检索结果-南通市图书馆

检索条件"主题词=MHC Ⅱ类基因"

共 4 条记录，以下是1-10 订阅

全选清除本页清除全部题录导出标记到"检索档案"

详细简洁

排序：

白头叶猴mhc ⅱ类基因遗传结构特征及其对肠道寄生虫感染的影响

白头叶猴MHC Ⅱ类基因遗传结构特征及其对肠道寄生虫感染的影响

引用

作者：宁真京广西师范大学

学位级别：硕士

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)是脊椎动物中具有高度多态性的一类多基因家族,与动物的免疫功能、性选择、遗传进化联系紧密。mhc基因作为功能性分子标记研究物种的遗传多样性以及评估病原体抵抗能力,相... 详细信息

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,mhc)是脊椎动物中具有高度多态性的一类多基因家族,与动物的免疫功能、性选择、遗传进化联系紧密。mhc基因作为功能性分子标记研究物种的遗传多样性以及评估病原体抵抗能力,相对于微卫星、线粒体控制区域等中性分子标记,可反映出物种的环境适应能力和生存潜力。白头叶猴是国家一级保护动物,更是我国特有的灵长类动物,了解其遗传多样性水平和生存潜能,有利于制定科学、合理的保护措施。本研究利用聚合酶链式反应和克隆测序的方法获得白头叶猴mhc ⅱ类基因外显子2序列,通过生物信息学软件对其遗传结构特征进行分析,同时采用分子生物学方法检测白头叶猴肠道阿米巴原虫和芽囊原虫的感染情况,基于此,探究白头叶猴mhc ⅱ类基因对肠道寄生虫感染的影响,进而为白头叶猴肠道寄生虫的防治工作提供理论基础。主要研究结果如下:(1)通过克隆测序获得136条有效序列,经对比分为22条Trle-DPB1等位基因、6条Trle-DQB1等位基因和1条Trle-DQA1等位基因。(2)Trle-DPB1等位基因共有37个单核苷酸多态性位点,导致27个氨基酸改变,其中,Trle-DPB1*21的变异位点最多,有20个。不同Trle-DPB1等位基因外显子2的氨基酸序列不同,说明它们的变异位点主要是非同义替换。Trle-DQB1等位基因共有6个单核苷酸多态性位点,导致4个氨基酸改变,其中Trle-DQB1*05的变异位点最多,有4个。Trle-DQB1*02、Trle-DQB1*03、Trle-DQB1*04的氨基酸序列完全相同,说明它们的变异位点主要为同义替换。此外,两位点基因的多态信息含量和期望杂合度均大于0.5,说明Trle-DPB1、Trle-DQB1含有较高的多态性。(3)分别用邻接法和最大似然法构建mhc ⅱ类基因外显子2的系统发育树,结果表明本研究白头叶猴mhc ⅱ类基因未发现跨物种多态现象。此外,在选择压力分析中发现Trle-DPB1受到正选择作用,Trle-DQB1受到净化选择作用。(4)采用分子生物学技术检测出白头叶猴感染Entamoeba ***3和Blastocystis *** 13,感染率分别为91.67%、25.00%。(5)应用SPSS 27.0对mhc ⅱ类基因与原虫感染情况进行相关性分析,结果表明Trle-DPB1*21、Trle-DQB1*05与阿米巴原虫的感染情况呈显著负相关;Trle-DQB1*01等位基因与芽囊原虫的感染情况呈显著正相关;杂合子与这两种寄生虫感染之间不存在显著的相关性。综上所述,Trle-DPB1、Trle-DQB1的遗传多态性较高,且与阿米巴原虫、芽囊原虫的感染情况存在相关性,初步推断Trle-DPB1*21、Trle-DQB1*05可能参与阿米巴原虫抗原肽的识别、呈递过程,Trle-DQB1*01可能为芽囊原虫的易感基因。

关键词：白头叶猴 mhc ⅱ类基因遗传多样性原虫寄生虫抗感性

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于SNP和mhc分子标记的高原鼠兔遗传多样性研究

基于SNP和MHC分子标记的高原鼠兔遗传多样性研究

引用

作者：吕博文青海师范大学

学位级别：硕士

高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原特有的植食性小型哺乳动物,作为该地区高寒草原和高寒草甸生态系统中的优势物种,对其遗传多样性、种群结构及生存潜能的探究,对理解高原鼠兔的生态适应性和进化历程至关重要。本研究以不同地理... 详细信息

高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原特有的植食性小型哺乳动物,作为该地区高寒草原和高寒草甸生态系统中的优势物种,对其遗传多样性、种群结构及生存潜能的探究,对理解高原鼠兔的生态适应性和进化历程至关重要。本研究以不同地理位置的高原鼠兔种群为对象,运用单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)和主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,mhc)两种不同的分子标记技术,对其遗传多样性和种群结构进行了分析与探讨。使用SNP标记分析了不同高原鼠兔种群间遗传多样性差异和遗传结构,使用mhcⅡ类基因探究了高原鼠兔该基因的多态性及维持其多态性的原因,两类分子标记的研究结果揭示了高原鼠兔在面对环境挑战时的遗传应对策略,为理解其适应性演化的分子机制提供了参考依据。这些发现深化了对高原鼠兔遗传背景的理解,对于制定科学且合理的管理策略具有实际意义。主要研究结果如下:(1)采用SNP标记对青海省13个高原鼠兔种群进行遗传多样性分析,结果显示花石峡种群具有最高的遗传多样性,而刚察种群的遗传多样性最低,这一差异可能源于种群间基因交流的程度不同。花石峡种群与其他种群间基因流动较频繁,尤其是与地理位置较远的种群,这可能为花石峡种群引入了新的等位基因,从而增加了其遗传多样性。相反,刚察种群的基因流动相对有限,主要与祁连种群有较少的基因交流,这限制了新等位基因的引入,可能是导致其遗传多样性较低的主要原因。(2)对青海省13个高原鼠兔种群遗传结构的分析揭示了地理隔离对种群遗传分化的重要影响。刚察和祁连种群表现出明显的遗传分化,柴达木盆地与共和盆地的地理隔离或为主要分化驱动力,而青海湖对于部分种群间的遗传分化也起到重要作用。此外,尽管黄河形成时期晚于高原鼠兔起源,但聚类分析和主成分分析结果共同表明,黄河对河南县种群产生了地理隔离效应,使其形成独立分支。(3)利用第二代测序(NGS)技术对高原鼠兔的mhc ⅱ类基因进行分析,成功鉴定出多个等位基因,包括20个Occu-DRB、37个Occu-DQA和71个OccuDQB,其中Occu-DQA和Occu-DQB等位基因显示出较高的多态性。从核苷酸序列和氨基酸序列两个不同的角度分析Occu-DRB、Occu-DQA和Occu-DQB基因发现,这些等位基因从单一突变位点到多个简约信息位点的变异均有体现,且各基因的碱基占比和GC含量存在差异。Occu-DRB和Occu-DQA等位基因的多态性主要通过碱基转换实现,而Occu-DQB则以碱基颠换为主。Occu-DQA和OccuDQB在抗原结合位点(ABS)区域显示了较高的变异率,而Occu-DRB在此区域未发现突变,这反映了不同mhc基因在调节免疫响应过程中的特异性作用。三个基因在密码子使用上的偏好性和同义密码子的不平衡使用增强了mhc分子的结构多样性和抗原呈递效率,可能反映了高原鼠兔在长期适应环境压力时的免疫进化策略。(4)对高原鼠兔Occu-DRB、Occu-DQA和Occu-DQB基因的选择压力分析表明,Occu-DRB基因主要受到净化选择和平衡选择的协同作用,维持了基因的稳定性和多样性,而Occu-DQA和Occu-DQB基因的多样性则受到平衡选择和正向选择的共同影响,这一差异反映了不同基因在适应性演化中可能发挥的不同作用。这些复合的选择机制共同维持了高原鼠兔mhc ⅱ类基因的多样性,并对种群的适应性演化起到了关键作用。

关键词：高原鼠兔种群遗传结构遗传多样性单核苷酸多态性 mhc ⅱ类基因

来源：

同方学位论文库评论