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issr分子标记技术在分析玉米自交系遗传关系研究中的适用性

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植物遗传资源学报 2005年第2期6卷 172-177,181页

作者：程春明石云素宋燕春黎裕王天宇中国农业科学院作物品种资源研究所江西省农科院旱地作物研究所南昌330200

利用issr分子标记技术对5 9份玉米自交系和1份大刍草材料进行遗传多样性分析。2 1对issr引物共扩增出4 75条不同位置的带,平均2 2 6条;多态性带4 6 9条,平均2 2 3条,百分率高达98 7% ;不同引物的多态性信息指数(PIC)在0 84～0 94之... 详细信息

利用issr分子标记技术对5 9份玉米自交系和1份大刍草材料进行遗传多样性分析。2 1对issr引物共扩增出4 75条不同位置的带,平均2 2 6条;多态性带4 6 9条,平均2 2 3条,百分率高达98 7% ;不同引物的多态性信息指数(PIC)在0 84～0 94之间。6 0份材料的遗传相似系数在0 2 3～0 4 8之间。经聚类分析,可将这些材料分成两大组,共9个亚组,并且在一定程度上与血缘和系谱是一致的,也存在一些例外。结果表明,issr标记尽管可以用于进行遗传多样性分析,但并不是最好的分子标记类型。综合考虑不同的分子标记类型的优缺点,认为issr标记在遗传研究较少的作物上应用潜力较大。

关键词：遗传多样性玉米自交系种质资源 issr issr分子标记技术遗传多样性分析玉米自交系关系研究适用性

issr分子标记技术在作物遗传育种中的应用

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广东蚕业 2020年第4期54卷 65-66页

作者：牛姣姣新乡学院河南新乡453003

作物遗传育种是专门研究农作物遗传改良的理论、方法与技术的科学;搞好作物遗传育种,可以为农业生产培育优良的作物品种。而issr分子标记技术则是一项重要的分子标记技术,该技术具有较高的稳定性与多态性,成本低廉,可以广泛应用于不同... 详细信息

作物遗传育种是专门研究农作物遗传改良的理论、方法与技术的科学;搞好作物遗传育种,可以为农业生产培育优良的作物品种。而issr分子标记技术则是一项重要的分子标记技术,该技术具有较高的稳定性与多态性,成本低廉,可以广泛应用于不同生物基因组多态性分析中。文章结合实例,阐述了issr技术在作物遗传育种中的应用。

关键词： issr分子标记技术作物遗传育种应用

基于issr技术对藏药“蒂达”3种基源植物的亲缘关系分析

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中国药房 2019年第12期30卷 1665-1669页

作者：李水仙夏从龙陈丽元大理大学基础医学院病理教研室云南大理671000 昆明医科大学第一附属医院药剂科昆明650032

目的:对藏药“蒂达”的3种基源植物紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行亲缘关系研究。方法:利用简单重复序列区间(issr)分子标记技术对紫红獐牙菜9个样品(样品ZT-1~ZT-5采自大理苍山感通寺,样品ZC-1~ZC-4采自大理宾川县)、青叶胆2个样... 详细信息

目的:对藏药“蒂达”的3种基源植物紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行亲缘关系研究。方法:利用简单重复序列区间(issr)分子标记技术对紫红獐牙菜9个样品(样品ZT-1~ZT-5采自大理苍山感通寺,样品ZC-1~ZC-4采自大理宾川县)、青叶胆2个样品(QYD-1~QYD-2)和椭圆叶花锚2个样品(HM-1~HM-2)进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。采用青叶胆的DNA基因组为模板DNA进行引物筛选,对筛选得到的8条引物进行PCR反应;对PCR扩增产物进行人工读带,建立原始数据矩阵,并计算多态性条带比率;同时,采用NTSYS 2.1软件计算遗传相似系数,并选择UPGMA法绘制聚类图。结果:通过8条issr引物共反应获得113条清晰可辨的PCR扩增产物条带,多态性位点百分率为100%。紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚3个品种共13个样品的遗传相似系数在0.301~0.500之间;紫红獐牙菜9个样品的种内遗传相似系数在0.752~0.929之间。聚类分析结果显示,当距离线为0.410时,可将13个样本分为3个类群,即青叶胆、椭圆叶花锚、紫红獐牙菜;当距离线为0.780时,可将紫红獐牙菜的9个样品分为2个亚类,一个亚类只有苍山感通寺采集的样品ZT-1,另一个亚类含有其余8个样品。结论:利用issr分子标记技术能从分子水平对紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行鉴别。紫红獐牙菜与青叶胆、椭圆叶花锚存在一定的亲缘关系,但亲缘关系相对较远、遗传差异较大;大理地区两个不同地点产紫红獐牙菜的遗传差异较小、亲缘关系较近,但表现出丰富的遗传多样性。

关键词： issr分子标记技术紫红獐牙菜青叶胆椭圆叶花锚鉴定亲缘关系遗传多样性

DNA条形码及issr技术对广藿香种质资源的分析

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现代中药研究与实践 2019年第1期33卷 8-11页

作者：胡珊陈洪毅邬龙怡孟鹤广州市香雪制药股份有限公司广东广州510663

目的采用DNA条形码技术和分子标记技术研究不同产地广藿香的遗传多样性,探讨从基因水平区分不同产地广藿香的方法。方法分别采用DNA条形码技术和issr分子标记技术对不同产地的广藿香进行分析。DNA条形码——PCR扩增ITS2和psbA-trnH条形... 详细信息

目的采用DNA条形码技术和分子标记技术研究不同产地广藿香的遗传多样性,探讨从基因水平区分不同产地广藿香的方法。方法分别采用DNA条形码技术和issr分子标记技术对不同产地的广藿香进行分析。DNA条形码——PCR扩增ITS2和psbA-trnH条形码序列,产物纯化后测序,采用软件CLUSTALX 1.81和MEGA 6.06对序列进行对比分析。issr分子标记——采用60条issr引物进行试验,筛选出条带清晰、多态性好的issr引物进行PCR、电泳及聚类分析。结果 DNA条形码技术分析结果显示不同产地广藿香差异很小;issr分子标记技术分析结果显示肇庆和阳春的广藿香亲缘关系较近,湛江广藿香与其他两个产地亲缘关系均较远。结论 issr分子标记技术可作为鉴别不同产地广藿香的依据之一。

关键词： DNA条形码 issr分子标记技术广藿香

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广东省巴戟天DNA条形码及遗传多样性分析

世界科学技术-中医药现代化 2021年第10期23卷 3765-3771页

作者：关婉张丹纯丁晓霞苏贺杜颂灵许素冰丘小惠黄志海宫璐广州中医药大学第二临床医学院广州510006 广州市中药活性成分手性研究重点实验室广州510006 广东省药品监督管理局中药全产业链质量评价重点实验室广州510006 广东省河源市紫金县南岭卫生院河源517438

目的构建广东省巴戟天DNA条形码数据库以及研究广东省不同产地巴戟天的遗传多样性。方法采用DNA条形码技术对149个巴戟天样本进行分析,构建DNA条形码数据库。利用issr分子标记技术对广东省8个居群的巴戟天进行遗传多样性分析。结果巴戟... 详细信息

目的构建广东省巴戟天DNA条形码数据库以及研究广东省不同产地巴戟天的遗传多样性。方法采用DNA条形码技术对149个巴戟天样本进行分析,构建DNA条形码数据库。利用issr分子标记技术对广东省8个居群的巴戟天进行遗传多样性分析。结果巴戟天五个通用条形码的PCR测序成功率为psbA-trnH>rbcL>matK>ITS2>ITS,149个巴戟天样本建立了含有569条序列的数据库。研究筛选出6条issr引物,从巴戟天中扩增得80条条带,多态性比率为92.50%,遗传相似系数在0.5625-0.8910,表明广东省巴戟天的遗传多样性较高。issr标记揭示的PCoA结果、UPGMA聚类分析结果一致,八个居群分为两大支。结论广东省巴戟天具有较高的遗传多样性。

关键词： DNA条形码 issr分子标记技术遗传多样性巴戟天

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基于issr分子标记的何首乌遗传多样性分析

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分子植物育种 2023年

作者：张丹纯丁晓霞关婉涂嘉俊宫璐黄娟丘小惠黄志海广东省中医院广州中医药大学第二临床医学院台州恩泽医疗中心(集团)路桥医院

何首乌(Polygonum multiflorum Thunb.)为《广东省岭南中药材保护条例》首批保护品种，为分析广东省道地药材何首乌的遗传多样性，该文采用issr分子标记技术对广东省何首乌8个居群38份样品进行分析。结果表明：(1)何首乌8条issr引物共... 详细信息

何首乌(Polygonum multiflorum Thunb.)为《广东省岭南中药材保护条例》首批保护品种，为分析广东省道地药材何首乌的遗传多样性，该文采用issr分子标记技术对广东省何首乌8个居群38份样品进行分析。结果表明：(1)何首乌8条issr引物共扩增得75条谱带，多态性位点数为73条，多态性位点百分数为97.33%；(2)各居群的遗传水平由高到低分别为：鼎湖山(DH)>德庆(DQ)>高州(GZ)>高要(GY)>惠州(HZ)>丰顺(FS)>乳源(RY)>从化(CH)；居群的遗传距离为0.0532～0.6419，遗传相似性系数为0.5263～0.9482，其中，居群肇庆鼎湖山(DH)与茂名高州(GZ)亲缘关系最近，居群广州从化(CH)与肇庆高要(GY)的亲缘关系最远。(3)基因多样性指数(H)为0.0663～0.2212，基因分化系数(Gst)为0.5286，遗传变异存在于居群间，居群间的基因流(Nm)为0.4459，基因流动性水平偏低，基因交流困难，种群发生分化。(4)PCoA结果、UPGMA聚类分析结果一致，所有居群分为两大支。上述结果提供了有效的种植建议，为尽可能更多地保存遗传多样性，应优先保护遗传多样性丰富的鼎湖山(DH)、德庆(DQ)居群，同时加强对现有种群的就地保护，为后续构建种质资源库提供参考。

关键词：何首乌 issr分子标记技术遗传多样性种质资源遗传结构

天女花与广玉兰杂交F_1代的issr遗传多样性分析

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西南农业学报 2016年第9期29卷 2225-2228页

作者：王明媚 Kevin Parris ZHANG Dong-lin 金晓玲李志辉杨玉洁中南林业科技大学湖南长沙410004 佐治亚大学美国佐治亚州雅典30602 克莱姆森大学美国南卡莱罗纳州克莱姆森29634 长江大学湖北荆州434025

利用issr分子标记技术探讨了天女花与广玉兰杂交后代9株幼苗的遗传多样性。9株F_1代幼苗根据生长健壮的情况依次标记为SA、SB、SC、SD、SE、SF,、SG、SH、SI。选用10个issr引物对亲本以及9株F_1代幼苗的基因组进行分析。结果表明,11株... 详细信息

利用issr分子标记技术探讨了天女花与广玉兰杂交后代9株幼苗的遗传多样性。9株F_1代幼苗根据生长健壮的情况依次标记为SA、SB、SC、SD、SE、SF,、SG、SH、SI。选用10个issr引物对亲本以及9株F_1代幼苗的基因组进行分析。结果表明,11株植物共扩增出96条DNA条带,其中多态性条带为85条,占总条带的88.5%。UPGMA聚类结果表明所有F_1代幼苗与六倍体父本更为相似,与二倍体的母本遗传距离较远。其中SC无论从叶片大小、边缘的形态在9株F_1代幼苗中与父本最相似,SG叶片为披针形,在9株F_1代幼苗中较为特殊。其余7株F_1代幼苗日渐成熟后再根据UPGMA聚类树状图进行形态多样性分析。

关键词： F1代遗传多样性种间杂交 issr分子标记技术天女花广玉兰多态性条带

issr分子标记在丝瓜杂交种纯度鉴定的应用

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分子植物育种 2021年第6期19卷 1928-1932页

作者：陈曦黄铭奇陈铣花秀凤陈庚福建省福州市蔬菜科学研究所福州350111

品种纯度鉴定对种子质量的保证十分关键。为了鉴定丝瓜杂交种‘农福丝瓜801’的遗传纯度,本研究利用issr分子标记技术对丝瓜杂交种‘农福丝瓜801’及其亲本的DNA指纹进行分析,试验从100条引物中筛选出具有特异性issr引物3个(issr-820,IS... 详细信息

品种纯度鉴定对种子质量的保证十分关键。为了鉴定丝瓜杂交种‘农福丝瓜801’的遗传纯度,本研究利用issr分子标记技术对丝瓜杂交种‘农福丝瓜801’及其亲本的DNA指纹进行分析,试验从100条引物中筛选出具有特异性issr引物3个(issr-820,issr-886,issr-891)。结果表明,issr-820为父母本特异性标记共显性引物,可快速有效地辨别杂交种;issr-891能以杂交种是否扩增出父本特征带为依据,可有效地鉴定出杂交种中所混杂的母本自交系种子;issr-886能区分父本机械系混杂。并且,issr分子鉴定结果与田间鉴定结果相一致,表明这些引物能有效应用于‘农福丝瓜801’种子纯度的快速鉴定。

关键词：丝瓜 issr分子标记技术种子纯度鉴定

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中国斑茅种质资源分子多态性分析

植物资源与环境学报 2004年第1期13卷 1-6页

作者：张木清洪艺珣李奇伟刘少谋张垂明杨荣仲福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室福建福州350002 广州甘蔗糖业研究所广东广州510316

　采用issr分子标记技术,对采自我国8省区的30个斑茅〔Erianthusarundinaceus(Retz.)Jesw.〕无性系的分子多态性进行了分析,共扩增出87条多态带,平均每个引物扩增的多态带数为5.1条,多态性条带比率(PPB)为64.89%,多态信息量(PIC)为0.58... 详细信息

　采用issr分子标记技术,对采自我国8省区的30个斑茅〔Erianthusarundinaceus(Retz.)Jesw.〕无性系的分子多态性进行了分析,共扩增出87条多态带,平均每个引物扩增的多态带数为5.1条,多态性条带比率(PPB)为64.89%,多态信息量(PIC)为0.58,说明我国斑茅具有较丰富的遗传多样性。根据研究结果进行聚类和主成分分析,可将30个斑茅无性系归为4大类,同一地区的斑茅无性系基本聚在同一类,呈现出一定的地域性分布规律。

关键词：中国斑茅种质资源分子多态性 issr分子标记技术遗传多样性