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鸡myf6基因遗传多态性及其遗传效应研究

遗传 2008年第1期30卷 71-76页

作者：孙文浩朱庆蒋小松杜华锐四川农业大学动物科技学院雅安625014 四川省畜牧科学研究院成都610066 大恒家禽育种有限公司成都610066

采用测序和单链构象多态(SSCP)的方法分析了myf6基因在5个优质肉鸡纯系和3个杂交配套系中的遗传分布、遗传变异及群体杂合性等群体遗传信息,并分析了myf6基因对胴体性状及肉质性状的遗传效应。结果发现该基因的CDS区域非常保守,仅在外显... 详细信息

采用测序和单链构象多态(SSCP)的方法分析了myf6基因在5个优质肉鸡纯系和3个杂交配套系中的遗传分布、遗传变异及群体杂合性等群体遗传信息,并分析了myf6基因对胴体性状及肉质性状的遗传效应。结果发现该基因的CDS区域非常保守,仅在外显子1的47位处发生点突变由G→A,由于人工选育的原因,该基因不同基因型的分布在2个优质肉鸡纯系中偏离了Hardy-Weinberg平衡,并且杂合度较低,遗传一致性较高,但在3个杂交配套系中仍都服从Hardy-Weinberg平衡,杂合度较高,达到了配套杂交的目的。野生型A基因可显著地提高活重、屠体重、胸肌重和腿肌重(P基因对增加活重、屠体重、胸肌重和腿肌重的加性效应值分别为45.54g,41.03g,6g和9.775g;对增加肌纤维直径和肌纤维密度的加性效应值分别为1.025μm和-29.99mm2。

关键词：鸡 myf6基因遗传结构产肉量肌肉嫩度

绵羊myf6基因多态性对胴体瘦肉性状的影响

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2022年第3期50卷 10-16页

作者：鲁玉洁周辉通柯娜王继卿黄兆春梁维炜甄慧敏罗玉柱刘秀李少斌甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室甘肃省牛羊基因改良工程实验室甘肃兰州730070 新西兰林肯大学农业与生命科学学院新西兰林肯7647

【目的】研究绵羊生肌因子6(myogenic factor 6,myf6)基因的多态性,分析其对羔羊胴体瘦肉性状的影响。【方法】以215只新西兰罗姆尼公羔为对象,采集其血样,屠宰后测定其后腿、腰部和肩部瘦肉量等胴体指标。提取血样基因组DNA,采用PCR-S... 详细信息

【目的】研究绵羊生肌因子6(myogenic factor 6,myf6)基因的多态性,分析其对羔羊胴体瘦肉性状的影响。【方法】以215只新西兰罗姆尼公羔为对象,采集其血样,屠宰后测定其后腿、腰部和肩部瘦肉量等胴体指标。提取血样基因组DNA,采用PCR-SSCP检测myf6基因5′UTR和第1外显子2个区域的多态性,分析核苷酸序列变异对羔羊胴体瘦肉性状的影响。采集绵羊乳腺、肝脏、心脏、背最长肌、脾脏、肺脏、卵巢和肾脏组织,以β-actin为内参基因,用RT-qPCR等方法检测myf6基因的相对表达量。【结果】在第1外显子区域,检测到1个SNP(c.129 C>T),有A和B 2种等位基因,存在AA和AB 2种基因型。在5′UTR区域检测到1个3 bp的碱基缺失(c.-589~-590 del ATA),有C和D 2种等位基因,存在CC和DD 2种基因型。2个区域的基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态。myf6基因第1外显子的基因型极显著影响了羔羊后腿、腰部和肩部3个部位的瘦肉量,以及总瘦肉量和腰部瘦肉比例(Pmyf6基因在绵羊乳腺、肝脏、心脏等8个组织中均有表达,但以背最长肌中的表达量最高(Pmyf6基因具有丰富的多态性,其基因型对胴体瘦肉性状有显著影响。

关键词：罗姆尼绵羊 myf6基因第1外显子胴体性状

巴美肉羊、小尾寒羊myf6基因多态性及其与肉质的相关性研究

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食品工业科技 2014年第5期35卷 126-129页

作者：郭月英任霆张静李婧袁倩程海星王乐靳烨内蒙古农业大学食品科学与工程学院内蒙古呼和浩特010018 包头市东河区食品药品监督管理局内蒙古包头市014000

实验采用聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP)方法对102只巴美肉羊、56只小尾寒羊的myf6基因片段进行多态性检测,分析myf6基因多态性与肉质的相关性。巴美肉羊和小尾寒羊在myf6基因片段上共检测到2种基因型AA和AB型,它们的基因型频... 详细信息

实验采用聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP)方法对102只巴美肉羊、56只小尾寒羊的myf6基因片段进行多态性检测,分析myf6基因多态性与肉质的相关性。巴美肉羊和小尾寒羊在myf6基因片段上共检测到2种基因型AA和AB型,它们的基因型频率分别为0.63、0.37和0.38、0.62;A、B的等位基因频率分别为0.81、0.19和0.69、0.31;多态信息含量分别为0.26和0.34,属中度多态。在巴美肉羊群体中,AA型,AB型的肉质指标无显著差异;在小尾寒羊群体中,小尾寒羊myf6的AA型与AB型在背最长肌处的红度值存在显著性差异(p<0.05)。

关键词：巴美肉羊小尾寒羊聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP) myf6基因肉质

努比亚山羊myf6基因的克隆及组织表达研究

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中国畜牧兽医 2021年第11期48卷 4084-4093页

作者：宋颖张叁保申玉建胡艳张瑜邹菊红徐建建连子童邹剑伟韦英明郑自华蒋钦杨广西大学动物科学技术学院南宁530004 广西大学农牧产业发展研究院南宁530004

研究旨在克隆努比亚山羊生肌因子6(myf6)基因,并对其进行生物信息学分析,检测myf6基因在努比亚山羊不同组织的表达差异以及努比亚山羊和隆林山羊背最长肌组织的表达差异。以努比亚山羊背最长肌组织cDNA为模板,PCR扩增获得myf6基因的完... 详细信息

研究旨在克隆努比亚山羊生肌因子6(myf6)基因,并对其进行生物信息学分析,检测myf6基因在努比亚山羊不同组织的表达差异以及努比亚山羊和隆林山羊背最长肌组织的表达差异。以努比亚山羊背最长肌组织cDNA为模板,PCR扩增获得myf6基因的完整编码区(CDS)后进行菌液验证,并进行序列相似性比对以及系统进化树构建;分析myf6蛋白理化性质并预测其亲/疏水性,预测蛋白二级结构和三级结构。采用实时荧光定量PCR检测myf6基因在努比亚山羊心脏、肝脏、脾脏、肾脏、背最长肌、皮下脂肪、瘤胃以及隆林山羊背最长肌中的表达。结果显示,努比亚山羊myf6基因CDS序列长729 bp,编码242个氨基酸。努比亚山羊myf6氨基酸序列与绵羊、黄牛、猪、驴、人、小鼠的相似性分别为99.3%、98.8%、94.1%、93.8%、93.4%和89.0%。蛋白理化性质分析结果表明,山羊myf6蛋白的分子质量为26.98 ku,为不稳定酸性蛋白;亲疏水性分析发现,该蛋白为亲水蛋白;跨膜结构和信号肽预测结果发现,该蛋白不含有跨膜结构和信号肽,不属于跨膜蛋白和分泌蛋白;二级结构预测结果显示,该蛋白主要由无规则卷曲(49.59%)构成,其次为α-螺旋(33.88%)、延伸链(9.50%)和β-转角(7.02%),三级结构预测结果与二级结构一致。实时荧光定量PCR结果显示,myf6基因在努比亚山羊背最长肌的表达量最高,显著高于其他组织(P0.05);对比努比亚山羊和隆林山羊背最长肌的myf6基因的表达情况发现,努比亚山羊的表达量显著高于隆林山羊(Pmyf6基因在肌肉分化中的作用提供了参考。

关键词：山羊 myf6基因克隆组织表达

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牦牛myf6基因克隆及生物信息学分析

中国畜牧兽医 2019年第6期46卷 1603-1611页

作者：雷秦祎付东海常永芳吴晓云梁春年褚敏阎萍甘肃农业大学兰州730070 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室兰州730050

本试验旨在克隆牦牛myf6基因,进行生物信息学分析并探究其在牦牛不同时期的表达情况。以青海雪多牦牛为研究对象,通过设计引物对其myf6基因CDS区进行克隆测序,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测研究。结果显示,牦牛myf6基因含有... 详细信息

本试验旨在克隆牦牛myf6基因,进行生物信息学分析并探究其在牦牛不同时期的表达情况。以青海雪多牦牛为研究对象,通过设计引物对其myf6基因CDS区进行克隆测序,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测研究。结果显示,牦牛myf6基因含有一个大小为729 bp的开放阅读框(ORF),编码242个氨基酸。同源性比对和进化树分析结果表明,牦牛myf6氨基酸序列与普通牛、绵羊亲缘性最近。对myf6蛋白理化性质进行预测分析得到其结构式为C1167H1870N336O372S13,理论等电点为5.64,其中丝氨酸含量最高,其次是亮氨酸、谷氨酸、脯氨酸和精氨酸;其疏水平均值为-0.586,亲水性最强为-2.467,疏水性最强为1.511,为亲水性、可溶性蛋白;有可形成卷曲螺旋部位;磷酸化位点预测其有26个丝氨酸激酶,10个苏氨酸激酶,5个酪氨酸激酶;亚细胞定位分析其编码产物在细胞核中分布最多(73.9%),其次为细胞骨架(13.0%)、细胞质(4.3%)、高尔基体(4.3%)、分泌系统小泡(4.3%)。蛋白质二级结构主要由无规则卷曲(49.17%)组成,其次是α-螺旋(33.47%)、延伸连(11.57%)及β-折叠(5.79%)。蛋白功能分析显示其生长因子功能几率较大(7.694),其次为转录调节作用,预测其作为一种生长因子参与机体生物学调控。实时荧光定量PCR结果显示,myf6基因在胎牛、6月龄、4~5岁牦牛背最长肌中均有表达,且在6月龄的表达量显著高于胎牛和4~5岁牦牛(Pmyf6生肌因子提供了重要的研究数据,为改良牦牛经济性状提供了参考。

关键词：牦牛 myf6基因生物信息学分析克隆

myf5、myf6基因在黔北麻羊与努黔F1代不同组织表达差异性的研究

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中国畜牧杂志 2019年第5期55卷 54-58页

作者：王鑫苑洪霞骆金红许厚强陈祥贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025

实验旨在探究myf5、myf6基因在黔北麻羊和努黔F_1代各组织间的相对表达水平。应用实时荧光定量PCR法检测myf5、myf6基因在黔北麻羊(3只)和努黔F_1代(3只)的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织间的相对... 详细信息

实验旨在探究myf5、myf6基因在黔北麻羊和努黔F_1代各组织间的相对表达水平。应用实时荧光定量PCR法检测myf5、myf6基因在黔北麻羊(3只)和努黔F_1代(3只)的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织间的相对表达量。结果表明:各组织myf5、myf6基因在黔北麻羊和努黔F_1代间表达差异不显著;2种基因在黔北麻羊臂三头肌、股二头肌和背最长肌相对表达量均极显著高于肾脏、肝脏、心脏、脾脏、肺脏(Pmyf5基因在肾脏相对表达量显著高于脾脏和肺脏(Pmyf6基因在心脏和肝脏相对表达量均显著高于脾脏(P基因在努黔F_1代臂三头肌、股二头肌和背最长肌相对表达量均极显著高于肝脏、肾脏、心脏、脾脏、肺脏(Pmyf5、myf6基因在黔北麻羊和努黔F_1代8种组织中均有表达且表达量不等,在肌肉组织中的表达量最高。

关键词： myf5基因 myf6基因表达差异黔北麻羊努黔F1代

鸭胚骨骼肌不同组织myf6基因表达的发育性变化研究

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中国畜牧兽医 2013年第2期40卷 138-142页

作者：朱春红宋迟陶志云宋卫涛胡艳束婧婷陈文峰李慧芳江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125 江苏腾达源农牧有限公司江苏姜堰225538

为研究myf6基因对鸭肌肉发育的影响,本试验利用实时荧光定量PCR绝对定量技术检测myf6基因在高邮鸭和金定鸭胚胎期第13、17、21、25、27天及出生后7日龄胸肌、腿肌发育过程中的表达量。结果显示,myf6基因在2个品种的胸肌和腿肌中均有表达... 详细信息

为研究myf6基因对鸭肌肉发育的影响,本试验利用实时荧光定量PCR绝对定量技术检测myf6基因在高邮鸭和金定鸭胚胎期第13、17、21、25、27天及出生后7日龄胸肌、腿肌发育过程中的表达量。结果显示,myf6基因在2个品种的胸肌和腿肌中均有表达,在不同品种同一肌肉组织中的表达变化规律一致,而在不同肌肉组织中的表达模式不同,其中在胸肌组织中21胚龄时表达量最高,随后表达量下降,维持相对较高表达水平;在腿肌组织中13胚龄时表达量较高,17胚龄时达到最高,随后表达量有所降低,并在21胚龄后急速下降至极低水平,但其表达在胚胎期后期(27胚龄)及初生期(7日龄)又有缓慢上升趋势。上述结果表明,myf6基因参与了胸、腿肌组织的发育,在胸、腿肌中表达模式不同,推测myf6基因在胸、腿肌中的调控存在差异,可能与其胸、腿肌不同肌纤维的发育与分化有关。

关键词：鸭 myf6基因骨骼肌发育性变化

Fbxl5和myf6基因的多态性与京海黄鸡生长、繁殖性能的关联分析及表达规律研究

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Fbxl5和Myf6基因的多态性与京海黄鸡生长、繁殖性能的关联分析及...

作者：袁曼曼扬州大学

学位级别：硕士

本试验采用PCR-SSCP技术检测了京海黄鸡中fbxl5(F-box and lecucine-rich repeat protein5)基因以及myf6(myogenicfactor6)基因的多态性,并且运用一般线性模型与京海黄鸡的经济性状进行相关联分析,旨在探讨这两个候选基因影响生长、繁... 详细信息

本试验采用PCR-SSCP技术检测了京海黄鸡中fbxl5(F-box and lecucine-rich repeat protein5)基因以及myf6(myogenicfactor6)基因的多态性,并且运用一般线性模型与京海黄鸡的经济性状进行相关联分析,旨在探讨这两个候选基因影响生长、繁殖性状的分子机理;同时,我们利用实时荧光定量PCR技术研究两个候选基因在京海黄鸡和金茅黄鸡公母鸡的不同组织的表达谱,以及不同生长时期的表达规律。主要研究结果如下:1.以Fbxl5基因为候选基因,对该基因CDS区进行了单核苷酸多态性检测。结果表明:试验共发现了四个突变位点,其中T14286C位于外显子3上,T14291C位于内含子3上,T15780C位于外显子4上,G19048A位于外显子5上,除了 T14286C突变造成了编码氨基酸从亮氨酸变成脯氨酸,是非同义突变外,其余位点均未造成编码氨基酸的改变,属于同义突变。我们利用PHASE2.1软件对该基因检测到的4个突变位点进行单倍型分析,发现在京海黄鸡12世代核心群母鸡群体中,这4个突变位点形成了 8种单倍型。与生长性状关联分析的结果表明,单倍型组合H1H8型个体的各周龄体重均高于其他单倍型组合个体,为优势单倍型组合,并且单倍型组合H1H8型个体和H3H8型个体在0、12、14、16周龄体重方面显著或极显著高于其他单倍型组合(Pmyf6基因为候选基因,对该基因CDS区进行了单核苷酸多态性检测。结果表明:试验在外显子1中共发现了一个变异位点T586C,经检测,在此位点上形成了三种基因型,分别为HH、Hh、hh,此处的突变导致其编码的氨基酸由丙氨酸突变成天冬氨酸,属于非同义突变。运用SPSS软件将myf6开基因在外显子1中所形成的突变位点与生长性状进行关联性分析,由结果可知,HH、Hh、hh三种基因型个体在0周、2周、4周、6周龄的体重无显著差异(P>0.05),但在8周、10周、12周、14周、16周龄上,Hh基因型个体体重极显著高于HH基因型个体(P基因型hh个体显著高于HH个体(P基因型个体的性状虽无显著差异(P>0.05),但Hh基因型个体均优于其他两种基因型个体。3.对两个候选基因的表达谱和表达规律进行的研究,发现在两个鸡种上,候选基因在胸肌、腿肌上均高表达;Fbxl5基因的表达规律结果表明:在金茅黄鸡公母鸡、京海黄鸡公鸡上,候选基因的表达量在出雏期为最高,之后均是先大幅下降然后有少量回升,而在京海黄鸡母鸡上,其表达量为先持续上升然后大幅下降。myf6基因的表达趋势较为稳定,在两个品种的鸡上,表达趋势总体上均为上升趋势,并在16周龄时达到最高,两个鸡种的表达规律表明,myf6基因在不同品种、不同时间段上、胸肌的表达量始终高于腿肌。

关键词： Fbxl5基因 myf6基因 PCR-SSCP 单核苷酸多态性表达

Fox01、myf6基因的甲基化水平和表达量与羊肉品质关系的研究

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Fox01、Myf6基因的甲基化水平和表达量与羊肉品质关系的研究

作者：程海星内蒙古农业大学

学位级别：硕士

FoxO1和myf6基因是重要的肉品质候选基因,巴美肉羊和苏尼特羊是我国内蒙古地区的典型优质品种,利用分子生物技术研究基因对其肉品质的影响具有重要意义。本试验通过检测6月龄、12月龄巴美肉羊和苏尼特羊FoxO1、myf6基因CpG岛的甲基化状... 详细信息

FoxO1和myf6基因是重要的肉品质候选基因,巴美肉羊和苏尼特羊是我国内蒙古地区的典型优质品种,利用分子生物技术研究基因对其肉品质的影响具有重要意义。本试验通过检测6月龄、12月龄巴美肉羊和苏尼特羊FoxO1、myf6基因CpG岛的甲基化状态,并测定其不同部位中的基因mRNA表达量及肉品质指标,研究基因甲基化水平与mRNA表达和肉品质三者之间的相关关系。结果表明：对FoxO1、myf6基因序列进行分析,预测出FoxO1基因含有1个CpG岛,myf6基因含有2个CpG岛;经BSP方法检测,FoxO1基因CpG岛为高度甲基化,myf6基因CpG岛1为低度甲基化,CpG岛2为中度甲基化且具有位点特异性。myf6基因CpG岛2的整体甲基化水平在苏尼特羊中12月龄显著高于6月龄(p基因甲基化水平与mRNA表达量的相关性分析发现,在巴美肉羊和苏尼特羊中FoxO1基因和myf6基因三个CpG岛的甲基化水平对其mRNA表达量均没有显著性影响。FoxO1基因CpG岛与myf6基因CpG岛1在巴美肉羊和苏尼特羊中的甲基化水平与各肉品质指标相关性均不显著;myf6基因CpG岛2甲基化水平与巴美肉羊臂三头肌的红度值呈显著正相关(p基因mRNA表达量在巴美肉羊臂三头肌中与红度值、胴体净肉率呈显著正相关(pmyf6基因mRNA表达量在巴美肉羊的背最长肌和臂三头肌中分别与净肉率和胴体净肉率呈显著正相关(pmyf6基因作为肉质候选基因与羊肉品质之间存在一定的关联性,调控这两个基因的表达能够影响羊肉品质。

关键词： FoxO1基因 myf6基因甲基化 mRNA表达量肉品质