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The combination of novel immune checkpoints HHLA2 and icoslg:A new system to predict survival and immune features in esophageal squamous cell carcinoma

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Genes & Diseases 2022年第2期9卷 415-428页

作者： Chaoqi Zhang Feng Wang Nan Sun Zhen Zhang Guochao Zhang Zhihui Zhang Yuejun Luo Yun Che Hong Cheng Jiagen Li Jie He Department of Thoracic Surgery National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/Cancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijing 100021PR China Biotherapy Center The First Affiliated Hospital of Zhengzhou UniversityZhengzhouHenan 450052PR China

Studies on immune checkpoint inhibitors targeting B7-CD28 family pathways in esophageal squamous cell carcinoma(ESCC)have shown promising ***,a comprehensive understanding of B7-CD28 family members in ESCC is still *** study aimed to construct a novel B7-CD28 family-based prognosis system to predict survival in patients with *** collected 179 cases from our previously published microarray data and 86 cases with qPCR ***,119 microarray data(GSE53624)were used as a training set,whereas the remaining 60 microarray data(GSE53622),all 179 microarray data(GSE53625)and an independent cohort with 86 qPCR data were used for *** underlying mechanism and immune landscape of the system were also explored using bioinformatics and *** examined 13 well-defined B7-CD28 family members and identified 2 genes(ICSOLG and HHLA2)with the greatest prognostic value.A system based on the combination HHLA2 and icoslg(B7-CD28 signature)was constructed to distinguish patients as high-or low-risk of an unfavorable outcome,which was further confirmed as an independent prognostic *** expected,the signature was well validated in the entire cohort and in the independent cohort,as well as in different clinical *** signature was found to be closely related to immune-specific biological processes and ***,high-risk group samples demonstrated high infiltration of Tregs and fibroblasts and distinctive immune checkpoint ***,we built the first,practical B7-CD28 signature for ESCC that could independently identify high-risk *** information may help inform immunotherapy-based treatment decisions for patients with ESCC.

关键词： Esophageal cancer HHLA2 icoslg Immune checkpoint Immunotherapy

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PTPN2及icoslg基因多态性和中国北方汉族人群白塞病的相关性分析

PTPN2及ICOSLG基因多态性和中国北方汉族人群白塞病的相关性分析

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第九届全国免疫学学术大会

作者：吴子燕陈华孙菲徐涓娟郑文洁李萍陈思沈敏张文尤欣吴庆军张奉春李永哲中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院风湿免疫科风湿免疫病学教育部重点实验室

目的:本研究旨在探究克罗恩病(Crohn’s disease,CD)易感基因蛋白酪氨酸磷酸酶非2型受体(tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2,PTPN2)和T-细胞可诱导共刺激分子配体(inducible T-cell co-stimulator-ligand,icoslg)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与中国北方汉族人群BD易感性的相关性。材料与方法:选取365例BD患者和569例健康对照,选择PTPN2(rs2542151、rs7234029、rs1893217和rs2847297)及icoslg(rs2838519和rs762421)基因的SNP位点,我们采用Sequenom MassArray方法进行基因分型。结果:在BD组中,rs1893217(PTPN2)CC,CT,TT的基因型频率分别为1.7%、30.7%、67.6%,健康对照组分别为2.8%、22.4%、74.8%,差异有统计学意义(χ=10.01,p=0.040)。在BD组中,rs2542151(PTPN2)GG,GT,TT的基因型频率分别为1.7%、29.7%、68.6%,健康对照组分别为2.8%、22.7%、74.5%,差异有统计意义(χ=7.49,p=0.024),但在最严格的Bonferroni校正后,这种弱相关性无统计意义(p=0.14)。另外,rs1893217和rs2542151(PTPN2)在BD病人有肠道受累组和健康对照组的等位基因频率差异有统计学意义(p=0.027,OR=1.89,95%CI=1.21-2.94;p=0.032,OR=1.86,95%CI=1.20-2.90)。而rs2847297和rs7234029(PTPN2),rs2838519和rs762421(icoslg)的等位基因频率及基因型频率分布,差异均无统计学意义(p>0.05)。结论:本次研究首次发现PTPN2基因位点rs1893217可能为中国北方汉族人群BD的易感性位点。icoslg(rs2838519和rs762421)的可能和中国北方汉族人群BD不相关。还需进一步的研究来深探PTPN2基因在BD发病过程的作用。

关键词：白塞病 PTPN2 icoslg SNP 中国北方汉族人群

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