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人早幼粒细胞cDNA文库中与gins2发生相互作用靶蛋白的筛选和鉴定

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吉林大学学报（医学版） 2021年第1期47卷 66-72页

作者：张曦潘玉卿余鑫郑亚婷郭成斌徐娜王良晓何亮杨丽云南省肿瘤医院昆明医科大学第三附属医院检验科云南昆明650118 昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室云南昆明650032

目的:采用酵母双杂交系统筛选与人gins2编码蛋白发生相互作用的靶蛋白,阐明其在急性早幼粒细胞白血病(APL)中的致病信号及相关机制。方法:采用热激法将诱饵质粒pGBKT7-gins2与人早幼粒细胞cDNA文库质粒共同转化至酵母AH109感受态细胞中... 详细信息

目的:采用酵母双杂交系统筛选与人gins2编码蛋白发生相互作用的靶蛋白,阐明其在急性早幼粒细胞白血病(APL)中的致病信号及相关机制。方法:采用热激法将诱饵质粒pGBKT7-gins2与人早幼粒细胞cDNA文库质粒共同转化至酵母AH109感受态细胞中,筛选与gins2编码蛋白相互作用的文库蛋白。利用多重报告基因检测和DNA测序对编码互作蛋白的阳性克隆进行生物信息学分析。结果:成功从文库中筛选到15个初始阳性克隆,其中10个能激活腺苷酸琥珀酸合成酶2(ADE2)和组氨醇氨基盐转移酶3(HIS3)报告基因,13个能激活β-半乳糖苷酶(LacZ)报告基因。对10个能在SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade培养基中生长的阳性克隆行DNA测序和基本局部比对搜索工具(BLAST)比对分析后,除8和9号测序失败,其余8个阳性克隆分属8种不同的蛋白编码基因,分别是RNA结合基序蛋白39(RBM39)、泛素样修饰因子激活酶1(UBA1)、金属硫蛋白2(MT2A)、线粒体钙离子摄入蛋白1(MICU1)、N-乙基马来酰亚胺敏感性融合蛋白辅因子(NSFL1C)、脂肪酰基辅酶a还原酶1(FAR1)、双特异性磷酸酶1(DUSP1)和细胞表面抗原14(CD14)。结论:成功筛选到与gins2发生相互作用的8个功能蛋白,推测目的蛋白可能在细胞损伤、转录调控和增殖代谢等方面发挥重要作用。

关键词：白血病人早幼粒细胞cDNA文库酵母双杂交 gins2

干扰gins2表达对HL60细胞增殖和凋亡的影响

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中国生物工程杂志 2013年第3期33卷 41-46页

作者：张曦刘北忠高艳军黎亮高远梅胡秀秀马鹏鹏钟梁重庆医科大学临床检验诊断学教育部重点实验室重庆400016 重庆医科大学附属永川医院中心实验室重庆402160

目的:探讨靶向抑制gins2基因表达后对人早幼粒细胞白血病细胞株HL60增殖和凋亡的影响及其机制。方法:RT-PCR分别检测gins2基因在三株白血病细胞HL60、U937、THP-1的表达。设计与合成针对gins2基因的干扰序列,稳定转染高表达该基因的HL6... 详细信息

目的:探讨靶向抑制gins2基因表达后对人早幼粒细胞白血病细胞株HL60增殖和凋亡的影响及其机制。方法:RT-PCR分别检测gins2基因在三株白血病细胞HL60、U937、THP-1的表达。设计与合成针对gins2基因的干扰序列,稳定转染高表达该基因的HL60细胞,荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达情况;RT-PCR和Western blot分别检测各组细胞转染后mRNA和蛋白质水平;MTT法检细胞的增殖和凋亡情况;流式细胞术分析细胞的凋亡率;Western blot检测凋亡相关蛋白的表达。结果:在三株白血病细胞株中,gins2的表达量由低到高依次是:THP-1,U937,HL60。干扰质粒转染HL60细胞后,与阴性对照组及未处理组相比,干扰组gins2的mRNA和蛋白质水平均显著降低,且细胞的增殖能力明显受抑。同时,凋亡相关蛋白Bax表达水平显著增高而Bcl2显著降低。结论:干扰gins2基因表达后,其mRNA和蛋白质水平均显著降低,可通过上调Bax表达,下调Bcl2表达来抑制HL60细胞增殖并促进其凋亡。

关键词： gins2 细胞凋亡 HL60细胞 Bax Bcl2

gins2基因沉默对K562细胞和NB4细胞凋亡的影响及作用机制的研究

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GINS2基因沉默对K562细胞和NB4细胞凋亡的影响及作用机制的研究

作者：高艳军重庆医科大学

学位级别：硕士

PML-C与gins2蛋白相互作用的胞内验证目的通过胞内实验验证PML-C与gins2蛋白之间的相互作用。方法将诱饵蛋白质粒pGBKT7-PML-C和文库蛋白质粒pACT2-gins2共同转化AH109酵母细胞，通过酵母双杂交技术验证二者在活细胞内的相互作用;构建pC... 详细信息

PML-C与gins2蛋白相互作用的胞内验证目的通过胞内实验验证PML-C与gins2蛋白之间的相互作用。方法将诱饵蛋白质粒pGBKT7-PML-C和文库蛋白质粒pACT2-gins2共同转化AH109酵母细胞，通过酵母双杂交技术验证二者在活细胞内的相互作用;构建pCMV-HA-PML-C及pCMV-Myc-gins2两种真核表达载体并共转染人胚肾293细胞，利用免疫共沉淀技术验证二者之间的相互作用。结果pGBKT7-PML-C诱饵蛋白质粒和pACT2-gins2靶蛋白质粒共转化AH109酵母细胞后，可见蓝色阳性克隆生长;pCMV-HA-PML-C和pCMV-Myc-gins2真核表达载体构建成功，共转染人胚肾293细胞，用兔抗HA多克隆抗体沉淀与HA-PML-C相互作用的蛋白后，用鼠抗Myc单克隆抗体进行Western blotting检测，可以检测到Myc-gins2蛋白。结论利用酵母双杂交和免疫共沉淀技术在胞内验证了PML-C与gins2间存在相互作用。PML(NLS-)与gins2蛋白相互作用的胞内验证目的：通过间接免疫荧光技术和免疫共沉淀实验验证PML（缺失核定位信号系统，NLS-）与gins2蛋白之间的相互作用。方法：构建pCMV-HA-PML（NLS-）和pCMV-Myc-gins2两种真核表达载体并共转染人胚肾293细胞，利用间接免疫荧光和免疫共沉淀技术在胞内验证二者之间的相互作用。结果：成功构建真核表达载体pCMV-HA-PML（NLS-）及pCMV-Myc-gins2，共转染人胚肾293细胞，HA-PML（NLS-）蛋白使用抗HA的一抗和FITC标记的羊抗兔IgG，Myc-gins2蛋白使用鼠抗Myc的一抗和TRITC标记的羊抗鼠IgG，在激光共聚焦显微镜下可观察到两种蛋白在人胚肾293细胞内的共定位;兔抗HA多克隆抗体沉淀与HA-PML（NLS-）相互作用的蛋白后，用鼠抗Myc单克隆抗体进行Western blotting检测，可以检测到Myc-gins2蛋白。结论：利用间接免疫荧光技术和免疫共沉淀实验验证PML（NLS-）与gins2蛋白间存在特异性相互作用。gins2基因沉默对K562细胞和NB4细胞凋亡的影响及作用机制的研究目的：通过构建gins2的短发卡RNA干扰载体，转染K562和NB4细胞，观察gins2基因沉默对K562细胞和NB4细胞凋亡的影响，为探寻白血病的诊疗靶点及其分子作用机制的研究奠定基础。方法：通过构建gins2的短发卡RNA干扰载体，转染K562和NB4细胞，用G418筛选后，利用荧光定量PCR技术和免疫印迹检测干扰效果;流式细胞术检测细胞凋亡，周期情况;间接免疫荧光检测细胞周期蛋白的定位及免疫印迹检测细胞周期蛋白，凋亡蛋白和信号通路蛋白的变化。结果：成功构建五组gins2的短发卡RNA干扰载体，在两株细胞中均有干扰效果，流式细胞术检测细胞凋亡率明显上升，细胞周期阻滞在G2期，且与CyclinB1蛋白在细胞内的定位相关;免疫印迹检测凋亡蛋白表达升高，并验证了细胞凋亡是通过P38MAPK信号通路发挥作用的。结论：gins2基因沉默后抑制细胞生长，凋亡率升高,细胞周期阻滞在G2期，且与P38MAPK信号通路相关。

关键词： PML-C gins2 酵母双杂交免疫共沉淀 PML(NLS-) gins2 间接免疫荧光免疫共沉淀免疫印迹 PGPU6/GFP/Neo载体 gins2基因 RNA干扰 NB4细胞 K562细胞

gins2在早幼粒细胞白血病发生中的作用及其分子机制研究

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GINS2在早幼粒细胞白血病发生中的作用及其分子机制研究

作者：张曦重庆医科大学

学位级别：硕士

第一部分干扰gins2表达对HL60细胞增殖和凋亡的影响目的：探讨干扰gins2基因表达后对人早幼粒细胞白血病细胞株HL60增殖和凋亡的影响及其机制。方法： RT-PCR分别检测gins2基因在3株白血病细胞株HL60、U937、THP-1中的表达量。设计并合... 详细信息

第一部分干扰gins2表达对HL60细胞增殖和凋亡的影响目的：探讨干扰gins2基因表达后对人早幼粒细胞白血病细胞株HL60增殖和凋亡的影响及其机制。方法： RT-PCR分别检测gins2基因在3株白血病细胞株HL60、U937、THP-1中的表达量。设计并合成针对gins2基因的靶向干扰序列，稳定转染高表达该基因的HL60细胞，荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达情况;RT-PCR和Western blot分别检测各组细胞转染后gins2的mRNA及蛋白水平;MTT法检测细胞的增殖和凋亡情况;流式细胞术分析细胞的凋亡率;Western blot检测凋亡相关蛋白的表达。结果：在3株白血病细胞株中，gins2的表达量由低到高依次是：THP-1，U937，HL60。干扰质粒转染HL60细胞后，与阴性对照组及未处理组相比，干扰组gins2的mRNA及蛋白水平均显著降低，且细胞的增殖能力明显受抑。同时，凋亡相关蛋白Bax表达水平显著增高而Bcl2显著降低。结论：下调gins2基因表达后，可通过上调Bax表达，下调Bcl2表达来抑制HL60细胞增殖并促进其凋亡。第二部分干扰gins2表达对HL60细胞周期调控因子的变化及机制目的：观察下调gins2基因的表达后对人白血病细胞株HL60周期调控因子的变化并探讨其机制。方法：脂质体介导并稳定转染干扰质粒的细胞为干扰组，转染阴性对照质粒的细胞为阴性对照组，只加入脂质体的细胞为空白对照组，未转染的HL60细胞为未处理组。采用集落形成实验测定细胞的增殖水平;流式细胞术分析各组细胞周期;Western blot检测CDK1、CyclinB1等周期调控蛋白的变化;同时采用RT-PCR检测ATM，CHK2,P53等周期调控因子mRNA水平的表达;Western blot检测其蛋白水平的表达情况。结果：和其他3组相比，干扰组细胞G2/M期细胞数明显增加且DNA合成受阻，增殖减慢。与G2/M期相关周期调控蛋白CDK1，cyclinB1的表达随时间变化而明显降低。RT-PCR和western blot均显示和其他三组相比，干扰组细胞ATM,CHK2,P53转录水平和翻译水平显著上调。结论：下调gins2表达后可抑制HL60细胞DNA复制并影响其G2/M期进程，机制可能与ATM，CHK2,P53等基因有关。第三部分携人gins2基因重组腺病毒载体的构建及其对HL60细增殖和凋亡的影响目的：使用AdEasy系统构建携带gins2基因的重组腺病毒载体并进行鉴定，观察上调gins2表达对HL60细胞增殖及凋亡的影响。方法：以pcDNA3.1-gins2质粒作为模版，RT-PCR法扩增gins2基因编码序列全长并克隆入穿梭载体pAdTrace-TO4，经转化、酶切和测序正确后，将产生的重组质粒pAdT-gins2转化入pAdEasy-1-BJ5183感受态进行同源重组，得到重组子pAdE-gins2。后将其转染HEK293细胞进行包装，行PCR和荧光显微镜鉴定重组腺病毒Ad-gins2。待扩增测定滴度后感染人HL60细胞，MTT法检测重组腺病毒感染后HL60细胞的生长情况，集落形成实验测定细胞的增殖情况，流式细胞术检测凋亡细胞个数，PCR和western blot法分别检测凋亡蛋白Bax，Bcl2的变化情况。结果：酶切、PCR、测序结果显示gins2基因克隆入穿梭质粒，并得到重组腺病毒Ad-gins2;PCR法和荧光显微镜显示包装成功;经三轮高效扩增病毒后病毒滴度达1.35×1012IU/ml，感染HL60细胞后，western blot可检测到gins2的表达，MTT和集落形成实验结果均表明gins2过表达后能促进细胞增殖，流式细胞术显示病毒感染细胞后凋亡率明显降低， Western blot显示凋亡蛋白Bax显著降低而Bcl2显著升高。结论：成功构建包含gins2基因的重组腺病毒载体，可通过上调Bcl2表达而抑制Bax表达促进HL60细胞增殖，为明确该基因在急性髓细胞白血病发生和发展中的作用机制奠定了一定基础。

关键词： HL60细胞 gins2基因细胞凋亡 Bax基因 Bcl2基因 gins2 基因 HL60细胞 G2期阻滞白血病 gins2基因细胞增殖重组腺病毒 HL60细胞

gins2与肝细胞癌预后及免疫治疗的相关性研究

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GINS2与肝细胞癌预后及免疫治疗的相关性研究

作者：熊楚晖青海大学

学位级别：硕士

目的:目前晚期肝细胞癌的免疫联合靶向治疗能很好的改善患者预后,但部分患者并不能获得良好的收益,在肝细胞癌中缺乏能够很好评估患者预后和治疗疗效的手段。在多数文献中表明gins2与肿瘤具有一定的相关性,但其在肝细胞癌中并没得到很... 详细信息

目的:目前晚期肝细胞癌的免疫联合靶向治疗能很好的改善患者预后,但部分患者并不能获得良好的收益,在肝细胞癌中缺乏能够很好评估患者预后和治疗疗效的手段。在多数文献中表明gins2与肿瘤具有一定的相关性,但其在肝细胞癌中并没得到很好的阐述,于是我们就此进行了研究,并试图探讨了gins2可以作为肝细胞癌预后和疗效评估的可能,或能作为肝细胞癌靶点治疗的新靶点的可能。方法:通过生物信息学的方法,用TCGA数据库中获得的肝细胞癌患者基因表达谱数据,分别对gins2的表达和肝细胞癌预后、免疫治疗相关影响因素的相关性进行了分析,并在其他数据库中进行了相关验证,随后又通过ROC(受试者曲线)比较了AFP与gins2在肝细胞癌中的诊断效能。结果:我们的研究表明gins2在肝细胞癌中诊断的灵敏度和特异度均高于AFP,且gins2与肝细胞癌预后及免疫治疗的相关影响因素密切相关。结论:gins2可能可以作为肝细胞癌预后和免疫治疗疗效评估的检测手段,并有潜力作为药物治疗的相关靶点。

关键词：肝细胞癌 gins2 肿瘤微环境肿瘤突变负荷微卫星不稳定

gins2在子宫颈鳞状上皮内瘤变及宫颈鳞癌组织中的表达

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GINS2在子宫颈鳞状上皮内瘤变及宫颈鳞癌组织中的表达

作者：张宇晴内蒙古医科大学

学位级别：硕士

目的探讨gins2在子宫颈鳞状上皮内瘤变及宫颈鳞癌组织中的表达。方法1、选取2020年6月至2021年11月就诊于内蒙古包钢医院的接受宫颈手术的18-65岁女性患者,依据纳入标准及排除标准收集病理检验为慢性炎症的正常宫颈组28例、CIN1(Cervica... 详细信息

目的探讨gins2在子宫颈鳞状上皮内瘤变及宫颈鳞癌组织中的表达。方法1、选取2020年6月至2021年11月就诊于内蒙古包钢医院的接受宫颈手术的18-65岁女性患者,依据纳入标准及排除标准收集病理检验为慢性炎症的正常宫颈组28例、CIN1(Cervical intraepithelial neoplasia 1,低级别上皮内瘤变)组30例、CIN2/3(Cervical intraepithelial neoplasia 2/3,高级别上皮内瘤变)组42例、SCC(Squamous cervical carcinoma,宫颈鳞状细胞癌)组32例,共计132例纳入本研究。2、将上述共132例宫颈组织蜡块切片行免疫组织化学染色实验检测gins2蛋白表达,镜下阅片按照判读标准进行半定量评分。3、分别从4组宫颈组织中选取距离2021年11月半年内的蜡块组织共53例(其中正常宫颈组12例,CIN1组14例,CIN2/3组16例,SCC组11例)行q PCR(Quantitative Real-time Polymerase Chain Reaction,实时荧光定量聚合酶链式反应)实验定量检测gins2基因表达量。4、使用SPSS26.0对数据进行统计学处理,采用卡方检验、Fisher确切概率法及独立样本T检验等,以P0.05无统计学差异。结果1、免疫组织化学染色法显示:(1)gins2蛋白在正常宫颈组、CIN1组、CIN2/3组、SCC组中的阳性率逐渐上升,差异具有统计学意义(P2/3组、正常组与SCC组,gins2蛋白表达均存在统计学差异(P2)随着临床分期、组织分化程度的提高,gins2的表达差异不具有统计学意义(P>0.05)。2、q PCR法显示:gins2 m RNA表达量在正常宫颈组、CIN1组、CIN2/3组、SCC组中逐渐升高,差异具有统计学意义(P2/3组、正常组与SCC组,gins2 m RNA表达均存在统计学差异(Pgins2的高表达与宫颈鳞癌的发生、发展密切相关,可以促进由正常宫颈组织发展为鳞状上皮内瘤变进而发生宫颈鳞癌的过程。2、gins2可能与宫颈鳞癌的分期及病理分级无关,它可能主要介导早期宫颈鳞癌的发生发展过程,是早期宫颈鳞癌筛查的标志物。3、gins2可能在辅助子宫颈上皮内瘤变的病理分级诊断中发挥作用。

关键词： gins2 宫颈鳞状上皮内瘤变宫颈鳞状细胞癌

PLOD2、SPP1、gins2基因在宫颈鳞状细胞癌中的预后价值分析

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PLOD2、SPP1、GINS2基因在宫颈鳞状细胞癌中的预后价值分析

作者：黄冠华南昌大学

学位级别：硕士

背景宫颈癌是严重威胁全球女性健康的恶性肿瘤之一,此研究关注于宫颈癌发生发展过程中相关基因的生物学机制,并挖掘具有生存预测价值的基因。方法提取GEO数据库中宫颈癌组织及正常组织的基因表达数据,从TCGA中提取宫颈癌患者转录组测序... 详细信息

背景宫颈癌是严重威胁全球女性健康的恶性肿瘤之一,此研究关注于宫颈癌发生发展过程中相关基因的生物学机制,并挖掘具有生存预测价值的基因。方法提取GEO数据库中宫颈癌组织及正常组织的基因表达数据,从TCGA中提取宫颈癌患者转录组测序数据、临床数据、生存时间以及生存状态信息;分析宫颈癌患者的基因表达差异情况;通过clusterprofiler包对差异基因进行功能富集分析;STRING数据库构建蛋白互作网络,通过Cytoscape进行构建网络的可视化;构建Cox比例风险回归模型研究宫颈癌中差异基因的预后价值,根据Cox回归模型中的风险回归系数构建风险评分系统;纳入具有统计学意义的临床指标绘制用以预测宫颈癌患者1年、3年及5年生存概率的列线图,并对列线图预测能力的准确性及患者受益情况进行验证与评价;通过GSEA对高风险评分患者进行功能富集分析。结果分析得到的139个差异基因显著富集于DNA复制、双链断裂修复、细胞迁移、嘧啶代谢等功能及通路当中,并在细胞周期、易位DNA合成终止、角质化包膜形成、DNA复制、有丝分裂细胞周期调控以及翻译蛋白质磷酸化的蛋白质功能区域中作用密集。单因素分析显示139个差异基因中有22个基因与患者预后相关（P＜0.05）。多因素分析显示PLOD2、SPP1及gins2是影响宫颈癌患者预后情况的独立影响因素（P＜0.05）。通过多因素Cox分析构建了由PLOD2、SPP1及gins2组成的预后模型,并依据基因的回归系数及基因表达量建立风险评分系统。验证表示该评分系统是影响宫颈癌患者预后情况独立影响因素;且评分高的患者较评分低的患者具有更差的预后（P＜0.001）。纳入风险评分、年龄、FIGO分期及BMI值构建列线图,其一致性指数为0.732。绘制ROC曲线,表明1年、3年和5年生存率预测AUC值分别为0.73、0.70和0.71。DCA曲线表明,纳入风险评分的预后模型（曲线下面积0.0186）相较未纳入风险评分的模型（曲线下面积0.0148）对患者有较高的净获益。GSEA分析表明高风险患者所表达的基因显著富集于自噬调节、卵母细胞减速分裂、WNT信号通路、NOTCH信号通路等。结论PLOD2、SPP1及gins2是宫颈癌患者的独立预后因素,具有潜在的预后预测价值。本研究构建的列线图预测宫颈癌患者的生存概率具有较好的准确性。

关键词：宫颈癌生物信息分析预后模型 PLDO2 SPP1 gins2

NSCLC新标志物的筛选及gins2基因在NSCLC中临床价值的研究

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NSCLC新标志物的筛选及GINS2基因在NSCLC中临床价值的研究

作者：王晶兰州大学

学位级别：硕士

研究背景:肺癌是我国发病率及死亡率最高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌（non-small cell lung carcinomal,NSCLC）是最常见的病理类型,主要包括腺癌及鳞状细胞癌。肺癌的发生发展是伴随一系列基因表达异常的复杂的病理生理过程,特别是参... 详细信息

研究背景:肺癌是我国发病率及死亡率最高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌（non-small cell lung carcinomal,NSCLC）是最常见的病理类型,主要包括腺癌及鳞状细胞癌。肺癌的发生发展是伴随一系列基因表达异常的复杂的病理生理过程,特别是参与DNA损伤、细胞周期和分化的基因与癌症的发生和转移密切相关。分子生物学技术的发展促进了一大批分子靶向药物研发并已应用于临床,缓解了临床治疗的困境,但由于肺癌异质性,分子靶向药物的治疗仍有其局限性,急需要挖掘出更多的潜在标志物,为临床治疗提供更多的可选择性,以及提供有效的早期诊断及预后。生物信息学是一门新兴交叉学科,在获取基因组学、转录组学、蛋白组学等数据后,利用生物信息学的方法可以对数据进行归类、注释,进一步研究疾病发生发展的可能分子机制。随着生物信息学重要性的突出,在疾病研究中利用其进行基因表达数据的分析,为疾病诊断、治疗及设计新药提供重要依据。研究目的:本研究旨在利用生物信息学的方法,大数据挖掘NSCLC中潜在标志物,并确定目前尚未深入研究的、可作为标志物的目的基因,利用癌TCGA、GEO数据库分析目的基因在NSCLC中的表达情况及通过强互作基因及蛋白发掘目的基因可能存在的分子机制,并且通过临床样本数据进行进一步验证,以期望为NSCLC寻找早期诊断及预后判断的新标志物,为NSCLC的治疗提供新的标志物,为NSCLC分子靶向治疗及预后判断开辟一条新途径。研究方法:基于GEO数据库下载NSCLC相关数据集,利用Calculate and draw custom Venn diagrams这个在线的韦恩图绘制工具将3组数据集合并取交集,获取显著差异表达基因（Differentially expression genes,DGEs）。通过Oncomine数据库及查阅文献初步确定目前在NSCLC方面研究较少但具有意义的目的基因gins2。基于TCGA数据库、GEO数据库分析gins2在NSCLC中的表达及生存曲线分析,再进一步采用TCGA数据库分析gins2互作基因。基于Genemania数据库、STRING数据库构建由DEGs编码的蛋白互作PPI网络,进一步分析gins2可能的分子机制。收集兰大二院及解放军联勤保障部队940医院胸外科经手术切除初诊为NSCLC的新鲜的癌组织及癌旁组织,采用RT-PCR技术检测gins2在不同分期、不同分化程度、不同病理类型的NSCLC癌组织及癌旁组织中的相对表达量,基于Graphpad Prism7软件TTest分析gins2的表达与NSCLC临床特征的相关性。研究结果:1.基于GEO数据库对3个数据集合并取交集,共获取17个显著上调的DEGs。***数据库分析及查阅文献,发现gins2在NSCLC的研究主要集中于LUSC,与性别、临床分期有相关性,在不同病理类型的表达中差异无显著统计学意义。3.基于TCGA数据库分析gins2强互作基因有CDT1,GMNN,CENPN。基于Genemania数据库、STRING数据库构建由DEGs编码的互作蛋白有20种。4.基于TCGA数据库、GEO数据库分析及临床样本数据验证gins2与临床特征的相关性,结果显示临床样本分析结果与TCGA大数据分析个别结果存在差异。临床样本分析示:（1）gins2在NSCLC癌组织与癌旁组织中表达具有显著差异性（P＜0.05）;（2）gins2在LUSD患者表达较LUAD患者显著上调;不同年龄阶段NSCLC患者gins2表达具有显著差异性（P＜0.05）;（3）男性患者较女性患者gins2表达上调;（4）gins2在吸烟患者表达较非吸烟患者显著上调（P＜0.05）;（5）gins2上调表达与肿瘤大小（P＜0.05）,淋巴结转移（p＜0.05）,肿瘤分期（p＜0.05）均具有显著性差异。TCGA数据库分析示gins2表达与病理类型、分期无显著相关性（P＞0.05）,生存曲线分析无统计学意义（P=0.78）,但GEO数据库分析示生存曲线有统计学意义（P=0.0002394）。结论:***2为NSCLC新的标志物。2.采用TCGA数据库进行大数据分析及临床样本数据验证gins2在NSCLC中的表达及意义,发现gins2的高表达与肿瘤增殖、侵袭有关,且吸烟者及男性可能是gins2表达上调的易感人群。***2是NSCLC潜在诊断及预后标志物,进一步研究相关药物抑制gins2的高表达,可以为临床治疗NSCLC开辟新的治疗途径,为进一步提高NSCLC患者疗效、延长生存期,改善预后具有重要临床意义。

关键词：生物信息学非小细胞肺癌 gins2 TCGA RT-PCR

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gins2与肿瘤相关性研究最新进展

临床医学进展 2023年第3期13卷 3144-3149页

作者：熊楚晖周瀛青海大学研究生院青海西宁

随着我国肿瘤发生率的持续增高,我们需要一个对于肿瘤更加有效的治疗方式和更为敏感的诊断方法,同时我们也要加深了解肿瘤的发生及发展过程,从中发现相关规律并找到予以防治的方法。gins2又称psf2与psf1,psf3,sld5共同组成gins复合体的... 详细信息

随着我国肿瘤发生率的持续增高,我们需要一个对于肿瘤更加有效的治疗方式和更为敏感的诊断方法,同时我们也要加深了解肿瘤的发生及发展过程,从中发现相关规律并找到予以防治的方法。gins2又称psf2与psf1,psf3,sld5共同组成gins复合体的组成部分,并在细胞复制修复及周期调控中发挥着重要作用。近来相关研究表明GISN2与多种肿瘤的预后及发展密切相关,本文就GISN2目前相关研究进展探讨其与肿瘤之间的相关关系。

关键词：肿瘤 gins复合体 gins2 psf2