检索结果-南通市图书馆

天津医药 2017年第12期45卷 1289-1292页

作者：翟惠惠赵洪波张琴杨丽华昆明医科大学第二附属医院妇科 650101 昆明医科大学

目的基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(fat2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析fat2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值。方法应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,... 详细信息

目的基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(fat2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析fat2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值。方法应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析fat2变异与卵巢癌患者生存之间的关系。应用genecards数据库收集与fat2基因相关的蛋白,绘制fat2相关蛋白网络图,对相关蛋白进行富集分析,分析蛋白富集的信号通路、生理过程及关键下游基因。结果 311例卵巢癌样本中有12例发生fat2基因变异,变异率为4%,扩增7例(2.3%),错义突变3例(1%),缺失2例(0.6%)。Kaplan-Meier生存曲线分析表明,fat2变异组总生存时间长于无变异组(P=0.033 8),无病生存时间与无变异组差异无统计学意义(P=0.387)。与fat2相关的蛋白有CTNNB1、ARVCF、CTNND1等21个,其中CTNNB1蛋白在卵巢癌中低表达,相关蛋白富集分析到Wnt信号通路、细胞黏附等细胞生理活动。结论 fat2基因可能可通过诱导Wnt通路中的关键蛋白CTNNB1降解发挥抑癌基因的作用。卵巢癌组织中fat2高表达是一种预后良好指标,可作为预测患者生存时间,判断预后的有效生物标志物。

关键词：卵巢肿瘤上皮性卵巢癌 fat2 Wnt信号通路 cbioprotal genecards

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