检索结果-南通市图书馆

光子学报 2001年第4期30卷 451-454页

作者：杨静丘江刘波中国科学院西安光学精密机械研究所西安710068

本文介绍了一种顺序排除算法 (SEA)及其多级算法 (msea) .SEA通过讨论模板的灰度信息和与局部图象的灰度信息和的关系来判断在搜索窗中的搜索点是否需要进行匹配运算 ,这样就减少了匹配估计次数 .msea是 SEA的多级算法 ,当搜索图背景较... 详细信息

本文介绍了一种顺序排除算法 (SEA)及其多级算法 (msea) .SEA通过讨论模板的灰度信息和与局部图象的灰度信息和的关系来判断在搜索窗中的搜索点是否需要进行匹配运算 ,这样就减少了匹配估计次数 .msea是 SEA的多级算法 ,当搜索图背景较复杂时 ,msea具有更高的效率 .作为耗尽型算法 (ESA) ,SEA和 msea不会降低匹配的准确性 .通过仿真实验证明 ,此算法在不降低匹配准确性的前提下 ,与常用的匹配算法相比较 ,有效地减少了运算量。

关键词：模板匹配 msea 顺序排除算法图象相关匹配跟踪灰度信息

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嵌合表皮生长因子疫苗E5T-msea的设计及抑瘤活性检测

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生物工程学报 2010年第3期26卷 357-362页

作者：尹晴晴贾海威张艳红刘传暄马清钧张部昌钟辉胥全彬安徽大学生命科学学院合肥230039 军事医学科学院生物工程研究所北京100850 中国人民解放军海军总医院北京100048

表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)及其配体在多种肿瘤细胞中高表达,免疫注射表皮生长因子(Epidermal growth factor,EGF)-载体蛋白所产生的抗体能够干扰EGFR与EGF的相互作用,进而抑制肿瘤生长。本实验室设计了... 详细信息

表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)及其配体在多种肿瘤细胞中高表达,免疫注射表皮生长因子(Epidermal growth factor,EGF)-载体蛋白所产生的抗体能够干扰EGFR与EGF的相互作用,进而抑制肿瘤生长。本实验室设计了EGF和TGFα的嵌合配体E5T,并将具有免疫增强作用的葡萄球菌肠毒素A(Staphylococcal enterotoxin A,SEA)与之融合。融合蛋白在大肠杆菌内表达后,通过金属螯合亲和层析,得到了纯度较高的E5T-msea融合蛋白。将E5T-msea免疫小鼠,能够产生高滴度的抗体,该抗体能够同时识别EGF和TGFα。将抗E5T-msea免疫血清与肿瘤细胞共培养,在1:10的稀释度下能显著抑制EGFR阳性肿瘤细胞的生长,而对EGFR阴性肿瘤细胞293T的生长没有明显影响。

关键词：表皮生长因子 msea E5T 肿瘤疫苗

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一种改进的运动估计算法

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微电子学与计算机 2006年第12期23卷 213-215页

作者：焦荣惠郭立郭利生中国科学技术大学电子科学与技术系安徽合肥230026

运动矢量估计问题是当今一个热点问题,它在诸如视频编码、目标实时跟踪等众多领域都有着广泛的应用,目前普遍采用的估计算法是块匹配算法(BMA)。经典的块匹配算法有顺序排除算法(SEA)和多级顺序排除算法(msea),文章在分析两种算法的基础... 详细信息

运动矢量估计问题是当今一个热点问题,它在诸如视频编码、目标实时跟踪等众多领域都有着广泛的应用,目前普遍采用的估计算法是块匹配算法(BMA)。经典的块匹配算法有顺序排除算法(SEA)和多级顺序排除算法(msea),文章在分析两种算法的基础上,对msea算法做了两点改进,实验结果表明改进后的算法计算量得到有效的减少,并且保证了估计的准确性。

关键词：块匹配运动估计 SEA msea 实时跟踪

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短内含子剪接调控元件的系统性特征分析

短内含子剪接调控元件的系统性特征分析

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作者：杨阳苏州大学

学位级别：硕士

背景与目的:前体信使RNA(pre-mRNA)剪接是去除内含子,将外显子连接的过程,是真核基因表达转录后水平调控的重要环节。人类基因组中,大多数内含子的平均长度是外显子的10倍以上。剪接依赖于剪接体从成千上万的内含子核苷酸中正确识别外... 详细信息

背景与目的:前体信使RNA(pre-mRNA)剪接是去除内含子,将外显子连接的过程,是真核基因表达转录后水平调控的重要环节。人类基因组中,大多数内含子的平均长度是外显子的10倍以上。剪接依赖于剪接体从成千上万的内含子核苷酸中正确识别外显子。外显子主要由4种核心剪接信号定义,包括5’剪接位点(5’splice site,5’ss)、3’剪接位点(3’splice site,3’ss)、分支点序列和多嘧啶区(PPT)。除此之外,还需要剪接调控元件(splicing regulatory elements,SRE)作为辅助性元件。剪接调控元件为位于外显子的剪接增强子或沉默子(exonic splicing enhancer/silencer,ESE/ESS),位于内含子的剪接增强子或沉默子(intronic splicing enhancer/silencer,ISE/ISS)。RNA结合蛋白(RBP)作为剪接调控因子与SRE结合促进或抑制剪接位点的识别。SRE通常是短序列,发生突变或与之结合的RBP失调,会产生剪接异常并导致疾病。然而,迄今为止,关于SRE序列及其如何调节剪接的知识仍然有限。方法:以运动神经元生存2(survival of motor neuron 2,SMN2)小基因(minigene)为研究模型,在内含子7的5’SS下游的第11-15位进行突变,构建一个完整的五聚体序列库,该库包含该突变位置的5个核苷酸的所有组合。将获得的1023个五碱基突变体和野生型小基因(WT SMN2)转染到HEK293细胞中,用荧光标记的半定量RT-RCR方法和非变性PAGE胶检测各五聚体序列对外显子7剪接的影响。利用了基序集富集分析(msea)方法,对数据库分析,从中识别出了对SMN2外显子7列入具有促进性和抑制性的SRE基序。最后在SMN1/2和MAPT小基因中验证得到的SRE对剪接的影响。结果:根据ΔPSI值(PSI:外显子7的列入率,ΔPSI:突变体的PSI与WT的PSI之差),从五聚体序列库中得到584个对SMN2外显子7列入具有促进性的五聚体和230个对SMN2外显子7列入具有抑制性的五聚体。从位置依赖分析和非位置依赖分析这两个层面,采用msea方法,富集到四类促进性基序包括U-rich,C-rich,CG-core和RBFOX相关序列,以及四类抑制性基序包括AG-core,UG-type,GCWCC-type和GAC-core。将 U-rich,C-rich,CG-core,UG-type,GCWCC-type分别在SMN1/2或MAPT小基因中验证。U-rich,C-rich都明显促进外显子7列入,且随着U-rich和C-rich序列的延长,促进外显子7列入的作用越强。CG的三重复序列(CGCGCG)在SMN2小基因中明显促进外显子7列入,在MAPT小基因中明显抑制外显子10列入。GCWCC在SMN2小基因和MAPT小基因中都强烈抑制盒式外显子列入。UG-type基序抑制外显子7列入的剪接效应存在两种机制,即二级结构干扰和自身序列携带的抑制信号。结论:五聚体库所有序列由ΔPSI值分析可分为SMN2外显子7促进性和抑制性两种类别序列,再结合msea分析,从五聚体序列库富集到具有SMN2外显子7促进性和抑制性的3聚体(3-mer)或4聚体(4-mer),我们发现了短序列中存在以下关键 SRE:U-rich,C-rich,CG-core 和 RBFOX 相关序列为强 ISE,而 AG-core,UG-type,GCWCC-type,和GAC-core为强ISS。从五聚体序列库中获得大量的剪接调控元件数据,对理解短RNA序列如何调控剪接具有重要的理论价值,同时可以作为一种宝贵的资源为其他复杂的剪接调控机制提供解释。在此基础上,可以进一步探索新发现的SRE在特定基因表达中的作用,以阐明其作用机理和生物学意义。

关键词：五聚体库 SMN2 msea 剪接调控元件促进性基序抑制性基序

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