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Correlations between recombination rate and intron distributions along chromosomes of ***

Progress in Natural Science:Materials International 2009年第4期19卷 517-522页

作者： Hong Li a,b, Guoqing Liu a, Xuhua Xia b a School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China b Department of Biology, University of Ottawa, Ottawa, Ont., Canada K1N 6N5 [a]School of Physical Science and Technology Inner Mongolia University Hohhot 010021 China [b]Department of Biology University of Ottawa Ottawa Ont. Canada K1N 6N5

Generally speaking, the intron size positively correlates with recombination rate in Caenorhabditis elegans genome. Here, we analyze the correlations between recombination rate and some measures of different intron lengths so as to know whether the recombination influences the introns of different lengths in the same way. Results show that the correlation between the recombination rate and the percentage of short introns (introns that are larger than 500 bp is positive. Average intron length correlates positively with the recombination rate for introns whose length is in the range of 100-1000 bp. We speculate that the recombination mainly exerts impact on introns whose length ranges from 100-1000 bp. We also show that the average intron number per gene correlates negatively with the recombination rate.

关键词： Recombination rate Percentage of introns intron length intron number per gene C. elegans

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