检索结果-南通市图书馆

植物资源与环境学报 2022年第2期31卷 39-48页

作者：连辉江淑珍熊远芳沈军陈世品福建农林大学林学院福建福州350002 福建农林大学园林学院兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室福建福州350002

以米槠〔Castanopsis carlesii(Hemsl.)Hayata〕花芽期、半开期和盛花期的雄花为研究材料,利用高通量测序平台构建米槠雄花发育过程的转录组数据库。分别对花芽期与半开期、半开期与盛花期以及花芽期与盛花期进行比较,筛选与雄花发育相... 详细信息

以米槠〔Castanopsis carlesii(Hemsl.)Hayata〕花芽期、半开期和盛花期的雄花为研究材料,利用高通量测序平台构建米槠雄花发育过程的转录组数据库。分别对花芽期与半开期、半开期与盛花期以及花芽期与盛花期进行比较,筛选与雄花发育相关的差异表达unigenes,并对差异表达unigenes进行功能注释。同时对米槠mads-box家族基因进行鉴定,分析其在米槠雄花发育3个时期的表达量变化。结果显示:在获得的转录组中,clean reads数为628800000~643700000,高质量总碱基量为6.29~6.44 Gb,Q30碱基百分比均不小于90.67%,GC含量为45.09%~45.39%。花芽期与半开期、半开期与盛花期以及花芽期与盛花期间分别有15086、6770和16150个差异表达unigenes。GO功能注释结果显示:差异表达unigenes主要注释在催化活性、连接和膜等相关的生物过程。KEGG代谢通路注释结果显示:差异表达unigenes主要注释在全局及概要图、碳水化合物代谢、环境适应性和信号转录等相关的代谢通路。说明催化酶在米槠雄花发育过程有重要作用,注释在细胞组分中的差异表达unigenes主要与花粉成熟相关,同时雄花发育受碳水化合物代谢和转录因子的调控。表达量分析发现,米槠type-Ⅱ型mads-box家族基因在雄花发育过程中的表达具有差异性。SHP和AG基因表达趋势相似,在花芽期表达量较低,半开期和盛花期表达量升高;AP 3基因随着雄花发育表达量逐渐升高;2个MIKC*类同源基因主要在半开期表达;3个AP1/FUL类同源基因在雄花发育3个时期中均有表达,但表达趋势有差异;AGL 6基因在雄花发育3个时期表达量均较高;4个SEP类同源基因在雄花发育中表达量较高,其中,SEP 3基因表达量最高,在雄花发育3个时期的表达量变化不大,其余3个SEP类同源基因均在盛花期表达量升至最高。综合分析结果表明:在米槠雄花转录组中,多数差异表达unigenes的功能与花粉发育和催化酶的作用相关,且参与碳水化合物代谢和转录等代谢通路。mads-box家族基因在雄花发育的3个时期差异表达,与雄花发育密切相关。

关键词：米槠雄花转录组差异表达unigenes mads-box家族基因

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烟草mads-box家族基因保守片段的克隆与序列分析

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中国烟草科学 2011年第3期32卷 21-27页

作者：李元元杨爱国王鲁罗成刚贾兴华刘贯山苏振刚王元英中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室青岛266101 中国农业科学院研究生院北京100081

mads-box家族基因在植物的生长发育过程中具有重要功能。在烟草生产中出现的早花现象与mads-box家族基因相关,为了能从烟草中克隆出与开花时间相关的基因,根据不同植物mads-box家族基因的保守区序列,设计简并引物,采用RT-PCR技术从烟草... 详细信息

mads-box家族基因在植物的生长发育过程中具有重要功能。在烟草生产中出现的早花现象与mads-box家族基因相关,为了能从烟草中克隆出与开花时间相关的基因,根据不同植物mads-box家族基因的保守区序列,设计简并引物,采用RT-PCR技术从烟草品种NC82茎尖中成功分离出27条cDNA片段,长度在122～146 bp之间。序列分析表明,其中有16条具有mads_MEF2类保守结构域,其推导的氨基酸序列与拟南芥等mads-box家族基因具有同源性,相似性平均能达到76%,并具有15个保守的氨基酸位点,其中7个位点参与蛋白与DNA的相互作用,4个位点具有蛋白二聚化功能。系统发育分析结果表明,这些保守片段分别和拟南芥9个不同的mads-box家族基因亚类最近似,其中许多亚家族与成花相关,说明NC82中存在具有调控开花的mads-box家族基因表达,并可能与NC82低温敏感,易早花特性相关。

关键词：烟草 mads-box家族基因 RT-PCR 序列分析

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甜樱桃成花相关mads-box基因的克隆及表达分析

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果树学报 2018年第1期35卷 20-31页

作者：段续伟倪杨张晓明闫国华王晶周宇张开春北京市林业果树科学研究院.北京市落叶果树工程技术研究中心.农业部都市农业(华北)重点实验室北京100093

【目的】克隆甜樱桃中可能参与成花途径的mads基因,分析其基本信息,研究其在不同组织中的表达情况。【方法】以甜樱桃‘萨米特’(‘Summit’)为试材,结合桃基因组分析,克隆得到14个可能参与成花的mads基因,分别命名为PaSOC1、PaAG、PaAP... 详细信息

【目的】克隆甜樱桃中可能参与成花途径的mads基因,分析其基本信息,研究其在不同组织中的表达情况。【方法】以甜樱桃‘萨米特’(‘Summit’)为试材,结合桃基因组分析,克隆得到14个可能参与成花的mads基因,分别命名为PaSOC1、PaAG、PaAP1、PaAP1-2、PaAP3、PaPI、PaSVP、PaAGL24、PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5、PaFLC,通过DNAMAN、SMART、protein BLAST和MEGA5等软件分析14个甜樱桃的mads基因结构、氨基酸结构域及其进化关系,RT-PCR检测其在樱桃根、叶芽、叶、花芽、花、韧皮部中的表达模式。【结果】14个甜樱桃mads成员大小为612~765 bp,均含有典型的mads结构域和K-box结构域,含有6~8个内含子。分属7个亚组,PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5属于SEP亚组,PaAP1、PaAP1-2属于AP1亚组,PaAG属于AG亚组,PaSOC1属于SOC1亚组,PaAP3和PaPI属于AP3/PI亚组,PaSVP属于SVP亚组,PaAGL24属于AGL24亚组,PaFLC并未聚到FLC亚组中。RT-PCR分析显示,14个mads基因在花芽或花中均有不同程度的表达,此外,除PaAP3、PaSEP1、PaSEP4及PaSEP5之外,其他几个基因在韧皮部中也有不同程度的表达。【结论】获得的甜樱桃mads-box基因结构高度保守,参与调控成花及花发育过程。

关键词：甜樱桃 mads-box家族基因信息学分析表达分析

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