检索结果-南通市图书馆

中国兽医学报 2005年第2期25卷 125-128页

作者：吴显实罗廷荣廖素环刘芳陆芹章黄伟坚温荣辉秦爱珍余克伦广西大学动物科学技术学院广西南宁530005

参考已发表的猪瘟病毒 (CSFV) Shimen株、HCL V株、Paderborn株的核苷酸序列 ,设计并合成 1 1对引物 ,应用RT- PCR技术 ,成功地分 1 1个片段扩增了 CSFV广西流行毒株 gxwz0 2的全基因组。将这 1 1个基因片段克隆 ,并测定了其核苷酸序列... 详细信息

参考已发表的猪瘟病毒 (CSFV) Shimen株、HCL V株、Paderborn株的核苷酸序列 ,设计并合成 1 1对引物 ,应用RT- PCR技术 ,成功地分 1 1个片段扩增了 CSFV广西流行毒株 gxwz0 2的全基因组。将这 1 1个基因片段克隆 ,并测定了其核苷酸序列。应用计算机生物软件 Vector NTI将 1 1个基因片段进行拼接 ,确认 CSFV gxwz0 2株全基因组序列的长度为 1 2 2 96个核苷酸 (Gen Bank收录号 AY3 6 776 7)。将 gxwz0 2株与国内外已发表的 Shimen、HCL V、3 9、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort1 87、Paderborn、CS、AL D、GPE- 、P97、L PC毒株进行全基因组核苷酸序列和推定的氨基酸序列比较 ,核苷酸同源性分别为 85 .4 %、 84 .6 %、88.7%、85 .7%、 85 .7%、 85 .3 %、85 .6 %、 95 .3 %、 85 .7%、85 .7%85 .4 %、83 .4 %、84 .3 % ,推定的氨基酸同源性分别为 92 .6 %、91 .7%、94 .2 %、 93 .1 %、92 .9%、92 .3 %、 93 .0 %、97.7%、92 .6 %、93 .0 %、92 .6 %、90 .5 %、90 .6 %。 gxwz0 2与 Shimen、HCL V的全基因组序列及推定的氨基酸序列有明显差异 ,表明 gxwz0 2株在遗传性和抗原性上发生了较明显的变化。系统发育树分析 ,所比较的 1 4株 CSFV被分为2个群 :gxwz0 2、Paderborn和 3 9这 3个毒株被归为群 .

关键词：猪瘟病毒基因组克隆序列分析 gxwz02株猪瘟

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广西猪瘟流行毒株全基因组的克隆与序列分析

广西猪瘟流行毒株全基因组的克隆与序列分析

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作者：吴显实广西大学

学位级别：硕士

根据已发表的猪瘟病毒(Classical Swine Fever Virus，CSFV)Shimen株、HCLV株和Paderborn株的全基因组序列，设计并合成11对引物，应用RT-PCR技术，成功地分11个片段扩增了CSFV广西流行毒株gxwz02的全基因组，并将这11个基因片段克隆到p... 详细信息

根据已发表的猪瘟病毒(Classical Swine Fever Virus，CSFV)Shimen株、HCLV株和Paderborn株的全基因组序列，设计并合成11对引物，应用RT-PCR技术，成功地分11个片段扩增了CSFV广西流行毒株gxwz02的全基因组，并将这11个基因片段克隆到pGEM-T和PMD18-T载体上，测定其核苷酸序列。应用计算机生物软件Vector NTI Suite 6将11个基因片段进行拼接，确认CSFV gxwz02株全基因组序列的长度为12296个核苷酸。将CSFV gxwz02株与国内外已发表的Shimen、HCLV、39、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort187、Paderborn、CS、ALD、GPE、P97、LPC毒株进行全基因组序列和推定的氨基酸序列比较，结果显示，核苷酸同源性分别为85.4％、84.6％、88.7％、85.7％、85.7％、85.3％、85.6％、95.3％、85.7％、85.7％、85.4％、83.4％、84.3％，推定的氨基酸序列同源性分别为92.6％、91.7％、94.2％、93.1％、92.9％92.3％、93.0％、97.7％、92.6％、93.0％、92.6％、90.5％、90.6％。gxwz02与Shimen、HCLV的全基因组序列及推定的氨基酸序列同源性有明显变异，表明gxwz02与Shimen、HCLV在遗传性和抗原性上存在较大差异。系统发育树分析表明，所比较的14株CSFV被分为两个群，gxwz02、Paderborn和39这3个毒株被归为群Ⅰ，其余的11个毒株被归为群Ⅱ，gxwz02与Paderborn的亲缘关系最接近。将gxwz02与Shimen、HCLV基因组中单个基因分别进行核苷酸及推定的氨基酸序列同源性比较，结果显示，基因NS5A、E2、NS2、E的遗传变异程度大，而NS3、NS4A、NS4B的遗传性则相对保守。

关键词：猪瘟病毒基因组序列分析 gxwz02株

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