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应用gdps转录物标记法进行水稻白叶枯病菌早期侵染表达谱分析

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中国农业科学 2009年第10期42卷 3501-3508页

作者：张新建高世强吴茂森何晨阳中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室

【目的】揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae ***,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异。【方法】采用gdps-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(gdps),对Xoo与水稻互作1、3和7d的总RNA进行反转录... 详细信息

【目的】揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae ***,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异。【方法】采用gdps-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(gdps),对Xoo与水稻互作1、3和7d的总RNA进行反转录,对病菌cDNA探针进行Cy3/Cy5选择性标记,与含有371个Xoo致病相关基因的芯片进行杂交。【结果】在水稻侵染的不同时期,Xoo致病相关基因表达谱存在差异。与在NBY中生长相比,Xoo在侵染1、3和7d时分别有42个(18个上调和23个下调)、51个(29个上调和22个下调)和33个(16个上调和17个下调)基因发生了差异表达;其中5个基因是共有上调表达的,5个是共有下调表达的。推测这些基因的差异表达可能与病菌适应寄主体内环境、生长与定殖以及为害与显症过程有关。【结论】应用gdps转录物标记技术可以成功地进行Xoo侵染过程的表达谱分析,鉴定出的差异表达的基因可以作为功能研究的靶标基因。

关键词：水稻白叶枯病菌 gdps 侵染早期表达谱差异表达基因

金黄色葡萄球菌gdps蛋白与致病性相关的调控功能研究

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金黄色葡萄球菌GdpS蛋白与致病性相关的调控功能研究

作者：商飞中国科学技术大学

学位级别：硕士

金黄色葡萄球菌是一种非常重要的人体致病菌,可以引发一系列疾病,从普通的皮肤类感染疾病,如丘疹、脓疱病、疔疮、烫伤样皮肤综合症,到可以致死的系统性感染疾病如肺炎、脑膜炎、骨髓炎、中毒性休克综合症以及败血症等。金黄色葡萄球菌... 详细信息

金黄色葡萄球菌是一种非常重要的人体致病菌,可以引发一系列疾病,从普通的皮肤类感染疾病,如丘疹、脓疱病、疔疮、烫伤样皮肤综合症,到可以致死的系统性感染疾病如肺炎、脑膜炎、骨髓炎、中毒性休克综合症以及败血症等。金黄色葡萄球菌之所以能成为重要致病菌并引发如此众多的疾病感染,主要原因在于可以表达和分泌大量的毒性因子。这些毒性因子主要包括分泌型蛋白:丝氨酸/半胱氨酸蛋白酶、核酸酶、溶血素、肠毒素、脂肪酶、凝固酵素,和细胞表面蛋白:蛋白质A(protein A),纤维蛋白原/胶原质-连接蛋白等。近年来,3’,5’-环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号分子调控系统受到越来越多的关注。c-di-GMP最早作为木葡糖醋酸杆菌纤维素合成酶的别构激活子被发现,目前已被认定为广泛存在于细菌当中的第二信使信号分子,参与多种复杂的生理活动的调控。c-di-GMP是由一系列含有GGDEF结构域的蛋白合成并由含有EAL或者HD-GYP结构域的蛋白降解。尽管在很多细菌当中c-di-GMP做为第二信使行使功能已经被深入的研究,但是在一些低GC含量的革兰氏阳性细菌当中,c-di-GMP究竟扮演什么样的角色需要更多的研究来揭示。全基因组测序信息显示金黄色葡萄球菌的基因组只编码了一个GGDEF结构域蛋白(gdps),而没有EAL或者HD-GYP结构域的蛋白。本研究采用生物基因芯片、实时荧光定量PCR等技术比较野生型金黄色葡萄球标准菌株NCTC8325与其gdps基因敲除株的基因表达差异。结果显示金黄色葡萄球菌中唯一的GGDEF结构域蛋白(gdps)影响了一些毒性基因的表达。在gdps基因敲除株中,一系列毒性因子的转录水平发生了变化,例如丝氨酸/半胱氨酸蛋白酶、纤维蛋白原连接蛋白,尤其是蛋白A(protein A,Spa)。蛋白A是金黄色葡萄球菌中的一种重要的胞壁蛋白,可以和多种哺乳动物的免疫球蛋白IgG的Fc端结合并被认为是金黄色葡萄球菌免疫逃避机制的重要组成元件,蛋白A的致病性已通过多种动物模型得到证实。基于蛋白A的重要性,本研究对gdps影响其表达的机制进行了更深入的探求。在gdps敲除株中,编码蛋白A的基因spa的转录水平降低了约8倍。有趣的是,spa的一个正调控因子sarS的转录水平在gdps敲除株中也有所下降,表明gdps影响spa的表达可能通过sarS。为了证明这一点,我们在gdps敲除株中转入含有编码全长gdps的序列的互补质粒,结果发现spa和sarS的转录水平被都回补到了野生型的水平。而另一方面,同样作为spa表达的调节因子的agr、sarA、sarT和rot的转录水平在gdps敲除株中则没有变化。因此,可以得出结论:gdps影响spa的表达通过sarS而不依赖于agr、sarA、sarT、和rot。此外,互补实验的结果表明gdps影响spa的表达依赖于其N-端结构域,而不依赖其C-端的GGDEF结构域,即gdps影响spa的表达不依赖于c-di-GMP信号通路。

关键词：金黄色葡萄球菌毒性因子蛋白A SarS 3’,5’-环二鸟苷酸 GGDEF gdps

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低gdps腹膜透析液及其对腹膜透析的影响

中国血液净化 2016年第4期15卷 196-198页

作者：左晶晶任红徐天上海交通大学附属瑞金医院肾脏科上海200025

去30年间,腹膜透析（peritoneal dialysis,PD）已经成为ESRD肾脏替代治疗的重要方式,据估计现全球接受PD治疗的ESRD患者达到了200,000人次,每年以大于6%的速度增长。随着腹膜透析龄的增加,腹膜发生形态学改变包括间皮细胞胶原旁区域的... 详细信息

去30年间,腹膜透析（peritoneal dialysis,PD）已经成为ESRD肾脏替代治疗的重要方式,据估计现全球接受PD治疗的ESRD患者达到了200,000人次,每年以大于6%的速度增长。随着腹膜透析龄的增加,腹膜发生形态学改变包括间皮细胞胶原旁区域的增厚和上皮旁区域毛细静脉透明样改变,伴随管腔狭窄或闭塞。

关键词：腹膜透析液 gdps 透析龄形态学改变 dialysis 肾脏替代治疗 peritoneal 细胞胶原残肾细胞凋亡

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通用数据库处理系统（gdps）介绍

图书情报工作动态 1994年第5期 18-19,7页

作者：朱献有

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GPS测量数据处理系统(gdps)

测绘地理信息 1993年第1期 50-50页

由武汉测绘科技大学工程测量系研制的“GPS测量数据处理系统(gdps)”是用于GPS控制网平差的软件,该软件是在微机上利用C语言,Quick BASIC,Foxbase,以及Auto-CAD开发而成,具有以下功能: 1.与多种接收机随机软件处理结果衔接; 2.完整的文... 详细信息

由武汉测绘科技大学工程测量系研制的“GPS测量数据处理系统(gdps)”是用于GPS控制网平差的软件,该软件是在微机上利用C语言,Quick BASIC,Foxbase,以及Auto-CAD开发而成,具有以下功能: 1.与多种接收机随机软件处理结果衔接; 2.完整的文件编缉; 3.三维无约束平差

关键词： GPS gdps 三维无约束平差随机软件数据处理系统控制网平差测量平差

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gdps——电子商务的根本解决之道

计算机 2002年第26期 8-8页

作者：木山

在电子商务高度发达的今天,业务的停顿是不可想象的事情,哪怕是只有几分钟的停顿,都有可能带来不可估量的损失。于是各种各样的灾难恢复的解决方案推了出来,你有你的优点,我有我的长处。

关键词：电子商务灾难恢复 gdps 交易服务器数据库自动控制系统虚拟磁带服务器数据中心

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华为波分产品通过gdps、STP测试认证

通信世界 2008年第37期 13-13页

华为9月25日宣布，其波分产品通过了IBM gdps和STP互通性测试认证，gdps是世界上最先进的异地容灾方案之一，适合于大型分布式企业的灾难恢复和连续运转。为了减少突发事件带来的业务损伤，越来越多的大型企业开始重视并完善其存储系统... 详细信息

华为9月25日宣布，其波分产品通过了IBM gdps和STP互通性测试认证，gdps是世界上最先进的异地容灾方案之一，适合于大型分布式企业的灾难恢复和连续运转。为了减少突发事件带来的业务损伤，越来越多的大型企业开始重视并完善其存储系统的可靠性和安全性。

关键词： gdps 测试认证 STP 产品波分华为大型企业容灾方案

中国建设银行核心业务容灾备份系统的研究与实践

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中国建设银行核心业务容灾备份系统的研究与实践

作者：李淑凤北京邮电大学

学位级别：硕士

在推行计算机应用的过程中,银行业已深深体会到系统可用性对银行业务的重要性。在保证本地机房的高可用性的基础上,对于意外引起的包括自然灾害、设备损毁等灾难性事件,仍然需要有相应的保护措施,以保障业务系统的连续运行,从而获得良... 详细信息

在推行计算机应用的过程中,银行业已深深体会到系统可用性对银行业务的重要性。在保证本地机房的高可用性的基础上,对于意外引起的包括自然灾害、设备损毁等灾难性事件,仍然需要有相应的保护措施,以保障业务系统的连续运行,从而获得良好的企业形象,保证社会的正常金融秩序。中国建设银行数据中心作为全行业务处理核心,系统的安全稳定运行和业务的可持续性对于全行业务的开展至关重要,并最终全面影响全行的竞争力。为进一步加强建行数据集中工程的安全性,提高灾难发生时系统应急处理能力,加快应急恢复的反应速度,对全行核心业务容灾备份系统的研究与实践至关重要。本论文着重研究与实践基于IBM大型机系统的容灾备份解决方案,在学习研究容灾备份层次分类的基础上,根据建行核心业务系统及应用处理特点,设计了核心业务容灾备份系统方案。此方案选择的备份恢复技术是gdps/XRC技术,此技术实现了数据零丢失并且系统自动恢复功能,是容灾备份解决方案中的最高层次解决方案。在论文期间,作者针对该方案对核心业务的容灾备份系统的进行了整体规划,并且依据整体规划对各功能模块进行了详细设计。在前期规划设计的基础上,作者还完成了具体的技术实施、业务数据同步与测试演练等工作,此后还对容灾备份系统的性能进行跟踪统计,实施优化处理。在论文期间通过对容灾备份知识的研究与实践,提出了更适应建行的解决方案。通过调查学习与研究,搭建了中国建设银行核心业务容灾备份系统。实现了容灾备份解决方案层次分类中最高层次的解决,即实现了数据恢复点与生产时间差异(RPO)小于2分钟;灾备中心主机系统重启恢复应用时间(RTO)小于2小时。使得建行容灾备份系统的容灾恢复能力达到世界领先水平。在容灾备份系统的日常维护过程中,作者根据遇到的问题对容灾备份系统进行了一系列总结及优化,将更先进的技术引入剑建行核心业务容灾备份系统中,包括零中断快速镜像技术、单磁盘卷多进程并行复制技术、XRC增量在同步技术等。这些技术的实施不仅对建行核心业务容灾备份系统进行了优化,还为两地三中心(生产中心、远程灾备中心、同城灾备中心)的理想架构奠定基础,为下一步的研究指明了方向。

关键词：容灾恢复 XRC gdps SDM

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WMO信息系统的诞生

气象软科学 2007年第1期 159-166页

作者： Geoff Love 刘华（翻译）肖红宪（校）不详澳大利亚气象局局长

二十世纪六十和七十年代，WMO正式出台了必要的政策和系统来支持免费和不受限制的国际气象信息和相关资料的交换。这个系统以前有，现在仍然有，三个主要部分：全球观测系统（GOS）、全球电信系统（GTS）和全球资料加工系统（gdps）。... 详细信息

二十世纪六十和七十年代，WMO正式出台了必要的政策和系统来支持免费和不受限制的国际气象信息和相关资料的交换。这个系统以前有，现在仍然有，三个主要部分：全球观测系统（GOS）、全球电信系统（GTS）和全球资料加工系统（gdps）。其中，gdps从2003年以来被称为全球资料加工数据处理和预报系统（GDPFS）。

关键词：信息系统 WMO 全球观测系统气象信息电信系统预报系统数据处理 gdps