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采用maldi-tof MS和全基因组测序鉴定和分析动弯杆菌属及其亲缘关系

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中华微生物学和免疫学杂志 2018年第6期38卷 446-450页

作者：张雪英叶红李爱云叶光勇冯南马裕朱宇宁沈应博张嵘浙江大学医学院附属妇产科医院检验科杭州310016 中国农业大学动物医学院北京100193 浙江大学医学院附属第二医院检验科杭州310009

目的用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（maldi-tof MS）技术结合16S rRNA基因测序鉴定动弯杆菌，并通过全基因组测序分析动弯杆菌的耐药基因及该菌属种间亲缘关系。方法将65例细菌性阴道病（bacterial vaginosis，BV）患者的阴道分... 详细信息

目的用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（maldi-tof MS）技术结合16S rRNA基因测序鉴定动弯杆菌，并通过全基因组测序分析动弯杆菌的耐药基因及该菌属种间亲缘关系。方法将65例细菌性阴道病（bacterial vaginosis，BV）患者的阴道分泌物标本厌氧培养获得25株动弯杆菌，采用maldi-tof MS及16S rRNA基因测序鉴定细菌种属，并提取细菌全基因组DNA进行二代测序，测序后得到的原始数据根据SPAdes软件进行拼接组装，并与ARGD耐药基因库比对得到这些细菌含有的获得性耐药基因，最后通过Harvest软件对所有菌株进行核心基因组多样性比较，构建进化树。结果采用maldi-tof MS鉴定动弯杆菌属仅能获得柯氏动弯杆菌的鉴定结果；采用16S rRNA基因测序能将动弯杆菌属菌株区分为柯氏动弯杆菌和羞怯动弯杆菌；全基因组分析显示动弯杆菌主要含有四环素耐药基因tet（o）及大环内酯类耐药基因erm（x），其中tet（o）基因的检出率为84.7%，erm（x）基因的检出率为61.5%；动弯杆菌属两个种内亲缘关系相近，种间亲缘关系甚远。结论本实验结果表明目前maldi-tof MS不能鉴定出动弯杆菌属中的羞怯动弯杆菌；动弯杆菌对四环素类及大环内酯类抗生素具有潜在的耐药性；动弯杆菌在种内进化缓慢，暂无新种出现的趋势。

关键词：动弯杆菌细菌性阴道病(BV) maldi—tof MS 全基因组测序耐药基因

maldi-tof质谱技术分析与鉴定病原细菌研究

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微生物学通报 2009年第3期36卷 416-426页

作者：其布勒哈斯田世民邹明强贺银凤陈艳赵贵明内蒙古农业大学内蒙古呼和浩特010018 中国检验检疫科学研究院北京100123

基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-MS)技术分析供试细菌并获得其蛋白质图谱,确定了与质谱分析有关的最佳培养条件和样品前处理方法,建立了应用maldi-tof-MS鉴定细菌的方法。通过对供试的不同细菌属、种和亚种的12株植物... 详细信息

基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-MS)技术分析供试细菌并获得其蛋白质图谱,确定了与质谱分析有关的最佳培养条件和样品前处理方法,建立了应用maldi-tof-MS鉴定细菌的方法。通过对供试的不同细菌属、种和亚种的12株植物病原细菌全细胞分析后的质谱图结果表明,根据特异性或不同的质量离子峰,maldi-tof-MS能进行在细菌属、种、亚种和菌株水平上的区分和鉴定。该方法准确、灵敏度高,且分析过程简单快速,具有广泛的开发和应用意义。

关键词： maldi—tof MS 细菌质量指纹图谱鉴定

maldi-tof质谱技术研究胰岛素海藻酸钠纳米粒特性

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海洋科学 2006年第1期30卷 73-77页

作者：曾新华谢麟卓慧钦黄河宁林庆梅易瑞灶黄河清厦门大学生命科学学院福建省化学生物学重点实验室环境科学研究中心福建厦门361005 三明学院化学与生物工程系福建三明365000 国家海洋局第三海洋研究所福建厦门361005

从海洋生物中提取海藻酸纳和壳聚糖作为纳米粒的包被材料,并分别包装成人胰岛素纳米粒。选用基质辅助激光解吸离子化飞行时间(Matrix-assistedlaserdesorptionionization/timeofflight,maldi-tof)质谱技术研究胰岛素海藻酸钠纳米粒包装... 详细信息

从海洋生物中提取海藻酸纳和壳聚糖作为纳米粒的包被材料,并分别包装成人胰岛素纳米粒。选用基质辅助激光解吸离子化飞行时间(Matrix-assistedlaserdesorptionionization/timeofflight,maldi-tof)质谱技术研究胰岛素海藻酸钠纳米粒包装、释放过程及在不同酸碱介质条件下的稳定性。

关键词： maldi—tof 质谱胰岛素纳米粒包装稳定性

利用maldi-tof MS技术简便、快速检测水华蓝藻的方法研究

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环境监控与预警 2016年第4期8卷 9-12页

作者：孙丽伟江文静厉以强孙洪芹郭艳敏杜阳吕锡武东南大学能源与环境学院江苏南京210018 江苏省环境监测中心江苏南京210036

以水华蓝藻为研究对象,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof MS)技术对其进行测定分析并获得了蛋白质指纹图谱。对铜绿微囊藻标准株(NIES-843)样品通过3种前处理方法得到的质谱图进行对比,确定了质谱分析的样品前处理方法,建... 详细信息

以水华蓝藻为研究对象,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof MS)技术对其进行测定分析并获得了蛋白质指纹图谱。对铜绿微囊藻标准株(NIES-843)样品通过3种前处理方法得到的质谱图进行对比,确定了质谱分析的样品前处理方法,建立了利用maldi-tof MS技术简便、快速检测水华蓝藻的方法。对在水华中出现的4种不同蓝藻进行maldi-tof MS分析,结果表明各种蓝藻具有其特征性波谱,可据此对水华蓝藻进行区分和鉴定。该方法快速、简便、精确、可程序化,具有广泛的应用前景。

关键词： maldi—tof MS 水华蓝藻质量指纹图谱快速检测

应用maldi-tof质谱技术检测多发性骨髓瘤Jak2基因单核苷酸多态性

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中国实验血液学杂志 2009年第5期17卷 1234-1237页

作者：仲悦娇陈宝安程璐冯继峰李玉峰钱军丁家华程坚高峰夏国华孙宁张琰张孝平许佩佩陆祖宏东南大学临床医学院附属中大医院血液科江苏南京210009 东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室江苏南京210096 江苏省肿瘤研究所江苏南京210009 淮安市第一人民医院江苏淮安223300 镇江市第一人民医院江苏镇江212002

本研究探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(maldi-tofMS)检测多发性骨髓瘤(MM)jak2基因的单核苷酸多态性(SNP)的实用性。用PCR扩增出含jak2基因2个SNP(C428T和C643T)位点的DNA片段作为模板,产物纯化后利用maldi-tofMS检测5例MM和... 详细信息

本研究探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(maldi-tofMS)检测多发性骨髓瘤(MM)jak2基因的单核苷酸多态性(SNP)的实用性。用PCR扩增出含jak2基因2个SNP(C428T和C643T)位点的DNA片段作为模板,产物纯化后利用maldi-tofMS检测5例MM和5例健康对照者样本的jak2基因多态性。结果表明:C428T和C643T位点基因型在多发性骨髓瘤病例与健康对照组的分布无差异,均为T/T纯合子。结论:本实验建立的基于maldi-tofMS与引物延伸技术检测jak2基因多态性的方法是一个快速、准确和可靠的检测方法。

关键词： jak2 多性骨髓瘤 maldi—tof MS 单核苷酸多态性

以甘-谷二肽为构筑单元的扇形树状分子的合成与表征

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高分子学报 2006年第5期16卷 712-716页

作者：李武松吉岩贾欣茹王冰冰危岩北京大学化学与分子工程学院北京100871 Department of Chemistry Drexel University

The synthesis and characterization of a series of peptide dendronswith glycin（Gly） and glutamate（Glu） as building blocks were *** dendrons were prepared with convergent method by protection,deprotection and DCC coupling *** the characterization of elemental analysis,（）1H-NMR,（）13C-NMR,FTIR,EI-MS and MAILD-tof MS,the designed molecular structure was *** could be predicted that the obtained compounds will exhibit unique properties and potential applications in the fields of biology,medicine and so *** studies on the properties of these compounds are in progress.

关键词：甘氨酸-谷氨酸树枝状分子多肽合成 maldi—tof

利用Yamamoto偶联反应合成碱基官能化的共轭聚合物研究

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华东理工大学学报（自然科学版） 2014年第5期40卷 549-554页

作者：朱秀娟陈淑丹胡爱国华东理工大学材料科学与工程学院上海市先进聚合物材料重点实验室上海200237

将碱基官能化和共轭聚合物结合起来具有重要的研究意义。本文设计合成了间二溴苯修饰的碱基化合物——二溴苯基腺嘌呤和二溴苯基胸腺嘧啶。采用过渡金属镍催化的Yamamoto反应合成了侧链带有碱基的共轭聚合物。通过核磁、红外、紫外可见... 详细信息

将碱基官能化和共轭聚合物结合起来具有重要的研究意义。本文设计合成了间二溴苯修饰的碱基化合物——二溴苯基腺嘌呤和二溴苯基胸腺嘧啶。采用过渡金属镍催化的Yamamoto反应合成了侧链带有碱基的共轭聚合物。通过核磁、红外、紫外可见光谱、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(maldi-tof)等方法对所得聚合物进行了分析表征。

关键词：碱基共轭聚合物 Yamamoto反应 maldi—tof

我国脑膜炎奈瑟菌孔蛋白PorA、PorB的多态性分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2007年第3期27卷 218-221页

作者：胡源邵祝军闫笑梅李波清赵飞肖迪任军郑明寰樊春祥何利华徐丽顾一心姜海郭凤华李马超陆美娟陈霞邹清华孟凡亮张建中中国疾病预防控制中心传染病预防控制所诊断室北京102206 中国疾病预防控制中心呼吸道传染病室北京102206 安徽省疾病预防控制中心

目的以蛋白质组学研究为基础，分析2003-2005年我国流脑暴发流行期间C群脑膜炎奈瑟菌菌株特征，建立以致病性相关蛋白多态性为目标的新分型方法。方法利用双向电泳和maldi-tof质谱鉴定分析2003-2005年流脑流行期内分离的66株C群脑膜炎... 详细信息

目的以蛋白质组学研究为基础，分析2003-2005年我国流脑暴发流行期间C群脑膜炎奈瑟菌菌株特征，建立以致病性相关蛋白多态性为目标的新分型方法。方法利用双向电泳和maldi-tof质谱鉴定分析2003-2005年流脑流行期内分离的66株C群脑膜炎奈瑟菌菌株及2株参考菌株的蛋白表达，重点分析与致病性相关的蛋白多态性特征。结果根据孔蛋白PorA、PorB在双向电泳中的多态性，建立了12个特征菌型。安徽菌株的PorA和PorB蛋白电泳谱型显示出了高度的一致性，而其他地区的菌株则显示出高度的多态性。结论PorA和PorB蛋白2-DE电泳谱型可以作为一种新的菌株分型方法，可能在菌型变迁检测和流脑暴发预警中具有重要应用前景。

关键词：脑膜炎奈瑟菌 PorA PorB 2-DE maldi—tof

长双歧杆菌NCC2705葡萄糖与乳糖代谢的比较蛋白质组学

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微生物学报 2008年第11期48卷 1451-1458页

作者：何湘刘大伟孙忠科王芳姜铮赵红庆陈宣男黄留玉袁静军事医学科学院疾病预防控制研究所北京100071 吉林大学公共卫生学院长春130021

【目的】以本实验室前期构建的长双歧杆菌NCC2705菌株蛋白质参考图谱为基础,研究长双歧杆菌发酵乳糖和葡萄糖的比较蛋白质组学。【方法】采用ImageMaster 2D Elite Platnum Version5.0比较分析3倍以上蛋白差异点;利用maldi-tof进行差异... 详细信息

【目的】以本实验室前期构建的长双歧杆菌NCC2705菌株蛋白质参考图谱为基础,研究长双歧杆菌发酵乳糖和葡萄糖的比较蛋白质组学。【方法】采用ImageMaster 2D Elite Platnum Version5.0比较分析3倍以上蛋白差异点;利用maldi-tof进行差异蛋白鉴定,每个蛋白质点的肽指纹图谱在长双歧杆菌NCC2705菌株的蛋白质数据库用Mascot进行检索;采用Pro-Q磷酸化试剂进行磷酸化蛋白的染色。【结果】鉴定到31个蛋白表达发生显著变化,在乳糖发酵中14个蛋白上调17个蛋白下调。这些蛋白为亲水性酸性蛋白,它们基因的CAI值均在0.5以上,主要包括糖代谢相关蛋白、应激蛋白、转录和翻译相关蛋白,还有一些未知功能的蛋白。此外,有两个蛋白:转醛缩酶(BL0715,transaldolase,tal)L3蛋白点和丙酮酸激酶(BL0988,pyruvate kinase,pyk)G9蛋白点发生了磷酸化作用。【结论】长双歧杆菌NCC2705在乳糖中生长快于葡萄糖,它们的降解途径是相同的;转醛缩酶和丙酮酸激酶发生了翻译后修饰作用,推测转醛缩酶在43T和47S发生了磷酸化,而丙酮酸激酶在65S发生了磷酸化。

关键词：比较蛋白质组乳糖代谢双向电泳 Pro—Q Diamond染色 maldi—tof 磷酸化蛋白