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鸡fatp1基因多态性与屠体性状的相关分析

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中国农业科学 2009年第9期42卷 3272-3278页

作者：张龙朱方俊王彦兰茜吕荣平刘益平朱庆四川农业大学动物科技学院/四川农业大学国家级动物类实验教学示范中心

【目的】研究fatp1基因多态性与优质肉鸡屠体性状的相关性,为进一步加快育种进程提供参考依据。【方法】利用PCR-SSCP技术对381只大恒优质鸡fatp1基因的部分外显子进行群体遗传学检测,计算基因频率和基因型频率,对多态性与屠体性状进行... 详细信息

【目的】研究fatp1基因多态性与优质肉鸡屠体性状的相关性,为进一步加快育种进程提供参考依据。【方法】利用PCR-SSCP技术对381只大恒优质鸡fatp1基因的部分外显子进行群体遗传学检测,计算基因频率和基因型频率,对多态性与屠体性状进行相关分析。【结果】在fatp1P3和P4两个位点上分别存在3种多态以及9种单倍型组合。P3位点不同基因型对活重、屠体重、半净膛、全净膛、胸肌重和腿肌重有显著影响,P4位点不同基因型对腿肌重和腹脂率有显著影响。9种单倍型组合AAMM、AAMN、AGMM、AGMN、AANN、AGNN、GGMM、GGMN和GGNN的频率分别为0.538、0.052、0.265、0.029、0.045、0.037、0.024、0.005和0.005,不同单倍型与腹脂重、胸肌重和胸肌率存在相关性。【结论】鸡fatp1不同基因型和单倍型组合与部分屠体性状和腹脂率存在相关性。

关键词：鸡 fatp1基因多态性单倍型 PCR-SSCP

牛fatp1基因5'侧翼启动子克隆及序列分析

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生物技术通报 2013年第5期29卷 86-92页

作者：龚婷许厚强陈伟赵佳福骆衡陈祥张勇贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室贵阳550025 贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025

旨在克隆牛fatp1基因5'侧翼启动子,研究其特异性转录调控元件的调控机制。利用PCR方法扩增牛fatp1基因5'侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,获得2 164 bp(-1 969-+194 bp)的5'侧翼启动子序列。利用生物信息软件对获得的2 164... 详细信息

旨在克隆牛fatp1基因5'侧翼启动子,研究其特异性转录调控元件的调控机制。利用PCR方法扩增牛fatp1基因5'侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,获得2 164 bp(-1 969-+194 bp)的5'侧翼启动子序列。利用生物信息软件对获得的2 164 bp 5'侧翼启动子克隆载体进行分析预测,发现其有4处转录起始点和40个潜在转录因子结合位点;该序列与人、小鼠、大鼠和狗的同源性分别为74.1%、71.1%、72.0%、62.8%,且不同物种fatp1基因5'侧翼区的同源序列主要集中在转录起始点上游-578--93 bp区域,保守性较强的区域在转录起始点上游-263--174 bp,推测转录起始点上游-263--174 bp可能是其核心启动子区域,从而成功克隆了fatp15'侧翼启动子序列2 164 bp,初步预测了该基因的核心启动子区域。

关键词：牛克隆 fatp1基因启动子转录因子

不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中fatp1基因表达研究

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饲料研究 2021年第3期44卷 5-8页

作者：孙政俞大阔张永云王绍卿唐娜杨忠李卫真云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 北京首农畜牧发展有限公司北京100176 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201 云南农业大学动物医学院云南昆明650201 云南生物制药有限公司云南昆明650503

为研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中fatp1基因的表达情况,试验选取216头处于泌乳盛期的健康德宏奶水牛,分为高乳脂率组(H组)、中乳脂率组(M组)和低乳脂率组(L组),采集乳样,用乳品分析仪测定乳脂率,利用气相色谱法测定脂肪酸含量。采... 详细信息

为研究不同乳脂率德宏奶水牛乳腺组织中fatp1基因的表达情况,试验选取216头处于泌乳盛期的健康德宏奶水牛,分为高乳脂率组(H组)、中乳脂率组(M组)和低乳脂率组(L组),采集乳样,用乳品分析仪测定乳脂率,利用气相色谱法测定脂肪酸含量。采集乳腺组织,利用荧光定量PCR法检测fatp1基因的mRNA表达水平,并与乳脂率和脂肪酸含量进行相关性分析。结果表明:H组乳脂率、总脂肪酸含量和长链脂肪酸含量均极显著高于M组和L组(P1),M组显著高于L组(P1),显著高于M组(P0.05)。fatp1基因mRNA表达水平为H组极显著高于L组(P1),而H组与M组、M组与L组均无显著差异(P>0.05)。相关性分析表明,乳脂率与乳中总脂肪酸、长链脂肪酸和不饱和脂肪酸含量间呈极显著正相关(P1),fatp1基因mRNA表达量与乳脂率、脂肪酸总量、长链脂肪酸含量、不饱和脂肪酸含量均呈极显著正相关(P1)。研究表明在乳脂合成的过程当中fatp1基因对脂肪酸的摄取和转运起到重要的调控作用。

关键词：德宏奶水牛乳腺组织 fatp1基因乳脂率脂肪酸

猪fatp1基因5'调控区多态性及其与脂肪性状的相关分析

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江苏农业学报 2011年第1期27卷 89-93页

作者：华绪川张立凡蔡兆伟蒋晓玲徐宁迎张金枝浙江大学动物科学学院浙江杭州310029 浙江省畜牧兽医局浙江杭州310020

脂肪酸转运蛋白1(Fatty acid transport protein 1,fatp1)是脂肪酸转运蛋白家族(fatps)的一员,具有促进脂肪细胞吸收利用长链和极长链脂肪酸的功能,在脂肪沉积过程中发挥着重要的作用。采用直接测序法寻找fatp1基因5'调控区+64～-723 b... 详细信息

脂肪酸转运蛋白1(Fatty acid transport protein 1,fatp1)是脂肪酸转运蛋白家族(fatps)的一员,具有促进脂肪细胞吸收利用长链和极长链脂肪酸的功能,在脂肪沉积过程中发挥着重要的作用。采用直接测序法寻找fatp1基因5'调控区+64～-723 bp片段的单核苷酸多态性,在-586 bp处发现了一个T→C突变SNP(单核苷酸多态性)座位,利用PCR-RFLP的方法检测它在3个试验猪群体中的基因型,发现该座位在皮特兰和金皮F2代猪群中存在多态性,而在金华猪中仅表现为fatp1g-586Tfatp1g-586T基因型。建立混合模型方程组分析该座位对188头金皮F2代猪脂肪性状的效应,结果显示,猪fatp1基因第-586座位的不同基因型与肩背膘厚、6～7肋背膘厚、最后一根肋骨处背膘厚、平均背膘厚和板油重显著相关(Pfatp1基因5'调控区的第-586位上的T→C突变对猪脂肪沉积有一定的影响。

关键词：猪 fatp1基因脂肪性状 PCR-RFLP

猪ATGL基因和fatp1基因5'调控区的多态性及其与胴体和肉质性状的相关分析

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猪ATGL基因和FATP1基因5'调控区的多态性及其与胴体和肉质性状的...

作者：华绪川浙江大学

学位级别：硕士

脂肪性状是影响畜禽肉质的重要因素。脂肪甘油三酯水解酶(Adipose triglyceride lipase, ATGL)是脂肪动员过程中脂肪水解的限速酶,而脂肪酸转运蛋白1 (Fatty acid transport protein 1, fatp1)具有促进脂肪细胞吸收利用长链和极长链脂... 详细信息

脂肪性状是影响畜禽肉质的重要因素。脂肪甘油三酯水解酶(Adipose triglyceride lipase, ATGL)是脂肪动员过程中脂肪水解的限速酶,而脂肪酸转运蛋白1 (Fatty acid transport protein 1, fatp1)具有促进脂肪细胞吸收利用长链和极长链脂肪酸的功能,在脂肪沉积过程中发挥着重要的作用。本研究以ATGL基因和fatp1基因为候选基因,在金华猪、岔路黑猪、皮特兰、杜洛克和大约克五个纯种猪群以及金皮F2代(金华×皮特兰)资源群体中对猪ATGL基因和fatp1基因5'调控区进行单核苷酸多态性(SNP)扫描并分析其与金皮F2代猪胴体和肉质性状的关系,主要结果如下：在ATGL基因的5'调控区发现存在A-253C→T以及A-845G→C和A-854T→C的连锁突变。生物信息学分析结果显示该序列可能存在启动子区域,并且A-845G→C突变导致部分潜在转录因子结合位点的产生或消失,提示这些SNP座位可能会影响ATGL基因的转录和表达。利用错配PCR-RFLP方法检测A-253C→T座位在不同猪种中的分布情况,结果发现A-253C→T座位在金华猪、岔路黑猪、皮特兰、杜洛克和金皮F2代猪中均存在多态性,且等位基因C的频率较高,为优势等位基因;但在大约克猪群中只有CC一种基因型。最小二乘分析显示,该座位CC基因型个体的胸腰结合处背膘厚和腰荐结合处背膘厚显著高于TT基因型个体,分别增加了11.41%和14.68%;而CC基因型个体的后腿脂肪重也显著高于CT和TT基因型个体。利用PCR-RFLP的方法对A-845G→C座位进行检测,结果发现,该座位在金华猪、岔路黑猪、杜洛克、大约克夏和金皮F2代猪群中均存在多态性,其中地方猪种中C等位基因的频率明显低于国外猪种,并且在金华猪群中没有检测到CC基因型,而在皮特兰猪群中只有GC一种基因型。相关分析显示,该座位GG基因型个体与GC基因型个体的肩部背膘厚、6-7肋背膘厚、平均背膘厚差异显著,分别增加了7.25%、9.06%、7.67%;在胸腰结合处背膘厚上,GG基因型个体比CC基因型个体增加了12.63%;在后腿脂肪重上,GG基因型个体比CC和GC基因型个体分别增加了11.27%和6.31%;而在眼肌面积上,GC基因型个体比GG基因型个体增加了10.29%。在fatp1基因的5'调控区发现主要存在F-586T→C、F-1026G→A和F-1240C→A三个突变座位。生物信息学分析结果显示,目的序列含有启动子、CpG岛、TATA box等调控基因转录和翻译的区域,并且F-1026G→A和F-1240C→A突变都会引起该序列转录因子结合位点的变化。利用PCR-RFLP的方法对F-586T→C座位进行检测,结果发现该座位只在皮特兰、杜洛克和金皮F2代猪群中存在多态性,且表现为较高频率的T等位基因;而在金华猪、岔路黑猪和大约克夏猪群中只有TT一种基因型。相关分析显示,该座位TT基因型个体的肩背膘厚、6-7肋背膘厚、胸腰结合处背膘厚、平均背膘厚和板油重显著高于CC基因型个体,分别增加了10.73%、11.92%、13.06%、9.43%和24.31%。利用PCR-RFLP的方法对F-1026G→A座位进行检测,结果发现该座位在金华猪、岔路黑猪、杜洛克、大约克夏和金皮F2代猪群中均存在多态性,但在杜洛克和大约克夏猪群中不存在AA基因型;而在皮特兰猪群中只有AG一种基因型。相关分析显示,该座位对猪6-7肋背膘厚的影响达到极显著水平(P=0.0075),GG基因型个体的6-7肋背膘厚比AA和AG基因型个体分别增加了13.86%和13.78%。利用四引物ARMS-PCR的方法检测F-1240C→A座位在不同猪种中的分布,结果发现该座位只在金华猪和金皮F2代猪群中存在多态性,并表现为较高频率的C等位基因;而在其它猪群中只有CC一种基因型,说明该SNP座位是金华猪所特有的。相关分析结果显示,该座位对猪肌内脂肪含量的影响达到了极显著水平(P=0.005),其中AA和AC基因型个体的肌内脂肪含量比CC基因型个体分别增加了42.81%和28.76%,而AA和AC基因型个体之间的差异不显著。以上研究结果表明,猪ATGL基因和fatp1基因5'调控区的多态座位对脂肪性状具有一定的影响,提示这两个基因可能是猪脂肪性状合适的候选基因。

关键词： ATGL基因 fatp1基因脂肪性状序列分析 PCR-RFLP 四引物ARMS-PCR 猪

鹌鹑fatp1、TBC1D1基因多态性及其与屠宰性状的关联分析

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黑龙江畜牧兽医 2019年第13期 133-136,139页

作者：王强朱梦婷郑炜王晓路张红玉赵宗胜朔州职业技术学院山西朔州036002 石河子大学动物科技学院新疆石河子832003

fatp1和TBC1D1基因在禽类糖类代谢和脂肪代谢中扮演着重要的角色,在家禽选育过程中可作为影响屠宰性能的候选基因。为了提高鹌鹑的屠宰性能,本试验选择145只鹌鹑作为试验材料,通过非探针高分辨率熔解曲线(HRM)的方法对其进行fatp1和TBC... 详细信息

fatp1和TBC1D1基因在禽类糖类代谢和脂肪代谢中扮演着重要的角色,在家禽选育过程中可作为影响屠宰性能的候选基因。为了提高鹌鹑的屠宰性能,本试验选择145只鹌鹑作为试验材料,通过非探针高分辨率熔解曲线(HRM)的方法对其进行fatp1和TBC1D1基因分型,并与屠宰性状(活重、屠体重、腿肌重、胸肌重、全净膛重、半净膛重、胸肌率、腿肌率)进行关联分析。结果表明:fatp1基因有一个多态位点存在AA、AG、GG 3种基因型,AA基因型鹌鹑的活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、腿肌重和胸肌重显著高于AG、GG基因型(P基因型鹌鹑的屠宰性能均明显高于其他两种类型的鹌鹑;AG、GG基因型间差异不显著(P>0.05),AA基因型鹌鹑的胸肌率高于AG基因型和GG基因型,GG基因型腿肌率高于AA基因型和AG基因型,但差异均不显著(P>0.05)。TBC1D1基因在变异位点处存在TT、TG和GG 3种基因型,TT基因型鹌鹑的半净膛重、全净膛重和胸肌重均显著高于TG基因型(P基因型鹌鹑的活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、腿肌重和胸肌重均显著高于GG基因型(P基因型鹌鹑的腿肌率、胸肌率均高于TG基因型和GG基因型,但差异不显著(P>0.05)。说明AA、TT基因型有可能是影响朝鲜鹌鹑屠宰性状的主效基因型,在选种中可作为辅助选择的分子标记。

关键词：鹌鹑 fatp1基因 TBC1D1基因屠宰性状多态性非探针高分辨率熔解曲线(HRM)

牛fatp1启动子调控PPAR基因转录水平的研究

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牛FATP1启动子调控PPAR基因转录水平的研究

作者：张青青贵州大学

学位级别：硕士

脂肪酸转运蛋白1(fatp1)促进长链脂肪酸进入细胞内,并协调游离脂肪酸的摄取,从而影响脂质分布与沉积,有研究表明fatp1能够促进脂肪在相关组织中沉积,在参与脂肪代谢的同时也参与能量代谢。过氧化物酶体增殖剂激活受体γ(PPARγ)作为一... 详细信息

脂肪酸转运蛋白1(fatp1)促进长链脂肪酸进入细胞内,并协调游离脂肪酸的摄取,从而影响脂质分布与沉积,有研究表明fatp1能够促进脂肪在相关组织中沉积,在参与脂肪代谢的同时也参与能量代谢。过氧化物酶体增殖剂激活受体γ(PPARγ)作为一种主要存在于脂肪组织细胞中的蛋白基因,既参与脂肪沉积过程的调控,也参与脂类代谢和脂肪细胞分化等过程。本研究以贵州黄牛为实验动物,采用qRT-PCR检测PPARγ基因在关岭黄牛、思南黄牛、黎平黄牛和威宁黄牛的心、肝、脾、肺、肾、背最长肌、脂肪等组织中的表达量;PCR克隆fatp1基因启动子区活性较高的3个片段,以及克隆PPARγ基因CDS区,构建p EGFP-N3-fatp1-Pn-PPARγ真核表达载体;将p EGFP-N3-fatp1-Pn-PPARγ重组载体转染小鼠3T3-L1脂肪细胞和牛原代脂肪细胞,通过观察绿色荧光的强弱,初步验证fatp1基因启动子能否驱动PPARγ基因在细胞中表达,并采用qRT-PCR检测PPARγ基因在小鼠3T3-L1和牛脂肪细胞中的表达量,进一步验证fatp1基因启动子对PPARγ基因在转录水平的调控作用。主要研究结果如下:(1)PPARγ基因在4个贵州地方黄牛不同组织中都有表达,在同一牛种资源不同组织中的表达存在差异,并且具有脂肪组织特异性;在不同的牛种质资源部分组织中PPARγ基因的表达也存在差异性。(2)fatp1-P8、fatp1-P7和fatp1-P4启动子片段对PPARγ基因在小鼠3T3-L1细胞和牛原代脂肪细胞中mRNA的表达都具有正向调控作用,并且fatp1-P4启动子片段的作用效果最显著。

关键词：启动子 fatp1基因 PPARγ基因小鼠3T3-L1脂肪细胞牛原代脂肪细胞 q RT-PCR