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分子植物育种 2023年

作者：汪美佳张震王文波王瑞张雪娇王文和王聪胡增辉冷平生何祥凤北京农学院林木分子设计育种高精尖创新中心北京农学院园林学院

脂肪氧合酶(Lipoxygenase， EC1.***.11.12，简称lox)是一种氧化还原酶，通常被认为是一类含有非血红素铁的蛋白质，能催化植物体内酚基甘油酯产生脂肪酸衍生物。另外，现有研究表明，脂氧合酶途径与植物的生长发育及抗逆反应密切相关... 详细信息

脂肪氧合酶(Lipoxygenase， EC1.***.11.12，简称lox)是一种氧化还原酶，通常被认为是一类含有非血红素铁的蛋白质，能催化植物体内酚基甘油酯产生脂肪酸衍生物。另外，现有研究表明，脂氧合酶途径与植物的生长发育及抗逆反应密切相关。槲树是优良的绿化树种，能够抵抗多种不良环境。为了进一步研究槲树lox基因家族的功能，本研究利用生物信息学工具，系统地对槲树基因组中lox基因家族成员进行鉴定，并对其进化关系、基因结构、蛋白质理化性质和保守基序、共线性分析以及顺式作用元件和组织特异性表达进行分析。结果表明，槲树全基因组中鉴定出18个lox家族基因，命名为Qdlox1～Qdlox18；根据系统发育树可以将lox基因分为2个亚家族(9-lox， 13-lox)，各基因成员分布于6条染色体上，其中2对基因存在串联复制现象；保守基序分析表明，槲树lox家族蛋白的保守基序具有很高的保守性；共线性分析表明，大部分同源基因结构具有相似性；转录组结果表明，Qdlox2基因在根、茎和叶中高表达。本研究结果表明槲树lox基因家族发生了扩张，为进一步研究lox基因家族与木本植物生长发育及抗逆反应的关系提供理论依据。

关键词：槲树脂肪氧合酶 lox基因家族进化分析

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杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究

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植物研究 2019年第6期39卷 927-934页

作者：朱利利庆军杜庆鑫何凤杜红岩中国林业科学研究院经济林研究开发中心郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心郑州450003

lox(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对lox基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特... 详细信息

lox(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对lox基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特征、分类和功能等。结果显示:杜仲lox基因家族有23条lox基因序列,分别定位于细胞质或叶绿体中,分为9-lox和13-lox两个亚家族,其中9-lox类型仅包含一个,13-lox类型包含22个;23个lox基因非平均分布于12条scaffolds上,一些基因发生串联分布;RNA-Seq表达结果显示6个13-lox类型基因在杜仲叶、果、树皮和种仁中几乎没有表达,而其他17个lox基因表达具有组织和时空表达特异性。研究结果为揭示杜仲lox基因家族成员的功能提供重要线索,为进一步研究lox基因家族提供理论基础。

关键词：杜仲 lox基因家族生物信息学基因功能

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基于EST库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆

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园艺学报 2008年第3期35卷 337-342页

作者：张波李鲜陈昆松浙江大学果实分子生理与生物技术实验室农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室杭州310029

利用猕猴桃EST库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了lox基因家族成员6个,命名为Adlox1-6。Adlox1、Adlox2、Adlox3和Adlox4为全长cDNA,编码区长度分别为2739、2595、2739和2709bp,Adlox5和Adlox6为cDNA片段,长度为1359和1557bp。猕猴桃Adlox2和Adlox5氨基酸序列同源性最高,约74%,而Adlox3和Adlox5仅为49%。生物信息学分析表明,Adlox1、Adlox3、Adlox4和Adlox6可能具有13-lox活性,在N端含有额外约60个氨基酸残基,而Adlox2和Adlox5则属于9-lox类型。猕猴桃Adlox1与番茄TomloxD具有最高氨基酸序列同源性(约80%),Adlox2和Adlox5与TomloxA高度聚类,序列同源性分别为68%和75%,Adlox4和Adlox6与TomloxC的氨基酸序列同源性分别为62%和63%,Adlox3与番茄lox基因序列同源性低于55%。

关键词：猕猴桃脂氧合酶 lox基因家族 EST 克隆

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桃脂氧合酶基因家族生物信息学及其表达特性分析

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果树学报 2016年第3期33卷 257-267页

作者：郭绍雷张斌斌马瑞娟俞明亮宋志忠南京农业大学园艺学院南京210095 江苏省农业科学院园艺研究所.江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014

【目的】脂氧合酶（lipoxygenase;lox;linoleate oxygen oxidoreductase;EC1.***.11.12）作为一种重要的酶,广泛参与植物生长、发育、成熟、衰老及植物抗逆过程,因其重要作用一直是国内外研究的重点和热点。研究利用生物信息学方法对桃LO... 详细信息

【目的】脂氧合酶（lipoxygenase;lox;linoleate oxygen oxidoreductase;EC1.***.11.12）作为一种重要的酶,广泛参与植物生长、发育、成熟、衰老及植物抗逆过程,因其重要作用一直是国内外研究的重点和热点。研究利用生物信息学方法对桃lox基因家族进行发掘和预测,以期为桃lox家族基因鉴定和功能分析提供基础信息,并在分子水平上为桃品种改良及采后保鲜提供明确的候选基因。【方法】采用生物信息学方法研究了桃lox基因家族成员数目、系统进化关系、假定蛋白质结构及分类,运用q RT-PCR技术研究lox基因家族在桃特异组织中的表达模式。【结果】桃lox基因家族包含13个假定蛋白,9-lox和13-lox类型分别有6个成员,另外存在1个特殊类型,与苹果具有相似性;桃lox蛋白氨基酸序列一致性在33.76%-90.84%;13个lox家族成员绝大多数是两性氨基酸,9-lox类型的6个家族成员的理论等电点都小于7,13-lox类型各等电点没有规律;13个蛋白质的二级结构除ppa017962m外以无规则卷曲为主要构成元件;染色体定位分析表明,lox家族基因并非平均分布在桃的8条染色体上,其中6号染色体上桃lox基因分布最多,ppa017962m未定位在任何特异染色体上;q RT-PCR的组织特异性表达结果表明,lox基因家族主要在果实和茎中的相对表达量较高。【结论】分离并鉴定了13个桃lox家族基因,其不均匀地分布在桃染色体上;多数桃lox基因主要在果实和茎部表达;ppa001634m、ppa001082m、ppa001216m、ppa001016m、ppa017962m在果实中的表达量最高,可能参与调控桃果实衰老软化过程。

关键词：桃 lox基因家族生物信息学基因表达

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