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The Impact of nA Stalk Deletion on hA Receptor Binding Specificity of Avian h7n9 in China in 2013-14 and Avian h7n7 in netherlands in 2003

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Computational Molecular Bioscience 2015年第1期5卷 1-6页

作者： Wei hu Department of Computer Science Houghton College Houghton NY USA

A novel avian origin influenza h7n9 virus emerged in March 2013 in China and caused severe disease in humans. The high human death rate has caused public health concern and attracted global attention. The influenza viruses have two surface proteins: hemagglutinin (hA) and neuraminidase (nA), with hA facilitating viral entry into a host cell and nA helping new viral particles leave a host cell to infect more host cells. In a previous study published in May 2003, we applied computational analysis to the hA sequences of this new virus. Our findings suggested that the hA of this virus had avian type receptors as its primary binding and human types as secondary binding, which was verified by several subsequent wet lab experiments in later months of 2013. We also showed that the human h7n9 and avian h7n9 in China in 2013 shared the same hA receptor binding patterns. The nA protein of this new virus has a stalk deletion that is associated with virulence and host adaptation. In the present study, we wanted to understand the biological effects of this nA deletion on the hA receptor binding preference of this virus. however, the nA proteins of human h7n9 in China in 2013 all carry a stalk deletion so we lack the nA proteins with no stalk deletion as a control. In this study, we chose instead the nA proteins of avian h7n9 in China in 2013-14 and those of avian h7n7 in netherlands in 2003 as some of them had a nA stalk deletion and some did not. We sought to employ a computational approach to revealing the impact of this nA stalk deletion on hA receptor binding preference of this virus. Our analysis implied that this deletion in the stalk region of nA enhanced the human receptor binding of avian h7n9 in China in 2013-14 and avian h7n7 in the netherlands in 2003.

关键词： h7n9 h7n7 Influenza Receptor Binding Specificity Stalk Deletion

h7n7亚型禽流感病毒血凝素B细胞和Th细胞表位预测及初步鉴定

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中国农学通报 2010年第4期26卷 11-14页

作者：白靓金宁一成岩石毅鲁会军南文龙田明尧赵翠青张金双关铭吉林大学药学院长春130021 军事医学科学院11所全军基因工程重点实验室长春130062

预测h7n7亚型禽流感病毒血凝素(hemagglutinin,hA)B细胞和Th细胞(ThelpCell,辅助T细胞,在免疫调节中起促进作用的T细胞亚群。)相关抗原表位,并对所获表位的抗原性进行初步鉴定。根据禽流感流行趋势,从GeneBank下载h7n7禽流感病毒hA氨基... 详细信息

预测h7n7亚型禽流感病毒血凝素(hemagglutinin,hA)B细胞和Th细胞(ThelpCell,辅助T细胞,在免疫调节中起促进作用的T细胞亚群。)相关抗原表位,并对所获表位的抗原性进行初步鉴定。根据禽流感流行趋势,从GeneBank下载h7n7禽流感病毒hA氨基酸序列,使用生物信息学方法,对所下载序列进行预测与分析,获得h7n7亚型禽流感病毒血凝素B细胞和Th细胞相关抗原表位。通过h7亚型禽流感病毒阳性血清,初步验证所选表位抗原性。获得了5个h7n7亚型禽流感病毒候选B细胞和Th细胞表位,经过间接ELISA方法分析,其中hA165～178,hA180～193,hA241～255表序列相对保守,与流行的h7n7亚型禽流感病毒hA相应区域具有较好的一致性,同时具有与h7型禽流感病毒阳性血清抗体结合能力,预示了其成为功能表位的可能。所筛选的表位具有成为h7n7亚型禽流感病毒hAB细胞和Th细胞相关抗原表位的可能,为h7n7亚型禽流感表位疫苗的研究奠定基础。

关键词：禽流感病毒血凝素 h7n7 抗原表位

一株野鸟源h7n7亚型禽流感病毒的全基因组序列分析及其对小鼠的感染性研究

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中国预防兽医学报 2021年第11期43卷 1135-1139,1177页

作者：仲启鑫张凤安崔鹏飞崔嘉琦谷文丽胡晗张元成邢鑫颜成邓国华陈化兰中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点开放实验室黑龙江哈尔滨150069 丽江市动物疫病预防控制中心云南丽江674199 陕西省动物疫病预防控制中心陕西西安710016

为了解h7n7亚型禽流感病毒(AIV)的生物学特性,本研究对2019年分离自我国云南省野鸟粪便中的一株低致病性h7n7 AIV WB/Yn/SY051/2019(h7n7)株进行全基因组序列测定、遗传演化分析和对BALB/c小鼠的感染性试验。序列分析结果显示,该株病毒h... 详细信息

为了解h7n7亚型禽流感病毒(AIV)的生物学特性,本研究对2019年分离自我国云南省野鸟粪便中的一株低致病性h7n7 AIV WB/Yn/SY051/2019(h7n7)株进行全基因组序列测定、遗传演化分析和对BALB/c小鼠的感染性试验。序列分析结果显示,该株病毒hA裂解位点基序为^(333)PEIPKGR↓GLF^(342),裂解位点处仅存在一个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒(LPAIV)的分子特征。遗传演化分析结果显示,除hA、nA基因与韩国野鸟h7n7病毒高度同源外,该株病毒内部基因PB2、nP、nS、M基因分别与野鸟源h1n1、h1n2、h9n7和h11n9AIV同源性较高,内部基因PB1和PA与野鸟源h5n3 AIV同源性较高,具有明显的遗传多样性。对BALB/c小鼠的感染性试验结果显示,该病毒不需要提前适应就能够在小鼠的肺脏和鼻甲内有效复制,并导致感染小鼠体质量轻微下降。表明野鸟中的h5和h7亚型LPAIV在向家禽传播的过程中具有突变为高致病性AIV的风险。本研究通过对一株野鸟源h7n7亚型AIV部分生物学特性的分析,为h7n7禽流感疫情的预警和综合防控提供了实验数据支持。

关键词：禽流感病毒 h7n7 生物学特性

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禽流感危机及其应对策略

中华流行病学杂志 2004年第3期25卷 185-187页

作者：易学锋罗会明广东省疾病预防控制中心广州510300

1997～2003年,以往仅感染禽类的禽流感(avian influenza)h5n1、h9n2、h7n7病毒却在我国香港、广东地区及荷兰分别引起人类疫情爆发或个案感染[1-5].2003年底至2004年初,亚洲有8个国家出现了禽流感h5n1爆发疫情,且在越南、泰国再次出现... 详细信息

1997～2003年,以往仅感染禽类的禽流感(avian influenza)h5n1、h9n2、h7n7病毒却在我国香港、广东地区及荷兰分别引起人类疫情爆发或个案感染[1-5].2003年底至2004年初,亚洲有8个国家出现了禽流感h5n1爆发疫情,且在越南、泰国再次出现人感染禽流感h5n1病毒,其中死亡18例(截止2004年2月10日的数据),引起全球高度关注[6].在短短的几年时间里,先后发生禽流感h5n1、h9n2、h7n7病毒跨越种属屏障直接感染人类的事件,预示着禽流感病毒的变异在加速.至今尚没有发现禽流感具有人传人的能力[1,5,7],但该病毒均属甲型流感病毒,而甲型流感病毒变异性非常快,就有可能通过抗原变异或通过与人流感病毒发生基因重配,形成重配株[8],从而具备人传人的能力.也就是说,它们有可能变为全球大流行株[1],有可能造成人的流感流行或世界大流行.因此,禽流感爆发和其越过种属屏障感染人类,已经对全人类健康构成严重的潜在威胁.

关键词：禽流感禽流感病毒分子生物学 h5n1 h9n2 h7n7

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广州市禽类从业人群禽流感病毒感染特征分析

中华流行病学杂志 2009年第11期30卷 1111-1113页

作者：柳洋鲁恩洁王玉林狄飚李铁钢周勇杨丽莉许晓茵傅传喜王鸣广州市疾病预防控制中心 510080 广州市白云区疾病预防控制中心广州市荔湾区疾病预防控制中心广州市番禺区疾病预防控制中心

目的应用血清流行病学调查广州市禽类从业人群感染禽流感病毒h5n1、h9n2、h7n7的状况，分析其感染特征。方法采集广州市与禽类接触相关的职业人群血清，包括农贸市场活禽零售与非禽类零售人群、企业化家禽养殖与农村家禽散养人群、活禽... 详细信息

目的应用血清流行病学调查广州市禽类从业人群感染禽流感病毒h5n1、h9n2、h7n7的状况，分析其感染特征。方法采集广州市与禽类接触相关的职业人群血清，包括农贸市场活禽零售与非禽类零售人群、企业化家禽养殖与农村家禽散养人群、活禽批发市场人群、野生鸟驯养人群、生猪屠宰人群以及一般人群，用血凝抑制试验、中和抗体试验检测h5、h9、h7IgG抗体；使用logistic回归分析、χ^2检验分析感染率分布。结果2881名调查对象中检测出4例h5抗体阳性（0．14％）；146例h9抗体阳性（5．07％），其中以活禽零售人群h9感染率最高（14．96％），企业化家禽养殖人群为8．90％，活禽批发人群为6．69％，野生鸟驯养人群为3．75％，生猪养殖人群为2．40％，非禽类零售人群为2．21％，农村家禽散养人群为1．77％，一般人群为2．30％。而1926名禽类从业人群中h7抗体均为阴性。结论人群中h5感染率较低，而h9感染率较高，未检测到h7感染；活禽零售、家禽批发、企业化家禽养殖等职业具有较高感染禽流感病毒的风险，其中以活禽零售感染风险最高，且接触家禽时间越长感染风险越高。

关键词：禽流感 h5n1 h9n2 h7n7 感染牢

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人群感染禽流感病毒(h5n1)研究进展

中华医学杂志 2007年第25期87卷 1794-1797页

作者：周蕾怀扬余宏杰中国疾病预防控制中心疾病控制与应急处理办公室北京100050

禽流感病毒一直以来认为只在禽类中发病和流行，由于存在种属屏障和受体特异性，其感染人类并导致发病、死亡少见报道。近年来，全球报道了多起禽流感病毒h5n1、h7n7、h7n3和h9n2亚型感染人并导致发病、死亡。2003年起，禽间（包括家禽... 详细信息

禽流感病毒一直以来认为只在禽类中发病和流行，由于存在种属屏障和受体特异性，其感染人类并导致发病、死亡少见报道。近年来，全球报道了多起禽流感病毒h5n1、h7n7、h7n3和h9n2亚型感染人并导致发病、死亡。2003年起，禽间（包括家禽、野禽和迁徙的候鸟）的高致病性禽流感h5n1疫情从亚洲。“逐渐向欧洲和非洲大陆扩散”。

关键词：禽流感病毒人群感染高致病性禽流感 h9n2亚型 h5n1 感染人类 h7n7 发病

湖北省重要淡水湖泊迁徙水禽禽流感病毒调查及两株低致病性h7n7病毒特性研究

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湖北省重要淡水湖泊迁徙水禽禽流感病毒调查及两株低致病性H7N7病...

作者：熊超超中国科学院研究生院（武汉病毒研究所）

学位级别：硕士

近年来，多种亚型禽流感病毒的频繁爆发给家禽养殖业和人类健康带来重大影响，而野鸟被认为与禽流感病毒的自然宿主，许多亚型的禽流感病毒均在鸟类当中分离到。秋冬两季，候鸟在全球范围内的迁徙为不同地区的病毒之间的重组和重配提供... 详细信息

近年来，多种亚型禽流感病毒的频繁爆发给家禽养殖业和人类健康带来重大影响，而野鸟被认为与禽流感病毒的自然宿主，许多亚型的禽流感病毒均在鸟类当中分离到。秋冬两季，候鸟在全球范围内的迁徙为不同地区的病毒之间的重组和重配提供了绝佳的机会。特别是其中的雁形目和鸻形目鸟类与禽流感病毒的传播具有重要关系。雁形目包括鸭、潜鸭、天鹅、各种雁类等游禽在内的约150个种;鸻形目含有鸻鹬类、鸥类和海雀类等涉禽在内的约350个种。这些鸟类在全球范围内分布极为广泛，并且多数具有迁徙习性。本文通过对湖北地区重要淡水湖泊迁徙水禽进行禽流感病毒监测，了解禽流感病毒在越冬地的部分特点和流行特征，掌握候鸟流感病毒的进化规律与生物学特性，对于病毒流行病学和公共卫生具有重要的意义。本研究于2013年11月至2014年3月之间，在湖北省沉湖、洪湖和龙感湖共采集野鸟粪便拭子样本共计1699枚，并分离出h5、h6和h7三个亚型的病毒共11株，分别来自于鸬鹚、豆雁等6个不同的宿主。对于迁徙候鸟栖息地实地考察发现，不同季节在不同栖息地上样本鸟类新鲜粪便样本采集数量具有显著差异。地理分布上，样本采集数在食物充足、滩涂面积较大的湖北沉湖中各月个份都相对更多，月采集量在300至600之间;时间分布上，在月平均气温气温低于10℃的12月、1月和2月份，各个湖泊栖息候鸟的粪便样本的采集数量明显多于气温更高的11月份和3月份，表明了鸟类在地理和时间分布上的不均匀。对分离的病毒hA片段进化分析表明，三株h5n6亚型的病毒在分类上均属于clade2.3.4，为高致病性禽流感病毒;一株h5n3亚型病毒为低致病性病毒。5株h6亚型病毒为欧亚株系野鸟来源，与北美来源的流感病毒亲缘关系相对较远，且具有相同的祖先。两株h7n7亚型病毒为欧亚株系来源，与2011年韩国野鸟身上分离的h7n9亚型病毒亲缘关系接近。对两株h7n7亚型病毒内部片段的进化分析表明，两株病毒是经过野鸟和家禽病毒重组而产生，其中两株病毒的PB2、PB1、hA和nP片段有共同的祖先，且PB1、hA和nP有着相同的进化路径。hAI实验显示两株h7n7亚型病毒均可以被h7n9抗体中和，且h7n7抗血清也能对h7n9病毒产生交叉反应。两株病毒在不同的细胞系MDCK和A549中复制状态良好，但是在不同的温度和ph条件病毒的持续感染能力各不相同，病毒在低温（4℃）和中性ph（ph=7.2）值条件下维持感染性能力为28天。对两株病毒内部毒力位点分析发现两株h7n7亚型病毒在若干个位点上均发生了毒力增强的突变，但对hA切割位点的分析表明两株病毒均为低致病性病毒，且对于神经氨酸酶抑制剂和离子通道抑制剂均敏感。BALB/c雌性小鼠身上的动物实验显示，两株h7n7亚型病毒感染的小鼠并没有表现明显致病症状，但在第1天第2天出现了2%–4%的体重丢失，病毒感染第3天小鼠体重恢复，并出现增长。对病毒感染的小鼠的呼吸道、肺脏、肾脏和肝脏进行的病毒检测均未能发现病毒。本文将通过对湖北省地区重要湖泊野鸟禽流感病毒的监测和分析，来了解野鸟禽流感病毒的生态分布、流行规律及病毒的生物学特性，为未来有效地预防和控制野鸟禽流感的流行提供科学参考和依据。

关键词：湖北省候鸟禽流感病毒监测 h7n7 生物学特性

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中国流感与人禽流感预防控制

中华流行病学杂志 2005年第11期26卷 837-838页

作者：肖东楼卫生部疾病控制司北京100044

一、近年来流感疫情1997年5-12月,以往仅能感染禽类的禽流感病毒h5n1却在香港地区引起人群感染暴发.这是全球首次发现禽流感病毒能直接感染人.1999年3月,香港又发生禽流感病毒h9n2感染人类的事件.2003年2月,香港再次发生人感染禽流感病... 详细信息

一、近年来流感疫情1997年5-12月,以往仅能感染禽类的禽流感病毒h5n1却在香港地区引起人群感染暴发.这是全球首次发现禽流感病毒能直接感染人.1999年3月,香港又发生禽流感病毒h9n2感染人类的事件.2003年2月,香港再次发生人感染禽流感病毒h5n1事件.同年3月,荷兰养殖场暴发禽流感病毒h7n7,随后,禽流感病毒通过结膜感染80多人,死亡1人.2003年12月,香港再次证实1人感染禽流感病毒h9n2.2003年底以来,禽流感病毒h5n1先后在亚洲的越南、泰国、韩国、日本、中国、俄罗斯等国家的禽类中发生暴发.目前,经实验室证实,禽流感病毒h5n1已经导致121人发病,其中62例死亡,病死率50%.在短短的几年时间里,先后发生禽流感病毒h5n1、h7n7、h9n2跨越种属屏障直接感染人类,引起世界各地流感专家们的高度关注.虽然,目前还没有发现禽流感h5n1、h7n7、h9n2病毒具有人传人的能力,但它们均属甲型流感病毒,且甲型流感病毒变异性非常大,有专家认为,禽流感病毒可能通过抗原变异或通过与人流感病毒发生基因重配,形成重配株,从而具备人传人的能力.因此,禽流感给人类带来了严峻的挑战,它具有极其重要的公共卫生意义.

关键词：人禽流感预防控制中国禽流感病毒感染暴发 h5n1 香港地区 h9n2 h7n7 感染人类

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2004-2012年我国禽流感流行情况

中华实验和临床病毒学杂志 2013年第3期27卷 239-240,F0003页

作者：张烨舒跃龙中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102600

禽流感病毒（AIV）是一类可以引起禽类感染和（或）致病的A型流感病毒,它能引起大多数家禽、野生水禽的感染.部分禽流感病毒已经跨种属传播感染人群,1997年香港第一次报道禽流感h5n1亚型病毒能感染人类,不断出现的h9n2、h7n2、h7n3、h7n... 详细信息

禽流感病毒（AIV）是一类可以引起禽类感染和（或）致病的A型流感病毒,它能引起大多数家禽、野生水禽的感染.部分禽流感病毒已经跨种属传播感染人群,1997年香港第一次报道禽流感h5n1亚型病毒能感染人类,不断出现的h9n2、h7n2、h7n3、h7n7等禽流感亚型感染人类的报道,并显示不同程度的致病性和病死率[1-3].2013年3月在中国首次报道新的基因重组h7 n9亚型禽流感病毒直接感染人类,导致重症肺炎引起死亡[4].

关键词：禽流感病毒流行情况 h5n1亚型 A型流感病毒感染人群感染人类 h9n2 h7n7