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Exploring novel candidate genes from the mouse genome informatics database: Potential implications for avian migration research

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Integrative Zoology 2016年第4期11卷 240-249页

作者： Andrea CONTINA Eli S.BRIDGE Jeffrey F.KELLY Oklahoma Biological Survey University of OklahomaNormanOklahomaUSA Department of Biology University of OklahomaNormanOklahomaUSA

To search for genes associated with migratory phenotypes in songbirds,we selected candidate genes through annotations from the mouse genome informatics database and assembled an extensive candidate-gene ***,we implemented a next-generation sequencing approach to obtain DNA sequences from the Painted Bunting *** focused on those sequences that were conserved across avian species and that aligned with candidate genes in our mouse *** genotyped short sequence repeats from the following candidate genes:ADRA1d,ANKRD17,CISH and *** studied the possible correlations between allelic variations occurring in these novel candidate migration genes and avian migratory phenotypes available from the published lit*** found that allele variation at MYH7 correlated with a calculated index of speed of migration(km/day)across 11 species of *** highlight the potential of the mouse genome informatics database in providing new candidate genes that might play a crucial role in regulating migration in birds and possibly in other *** research effort shows the benefits and limitations of working with extensive genomic datasets and offers a snapshot of the challenges related to cross-species validation in behavioral and molecular ecology studies.

关键词： avian migration candidate gene approach mouse genome informatics MYH7 songbirds

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