检索结果-南通市图书馆

作者：李晓伟大连医科大学

学位级别：硕士

目的:hoxb在肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,Cc RCC)的产生发展中起至关重要作用。据报道,hoxb在许多癌症中都存在。虽然hoxb在多种癌症的发生和预后中的作用已经得到部分证实,但还没有对cc RCC进行进一步的生物信息学... 详细信息

目的:hoxb在肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,Cc RCC)的产生发展中起至关重要作用。据报道,hoxb在许多癌症中都存在。虽然hoxb在多种癌症的发生和预后中的作用已经得到部分证实,但还没有对cc RCC进行进一步的生物信息学分析。本研究运用生物信息学技术,对多种公共生物数据库的进行多重分析与验证,分析hoxb(Homeobox B)在癌症中的表达,进一步推测hoxb在肾透明细胞癌中的作用机制。方法:利用ONCOMINE数据库将hoxb基因在各种癌症组织中的m RNA表达水平进行分析。为进一步研究,肾透明细胞癌(Kidney renal clear cell carcinoma,KIRC:)、乳头状肾细胞癌(Kidney renal papillary cell carcinoma;KIRP)、嫌色细胞肾细胞癌(Kidney chromophobe,KICH)这三种肾癌和正常组织中hoxb基因表达的差异,采用GEPIA网站对hoxb基因在三种肾肿瘤的表达情况进行差异分析,以及hoxb在cc RCC肿瘤不同分期中的表达,为了研究hoxb的蛋白水平与cc RCC患者生存率(OS)之间的关系,我们利用人类蛋白质图谱验证了hoxb的差异表达以及其与OS的关系。使用STRING在线数据库分析了hoxb基因蛋白间的关系,为探讨hoxb与肿瘤通路之间的关系,最后研究hoxb对多种抗癌药物的敏感性。使用GSCALite分析拷贝数变异(Copy number variations,CNV)、甲基化、癌症潜在途径和药物敏感性。本文中使用了c Bio Portal在线工具,解析了cc RCC(TCGA)的hoxb共表达关系;并使用clustvis在线工具进行可视化;使用STRING在线数据库分析hoxb基因间的关系,从而检测出与hoxb相互作用的关键基因,并使用DAVID数据库中的基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集和PANTHER通路分析,预测hoxb基因的相关功能和可能控制途径,并通过R语言进行可视化处理。进一步通过c Bio Portal数据库验证hoxb基因与相关通路经典蛋白相关性:结果:与正常组织相比,cc RCC中,hoxb1/6/8/9的m RNA水平显著下调,而在包括肾细胞癌在内的几乎所有肿瘤中,hoxb3/4/7的m RNA水平都上调。在三类肾癌组织中,KIRC中hoxb3/5/6/8/9在肿瘤组织中的表达较肾组织明显下调;KIRP中hoxb6表达较肾组织明显下调;KICH中hoxb5/8的表达显著下调。因为,cc RCC在各个类型的肾癌中发病率最高,以及hoxb在cc RCC中体现出了明显的差异性,所以,本文选取cc RCC为重点研究对象。我们已经发现hoxb5、6、7、8四个基因在cc RCC不同分期中表达差异显著,同时我们发现在cc RCC中hoxb2/5/6/7/8/9高m RNA因子水平的患者具有较高的OS,而hoxb3/4无明显统计学意义。并结合GSCALITE网站分析,cc RCC中hoxb基因甲基化均上调,而hoxb3/5/6/8甲基化显著与基因表达成负相关,由于DNA异常甲基化是肿瘤发生的机制之一,因此我们推测hoxb5/6/8/9可能是肾细胞癌的潜在治疗靶点。通过GSCALITE网站分析得知,hoxb与多种癌症相关通路密切相关,并都表现为抑癌效果,同时hoxb5/9与CCT036477药物靶点正相关,而药物中CCT036477是经典的Wnt信号的抑制剂。我们发现hoxb1-9基因间存在明确的正相关性,其中hoxb5与hoxb6相关性最强;我们通过对KEGG富集和PANTHER通路中的分析。得出hoxbs基因发挥作用可能与Wnt途径密切相关,发现了hoxb5/6/8/9与许多Wnt通路经典蛋白质与基因有关,如MYC、CTNNB、Cyclin D1(CCND1)和肿瘤蛋白p53(TP53)共表达,进而证明hoxb5/6/8/9通过Wnt信号通路遏制了肾癌细胞的生长。结论:本研究提示hoxb5/6/8/9是肾透明细胞癌患者的潜在靶点。hoxbs可能通过Wnt信号通路抑制肾癌细胞的生长。我们对hoxb家族及其分子机制的分析可能会为进一步的研究提供理论基础。

关键词：肾透明细胞细胞癌 hoxb基因 Wnt

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hoxb基因与白血病关系的研究进展

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国际儿科学杂志 2012年第6期39卷 609-611,614页

作者：孝飞飞(综述) 贾秀红(审校) 山东省滨州医学院附属医院儿科 256603

hoxb基因是同源盒基因家族的成员之一，在造血调控中发挥重要的作用，其表达异常参与了白血病的发生，各亚型的差异性高表达影响白血病的进展及表型，还与白血病的治疗和预后密切相关，表达水平越高对治疗的反应越差，预后也较差。通过... 详细信息

hoxb基因是同源盒基因家族的成员之一，在造血调控中发挥重要的作用，其表达异常参与了白血病的发生，各亚型的差异性高表达影响白血病的进展及表型，还与白血病的治疗和预后密切相关，表达水平越高对治疗的反应越差，预后也较差。通过转基因、抑制P21、联合细胞因子或MS-5细胞株、全反式维甲酸等方法在基因水平进行研究，可为揭示白血病的发病机制及治疗和预后提供理论基础。

关键词： hoxb基因白血病同源盒基因

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hoxb家族基因与造血干/祖细胞的功能

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中国实验血液学杂志 2005年第2期13卷 343-347页

作者：唐宇宏汪承亚南京医科大学第一附属医院血液科南京210029

最近许多研究证明,同源盒基因(homeobox gene,HOX)家族在正常的造血过程中起着重要的作用。作为一类转录因子,HOX基因产物通过结合到特异的DNA序列来调控靶基因的表达。HOX家族成员之一--hoxb, 尤其是hoxb4引起了人们的极大兴趣。研究... 详细信息

最近许多研究证明,同源盒基因(homeobox gene,HOX)家族在正常的造血过程中起着重要的作用。作为一类转录因子,HOX基因产物通过结合到特异的DNA序列来调控靶基因的表达。HOX家族成员之一--hoxb, 尤其是hoxb4引起了人们的极大兴趣。研究发现,hoxb4的表达与造血干细胞的自我更新和祖细胞高效增殖功能密切相关,本文就有关这方面的一些新的研究进展作一综述。

关键词： hoxb基因自我更新造血干细胞细胞增殖

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HCMV感染对人神经胶质瘤细胞hoxb1～4及hoxb9基因表达影响的研究

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中国人兽共患病杂志 2004年第7期20卷 613-616页

作者：戴橄陈利玉李太存邬国军罗敏华中南大学湘雅医学院微生物学教研室长沙410078

目的　研究人神经胶质瘤U2 5 1细胞株的hoxb基因表达状态及人类巨细胞病毒 (HCMV)感染对U2 5 1细胞hoxb1,hoxb2 ,hoxb3,hoxb4及hoxb9基因表达的影响 ,以探讨HCMV致畸的可能机制。方法　应用半定量逆转录 -聚合酶链反应 (RT -PCR)技术检... 详细信息

目的　研究人神经胶质瘤U2 5 1细胞株的hoxb基因表达状态及人类巨细胞病毒 (HCMV)感染对U2 5 1细胞hoxb1,hoxb2 ,hoxb3,hoxb4及hoxb9基因表达的影响 ,以探讨HCMV致畸的可能机制。方法　应用半定量逆转录 -聚合酶链反应 (RT -PCR)技术检测U2 5 1细胞感染HCMV和 /或全反式维甲酸 (ATRA)处理前后hoxb1,hoxb2 ,hoxb3,hoxb4和hoxb9基因的相对表达水平。结果　U2 5 1细胞表达hoxb1,hoxb2 ,hoxb3,hoxb4及hoxb9基因 ;HCMV感染后 ,U2 5 1细胞hoxb1基因表达明显上调 ,hoxb2和hoxb4基因表达轻微上调 ,hoxb3基因于HCMV感染后表达被抑制 ,hoxb9基因的表达在HCMV感染后不同时间无明显变化 ;ATRA能显著上调HCMV感染后U2 5 1细胞hoxb1基因的表达。结论　HCMV感染能诱导U2 5 1细胞hoxb基因表达改变 ,HCMV有可能通过调控hoxb基因表达异常引起胚胎发育畸形。

关键词：人类巨细胞病毒 hoxb基因 RT—PCR 神经胶质瘤 U251细胞株

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人类巨细胞病毒感染对U251细胞hoxb1基因表达的影响

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中国现代医学杂志 2003年第15期13卷 7-9页

作者：戴橄陈利玉李太存邬国军罗敏华中南大学湘雅医学院微生物学教研室长沙410078

目的 :通过研究人神经胶质瘤U2 5 1细胞株的HOX基因表达状态及人类巨细胞病毒 (HCMV)感染对U2 5 1细胞hoxb1基因表达的影响 ,以探讨HCMV致畸的可能机制。方法 :应用半定量逆转录 -聚合酶链反应 (RT -PCR)技术。结果 :U2 5 1细胞表达hoxb... 详细信息

目的 :通过研究人神经胶质瘤U2 5 1细胞株的HOX基因表达状态及人类巨细胞病毒 (HCMV)感染对U2 5 1细胞hoxb1基因表达的影响 ,以探讨HCMV致畸的可能机制。方法 :应用半定量逆转录 -聚合酶链反应 (RT -PCR)技术。结果 :U2 5 1细胞表达hoxb1基因 ;HCMV感染后 ,U2 5 1细胞hoxb1基因表达明显上调 ;ATRA能显著上调HCMV感染后U2 5 1细胞hoxb1基因的表达。结论 :HCMV感染能诱导U2 5 1细胞hoxb1基因表达上调 ,HCMV有可能通过调控hoxb基因表达异常引起胚胎发育畸形。

关键词：人类巨细胞病毒 hoxb基因 RT-PCR 人神经脑质瘤U251细胞株

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