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纳米碳管在hyperchem中的自动生成及其力学性能探究

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计算机与应用化学 2004年第3期21卷 485-488页

作者：沈海军姚卫星史友进南京航空航天大学航空宇航学院江苏南京210016

hyperchem 是当今国际上知名的物理化学软件之一。本文作者使用Visual Basic 5.0计算机语言环境,结合hyperchem的Tcl、Hcl 语言及DDE 功能,开发了hyperchem 中自动生成纳米碳管的软件模块。然后,采用hyperchem 及其提供的MM+力场,分别... 详细信息

hyperchem 是当今国际上知名的物理化学软件之一。本文作者使用Visual Basic 5.0计算机语言环境,结合hyperchem的Tcl、Hcl 语言及DDE 功能,开发了hyperchem 中自动生成纳米碳管的软件模块。然后,采用hyperchem 及其提供的MM+力场,分别对自动生成的纳米碳管及另外一种富勒烯/纳米管的拉伸力学性能进行了尝试性的分子动力学模拟。本文的纳米碳管生成模块及纳米碳管拉伸力学性能探究对hyperchem 用户进一步深入研究纳米碳管的性能具有实际的参考价值。

关键词：纳米碳管 hyperchem 自动生成拉伸力学性能生成模块分子动力学

利用hyperchem获取反应过渡态的方法

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计算机与应用化学 2003年第4期20卷 537-539页

作者：郑柯文高金森徐春明石油大学重质油加工国家重点实验室北京102249

利用hyperchem的动态数据交换DDE(Dynamic Data Exchange)功能,通过Excel中的Visual BasicA编程来控制Hy-perChem的运行,从而控制反应过程中的反应坐标和反应步长,计算得到反应系统沿反应坐标的能量变化曲线,从而可获取反应的过渡态和... 详细信息

利用hyperchem的动态数据交换DDE(Dynamic Data Exchange)功能,通过Excel中的Visual BasicA编程来控制Hy-perChem的运行,从而控制反应过程中的反应坐标和反应步长,计算得到反应系统沿反应坐标的能量变化曲线,从而可获取反应的过渡态和活化能△E。利用该计算方法搜寻了喹啉分子在S-Mo-Ni催化剂晶体表面催化加氢反应的过渡态,取得较好的效果。利用该方法可以确定复杂反应过渡态,从而为实验研究起理论指导作用。

关键词： hyperchem 反应过渡态反应坐标反应步长能量变化曲线化工反应

基于MFC和hyperchem的分子三维结构批量实现方法

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计算机与应用化学 2002年第4期19卷 385-386页

作者：雷静周家驹中国科学院过程工程研究所北京100080

在药物分子设计中,化合物三维结构信息是进行三维药效团搜索,建立药效模型,发现新先导化合物的基础。本文介绍了用MFC编写程序,结合PC机上运行的分子模拟软件hyperchem提供的动态连接库和专用脚本语言,实现分子三维结构批量转化的方法,... 详细信息

在药物分子设计中,化合物三维结构信息是进行三维药效团搜索,建立药效模型,发现新先导化合物的基础。本文介绍了用MFC编写程序,结合PC机上运行的分子模拟软件hyperchem提供的动态连接库和专用脚本语言,实现分子三维结构批量转化的方法,从而为化合物三维结构数据库的建立奠定了基础。

关键词： MFC hyperchem 三维结构批量转化药物分子设计三维药效团模型

一种自动化分子模拟平台的搭建方法及初步应用

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西北工业大学学报 2006年第4期24卷 448-452页

作者：任华张秋禹陈晓伟西北工业大学理学院陕西西安710072

提出一种在PC机上搭建简易自动化分子模拟平台的方法,该平台软件条件为基于W in-dow s系统的办公软件excel和分子模拟软件hyperchem,hyperchem由excel内的脚本驱动,平台突出优点是能实现大量分子的批量化自动模拟。文中给出了平台的设... 详细信息

提出一种在PC机上搭建简易自动化分子模拟平台的方法,该平台软件条件为基于W in-dow s系统的办公软件excel和分子模拟软件hyperchem,hyperchem由excel内的脚本驱动,平台突出优点是能实现大量分子的批量化自动模拟。文中给出了平台的设计和具体实现过程,并对其应用做了初步研究,研究表明该平台可以取代以往的手动模拟操作,得出与手动操作同样令人满意的结果,而效率却有极大提高。另外该平台可扩展性强,可以通过简单的代码修改来完成各种分子模拟任务。

关键词：分子模拟自动化 hyperchem 脚本

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hyperchem在结构化学教学中的应用

重庆教育学院学报 2004年第6期17卷 20-22页

作者：谭君重庆教育学院生命科学与化学系重庆400067

计算机在化学教学中的应用越来越广泛 .hyperchem软件包是一种专业的计算化学软件 ,在结构化学的教学中 ,应用它建立分子模型、显示分子轨道、研究分子反应和模拟分子光谱 ,可以使深奥、抽象的理论知识形象化 ,简单化 ,同时可以培养学... 详细信息

计算机在化学教学中的应用越来越广泛 .hyperchem软件包是一种专业的计算化学软件 ,在结构化学的教学中 ,应用它建立分子模型、显示分子轨道、研究分子反应和模拟分子光谱 ,可以使深奥、抽象的理论知识形象化 ,简单化 ,同时可以培养学生对现代理论化学的兴趣 .

关键词： hyperchem 计算化学软件包结构化学化学教学分子模型分子轨道分子光谱

Ant colony optimization as a descriptor selection in QSPR modeling for prediction of λ_(max) of azo dyes

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Chinese Chemical Letters 2012年第10期23卷 1209-1212页

作者： Morteza Atabati Farzaneh Khandani School of Chemistry Damghan UniversityDamghanIran

量的 structureproperty 关系(QSPR ) 研究为偶氮的染料的最大的预言被建议。在结构的 3D 几何学的优化以后，不同描述符被 hyperchem 和龙软件计算。QSPR 的一个主要问题是描述符空格的高维数；因此，描述符选择是为这些研究的最重要... 详细信息

量的 structureproperty 关系(QSPR ) 研究为偶氮的染料的最大的预言被建议。在结构的 3D 几何学的优化以后，不同描述符被 hyperchem 和龙软件计算。QSPR 的一个主要问题是描述符空格的高维数；因此，描述符选择是为这些研究的最重要的步。在这份报纸，一个蚂蚁殖民地优化(ACO ) 算法被建议选择最好的描述符。

关键词：定量构效关系偶氮染料蚁群优化描述符预测 hyperchem 建模定量结构

Mechanism and Kinetic of Free Radical Reactions for Propane Using theoretical Calculations

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Journal of Chemistry and Chemical Engineering 2012年第6期6卷 563-573页

作者： Abbas A- Ali Drea Nadia Izet Department of Chemistry College of Science Babylon University post box No.4 Hilla-lraq Department of Chemistry College of Education for Girls AL-Kufa University Al Najafe-lraq

Quantum calculation method has been used to understand and investigate the free radical reactions of propane with hydroxyl radical in vacuum through modern quantum mechanics that is package on hyperchem 8.02 program. Optimized structures and structural reactivates have been studied through bond stability and angles using DFT calculation based on the basis set 6-31G*. Energetic properties have been calculated like total energy, Gibbs free energy, entropy, heat of formation, and rate constant for all chemical species that"s participate in the suggested reaction mechanism. Reaction mechanism and rate determining step had been suggested according to calculation of energy barrier values, and compares between the suggested competitive reactions for each probable reaction step. Suggested structures and the probable transition states have been studied.

关键词：自由基反应量子计算反应机理丙烷动力学 hyperchem 吉布斯自由能速率常数

^13C-Nuclear Magnetic Resonance （Experimental and Theorical） and FTIR of Interpenetrating Polymer Networks Based in PolyurethanelPolyaniline （PU/PANI）

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材料科学与工程（中英文版） 2010年第1期4卷 45-50页

作者： Norma-Aurea Rangel-Vaizquez Rene Salgado-Delgado Edgar Garcia-Hernandez Ana MariaMendoza-Martinez Mario Alejandro Gomez-Jimenez Departamento de Metalmecanica del Instituto Tecnologico de Queretaro. Ave. Tecnologico Esq. Mariano Escobedo S/N Col Centro CP 76000 Querdtaro Qro. Mexico Division de Estudios de Posgrado e Investigacion del Instituto Tecnologico de Zacatepec. Calzada Instituto Tecnologico Num. 27 Col. Ampliacion Plan de Ayala CP. 62780 Zacatepec Morelos Mexico Division de Estudios de Posgrado e Investigacion del Instituto Tecnologico de Ciudad Madero. Juventino Rosas y Jesus Urueta S/N Col. Los Mangos CP. 89440 Ciudad Madero Tamaulipas Mexico

3 PU/PANI ratios (90/10, 80/20, 70/30, respectively), were analyzed by means of the hyperchem software 8.0v to determine the theorical structure of all materials. The Gibbs free energy was calculated from the molecular geometry analysis, obtaining a value of energy of -3869 Kcal/mol, being proven for molecular dynamic (-3516 Kcal/mol), Langevin dynamic (-3462 Kcal/mol) and Monte Carlo (-3495 Kcal/mol), these values showed that the reaction was carried out. FTIR and 13C-NMR were used to characterize the structure of 3 PU/PANI ratios, the region from 1750 to 1600 cm-1 showed different absorptions of the NH scissor of bending vibration bonds, which represents the characteristic region of the combination of PANI and PU segments. The displacements from 1740 to 1700 cm-1 were attributed to the interruption of interactions in the PU chains due to the presence of PANI present in the womb of the IPN (PU/PANI). Also, the C-H bonds of the PANI increased with the percentage of PANI in the IPN, because of some chemical bonds exist due to the conjunction between the PU and PANI. Finally, 13C-NMR and FTIR characterizations clearly showed the conversion of quinonoid to benzenoid rings.

关键词：互穿网络聚合物红外光谱特征聚苯胺聚氨酯核磁共振 hyperchem 分子动力学实验

胡敏酸作用下多溴联苯醚三维分子结构变化特征

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环境科学与技术 2016年第9期39卷 8-13页

作者：单慧媚马腾刘崇炫肖骢中国地质大学(武汉)环境学院盆地水文过程与湿地生态恢复学术创新基地湖北武汉430074 生物地质与环境地质国家重点实验室

尽管持久性有机污染物多溴联苯醚（PBDEs）具有疏水性,土壤和沉积物对其有很强的固着能力,仍然在地下水中检测到PBDEs污染物,其中,可溶性有机质胡敏酸（HA）与PBDEs的相互作用可能是影响PBDEs在土壤—地下水中迁移的关键。为揭示HA作用... 详细信息

尽管持久性有机污染物多溴联苯醚（PBDEs）具有疏水性,土壤和沉积物对其有很强的固着能力,仍然在地下水中检测到PBDEs污染物,其中,可溶性有机质胡敏酸（HA）与PBDEs的相互作用可能是影响PBDEs在土壤—地下水中迁移的关键。为揭示HA作用对PBDEs环境行为的影响机理,文章基于hyperchem软件平台,构建HA和PBDEs的三维分子结构,计算并对比作用前后结构参数的变化,结果发现：（1）PBDEs分子结构在水环境中是不稳定的;（2）随着溴原子个数的增加,PBDEs的表面积、体积、疏水性和极性增大,PBDEs疏水性在4.27-11.39之间,远大于HA（-0.95）;（3）HA对PBDEs的影响主要通过氢键或羟基发生,作用后,HA和PBDEs的分子空间构型都发生了改变,PBDEs的栅格表面积、体积和极性均增强,而疏水性降低到2.63-8.99之间。研究显示HA作用改变了PBDEs三维分子结构,导致其疏水性减弱,从而促进了PBDEs在水环境中的迁移。

关键词：胡敏酸多溴联苯醚三维分子结构 hyperchem