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Lnc-67靶向mdk抑制小鼠脑神经瘤细胞的增殖、侵袭和迁移能力

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Lnc-67靶向MDK抑制小鼠脑神经瘤细胞的增殖、侵袭和迁移能力

作者：余玉甜南昌大学

学位级别：硕士

Midkine（mdk）是一种肝素结合生长因子,研究表明它在各种实体肿瘤中多发挥了重要作用,也是分子治疗的靶标。近年来,mdk在癌症中的作用及调控机制逐渐被揭示。此外非编码RNA,尤其是长链非编码RNA（long noncoding RNA,lnc RNA）作为一... 详细信息

Midkine（mdk）是一种肝素结合生长因子,研究表明它在各种实体肿瘤中多发挥了重要作用,也是分子治疗的靶标。近年来,mdk在癌症中的作用及调控机制逐渐被揭示。此外非编码RNA,尤其是长链非编码RNA（long noncoding RNA,lnc RNA）作为一种调控基因,能够调节其周围基因的表达。因此,lncRNA也常用于治疗人类恶性肿瘤。在对小鼠侧脑室不同类型细胞的表达谱进行分析时,我们发现了一个新的lnc RNA并命名为lnc67,它与mdk具有反向重叠的位置关系。本研究以小鼠脑神经瘤细胞（Neuro-2a）为研究材料,通过在Neuro-2a中过表达lnc67,探究lnc67对靶基因mdk的调控作用,以及对Neuro-2a的影响。并通过转录组测序技术探索lnc67的调控机制,从生物信息学的角度发掘出关键的基因,并挖掘它在影响癌细胞进展方面的作用。研究结果如下:1、实时荧光定量PCR和Western Blot分析表明,过表达lnc67之后,mdk的m RNA和蛋白的表达量均被下调。2、通过Transwell细胞侵袭、EdU细胞增殖和划痕实验研究过表达lnc67对Neuro-2a进展的影响。结果表明,在过表达lnc67之后,Neuro-2a的增殖、侵袭和迁移均受到抑制。3、利用生物信息学对RNA转录组测序数据进行分析。结果显示,过表达lnc67使得Wnt,TNF和溶酶体相关通路受到显著影响。研究结果显示,lnc67通过影响细胞自噬,TNF凋亡和Wnt信号通路调控脑神经瘤细胞的增殖、迁移、侵袭和凋亡,该研究可望为肿瘤的治疗研究提供理论参考。

关键词： mdk 小鼠脑神经瘤细胞非编码RNA 转录组测序

基于计算的肝癌比较肝炎/肝硬化组织BRCA1,NEK2,GPSM2,mdk新网络构建及分析

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基于计算的肝癌比较肝炎/肝硬化组织BRCA1,NEK2,GPSM2,MDK新网络...

作者：庄婧北京邮电大学

学位级别：硕士

本论文原创重构了非肿瘤肝炎/肝硬化组织(感染HBV或HCV)和肝癌GSE10140-10141库显著性差异表达BRCA1、NEK2、GPSM2、mdk的新分子和知识网络,分析提出和验证了新假说,整合基因表达差异显著性分析方法SAM、基于线性规划和分解过程的基因... 详细信息

本论文原创重构了非肿瘤肝炎/肝硬化组织(感染HBV或HCV)和肝癌GSE10140-10141库显著性差异表达BRCA1、NEK2、GPSM2、mdk的新分子和知识网络,分析提出和验证了新假说,整合基因表达差异显著性分析方法SAM、基于线性规划和分解过程的基因重构网络构建算法GNRInfer、Kappa统计和模糊启发式聚类分析的DAVID、分子注释系统MAS。相较非肿瘤肝炎/肝硬化组织,肝癌中BRCA1网络的不同激活分子的细胞周期模块计算结果显示为细胞周期,细胞凋亡过程负调节,凋亡过程中半胱氨酸型内肽酶活性负调节,细胞凋亡负调节,程序性细胞死亡负调节,参与有丝分裂细胞周期的泛素蛋白连接酶活性负调节等。因此我们提出肝癌中BRCA1激活负向调节凋亡相关的细胞周期,并且它们之间相互验证。相较非肿瘤肝炎/肝硬化组织,肝癌中NEK2网络的不同激活分子的细胞周期模块计算结果显示为细胞周期调节,有丝分裂细胞周期,RNA聚合酶Ⅱ启动子转录,转录因子活性序列特异性DNA结合,DNA模板转录正调节,RNA聚合酶Ⅱ启动子转录正调节,转录因子结合,转录负调节,转录辅因子活性等。因此我们提出肝癌中NEK2激活转录相关的细胞周期调节网络,并且它们之间相互验证。相较非肿瘤肝炎/肝硬化组织,肝癌中GPSM2网络的不同激活分子的信号转导模块计算结果显示为细胞间信号转导,MAPK,小GTP酶,细胞表面受体,IκB激酶/NF κB,肿瘤坏死因子,外源凋亡,NFκB,鞘脂,RIGI样受体,脂肪细胞因子,p38 MAPK,肿瘤坏死因子受体结合,CD40受体结合等的信号通路。因此我们提出肝癌中GPSM2激活细胞间信号转导网络,并且它们之间相互验证。相较非肿瘤肝炎/肝硬化组织,肝癌中mdk网络的不同激活分子的信号转导模块计算结果显示为细胞内信号转导,MAPK活性,Ras,腺苷酸环化酶调节和抑制G蛋白偶联受体,肽基丝氨酸磷酸化的正调节,催产素,钙调蛋白依赖性蛋白激酶,ATP结合等信号通路,因此我们提出肝癌中mdk激活细胞内信号转导网络,并且它们之间相互验证。

关键词：肝癌 BRCA1 NEK2 GPSM2 mdk

基于转录组学分析mdk基因在胶质母细胞瘤中的预后作用及与肿瘤免疫微环境的关系

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基于转录组学分析MDK基因在胶质母细胞瘤中的预后作用及与肿瘤免...

作者：赵小玉新疆医科大学

学位级别：硕士

目的:胶质母细胞瘤(GBM)是人体中常见最致命的原发性恶性脑肿瘤之一,针对它的治疗方法是神经肿瘤学的重大挑战,不幸的是,尽管经过在基础生理和临床研究中多年的不断努力,胶质母细胞瘤患者的预后仍然很差。因此,在寻找一种新的替代方案... 详细信息

目的:胶质母细胞瘤(GBM)是人体中常见最致命的原发性恶性脑肿瘤之一,针对它的治疗方法是神经肿瘤学的重大挑战,不幸的是,尽管经过在基础生理和临床研究中多年的不断努力,胶质母细胞瘤患者的预后仍然很差。因此,在寻找一种新的替代方案来改善胶质母细胞瘤患者的总生存期、自由进展生存期和生活质量方面仍需进行更进一步的探索。经过研究调查发现mdk是一种通过配体依赖受体激活的生物反应启动信号的蛋白质,它在多种癌症类型中上调,下游信号可能与大量导致癌症发生和进展的表型特征有关。然而,mdk在胶质母细胞瘤中的临床价值与肿瘤免疫微环境的关系尚不清楚,本研究旨在探讨其在GBM中的临床预后价值及其与肿瘤免疫微环境的关系。方法:我们从TCGA-GBM和GTEx数据库中使用UCSC XENA(http://***/datapages)经过Toil流程统一处理TPM格式的RNAseq数据,获得了166个GBM组织和1157个正常组织,利用t和卡方检验来评估mdk的表达水平及其在GBM中的临床意义。并通过Kaplan-Meier方法、Cox回归分析确定mdk在GBM中的预后价值。采用基因集富集分析(GSEA)筛选生物学通路及Spearman相关性分析确定mdk表达与免疫细胞浸润、免疫检查点基因与TP53之间的关联。通过单细胞RNA测序分析mdk在不同亚型GBM之间的表达传递。结果:mdk在包括GBM在内的多种癌症中显著上调,并且具有很高的诊断价值,Kaplan-Meier生存率和Cox回归分析显示,AUC为0.984,mdk的高表达与GBM患者的不良预后相关。基因集富集分析(GSEA)发现高表达mdk与有丝分裂细胞周期、DNA修复、Rho GTP酶信号传导、TP53转录调控、细胞分裂检查点途径有关呈显著相关性。我们还探讨了mdk与肿瘤免疫相互作用的相关性,发现mdk表达水平与GBM中的免疫细胞浸润、免疫检查点基因和TP53显著相关。结论:mdk是在广泛的癌组织中表达的泛癌症生物标志物,它可以用作患者对治疗或产生毒性反应的可能性的预测生物标志物,并允许监测其治疗结果。mdk是提高GBM患者免疫治疗疗效的潜在靶标。因此,mdk作为一种分泌蛋白可以作为常规可用的血液或尿液生物标志物,可能在预测免疫治疗反应中发挥出有效作用。

关键词： mdk 胶质母细胞瘤预后免疫浸润

mdk软件不能模拟仿真STM32的问题解决方法

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单片机与嵌入式系统应用 2013年第10期13卷 24-25,35页

作者：刘勇军杨选成中山市中等专业学校中山528458

学习和使用RealView mdk开发工具及STM32等芯片时,如果每个系列芯片都要购买、制作评估板或开发板的话,经济条件不允许,也不现实。当然也可以在没有硬件的条件下,通过mdk软件的模拟仿真来学习STM32系列芯片的编程,但mdk软件对模拟仿真... 详细信息

学习和使用RealView mdk开发工具及STM32等芯片时,如果每个系列芯片都要购买、制作评估板或开发板的话,经济条件不允许,也不现实。当然也可以在没有硬件的条件下,通过mdk软件的模拟仿真来学习STM32系列芯片的编程,但mdk软件对模拟仿真的支持不是很全面,大部分芯片都不能模拟仿真,必须通过相应的设置和相关的操作,才能完成模拟仿真。

关键词：模拟仿真 mdk STM32

mdk环境下基于Cortex-M3的FreeRTOS移植

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长沙民政职业技术学院学报 2013年第4期20卷 164-166页

作者：刘湘云吴舒辞中南林业科技大学计算机与信息工程学院湖南长沙410004 长沙民政职业技术学院图书信息中心湖南长沙410004

根据FreeRTOS和Cortex-M3的基本特征,用汇编语言和C语言修改了移植过程中的源代码,总结了FreeRTOS移植的一般方法。移植过程使用STM32F103ZE处理器自带的固件库,提高了应用程序开发速度,对其它内核的处理器基于FreeRTOS的开发应用有一... 详细信息

根据FreeRTOS和Cortex-M3的基本特征,用汇编语言和C语言修改了移植过程中的源代码,总结了FreeRTOS移植的一般方法。移植过程使用STM32F103ZE处理器自带的固件库,提高了应用程序开发速度,对其它内核的处理器基于FreeRTOS的开发应用有一定的参考价值。

关键词： mdk Cortex—M3 FreeRTOS 移植嵌入式实时操作系统

mdk在鼻咽癌组织中的表达情况及其临床意义

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临床医学工程 2016年第7期23卷 925-926页

作者：杨海劲李金媚吴昆鹏河源市人民医院/暨南大学附属河源医院肿瘤中心广东河源517000 广东医科大学附属医院肿瘤中心广东湛江524000

目的探讨mdk在鼻咽癌组织中的表达情况及与鼻咽癌患者临床病理特征之间的相关性。方法利用免疫组化方法检测56例鼻咽癌组织标本与28例非癌鼻咽黏膜组织标本的mdk表达情况。结果 mdk在鼻咽癌患者中的表达较非癌鼻咽黏膜组织明显升高(P=0.... 详细信息

目的探讨mdk在鼻咽癌组织中的表达情况及与鼻咽癌患者临床病理特征之间的相关性。方法利用免疫组化方法检测56例鼻咽癌组织标本与28例非癌鼻咽黏膜组织标本的mdk表达情况。结果 mdk在鼻咽癌患者中的表达较非癌鼻咽黏膜组织明显升高(P=0.001)。高表达的mdk与鼻咽癌患者肿瘤临床分期(P=0.001)、N分期(P=0.000)、M分期(P=0.025)呈正性相关。结论 mdk在鼻咽癌组织中高表达,并且与鼻咽癌患者的恶性程度相关。

关键词：鼻咽癌 mdk 肿瘤标志物

LncRNA LBX2-AS1调控mdk对结肠癌细胞侵袭及转移的影响

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2023年第11期 191-197页

作者：李梦婷张志杰陈峭李灿赵正孝柳州市中医医院·柳州市壮医医院消化内科广西柳州545001

目的探讨LBX2-AS1调控mdk对CRC细胞侵袭及转移的影响。方法选取80例我院结肠癌患者的癌组织及癌旁组织,qPCR法检测LBX2-AS1在组织中的表达量并分析其与结肠癌临床病理特征的相关性。通过生物信息学预测、qPCR检测并结合双荧光素酶实验... 详细信息

目的探讨LBX2-AS1调控mdk对CRC细胞侵袭及转移的影响。方法选取80例我院结肠癌患者的癌组织及癌旁组织,qPCR法检测LBX2-AS1在组织中的表达量并分析其与结肠癌临床病理特征的相关性。通过生物信息学预测、qPCR检测并结合双荧光素酶实验分别验证LBX2-AS1与miR-219a-2-3p、miR-219a-2-3p及mdk的靶向关系。将细胞分为 CON组、OE-NC组、OE-LBX2-AS1组、OE-LBX2-AS1+miR-219a-2-3p mimics组。使用CCK实验、划痕、Transwell侵袭实验检测细胞增殖、侵袭和转移能力;通过qPCR及Western blot了解mdk、TGF-β1、Vimentin、snail的表达情况。结果与癌旁组织相比,LBX2-AS1 在 CRC组织中明显高表达,且表达水平与结肠癌的病理T分期以及淋巴结转移呈现正相关。生物信息学预测LBX2-AS1可作为ceRNA靶向调控miR-219a-2-3p促进mdk的表达,过表达LBX2-AS1后miR-219a-2-3p表达明显下降。双荧光素酶报告分析表明miR-219a-2-3p可分别作用于LBX2-AS1及mdk。与 CON组及NC 组相比,OE-LBX2-AS1组细胞增殖率升高,划痕距离缩短,侵袭细胞数增多,mdk、TGF-β1、Vimentin、snail表达增加;与OE-LBX2-AS1组相比,OE-LBX2-AS1+miR-219a-2-3p mimic组,细胞增殖率下降,划痕距离增宽,侵袭细胞数减少,mdk、TGF-β1、Vimentin、snail表达降低(Pmdk,并可能通过激活 TGFβ信号通路,促进Vimentin、snail的表达,从而促进结肠癌细胞侵袭及转移。

关键词： lncRNA LBX2-AS1 mdk 结肠癌侵袭转移

基于mdk RTX的Cortex-M3多任务应用设计

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单片机与嵌入式系统应用 2008年第12期8卷 30-33页

作者：方安平武永谊武汉理工大学

mdkRL-RTX是ARM公司推出的最新实时多任务内核,Cortex-M3是ARM公司最新发布的嵌入式处理器。将RL-RTX实时多任务内核应用到Cortex-M3处理器上,可大大提高代码密度,减少系统内存,提升系统性能。本文介绍了RL-RTX在Cortex-M3上的移植以及... 详细信息

mdkRL-RTX是ARM公司推出的最新实时多任务内核,Cortex-M3是ARM公司最新发布的嵌入式处理器。将RL-RTX实时多任务内核应用到Cortex-M3处理器上,可大大提高代码密度,减少系统内存,提升系统性能。本文介绍了RL-RTX在Cortex-M3上的移植以及多任务应用设计方法。

关键词： mdk RL-RTX Cortex-M3多任务应用

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《死亡追杀令》(mdk)全攻略

光盘技术 1997年第6期 47-48页

作者：张轲

如果你喜欢动作、射击的游戏,相信mdk绝对不会令你失望;除了有普通的射击外,又有飞行和滑雪,整个游戏充满了黑暗及罪恶。最令人赞叹的是,游戏要求的配置并不高:建议配置是P90,但在P75下也有极佳的流畅效果。不单如此,游戏的AI也有它的... 详细信息

如果你喜欢动作、射击的游戏,相信mdk绝对不会令你失望;除了有普通的射击外,又有飞行和滑雪,整个游戏充满了黑暗及罪恶。最令人赞叹的是,游戏要求的配置并不高:建议配置是P90,但在P75下也有极佳的流畅效果。不单如此,游戏的AI也有它的特点,mdk内的敌人不象其它射击游戏一样绝大部分由前面走出来。在mdk中,当你和前面的敌人在交战时,游戏内的再生器会把机械怪射至你的后方,从后面对你进行夹击。而且另外一个有趣

关键词： mdk 核子弹再生器

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