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The complete mitochondrial genome of the hybrid grouper epinephelus moara(♀)×epinephelus tukula(♂), and phylogenetic analysis in subfamily Epinephelinae

引用

Acta Oceanologica Sinica 2020年第12期39卷 65-75页

作者： Zhentong Li Yongsheng Tian Meiling Cheng Linna Wang Jingjing Zhang Yuping Wu Zunfang Pang Wenhui Ma Jieming Zhai College of Fisheries and Life Science Shanghai Ocean UniversityShanghai 201306China Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology(Qingdao)Qingdao 266071China Yellow Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy of Fishery SciencesQingdao 266071China College of Fisheries and Life Science Dalian Ocean UniversityDalian 116023China Laizhou Mingbo Aquatic Co.Ltd. Laizhou 261400China

The mitochondrial genome(mitogenome)of hybrid grouper epinephelus moara(♀)×epinephelus tukula(♂),a new hybrid progeny,can provide valuable information for analyzing phylogeny and molecular *** this study,the mitogenome was analyzed using PCR amplification and sequenced,then the phylogenetic relationship of ***(♀)×***(♂)and 35 other species were constructed using Maximum Likelihood and NeighborJoining methods with the nucleotide sequences of 13 conserved protein-coding genes(PCGs).The complete mitogenome of ***(♀)×***(♂)was 16695 bp in length,which contained 13 PCGs,2 rRNA genes,22 tRNA genes,a replication origin and a control *** composition and order of these genes were consistent with most other *** the 13 PCGs,12 PCGs were encoded on the heavy strand,and ND6 was encoded on the light *** mitogenome of the ***(♀)×***(♂)had a higher AT nucleotide content,a positive AT-skew and a negative *** protein initiation codons were ATG,except for COX and ND4(GTG),ATP6(CTG),and ND3(ATA).ND2,COXII,ND3,ND4 and Cytb had T as the terminating codon,COXIII’s termination codon was TA,and the remaining PCGs of that were *** tRNA genes,except for the lacking DHU-arm of tRNASer(AGN),were predicted to form a typical cloverleaf secondary *** addition,sequence similarity analysis(99%identity)and phylogenetic analysis(100%bootstrap value)indicated that the mitochondrial genome was maternally *** study provides mitogenome data for studying genetic,phylogenetic relationships and breeding of grouper.

关键词： epinephelus moara(♀)×epinephelus tukula(♂) epinephelus moara epinephelus tukula mitochondrial genome phylogeny

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