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knox Balbastro 见证创意女性领袖的力量

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现代广告 2019年第14期 34-35页

作者：戴莉娟 knox Balbastro(口述) 不详阿里巴巴集团

knox’s personal slogan is'evolve always'.That’s why her career has spanned every shape and screen advertising can fit in--from activations to TVCs,tech builds to social media.As the former social media creative lead at Digitas,she pushed creative boundaries creating campaigns for Disney Studios,Marvel,and Star Wars across the region.Her next big leap:championing creativity at the Alibaba headquarters in Hangzhou,China.As a staff content strategist,her goal is to create a brand voice for globale-commerce platform AliExpress while driving content for the new retailtainment landscape.

关键词：全球速卖通阿里巴巴集团 knox Balbastro 代理公司

甘蓝型油菜Bnknox基因家族的鉴定与分析

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作物学报 2023年第11期49卷 2991-3006页

作者：陈吴钧刘江栋蒋凯旋王幼平蒋金金扬州大学生物科学与技术学院江苏扬州225009

植物特异的KNOTTED-LIKE HOMEOBOX(knox)蛋白属于转录调控因子家族,该家族在植物生长发育过程和各种胁迫应答中发挥着重要的作用。knox蛋白中存在4个保守的结构域:TALE(three amino acid loop extension)类型的HD(homeodomain)、ELK结构... 详细信息

植物特异的KNOTTED-LIKE HOMEOBOX(knox)蛋白属于转录调控因子家族,该家族在植物生长发育过程和各种胁迫应答中发挥着重要的作用。knox蛋白中存在4个保守的结构域:TALE(three amino acid loop extension)类型的HD(homeodomain)、ELK结构域,以及2个亚结构域knox1和knox2。目前,甘蓝型油菜的Bnknox基因家族还未有系统的研究报道。本研究通过生物信息学分析鉴定获得甘蓝型油菜的36个Bnknox家族成员。通过序列比对和系统发育树分析,将其分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅱ和M类)。进化分析表明,全基因组复制(whole genome duplication,WGD)和片段复制(segmental duplication)是Bnknox基因家族扩张的主要动力。基于甘蓝型油菜不同发育时期组织/器官的RNA-seq分析发现,该基因家族的BnKNAT25/26/29/30在胚乳和种子发育过程中特异表达,而BnKNAT31/32/34在成熟种子中高表达。通过Bnknox家族的顺式作用元件分析和非生物胁迫条件下的表达模式分析,本文鉴定获得17个响应干旱和渗透胁迫的Bnknox成员。

关键词：甘蓝型油菜 knox 基因家族表达模式非生物胁迫

PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE1 is Required for Inflorescence Meristem and Organ Development in Arabidopsis

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Journal of Integrative Plant Biology 2013年第8期55卷 682-695页

作者： Chengwu Liu Hengfu Yin Peng Gao Xiaohe Hu Jun Yang Zhongchi Liu Xiangdong Fu Da Luo National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics Institute of Plant Physiology and EcologyShanghai Institutes for Biological Sciencesthe Chinese Academy of Sciences State Key Laboratory of Biocontrol School of Life SciencesSun Yat-sen University Department of Cell Biology and Molecular Genetics University of MarylandCollege ParkMD 20742USA State Key Laboratory of Plant Cell and Chromosome Engineering Institute of Genetics and Developmental Biologythe Chinese Academy of Sciences

Phosphatidylserine （PS）, a quantitatively minor membrane phospholipid, is involved in many biological processes besides its role in membrane structure. One PS synthesis gene, PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE1 （PSSl）, has been discovered to be required for microspore development in Arabidopsis thaliana L. but how PSS1 affects postembryonic development is still largely unknown. Here, we show that PSSl is also required for inflorescence meristem and organ development in Arabidopsis. Disruption of PSSI causes severe dwarfism, smaller lateral organs and reduced size of inflorescence meristem. Morphological and molecular studies suggest that both cell division and cell elongation are affected in the pssl-1 mutant. RNA in situ hybridization and promoter GUS analysis show that expression of both WUSCHEL （WUS） and CLA VA TA3 （CL V3） depend on PSS1. Moreover, the defect in meristem maintenance is recovered and the expression of WUS and CLV3 are restored in the pssl-1 clvl-1 double mutant. Both SHOOTSTEMLESS （STM） and BREVIPEDICELLUS （BP） are upregulated, and auxin distribution is disrupted in rosette leaves of pssl-1. However, expression of BP, which is also a regulator of internode development, is lost in the pssl-1 inflorescence stem. Our data suggest that PSS1 plays essential roles in inflorescence meristem maintenance through the WUS-CLV pathway, and in leaf and internode development by differentially regulating the class I knox genes.

关键词： Arabidopsis CLV3 knox WUS meristem,

组织表达分析瓠瓜knox基因家族全基因组鉴定及

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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2023年 1-10页

作者：徐晓燕黄小忠刘万仙张曼江苏农林职业技术学院茶与食品科技学院江苏省农业科学院蔬菜研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

【目的】探明瓠瓜knox基因家族特征,在瓠瓜全基因组水平上对knox基因家族成员进行鉴定和分析,研究其组织表达模式。【方法】利用生物信息学方法,对瓠瓜knox家族基因成员进行鉴定、编码蛋白理化性质分析及家族成员结构域和保守基序分析,利用MEGA 5.05软件构建系统进化树,采用实时荧光定量PCR技术,分析knox基因在瓠瓜不同组织(根、茎、叶、花、果实)中的表达情况。【结果】鉴定到12个瓠瓜knox家族基因,这些基因分布在6条染色体上,且均定位于细胞核。大多数瓠瓜knox家族蛋白含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域knox1、knox2、ELK和Homeobox＿KN。系统进化分析将瓠瓜knox基因分为knox ClassⅠ和knox ClassⅡ2大类群,2个类群又可进一步分为5个分支,其中ClassⅠ-C为瓠瓜特有的进化分支。knox基因启动子区有多个激素响应元件和植物生长相关元件。组织表达分析发现,瓠瓜knox基因具有不同的表达模式,knox ClassⅠ类基因表达具有组织特异性,在根、茎和果实中表达量较高,在其余组织中表达量较低或不表达,其中Lsi04G014450在根和茎中表达量最高,Lsi11G006380在果实中表达量最高;knox ClassⅡ类基因在所有组织中均有较高表达。【结论】瓠瓜knox基因家族有12个成员,分布于6条染色体上,在进化关系上可分为5组,具有瓠瓜特有的进化分支,在不同组织中的表达具有特异性。

关键词：瓠瓜 knox 生物信息学组织表达

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玉米knox基因家族鉴定及表达分析

分子植物育种 2023年第3期21卷 708-716页

作者：王纪良姬祥卓金兵兵陈奋奇白明兴彭云玲甘肃农业大学农学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室兰州730070

knox基因家族存在于大部分植物体中,是同源异型盒基因家族的一类,其编码的转录因子参与调控植物的模式形成、形态建成等生理活动。用含有knox结构域的隐马尔可夫模型文件(PF03790,PF03791)作为探针结合Hmmsearch软件,对玉米(Zea mays L.... 详细信息

knox基因家族存在于大部分植物体中,是同源异型盒基因家族的一类,其编码的转录因子参与调控植物的模式形成、形态建成等生理活动。用含有knox结构域的隐马尔可夫模型文件(PF03790,PF03791)作为探针结合Hmmsearch软件,对玉米(Zea mays L.)基因组中knox家族成员进行了鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化树、基因在染色体定位、顺式作用元件和组织特异性表达模式进行了分析。通过hmmer搜索鉴定出16个玉米knox基因,其蛋白的氨基酸数在154~484之间,分子量在16.3~52.9 kD之间,等电点在4.33~7.74之间,其成员基因主要位于细胞核。根据玉米和拟南芥knox基因进化树分析,可将其分为2个进化分支。染色体定位结果表明,玉米knox基因家族的16个家族成员分布于9条不同染色体。1号染色体(Chr.01)分布6个成员,其中2个成员基因为串联重复基因。除Zmknox8和Zmknox9外,所有成员启动子区域都存在多个响应激素、光和逆境信号的cis-element。此外,Zmknox14和Zmknox15在嫩叶中表达量最高,可能与玉米叶细胞中次生细胞壁沉积作用有关。本研究为进一步了解knox的进化特征和功能提供参考。

关键词：玉米 knox 基因家族生物信息学分析

CiKN6对柑橘叶形及光合的影响和转基因材料的创制

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CiKN6对柑橘叶形及光合的影响和转基因材料的创制

作者：邓罗华中农业大学

学位级别：硕士

植物叶片的形态多样,一直是发育生物学研究的热点。叶形与植株的光合效率和蒸腾效率密切相关,一定的程度上可以影响作物的生产量。在几乎都是单叶性状的柑橘类果树中,枳（Citrus trifoliata）独特的三出复叶性状可作为杂交后代选育的标... 详细信息

植物叶片的形态多样,一直是发育生物学研究的热点。叶形与植株的光合效率和蒸腾效率密切相关,一定的程度上可以影响作物的生产量。在几乎都是单叶性状的柑橘类果树中,枳（Citrus trifoliata）独特的三出复叶性状可作为杂交后代选育的标记性状。如果能够筛选出调控柑橘叶形发育的关键基因,可以以该基因作为柑橘杂交后代选育的分子标记,为育种早期选择提供便利。本课题以单叶的柠檬（Citrus limon）和三叶的枳作为研究材料,通过转录组分析筛选出9个参与叶形发育的KNOTTED1-like homeobox（knox）家族基因,发现Ci KN6与叶形发育密切相关,所以选择Ci KN6进行深入研究,并探讨了Ci KN6参与柑橘叶形发育的机制。主要研究结果如下:1.利用转录组测序（RNA-seq）分析叶形发育过程中的关键基因,首先把柠檬和枳的叶片发育过程分为4个阶段:裂叶形成初期（S1）、裂叶完全成形期（S2）、叶片发育中期（S3）、叶片成熟期（S4）。将S1时期的柠檬和枳叶片、S1时期和S2时期的枳叶片作为样本进行转录组测序,将这两个样本的差异表达基因（DEGs）进行成对比较分析,筛选出604个与裂叶形成相关的候选基因,包括了9个knox同源家族基因,对比Ci KN6在不同叶形柑橘中的表达模式,发现在叶片发育的4个时期,枳中的Ci KN6表达量均要高于柠檬,尤其在裂叶形成初期。将Ci KN6转化拟南芥（Arabidopsis）,超表达拟南芥出现裂叶表型,说明Ci KN6的表达能够影响植物叶形发育。将35S:Ci KN6超表达载体稳定转化柠檬,转基因柠檬的叶边缘出现锯齿,柠檬叶片的解剖学结构与枳变得更加的相似。2.对35S:Ci KN6柠檬植株转录组测序结果进行生信分析,发现DEGs富集在细胞骨架建成,应激反应、激素代谢、细胞周期等生物过程。选择激素调控途径进行探究,结果显示35S:Ci KN6柠檬植株生长素含量明显高于野生型。对35S:Ci KN6柠檬叶缘和叶中部的生长素合成、运输相关基因进行定量分析,发现叶缘和叶中部这些基因的表达具有显著差异。用DR5对叶片生长素分布进行可视化观察,相比几乎观察不到生长素信号的野生型柠檬,35S:Ci KN6柠檬叶片有明显的生长素信号分布在叶缘与叶片褶皱处;说明35S:Ci KN6柠檬叶形的发育受生长素调控。另外,对35S:Ci KN6柠檬叶片的光合性能进行了探究,发现Ci KN6的表达影响了植株的光合速率。

关键词：柑橘 knox 叶形生长素

Genome-Wide Identification, Classification and Evolutionary Expansion of knox Gene Family in Rice (Oryza sativa) and Populus(Populustrichocarpa)

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American Journal of Plant Sciences 2018年第6期9卷 1071-1092页

作者： Haizheng Xiong Ainong Shi Dianxing Wu Yuejin Weng Jun Qin Waltram Second Ravelombola Xiaoli Shu Wei Zhou State Key Lab of Rice Biology Institute of Nuclear Agricultural Sciences Zhejiang University Hangzhou China University of Arkansas Division of Agriculture Dept. of Horticulture 316 PTSC University of Arkansas Fayetteville AR USA

The knox gene family codes for transcriptional regulators with a variety of functions in plant developmental and physiological processes. In this study, a genome-wide comparative analysis of knox genes in Poplar (Populustrichocarpa) and rice (Oryza sativa L. ssp. japonica) was carried out. With comprehensive computational analyses, which take into account the gene structures, phylogeny and conserved motifs, 15 and 13 knox genes in Poplar and rice were identified, respectively. These knox genes were further divided into 3 groups. The Poplar gene POPTR_0012s04040 and the rice genes LOC_Os03g47042 and LOC_Os03g47022 were classified to a new group of knox genes without ahomeobox domain together with KNATM, which were proposed to play potential role in plant development and pluripotency. The identification of KNATM homolog in monocotyledons (rice) provided a strong support for proposing an ancient shuffling of HOMEOBOX gene with MEINOX gene took place in the knox phylogeny. Using subcellular location information, GO (gene ontology) and expression profile analysis, knox genes in rice and poplar were proposed to function similarly to the members in Arabidopsis. Our observations may lay the foundation for future functional analysis of knox genes in rice and poplar to unravel their biological roles in cellular pluripotency.

关键词： knox Family Evolutionary Expansion Oryza sativa Populustrichocarpa

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水稻转录因子OsTCP15的功能研究

水稻转录因子OsTCP15的功能研究

作者：林增顺湖南农业大学

学位级别：硕士

为了研究水稻倒伏的分子生物学机制,为水稻抗倒伏高产优质育种提供基因资源。本研究采用水稻OsTCP15融合VP64(VP64为转录激活子基序)的CaMV35S过表达得到的茎秆强度显著增强的水稻OsTCP15-VP、单独CaMV35S过表达OsTCP15转化野生型水稻... 详细信息

为了研究水稻倒伏的分子生物学机制,为水稻抗倒伏高产优质育种提供基因资源。本研究采用水稻OsTCP15融合VP64(VP64为转录激活子基序)的CaMV35S过表达得到的茎秆强度显著增强的水稻OsTCP15-VP、单独CaMV35S过表达OsTCP15转化野生型水稻得到的OsTCP15-OE、水稻OsTCP15融合EAR(EAR为转录抑制子基序)的CaMV35S过表达得到的OsTCP15-EAR等3个转基因株系及其野生型(WT)材料,对它们进行了维管束数目、厚壁组织厚度、木质素沉积等表型分析;茎秆力学性能分析;茎秆节间次生细胞壁成分分析;转录组分析及荧光定量PCR验证;OsTCP15的组织表达模式及其在转基因株系的过表达分析;knox表达量检测验证及其组织表达模式分析;水稻OsTCP15蛋白与OSH15启动子的互作分析。获得了如下主要研究结果。(1)水稻OsTCP15-VP、OsTCP15-OE两个转基因株系均比其WT的茎秆维管束数目增多,木质素含量减少,茎秆维管系统的厚壁组织变厚;而水稻OsTCP15-EAR转基因株系比其WT的茎秆维管束数目减少,木质素含量增加,茎秆维管系统的厚壁组织变薄。(2)水稻OsTCP15-VP和TCP15-OE两个转基因株系均比其WT的茎秆拉力强度增加,纤维素含量增加,半纤维素中葡萄糖含量增加;而水稻OsTCP15-EAR转基因株系的茎秆拉伸强度比其WT的降低,纤维素含量降低,半纤维素中葡萄糖含量减少。(3)水稻OsTCP15-VP和TCP15-OE两个转基因株系分别与其WT相比较,其的木质素合成基因OsPAL1、纤维素合成基因OsCESA4、半纤维素合成基因OsGT43与次生壁合成关键调控基因OsSWN1、OsSWN2、OsSWN7、OsMYB46等的表达均下调;而水稻OsTCP15-EAR转基因株系的表达则上调。(4)水稻OsTCP15-VP和TCP15-OE两个转基因株系分别与其WT相比较,其knox基因OSH15的表达上调;而水稻OsTCP15-EAR转基因株系的表达则下调。并且,与OsTCP15相似,其OSH15在茎秆有较高的表达量,暗示其OSH15可能位于OsTCP15的下游。(5)水稻knox基因OSH15的启动子上存在3个TCP结合元件,水稻OsTCP15蛋白直接结合OSH15的启动子,从而直接激活OSH15的表达。总之,本研究发现水稻OsTCP15参与其茎秆维管组织发育及细胞壁合成调控。水稻OsTCP15通过直接结合OSH15启动子的序列,启动OSH15的表达,从而调控茎秆维管束数目、厚壁组织厚度与次生细胞壁的合成。

关键词：水稻转录因子 OsTCP15 抗倒伏维管束细胞壁 knox

蛇足石杉孢子及孢子囊显微结构及发育相关基因分析

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蛇足石杉孢子及孢子囊显微结构及发育相关基因分析

作者：任静宇西北大学

学位级别：硕士

蛇足石杉(Huperzia serrata(Thunb.)Trev.)又名千层塔,因体内含石杉碱甲的成分而备受关注。石杉碱甲来源于野生的蛇足石杉植株,目前尚未出现可以替代石杉碱甲的其他天然产物,资源紧缺已成为制约石杉碱甲药物开发的瓶颈。本研究利用光学... 详细信息

蛇足石杉(Huperzia serrata(Thunb.)Trev.)又名千层塔,因体内含石杉碱甲的成分而备受关注。石杉碱甲来源于野生的蛇足石杉植株,目前尚未出现可以替代石杉碱甲的其他天然产物,资源紧缺已成为制约石杉碱甲药物开发的瓶颈。本研究利用光学显微镜对蛇足石杉孢子及孢子囊的发生和发育进行显微结构观察,对人工培养的蛇足石杉孢子进行生活力及生理指标测定,同时筛选出与孢子生长相关基因Hsknox1、Hsknox2;除此之外,利用SSR分子标记技术在蛇足石杉近缘物种中进行了遗传多样性分析,确立了蛇足石杉、皱边石杉、四川石杉、小杉兰之间的亲缘关系,研究结果如下:(1)对蛇足石杉孢子及孢子囊的显微结构观察可以看出,蛇足石杉的孢子囊壁分为内层和外层,成熟期的细胞壁达到4-5层;蛇足石杉的孢子从生长初期到孢子成熟的整个过程中,孢子囊中孢子的数量不断增加,后释放;绒毡层作为孢子囊壁的最内一层,紧靠孢子内壁,对孢子的发育具有重要的作用;在孢子成熟期,绒粘层开始退化断裂,这也说明了在发育的后期,绒粘层发挥的作用较少。(2)对不同培养时期蛇足石杉孢子的活力进行了测定,首先对测定方法进行了筛选,最终确定为亚甲基蓝法,测定结果表明随着培养时间的增长,蛇足石杉孢子的活力呈现下降的趋势。同时对培养过程中蛇足石杉孢子的SOD酶活性、可溶性蛋白及脯氨酸的含量进行测定,可溶性蛋白的含量随着培养时间的增长呈现急剧下降的趋势,脯氨酸的含量也是随着培养天数的增加,逐渐下降。SOD酶活性随着培养天数的增加,清除自由基的能力也随之增强。(3)成功克隆出蛇足石杉Hsknox1、Hsknox2基因,Hsknox1基因的ORF区共有1524个碱基,Hsknox2基因共有756个碱基。利用软件对这两个基因对应的蛋白序列进行生物信息学预测,预测结果包括以下几个方面:Hsknox1蛋白由507个氨基酸组成,Hsknox2蛋白由251个氨基酸残基组成;将蛇足石杉的Hsknox1、Hsknox2蛋白的序列与数据库中同源序列比对,得出蛇足石杉与小杉兰的亲缘关系最近;Hsknox1蛋白属于knox蛋白家族的knoxⅡ类,而Hsknox2蛋白属于knox蛋白家族的knoxⅠ类;通过对两种蛋白的结构和功能进行分析,得出两者均属于典型的knox蛋白家族;通过在线软件分预测三个蛋白的亚细胞定位,两个蛋白均定位在细胞核中,通过在线软件分析可以为后期深入蛋白层次研究奠定理论基础。(4)通过对蛇足石杉不同居群中SSR引物的筛选,并在其近缘物种皱边石杉、四川石杉、小杉兰共3个物种天然居群的15个个体进行SSR验证,得出每个基因位点中全部是多态的,即多态位点比率达到100%。各基因位点在四种石杉属植物中的主要基因片段大小初步显示了四种石杉属植物的种间关系密切,其中小杉兰与蛇足石杉亲缘关系最近。通过验证,进一步筛选出可用于石杉科石杉属植物的遗传多样性分析的多态性引物。

关键词：蛇足石杉孢子显微结构 knox SSR