检索结果-南通市图书馆

糜子grf转录因子全基因组鉴定及在茎分生组织中的表达特征

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2024年第3期46卷 242-255页

作者：韦恒刘天鹏何继红董孔军任瑞玉张磊李亚伟郝子义杨天育甘肃农业大学生命科学技术学院兰州730070 甘肃省农业科学院作物研究所兰州730070

为了解糜子(Panicum miliaceum L.)grf(growth-regulating factor)基因家族成员全基因组信息及其在营养生长阶段分生组织中的表达特征,本研究通过生物信息学和转录组测序相结合的方法,分析了糜子grf基因家族成员的染色体分布、基因结构... 详细信息

为了解糜子(Panicum miliaceum L.)grf(growth-regulating factor)基因家族成员全基因组信息及其在营养生长阶段分生组织中的表达特征,本研究通过生物信息学和转录组测序相结合的方法,分析了糜子grf基因家族成员的染色体分布、基因结构、系统进化关系、顺式作用元件及其在营养器官茎分生组织中的表达特征。结果表明:糜子grf基因家族包含21个成员,家族成员含有1~4个内含子和2~5个外显子,编码蛋白长度为224~618个氨基酸,等电点为4.93~9.69;Pmgrf基因不均等分布于12条染色体上,除Pmgrf13定位于细胞核和叶绿体外,其余均定位于细胞核。系统进化分析显示,糜子21个grf基因分为4个亚族(A、B、C和D)。顺式作用元件分析表明,在糜子grf基因上游2000 bp序列中,普遍存在数目不等、种类不同的参与光响应、激素响应、干旱诱导、低温和其他环境胁迫响应的顺式作用元件。对糜子高秆品种陇糜12号和矮秆品种张778拔节期节间和节部分生组织分别取样进行转录组测序及qRT-PCR分析,结果发现:Pmgrf3、Pmgrf12在矮秆品种张778中表达量显著高于高秆品种陇糜12号,而Pmgrf4、Pmgrf16和Pmgrf21的表达特征与之相反;Pmgrf2和Pmgrf5在张778节间分生组织中的表达量显著高于陇糜12号,其余grf基因不表达或差异表达不显著,表明Pmgrf2、Pmgrf3、Pmgrf4、Pmgrf5、Pmgrf12、Pmgrf16和Pmgrf21等7个基因与糜子株高的形成相关。

关键词：糜子 grf基因转录组株高

同方期刊数据库

杉木grf和GIF基因家族鉴定、表达与互作分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

核农学报 2024年第7期38卷 1224-1233页

作者：邱姗王文新江梅黄华宏林二培浙江农林大学林业与生物技术学院/亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300

生长调节因子(grf)和grf相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究grf和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个Clgrfs基因和2个Cl... 详细信息

生长调节因子(grf)和grf相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究grf和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个Clgrfs基因和2个ClGIFs基因。分析结果显示,Clgrfs氨基酸残基数目范围为386(Clgrf4)~723 aa(Clgrf3),等电点为7.07(Clgrf4)~9.26(Clgrf5);2个ClGIFs蛋白氨基酸数目分别为242和258 aa,等电点均在6左右,蛋白质分子质量分别为25.64和27.96 kDa。保守结构域和基序分析发现Clgrfs蛋白均含QLQ和WRC结构域,ClGIFs蛋白均含SSXT结构域,且高度保守。进一步分析结果显示,Clgrfs分别属于进化枝Ⅲ和进化枝Ⅵ,且均受miR396调控。表达分析结果表明,Clgrfs基因的表达具有一定的组织特异性,而ClGIFs在不同组织呈组成性表达,且Clgrfs和ClGIFs基因均能响应赤霉素(GA3)和水杨酸(SA)的处理。酵母双杂交结果表明5个Clgrfs蛋白和2个ClGIFs蛋白均存在互作关系。本研究结果为进一步研究杉木grf和GIF基因的功能提供了理论基础。

关键词：杉木 grf基因 GIF基因表达分析互作

滇水金凤花距发育相关基因grf的克隆及表达分析

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物科学学报 2022年第5期40卷 669-676页

作者：魏春梅蔡斌陶宇蝶李林菊赵秋燕周敏黄美娟黄海泉西南林业大学园林园艺学院国家林业和草原局西南风景园林工程技术工程研究中心云南省功能性花卉资源及产业化技术工程研究中心西南林业大学园林园艺花卉研发中心昆明650224

采用RT-PCR技术对滇水金凤(Impatiens uliginosa Franch.)grf基因进行克隆,对其编码蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,并利用qRT-PCR方法分析grf基因的时空表达模式。结果显示,从滇水金凤中成功获得两个grf基因,其cDNA全长分别为1... 详细信息

采用RT-PCR技术对滇水金凤(Impatiens uliginosa Franch.)grf基因进行克隆,对其编码蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,并利用qRT-PCR方法分析grf基因的时空表达模式。结果显示,从滇水金凤中成功获得两个grf基因,其cDNA全长分别为1137和903 bp,分别编码378和300 aa,分别命名为Iugrf1和Iugrf2,二者均具有QLQ和WRC结构域。除了保守区域外,滇水金凤grf基因编码产物序列与其他物种的同源性较低。系统进化分析结果表明,Iugrf1和Iugrf2分别位于两个不同的进化分支。基因表达分析发现,Iugrf1在花苞期和盛花期距部表达量最高,而在檐部的表达随花距的发育逐渐降低。Iugrf2在花苞期檐部表达量最高,随着花距的发育逐渐降低。此外,Iugrf1和Iugrf2基因均在始花期花距弯部表达量最高,且随着花距的发育,在尖部和弯部的表达量逐渐降低,而在基部的表达量逐渐升高。推测滇水金凤的两个基因为同源基因,Iugrf1主要参与花距距部的生长和发育,而Iugrf2主要参与檐部的生长和发育。

关键词：滇水金凤花距发育 grf基因基因克隆表达分析

Brgrf5基因参与植物生长以及盐和渗透胁迫抗性的调控

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2024年第2期22卷 365-370页

作者：赵乾宇张慧敏刘倩邱念伟李化银王凤德高建伟曲阜师范大学生命科学学院曲阜273165 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所国家蔬菜改良中心山东分中心山东省设施蔬菜生物学重点实验室济南250100 山东师范大学生命科学学院济南250100

大白菜(Brassica rapa ***)年播种面积约2×10^(6)hm^(2),在保障国民蔬菜正常供应中发挥了重要作用。叶是大白菜的主要食用器官,因此挖掘调控大白菜叶大小发育的关键基因将会对下一步通过基因工程等手段改良大白菜提供帮助。本研究从大... 详细信息

大白菜(Brassica rapa ***)年播种面积约2×10^(6)hm^(2),在保障国民蔬菜正常供应中发挥了重要作用。叶是大白菜的主要食用器官,因此挖掘调控大白菜叶大小发育的关键基因将会对下一步通过基因工程等手段改良大白菜提供帮助。本研究从大白菜自交系‘福山包头’中克隆了一个grf基因,命名为Brgrf5。通过生物信息学的分析发现,Brgrf5基因含有1个内含子,CDS序列长1044 bp,在进化上Brgrf5与拟南芥Atgrf7处于同一个分支并且二者的氨基酸一致性高达70.7%,暗示二者在功能上可能具有一定的相似性。进一步的研究也证实了上述猜测,在拟南芥中过量表达Brgrf5基因明显促进了转基因植株不同组织器官的增大,但也同时降低了转基因植株对盐和渗透胁迫的抗性,该结果与对Atgrf7的研究结果一致。研究结果将为下一步Brgrf5基因应用于大白菜遗传改良提供一定的基础。

关键词：大白菜 grf基因生长发育非生物胁迫

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

毛竹Pegrf1基因克隆及初步功能分析

分子植物育种 2021年第21期19卷 7084-7091页

作者：娄永峰宋晓琛孙化雨高志民江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室南昌330013 国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室北京市共建竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

为了探究生长调控因子(grf)转录因子在竹笋-茎秆生长中的作用,本研究以毛竹(Phyllostachys edulis)为材料,通过RT-PCR方法进行grf基因的克隆,应用生物信息学方法对其序列进行分析,利用RT-qPCR对其在毛竹竹笋-幼竹的生长过程中的表达模... 详细信息

为了探究生长调控因子(grf)转录因子在竹笋-茎秆生长中的作用,本研究以毛竹(Phyllostachys edulis)为材料,通过RT-PCR方法进行grf基因的克隆,应用生物信息学方法对其序列进行分析,利用RT-qPCR对其在毛竹竹笋-幼竹的生长过程中的表达模式进行分析,并通过在拟南芥中异位表达初步分析其功能。结果表明,从毛竹中克隆获得1个1 164 bp的grf基因,命名Pegrf1,其编码387个氨基酸;蛋白序列分析表明Pegrf1具有完整的grf特征结构域WRC和QLQ。进化分析显示,Pegrf1与水稻等单子叶植物的grfs聚类在较近的分支,亲缘关系较近。在毛竹竹笋生长过程中,Pegrf1主要在幼嫩竹笋中表达,在快速生长阶段的表达量明显高于生长缓慢时期,在竹笋顶端及中部的表达量明显高于基部。过量表达Pegrf1能增加转基因拟南芥的株高。本研究结果可为阐明grf基因在竹子的生物学功能提供了参考。

关键词：毛竹 grf基因功能分析茎秆株高