检索结果-南通市图书馆

Over 50,000 Metagenomically Assembled Draft genomes for the Human Oral Microbiome Reveal New Taxa

Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2022年第2期20卷 246-259页

作者： Jie Zhu Liu Tian Peishan Chen Mo Han Liju Song Xin Tong Xiaohuan Sun Fangming Yang Zhipeng Lin Xing Liu Chuan Liu Xiaohan Wang Yuxiang Lin Kaiye Cai Yong Hou Xun Xu Huanming Yang Jian Wang Karsten Kristiansen Liang Xiao Tao Zhang Huijue Jia Zhuye Jie BGI-Shenzhen Shenzhen 518083China Shenzhen Key Laboratory of Human Commensal Microorganisms and Health Research BGI-ShenzhenShenzhen 518083China Shenzhen Engineering Laboratory of Detection and Intervention of Human Intestinal Microbiome BGI-ShenzhenShenzhen 518083China Laboratory of Genomics and Molecular Biomedicine Department of BiologyUniversity of CopenhagenCopenhagen DK-2100Denmark James D.Watson Institute of genome Sciences Hangzhou 310058China BGI-Qingdao BGI-ShenzhenQingdao 266555China

The oral cavity of each person is home to hundreds of bacterial *** taxa for oral diseases have been studied using culture-based characterization as well as amplicon sequencing,metagenomic and genomic information remains scarce compared to the fecal ***,using metagenomic shotgun data for 3346 oral metagenomic samples together with 808 published samples,we obtain 56,213 metagenome-assembled genomes(MAGs),and more than 64%of the 3589 species-level genome bins(SGBs)contain no publicly available *** resulting genome collection is representative of samples around the world and contains many genomes from candidate phyla radiation(CPR)that lack ***,it enables the discovery of new taxa such as a genus Candidatus Bgiplasma within the family ***-scale metagenomic data from massive samples also allow the assembly of strains from important oral taxa such as Porphyromonas and *** oral microbes encode genes that could potentially metabolize *** from these findings,a strongly male-enriched Campylobacter species was *** samples would be more user-friendly collected than fecal samples and have the potential for disease ***,these data lay down a genomic framework for future inquiries of the human oral microbiome.

关键词： Metagenomics Human oral microbiome Metagenome-assembly genome genome catalog Gender

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：