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LncRNA AK093407通过ifitm1对结直肠癌恶性表型的影响及相关机制研究

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LncRNA AK093407通过IFITM1对结直肠癌恶性表型的影响及相关机制...

作者：田朵朵承德医学院

学位级别：硕士

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是一种较多见的恶性肿瘤,其疾病发生率和死亡率都极高,找寻有效的分子靶点对疾病诊断和治疗有重要的意义。长链非编码RNA(long noncoding RNAs,Lnc RNAs)是一种新型非编码RNA分子,通过充当肿瘤癌基因或... 详细信息

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是一种较多见的恶性肿瘤,其疾病发生率和死亡率都极高,找寻有效的分子靶点对疾病诊断和治疗有重要的意义。长链非编码RNA(long noncoding RNAs,Lnc RNAs)是一种新型非编码RNA分子,通过充当肿瘤癌基因或抑制因子,在肿瘤发展中发挥重要作用。ifitm1(interferon induced transmembrane protein 1)是IFN诱导的跨膜蛋白家族中的一个成员,在一些常见肿瘤如胆囊癌、食管癌及胃癌中高表达。有研究表明ifitm1可能与Wnt/β-catenin信号通路激活密切相关,该通路被认为是结直肠癌发生发展的起始事件,在结直肠癌患者中能观察到Wnt/β-catenin信号的增加。本研究从组织和细胞水平观察了Lnc RNA AK093407和ifitm1在结直肠癌中的作用,探讨Lnc RNA AK093407是否通过ifitm1影响结直肠癌细胞的恶性表型以及对Wnt/β-catenin通路的影响,前期研究已发现Lnc RNAAK093407在结直肠癌中高表达,且对结直肠癌细胞凋亡和侵袭等恶性表型有影响,希望进一步的研究可以为结直肠癌临床分子靶向治疗提供新方向。目的:观察Lnc RNA AK093407和ifitm1在结直肠癌中的表达水平;分析Lnc RNA AK093407和ifitm1对结直肠癌细胞系恶性表型的影响;探讨Lnc RNA AK093407是否通过ifitm1影响结直肠癌恶性表型;探究ifitm1对Wnt/β-catenin通路相关因子的作用。方法:q RT-PCR检测Lnc RNA AK093407和ifitm1在人结直肠癌组织和细胞系中的RNA表达水平;WB检测ifitm1在结直肠癌中的蛋白表达水平;采用si RNA和慢病毒在结直肠癌细胞系HCT-15、HCT-116中构建Lnc RNA AK093407过表达组(LV-Lnc RNA AK093407)、Lnc RNA AK093407沉默组(si-Lnc RNA AK093407)、ifitm1过表达组(LV-ifitm1)、ifitm1沉默组(si-ifitm1)、Lnc RNA AK093407过表达且ifitm1沉默组(LV-Lnc RNA AK093407/si-ifitm1)、Lnc RNA AK093407沉默且ifitm1过表达组(si-Lnc RNA AK093407/LV-ifitm1)、过表达NC组(LV5-NC)和沉默NC组(siNC);MTT实验检测细胞增殖能力;平板克隆实验检测集落形成能力;Annexin V-APC/PI染色法检测细胞凋亡率;细胞划痕实验检测迁移能力;Transwell检测细胞侵袭能力;蛋白质印迹实验检测Wnt/β-catenin通路相关因子β-catenin、c-myc、cyclin D1、E-cadherin、Vimentin、MMP-2和MMP-9等表达情况。结果:1.Lnc RNA AK093407和ifitm1在人结直肠癌组织中的表达水平高于癌旁组织。2.Lnc RNA AK093407和ifitm1在人结直肠癌细胞系HCT-15、HCT-116中的表达水平高于正常结直肠上皮细胞CCD-841 con。3.过表达Lnc RNA AK093407和ifitm1后,HCT-15、HCT-116细胞增殖、侵袭和迁移能力均提高,凋亡率下降;沉默Lnc RNA AK093407和ifitm1后,HCT-15、HCT-116细胞增殖、侵袭和迁移能力均下降,凋亡率提高。4.与对照组相比,实验组LV-Lnc RNA AK093407/si-ifitm1组细胞增殖、迁移和侵袭能力明显下降,凋亡率增加,实验组si-Lnc RNA AK093407/LV-ifitm1组细胞增殖、迁移和侵袭能力提高,凋亡率下降。5.HCT-15和HCT-116细胞中过表达ifitm1后,Wnt/β-catenin通路相关因子β-catenin、c-myc、cyclin D1、Vimentin、MMP-2和MMP-9蛋白表达水平升高,E-cadherin蛋白表达水平降低。结论:1.Lnc RNA AK093407和ifitm1在结直肠癌组织和结直肠癌细胞系中的表达均高于癌旁组织和正常结肠上皮细胞。2.结直肠癌细胞系中Lnc RNA AK093407和ifitm1均与细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等恶性表型密切相关。3.Lnc RNA AK093407可能通过ifitm1影响结直肠癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭等恶性表型。4.ifitm1可能通过调控Wnt/β-catenin信号通路影响肿瘤进程。

关键词：结直肠癌 LncRNA ifitm1 Wnt/β-catenin信号通路

抑瘤汤通过ifitm1/Wnt/β-catenin信号通路调控骨肉瘤恶性增殖的机制研究

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抑瘤汤通过IFITM1/Wnt/β-catenin信号通路调控骨肉瘤恶性增殖的...

作者：刘俊良广西中医药大学

学位级别：硕士

目的:1.通过体外实验,抑瘤汤含药血清对骨肉瘤U2-OS细胞的干预,探究抑瘤汤对骨肉瘤细胞的生长影响。2.通过构建骨肉瘤裸鼠模型,探讨抑瘤汤对裸鼠体重、瘤体体积、瘤重、抑瘤率的影响,并检测瘤体中ifitm1、Wnt、β-catenin的蛋白、m RNA... 详细信息

目的:1.通过体外实验,抑瘤汤含药血清对骨肉瘤U2-OS细胞的干预,探究抑瘤汤对骨肉瘤细胞的生长影响。2.通过构建骨肉瘤裸鼠模型,探讨抑瘤汤对裸鼠体重、瘤体体积、瘤重、抑瘤率的影响,并检测瘤体中ifitm1、Wnt、β-catenin的蛋白、m RNA的表达,以探究抑瘤汤、ifitm1、Wnt/β-catenins三者在骨肉瘤治疗上可能存在的关系。方法:1.体外实验:用抑瘤汤干预U2-OS细胞,观察U2-OS细胞被干预后增殖、侵袭迁移,凋亡的变化。2.体内实验:取SPF裸鼠30只,查随机数字表,随机分配到3组,每组10只。分为抑瘤汤组,顺铂组和生理盐水组。每只裸鼠予左后肢胫骨部位注射浓度为1×10～7个/ml的U2-OS细胞悬液0.1ml,用于构建骨肉瘤裸鼠移植模型。造模成功后,瘤体长至0.5cm x 0.5cm后开始给药。每间隔5天就记录一次各组裸鼠皮下瘤体的体积、裸鼠体重变化。在25天后,处死裸鼠,称量瘤体重量,计算各个组的抑瘤率。取材后的样本用于Western Blot、q RT-PCR试验,检测相关m RNA和蛋白表达。结果:1.抑瘤汤对U2-OS细胞影响:抑瘤汤含药血清可抑制骨肉瘤U2-OS细胞增殖、侵袭迁移,促进凋亡。2.1各组裸鼠骨肉瘤移植模型给药后,各组裸鼠瘤体体积、重量、抑瘤率的变化:与生理盐水组相比,抑瘤汤组和顺铂组瘤体体积明显缩小。抑瘤汤组、顺铂组的抑瘤率分别为:32%、55%,与生理盐水组相比抑瘤汤组、顺铂组的瘤重均降低。生理盐水组裸鼠体重小于抑瘤汤组、顺铂组。2.2各组裸鼠骨肉瘤移植模型肿瘤组织中ifitm1/Wnt/β-catenin的m RMA的表达:与NS组与顺铂组比较,抑瘤汤组的ifitm1 m RNA表达降低,NS组与顺铂组两两比较差异无统计学意义;与NS组比较,抑瘤汤组与顺铂组Wnt m RMA表达升高;与NS组比较,抑瘤汤组与顺铂组β-catenin m RMA表达升高。2.3各组裸鼠骨肉瘤移植模型肿瘤组织中ifitm1/Wnt/β-catenin的蛋白的表达:与NS组与顺铂组比较,抑瘤汤组的ifitm1蛋白表达降低(P1.通过体内外实验发现,抑瘤汤可抑制骨肉瘤U2-OS生长,改善骨肉瘤裸鼠生存质量。2.抑瘤汤可能是通过抑制ifitm1表达,引起Wnt/β-catenin的高表来抑制骨肉瘤的生长。

关键词：骨肉瘤抑瘤汤 ifitm1 Wnt/β-catenin信号通路

ifitm1基因多态性对儿童流感发病风险和病情严重程度影响的研究

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2023年第10期 8-12页

作者：卫严冰罗雪峰何志伟安亮中国人民大学统计学院流行病与卫生统计院北京100080 上海市孟超肿瘤医院上海200000

探讨干扰素诱导跨膜蛋白1(ifitm1)基因多态性对儿童流感发病风险和病情严重程度之间的关系。方法选择来我院治疗的98例流感患儿和110例健康儿童。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)来分析ifitm1基因3个不同区域的... 详细信息

探讨干扰素诱导跨膜蛋白1(ifitm1)基因多态性对儿童流感发病风险和病情严重程度之间的关系。方法选择来我院治疗的98例流感患儿和110例健康儿童。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)来分析ifitm1基因3个不同区域的多态性位点(rs77537847、rs11246062和rs3197137)。使用SHEsis在线网站分析ifitm1基因3个位点的哈德温伯格平衡(HWE)。以流感类型和病情严重程度为条件,进行亚型分析。结果与对照组相比,rs77537847位点的GG基因型频率和G等位基因频率在流感患儿中明显较高(P0.05)。但该位点的GG基因型与更重的病情程度有关(Pifitm1基因rs77537847位点的GG基因型与儿童较高的流感感染率有关,并预示着更严重的流感病情。这可能为将来筛查流感易感及重症人群提供了潜在标志物。

关键词：流感 ifitm1 基因多态性易感性病情程度

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ifitm1在肝癌组织中的表达及临床意义

局解手术学杂志 2022年第4期31卷 315-318页

作者：吴垵梦马志健章维袁静罗良米日古丽郑威楠成都医学院公共卫生学院预防医学系四川成都610500 海南医学院人体解剖学教研室海南海口571199 成都医学院基础医学院人体解剖学与组织胚胎学教研室/发育与再生四川省重点实验室四川成都610500

目的探讨肝癌组织中干扰素诱导的跨膜蛋白1(ifitm1)的表达及其在病理分级中的意义。方法采用免疫组织化学法检测ifitm1在肝癌组织中的表达并分析其与病理分级的关系。结果ifitm1在肝癌组织中的表达低于正常肝组织,差异有显著统计学意义(... 详细信息

目的探讨肝癌组织中干扰素诱导的跨膜蛋白1(ifitm1)的表达及其在病理分级中的意义。方法采用免疫组织化学法检测ifitm1在肝癌组织中的表达并分析其与病理分级的关系。结果ifitm1在肝癌组织中的表达低于正常肝组织,差异有显著统计学意义(P1);肝癌组织病理分级与ifitm1表达呈正相关,肝癌组织的分化程度越高,ifitm1表达水平越高,肝癌的恶性程度越低;而肝癌组织的分化程度越低,ifitm1表达水平越低,肝癌的恶性程度越高,差异有显著统计学意义(P1)。结论ifitm1在肝癌组织中低表达,不同病理分级中ifitm1的表达不同,可能与肝癌的发生有关。

关键词：肝癌 ifitm1 病理分级免疫组织化学

基于生物信息分析的ifitm1与结直肠癌的研究

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中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生 2022年第3期 59-65页

作者：付沛冉杨靖宇杜凌雪马茹婧赵学荣承德医学院临床学院河北承德067000 承德医学院免疫学教研室河北承德067000

结直肠癌(Colorectal cancer)是胃肠道中常见的恶性肿瘤。ifitm1是干扰素诱导的跨膜蛋白家族(ifitms)的重要组成成分,在多种癌组织中高表达,同时也因能够通过促进肿瘤发展过程而牵扯进来。但是人们对ifitm1的了解仅限于其参与机体对抗... 详细信息

结直肠癌(Colorectal cancer)是胃肠道中常见的恶性肿瘤。ifitm1是干扰素诱导的跨膜蛋白家族(ifitms)的重要组成成分,在多种癌组织中高表达,同时也因能够通过促进肿瘤发展过程而牵扯进来。但是人们对ifitm1的了解仅限于其参与机体对抗病毒过程。方法:这项研究通过使用Oncomine(https://***),基因表达谱互动分析(GEPIA),Kaplan-Meier绘图仪、cBioPortal、GeneMANIA和TIMER这些工具,分析结直肠癌癌患者中的ifitm1的差异表达、预后价值、基因改变和免疫细胞浸润。结果:ifitm1在结直肠癌组织中的表达水平明显升高,ifitm1与患者的临床癌症分期和短无病生存期(OS)有关。其可能是结直肠癌患者生存的潜在预后生物标志物。此外,ifitm1的功能主要与免疫应答、细胞对刺激的反应、免疫效应器过程、生物体之间的物种间相互作用以及细胞表面受体信号通路有关。在结肠癌和直肠癌中,ifitm1的表达与多种免疫细胞和浸润明显相关,包括六种类型的CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、B细胞、CD8+T细胞和树突状细胞。结论:这项研究可能为选择ifitm1作为结直肠癌预后生物标志物提供新的见解。

关键词：生物信息学分析结直肠癌 ifitm1

ifitm1基因克隆及其在不同生长阶段牦牛各组织中的表达分析

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中国预防兽医学报 2021年第2期43卷 139-144,190页

作者：王海鹏李娟王利郑姚张玲西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室四川成都610041

为鉴定牦牛ifitm1基因并分析其在不同生长阶段牦牛5种组织中的转录水平和蛋白表达量。本研究采用根据普通牛ifitm1基因设计的引物,PCR扩增牦牛ifitm1基因并利用生物信息学软件分析其序列,结果显示,获得牦牛546 bp的ifitm1基因cDNA序列,... 详细信息

为鉴定牦牛ifitm1基因并分析其在不同生长阶段牦牛5种组织中的转录水平和蛋白表达量。本研究采用根据普通牛ifitm1基因设计的引物,PCR扩增牦牛ifitm1基因并利用生物信息学软件分析其序列,结果显示,获得牦牛546 bp的ifitm1基因cDNA序列,其中编码(CDS)区为375 bp,编码124个氨基酸残基。牦牛ifitm1基因序列与普通牛的同源性最高,为98.7%。进一步采用荧光定量PCR检测ifitm1基因在不同生长阶段牦牛各组织中的转录水平,结果显示,ifitm1在1日龄、15月龄和5岁龄牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏中均有不同程度的转录水平,在肝脏中的转录水平均显著高于在脾脏、肺脏和肾脏中的转录水平(pifitm基因在牦牛肝脏中的转录水平呈现先上升后下降的趋势,15月龄相对于1日龄时的转录水平显著升高(p1),随着年龄的增长ifitm1基因的转录水平在耗牛肺脏中呈现持续下降的趋势,而在脾脏和肾脏中呈现先下降后稳定的趋势,且5岁龄相对于1日龄时的转录水平均显著降低(p1)。同时采用免疫组化技术检测ifitm1蛋白在牦牛肝脏中的定位及表达。结果显示,ifitm1蛋白在3个生长阶段牦牛的肝脏中均有表达并定位于细胞膜,且该蛋白表达量随着年龄的增长呈现先下降后上升的趋势。本研究为深入探究ifitm1蛋白的功能奠定基础。

关键词：牦牛 ifitm1 基因克隆组织表达免疫组化

沉默ifitm1基因对卵巢癌CP70细胞增殖和侵袭能力的影响

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西安交通大学学报（医学版） 2016年第4期37卷 543-546,577页

作者：杨蓉高婷婷姚念玲王建陈必良陕西省第二人民医院妇产科陕西西安710004 第四军医大学唐都医院妇产科陕西西安710038 第四军医大学西京医院妇产科陕西西安710033

目的探讨siRNA沉默ifitm1基因表达对卵巢癌CP70细胞增殖和侵袭的影响。方法利用脂质体转染法将靶向ifitm1的小干扰RNA(siRNA)转染卵巢癌细胞株CP70;qRT-PCR和Western blot观察转染后CP70细胞ifitm1mRNA和蛋白表达的变化;平板克隆形成实... 详细信息

目的探讨siRNA沉默ifitm1基因表达对卵巢癌CP70细胞增殖和侵袭的影响。方法利用脂质体转染法将靶向ifitm1的小干扰RNA(siRNA)转染卵巢癌细胞株CP70;qRT-PCR和Western blot观察转染后CP70细胞ifitm1mRNA和蛋白表达的变化;平板克隆形成实验和Transwell小室分别检测各组细胞增殖和侵袭能力的变化。结果转染组CP70细胞的ifitm1mRNA和蛋白表达明显受抑制;转染组、阴性对照组及转染试剂对照组形成克隆数分别为84、181、178,克隆形成率分别为42%、90.5%、89%,迁移出的细胞分别约为59个、121个、126个,转染组结果与其他两组之间有统计学差异,说明转染ifitm1siRNA抑制了卵巢癌CP70细胞增殖和侵袭能力。结论沉默ifitm1可以降低卵巢癌细胞的增殖和侵袭能力,ifitm1可能成为卵巢癌治疗的潜在新靶点。

关键词： ifitm1 小干扰RNA 卵巢癌细胞增殖细胞侵袭

奶牛早期妊娠阶段外周血中ifitm1和RSAD2基因的表达

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华中农业大学学报 2015年第3期34卷 89-96页

作者：程蕾王定发向敏胡修忠刘晓华凌明湖夏瑜武汉市农业科学院畜牧兽医科学研究所武汉430208

为研究干扰素刺激基因ifitm1和RSAD2在奶牛早期妊娠阶段外周血中的表达规律,于人工授精后0、14、18、21和28d采集奶牛外周血,利用荧光定量PCR检测ifitm1和RSAD2的相对表达量,采用化学发光法同步检测血清中孕酮浓度;并深入分析自然发情... 详细信息

为研究干扰素刺激基因ifitm1和RSAD2在奶牛早期妊娠阶段外周血中的表达规律,于人工授精后0、14、18、21和28d采集奶牛外周血,利用荧光定量PCR检测ifitm1和RSAD2的相对表达量,采用化学发光法同步检测血清中孕酮浓度;并深入分析自然发情和同期发情2种状态下青年母牛外周血中RSAD2基因的相对表达及其在18d和21d外周血白细胞亚类(淋巴细胞、NK细胞、单核细胞)中的相对表达。结果表明,妊娠牛与空怀牛血清孕酮在21d和28d呈显著差异。人工授精后14d和18difitm1基因在妊娠牛与空怀牛中都显著下调,但在空怀牛与妊娠牛间差异不显著。妊娠牛外周血中RSAD2于21d显著上调;18d时,RSAD2在妊娠青年牛外周血中的表达量显著高于空怀牛。进一步分析结果表明:自然发情条件下,妊娠牛外周血中RSAD2表达量显著高于空怀牛,同期发情条件下该基因在趋势上与之类似但统计学上不显著。人工授精后18d和21d,RSAD2在妊娠牛与空怀牛外周血淋巴细胞、NK细胞和单核细胞中的表达均无显著差异。研究提示:ifitm1不适合用于奶牛早期妊娠诊断;利用RSAD2的相对表达量可望对青年牛在18d做出早期诊断,具体判别标准有待于进一步扩群分析。

关键词：奶牛 ifitm1 RSAD2 妊娠诊断基因表达

维吾尔族妇女子宫颈癌组织中ifitm1、Ki-67和PCNA的表达

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临床与实验病理学杂志 2015年第6期31卷 690-692页

作者：赵志敏王红英木拉提郑威楠杨昕李玉华左强强龙海晨张金莉潘泽民新疆石河子大学医学院生物化学教研室石河子832002 新疆医科大学基础医学院微生物学教研室乌鲁木齐830000 新疆石河子大学医学院第一附属医院普外科石河子832000 新疆医科大学自治区中医医院病理科乌鲁木齐830000 新疆喀什地区第一人民医院病理科喀什844000

目的探讨维吾尔族妇女子宫颈癌组织中ifitm1、PCNA和Ki-67蛋白的表达。方法采用免疫组化SP法检测ifitm1、PCNA和Ki-67蛋白在维吾尔族妇女子宫颈癌和慢性子宫颈炎组织中的表达。结果 ifitm1蛋白在子宫颈鳞癌组织中的表达低于慢性子宫颈... 详细信息

目的探讨维吾尔族妇女子宫颈癌组织中ifitm1、PCNA和Ki-67蛋白的表达。方法采用免疫组化SP法检测ifitm1、PCNA和Ki-67蛋白在维吾尔族妇女子宫颈癌和慢性子宫颈炎组织中的表达。结果 ifitm1蛋白在子宫颈鳞癌组织中的表达低于慢性子宫颈炎组织,差异有统计学意义(P=0.003);子宫颈癌组织中Ki-67和PCNA蛋白表达高于慢性子宫颈炎组织,差异有统计学意义(P=0.019,P=0.000)。结论 ifitm1蛋白在子宫颈癌组织中的表达降低,Ki-67和PCNA蛋白在子宫颈癌组织中的表达水平增高,可能与维吾尔族妇女子宫颈癌的发生有关。

关键词：子宫颈肿瘤 ifitm1 Ki-67 PCNA 免疫组织化学