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北极狐ghr基因单核苷酸多态性及其与生长性状的相关性分析

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遗传 2010年第6期32卷 599-605页

作者：杜智恒刘宗岳白秀娟东北农业大学动物科技学院哈尔滨150030

文章采用单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序的方法检测了北极狐生长激素受体(Growth hormne receptor,ghr)基因的单核苷酸多态性(SNPs),并针对该群体的特点建立合适的统计分析模型,对ghr基因多态性与生长性状的相关性进行了分析。结果... 详细信息

文章采用单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序的方法检测了北极狐生长激素受体(Growth hormne receptor,ghr)基因的单核苷酸多态性(SNPs),并针对该群体的特点建立合适的统计分析模型,对ghr基因多态性与生长性状的相关性进行了分析。结果表明,在北极狐ghr基因的外显子1和外显子5上发现了4个多态位点,分别为5′UTR上的G3A和外显子1上的C99T突变,外显子5上的T59C和G65A突变;ghr基因G3A和C99T多态性与母狐的体重性状显著相关(P<0.05),T59C和G65A多态性与公狐的体重性状显著相关(P<0.05),与母狐的皮张长度性状极显著相关(P<0.01)。因此,可以利用以上点突变对北极狐的体重及皮张长度性状进行标记辅助选择研究,以达到快速选育出快大、优质的北极狐的目的。

关键词：北极狐 ghr基因单核苷酸多态生长性状

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藏绵羊ghr基因5′侧翼区序列特征分析

遗传 2007年第8期29卷 963-971页

作者：马志杰魏雅萍钟金城陈智华卢虹童子保青海省畜牧兽医科学院畜牧研究所西宁810016 西南民族大学生命科学与技术学院成都610041

对欧拉型藏绵羊生长激素受体(ghr)基因5′侧翼区(包括P1启动子和外显子1A)进行了T-A克隆和序列测定(GenBank accession ***116490),在分析其序列结构特征的基础上与GenBank中摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛进行了比较基因组学和系统... 详细信息

对欧拉型藏绵羊生长激素受体(ghr)基因5′侧翼区(包括P1启动子和外显子1A)进行了T-A克隆和序列测定(GenBank accession ***116490),在分析其序列结构特征的基础上与GenBank中摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛进行了比较基因组学和系统进化研究,结果表明:(1)欧拉型藏绵羊ghr基因启动子P1区存在C/EBP、C/EBPb、SP1、Cap、USF、HFH-2、HNF-3b、Oct-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与ghr基因的转录调控和起始以及特异表达有关。在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.55%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在一(TG)11微卫星位点;(2)在启动子P1区,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.7%、94.2%、85.9%、86.5%;而在外显子1A区段,藏绵羊与摩弗伦羊、山羊、普通牛、欧洲野牛各物种间同源性大小分别为99.0%、97.0%、92.7%、94.6%。物种间欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊同源性最高,而欧拉型藏绵羊与普通牛最低。(3)邻接法(即NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,欧拉型藏绵羊与摩弗伦羊先聚为一类,再与山羊聚类形成一个大分支,而普通牛和欧洲野牛先聚类形成另一大分支,两大分支最后再聚为一起,其聚类结果与线粒体DNA和动物学分类的研究结果一致。

关键词：欧拉型藏绵羊 ghr基因克隆微卫星启动子

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北极狐ghr基因cDNA的克隆及序列分析

兽类学报 2010年第1期30卷 65-73页

作者：杜智恒宁方勇杨春山白秀娟东北农业大学动物科技学院哈尔滨150030

本文根据狗(AF133835)的ghr基因cDNA编码全序列设计了三对引物,利用RT-PCR方法克隆出北极狐ghr基因编码区全长cDNA序列(GenBank accession ***304325)。结果表明,北极狐ghr的ORF为1917bp,编码638个氨基酸的前体蛋白,由18个氨基酸的信号... 详细信息

本文根据狗(AF133835)的ghr基因cDNA编码全序列设计了三对引物,利用RT-PCR方法克隆出北极狐ghr基因编码区全长cDNA序列(GenBank accession ***304325)。结果表明,北极狐ghr的ORF为1917bp,编码638个氨基酸的前体蛋白,由18个氨基酸的信号肽和620个氨基酸的成熟肽组成。通过同源性比较发现北极狐与狗的同源性最高,达到98%。另外,利用邻接法(NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,北极狐与狗先聚为一类,该聚类结果与传统的物种进化关系基本一致。另外,通过氨基酸对位序列比较发现,北极狐ghr在氨基酸序列上存在明显的特异性,如45和451位分别为A和E,而其它物种均分别为T(大鼠为K)和A(牛羊为V,鼠为T)。

关键词：北极狐 ghr基因克隆序列分析

ghr基因9-bp InDel与陕北白绒山羊体重和生长性状的关联研究

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家畜生态学报 2019年第2期40卷 27-31页

作者：闫海龙白洋洋王真陈晓飞邓润辉刘锦旺董书伟朱海鲸蓝贤勇屈雷榆林学院生命科学研究中心陕西榆林719000 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100

生长激素受体(growth hormone receptor,ghr)是生长激素(GH)的特定跨膜受体,对动物正常的生长发育具有重要作用。该试验随机选择532只陕北白绒山羊,通过降落PCR (Touch down PCR)方法鉴定陕北白绒山羊ghr基因第一内含子存在的9bp插入缺... 详细信息

生长激素受体(growth hormone receptor,ghr)是生长激素(GH)的特定跨膜受体,对动物正常的生长发育具有重要作用。该试验随机选择532只陕北白绒山羊,通过降落PCR (Touch down PCR)方法鉴定陕北白绒山羊ghr基因第一内含子存在的9bp插入缺失(InDel)情况并分析其与体重、生长性状的相关性。研究发现,陕北白绒山羊ghr基因共出现II、ID、DD 3种基因型;相关分析结果表明,在体重、髋宽、体高、荐高和胸深指标上,基因型ID或DD个体相比较II型个体更具显著性优势(P基因D更有利于山羊的生长发育。研究表明ghr基因可作为陕北白绒山羊体重和生长性状的候选基因,为陕北白绒山羊产业快速高效发展提供科学理论依据。

关键词：陕北白绒山羊 ghr基因插入/缺失(InDel) 体重生长性状相关分析

ghr基因遗传变异及其对中国西门塔尔牛胴体性状的效应分析

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2015年第4期36卷 31-34页

作者：武秀香杨章平毛永江施雪奎黄必志王安奎亏开兴徐州医学院生物学教研室江苏徐州221004 扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 苏州大学科技处江苏苏州215006 云南省草地动物科学研究院云南昆明650212

为探索生长激素受体(ghr)基因在中国黄牛不同群体中的变异以及ghr基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,采用PCR-SSCP技术对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛及中国西门塔尔牛共367头个体ghr基因部分外显子遗传变异进行检测,分析群体遗传特... 详细信息

为探索生长激素受体(ghr)基因在中国黄牛不同群体中的变异以及ghr基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,采用PCR-SSCP技术对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛及中国西门塔尔牛共367头个体ghr基因部分外显子遗传变异进行检测,分析群体遗传特征,并运用SPSS17.0软件中GLM模型分析所检测的遗传变异与中国西门塔尔牛部分肉质性状的关联性。结果表明:在ghr基因DNA序列中发现T229C多态位点,雷琼牛群体处于Hardy-Weinberg平衡状态,其他群体偏离平衡。对ghr基因T229C位点与胴体性状关系分析表明:该位点对肌肉生长性状效应显著,对宰前活重、胴体重、屠宰率、胴体产肉率、净肉率、肉骨比、头与蹄重、脂肪覆盖率也有显著影响。结果提示ghr基因可作为牛屠宰及肉质性状的候选基因。

关键词：中国黄牛 ghr基因遗传变异胴体性状

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威宁绵羊ghr基因克隆及组织表达

基因组学与应用生物学 2019年第1期38卷 1-6页

作者：吴雪易鸣程朝友付正仙杨德文程均华王振王金洲刘若余贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 威宁县畜禽品种改良站威宁553100 威宁县畜牧产业局威宁553100

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊ghr基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析,此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对ghr基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、... 详细信息

本试验以6月龄、1周岁和2周岁的威宁绵羊公母羊为研究对象,利用分子手段对威宁绵羊ghr基因编码区序列进行克隆,并进行生物信息学分析,此外,本试验同时采用实时荧光定量PCR的手段对ghr基因在威宁绵羊不同性别及不同生长阶段心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及背最长肌6个组织中mRNA水平上的表达规律进行探究,结果显示:威宁绵羊ghr基因CDS区序列长度为1 905 bp,发现2个SNP位点。ghr基因在威宁绵羊各组织均有不同程度的表达,在不同性别、不同生长阶段相同组织中的表达具有一定的显著性差异。

关键词：威宁绵羊 ghr基因克隆组织表达

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威宁绵羊ghr基因多态性分析

基因组学与应用生物学 2016年第8期35卷 2027-2031页

作者：王振申小云王金洲盘道兴熊勇刘若余贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025 贵州省扶贫办公室外资项目管理中心.贵阳550004 西南科技大学生命科学院绵阳621010

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种,本试验利用威宁绵羊构建DNA池,设计8对引物扩增威宁绵羊ghr基因外显子及部分内含子序列。将PCR产物纯化并进行双向测序,通过DNAStar和BLAST等生物软件分析确定SNP位点。利用生物信息... 详细信息

为了更好地保护和开发利用威宁绵羊这一优良地方品种,本试验利用威宁绵羊构建DNA池,设计8对引物扩增威宁绵羊ghr基因外显子及部分内含子序列。将PCR产物纯化并进行双向测序,通过DNAStar和BLAST等生物软件分析确定SNP位点。利用生物信息学软件分析SNPs对ghr基因的m RNA二级结构的影响、生长激素受体二级和三级结构的改变。结果表明,在扩增的ghr基因中筛选到4个SNPs:Exon1-C^(112)T、Exon4-C^7T、Exon8-A^(27)T、Intron4-C^(27)T,其中Exon8-A^(27)T为错义突变,导致编码的异亮氨酸(Ile)变为苯丙氨酸(Phe);Exon1-C^(112)T和Exon4-C^7T位点对其编码的氨基酸没有影响,是同义突变;Intron4-C^(27)T在内含子区,不参与氨基酸编码。本研究将为更好地保护和开发利用威宁绵羊提供一些参考。

关键词： ghr基因 SNPs 威宁绵羊

青海高原型牦牛ghr基因多态性与生长发育的关联性

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2024年第1期52卷 9-15,35页

作者：丁维芹祁增源刘亚倩韩银仓李文浩孙永刚青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室青海西宁810016 甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室甘肃兰州730070

【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因ghr多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30~36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其ghr基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分... 详细信息

【目的】探索青海高原型牦牛(Bos grunniens)生长激素受体(growth hormone receptor)基因ghr多态性及其与生长性状的关联性。【方法】以440头同等放牧条件下的30~36月龄健康牦牛为试验群体,PCR扩增其ghr基因,测序后用DNASTAR 7.1软件分析单核苷酸多态性(SNP)位点,研究不同基因型及其合并基因型与生长发育指标(体质量、体高、体斜长、胸围和管围)的关联性。【结果】青海高原型牦牛ghr基因上存在g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A 3个SNP位点,其中g.732195A>G上存在2种基因型(AA,AG),g.732091C>G和g.732373G>A上各存在3种基因型(分别为CC、CG、GG和GA、AA、GG);卡方检验表明,g.732091C>G、g.732195A>G和g.732373G>A均处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态,且g.732195A>G为低度多态(PICG和g.732373G>A为中度多态(0.25G、g.732195A>G和g.732373G>A能够显著或极显著影响高原型牦牛的体质量和胸围,优势基因型分别为g.732091C>G和g.732373G>A的GG以及g.732195A>G的AA。对合并基因型分析发现,合并基因型GG-AA-GG个体的生长发育尤其是体斜长表现最佳。【结论】青海高原型牦牛ghr基因有3个SNP位点,因其与青海高原型牦牛的部分生长性状相关,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因。

关键词：高原型牦牛 ghr基因 SNP位点基因多态性合并基因型

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GH和ghr基因多态性与滩羊生长性状的关联分析

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黑龙江畜牧兽医 2015年第6期 31-34,39页

作者：马青刘彩凤施安马丽娜李颖康宁夏农林科学院银川750021 宁夏盐池县农牧局宁夏盐池751500 宁夏大学农学院银川750021

为了解滩羊生长发育的遗传机制,寻找与生长性状相关的分子标记,试验采用PCR-RFLP方法检测宁夏滩羊GH和ghr基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与滩羊生长性状的关联性。结果表明:GH基因第2内含子和ghr基因第4外显子分别... 详细信息

为了解滩羊生长发育的遗传机制,寻找与生长性状相关的分子标记,试验采用PCR-RFLP方法检测宁夏滩羊GH和ghr基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与滩羊生长性状的关联性。结果表明:GH基因第2内含子和ghr基因第4外显子分别经PvuⅡ和HpaⅡ酶切各产生BB(0.375 0)、AB(0.625 0)和DD(0.825 0)、CD(0.175 0)2种基因型;GH基因PvuⅡ位点的不同基因型个体初生重和6月龄体重差异显著(P基因型;ghr基因HpaⅡ位点的CD基因型初生重和6月龄体重显著高于DD基因型(P基因型与断奶重差异不显著。对这两个SNPs位点进行基因互作分析发现双杂合基因型个体各生长性状均显著高于其他基因型组合(P基因型组合,可作为滩羊生长性状的遗传标记。

关键词：滩羊 GH基因 ghr基因合并基因型生长性状