大增加。抗菌肽(AMPs)具有广谱抑菌活性,独特的多靶点作用机制可有效抑制多重耐药菌株,并且不易导致细菌产生抗性,然而,由于成本和毒性等问题限制了抗菌肽在食品领域的推广应用。为此,本文试图通过协同使用抗菌肽的方式,降低抗菌肽的使用量,以取得抑菌活性和毒性之间的平衡。首先我们用携带ndm的大肠杆菌O157:H7和多株具有不同病原学特征的大肠杆菌O157:H7筛选出高选择性的抗菌肽,然后研究了抗菌肽之间的协同抑菌活性和膜作用特征,随后评价其稳定性以确定适用范围,最后将其应用到生菜和黄瓜中,验证其实际抑菌效果和对食品感官品质的影响。主要研究结果如下:(1)从12种抗菌肽中筛选出选择指数最高的thanatin和BF-15a3,对3株大肠杆菌O157:H7最低抑菌浓度的几何平均值分别为4和10μg/m L,在128μg/m L时溶血率小于5%。(2)抗菌肽thanatin和BF-15a3对44株大肠杆菌O157:H7的抑菌活性几乎不受其病原学特征影响,MIC范围分别为2-8μg/m L和4-32μg/m L。用于测试的44株大肠杆菌O157:H7中有93.18%携带stx2(同时还携带eae或hly中至少一种),毒力较强;分属于ST11、ST4429和ST1423三种ST型和19种PT型,以ST11为主要优势克隆,具有显著的多态性;其中36株显示出对9种抗菌药物中至少一种的抗药性,耐药情况较严重。(3)棋盘抑菌试验中thanatin和BF-15a3对大肠杆菌O157:H7表现出协同抑菌作用,组合使用的最低抑菌浓度降低至单独使用时的1/4或1/8。组合使用不会导致溶血活性或细胞毒性的增强,而且不易诱导细菌产生耐药性。(4)杀菌动力学结果表明更低浓度的thanatin和BF-15a3组合能够快速杀灭大肠杆菌O157:H7。研究了抗菌肽协同对大肠杆菌的膜作用机制,结果表明thanatin和BF-15a3组合可破坏细胞膜完整性,二者协同增加大肠杆菌的外膜和内膜通透性,导致胞内离子和细胞质外泄,ROS含量增加,最终导致细菌死亡。(5)稳定性测试结果表明thanatin和BF-15a3的抑菌活性易受血清、模拟胃肠液、高浓度盐的影响而降低,而对高温、生理浓度盐、中性及碱性环境的耐受性较强,适宜在4℃或-20℃长期储存。(6)抗菌肽组合处理能够显著抑制储存期间鲜切生菜、黄瓜表面大肠杆菌O157:H7的生长,并且不会影响食品的感官品质。

关键词：大肠杆菌O157:H7 耐药性 ndm 抗菌肽协同作用

Oracle Spatial ndm路网模型构建及应用

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测绘科学 2014年第5期39卷 27-31页

作者：程立君王发良崔少芳北京吉威时代软件股份有限公司北京100043 国家基础地理信息中心北京100830

地理国情普查提出构建"道路网专题数据库",但目前还没有针对国情普查道路网络模型相关研究。本文根据地理国情普查道路数据采集技术规范,基于前期汇交的试点数据,提出了地理国情普查道路网的概念模型和逻辑模型;并利用Oracle Spatial ND... 详细信息

地理国情普查提出构建"道路网专题数据库",但目前还没有针对国情普查道路网络模型相关研究。本文根据地理国情普查道路数据采集技术规范,基于前期汇交的试点数据,提出了地理国情普查道路网的概念模型和逻辑模型;并利用Oracle Spatial ndm网络数据模型,对地理国情普查道路网进行了物理设计;初步分析了道路网构建的方法和步骤,分别利用ndm函数和ArcGIS网络分析工具对道路网数据进行应用分析验证。研究表明,利用Oracle Spatial ndm能满足地理国情普查道路网的存储与应用需求;同时,ndm的开放性也能满足其他GIS平台的应用扩展。

关键词：地理国情普查 Oracle Spatial ndm 道路网模型网络数据分析