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第三届数字制造与自动化国际会议

作者： Zhao Li Zhang Tianchi Zhang Jing College of Computer Science and Technology Harbin Engineering University Department of computer science and Information Engineering Harbin Normal University

The flexibility in protein docking is a major challenge in bioinformatic research.. Protein docking problem is essentially an optimization problem. In this review we describe the methods of existing flexible protein-protein docking ,focusing on the optimization algorithms . We divide the different methods into categories for presenting clearly.

关键词： flexible docking optimization algorithms protein-protein docking

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Role of Residue 90 in Catalysis of Cytochrome P450 2C9

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Chemical Research in Chinese Universities 2009年第6期25卷 904-908页

作者： WANG Ying ZHOU Yi-han GUO Ying-jie XU Xue-lian SI Da-yong ZHOU Hui LI Ze-sheng College of Life Science State Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry Institute of Theoretical Chemistry Jilin University Changchun 130021 P. R. China

The cytochrome P450 mutant CYP2C9.13（L90P） shows a greatly impaired catalytic activity compared with the wild-type. We constructed the mutants by substitution at residue 90 of CYP2C9, expressed in COS-7 cells, assayed their thermal stability and catalysis activity and analyzed the mutants via molecular dynamic（MD） simulation and flexible docking. Mutant L90E exhibits a significantly lower catalytic activity than the wild-type for the hydroxylation of diclofenac, lornoxicam and luciferin and its molecular dynamics simulation results indicate that the size of the entrance of substrate access was reduced significantly. An increase or minor decrease of catalytic activity was observed for mutants L90Q, L90W, L90R, L90I and L90G, and the sizes of the entrances of substrate access and the active site cavities had a little change in those mutants. The thermal stability and the potential energy of the MD simulation of these mutants showed a similar tendency as the catalysis assays did. flexible docking results show the fluctuation of interaction energy is due to the change of electrostatic potential distribution. All the above facts show that the changes in the catalysis activity of the mutants caused by the substitution at residue 90 are due to the changes in the size of entrance, the shape and size of active site cavity, electrostatic potential distribution and thermal stability. The residue 90 of CYP2C9 has an important effect on the enzyme catalytic activity.

关键词： CYP2C9 Mutation Molecular dynamics(MD) flexible docking Catalytic activity

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“一带一路”物流中心大数据体系的建设

引用

物流管理 2017年第11期

作者：孙彬王东

“一带一路”沿线各地展现出物流业态纷繁而复杂的形势，新丝路“物流通”战略以产业中高端转化为宗旨，急需适用性良好的物流集散中心。面对物流业务的信息暴增、业态种类繁多、信息价值稀疏和需求碎片化等特征，应明确大数据体系建设... 详细信息

“一带一路”沿线各地展现出物流业态纷繁而复杂的形势，新丝路“物流通”战略以产业中高端转化为宗旨，急需适用性良好的物流集散中心。面对物流业务的信息暴增、业态种类繁多、信息价值稀疏和需求碎片化等特征，应明确大数据体系建设的指导思想，归纳“一个核心、三类需求、三个平台和两大门户”的主要建设内容，设计“五个层次，三条总线”的建设框架，实现新丝路沿线物流业态的精准化责任追溯和碎片化价值聚集，助力产业中高端转化，提升产业灵活适用性，以达到维护物流数据主权、提升物流资源利用率和激励产业创新的目标。物流中心大数据体系架构可靠性和适用性良好，对物流通战略的促进作用明显，体现出大数据价值汇集的发展优势。

关键词： “一带一路” 物流中心大数据灵活对接责任追溯 the Belt and Road Initiative logistics center Big Data flexible docking responsibility traceability

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