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中国荷斯坦乳牛drb3基因多态性的PCR-SSCP分析及其与泌乳性状的相关性

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中国兽医科学 2008年第10期38卷 889-892页

作者：杨东英德州学院生物系山东省生物物理重点实验室山东德州253023

采用PCR-SSCP技术,对中国荷斯坦乳牛drb3基因的多态性进行了分析,并用线性数学模型分析了各种基因型与乳牛乳腺炎的相关性。结果显示,drb3基因有AA、BB和AB 3种基因型,其基因型频率分别为0.46,0.33和0.21;drb3基因多态的产生是第88位产... 详细信息

采用PCR-SSCP技术,对中国荷斯坦乳牛drb3基因的多态性进行了分析,并用线性数学模型分析了各种基因型与乳牛乳腺炎的相关性。结果显示,drb3基因有AA、BB和AB 3种基因型,其基因型频率分别为0.46,0.33和0.21;drb3基因多态的产生是第88位产生A→T突变、第118位产生T→A突变以及第165位产生A→G的替换造成的;基因型频率分布的2χ值为19.56(Pdrb3基因的突变处于Hardy-Weinberg非平衡状态。相关性分析表明,不同基因型乳牛之间泌乳性状的差异不显著。

关键词： drb3基因 SSCP 乳腺炎体细胞评分体细胞计数

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河西绒山羊drb3基因外显子2多态性分析

生物技术通报 2012年第9期28卷 80-86页

作者：罗秀刚马小军张小丽岳燕李富强姜力飞甘肃农业大学动物医学院兰州730070 甘肃省草食动物生物技术重点实验室兰州730070

研究采用PCR-SSCP方法检测1 046只河西绒山羊drb3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义。结果表明,河西绒山羊drb3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001-LG018)控制... 详细信息

研究采用PCR-SSCP方法检测1 046只河西绒山羊drb3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义。结果表明,河西绒山羊drb3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001-LG018)控制的31个基因型,LG005为优势等位基因,LG005*005为优势基因型,18个单倍型序列分析发现44个核苷酸多态位点、29个氨基酸多态位点;与GenBank下载序列比对分析结果表明,16个drb3的等位基因是本研究首次发现;drb3基因遗传多态指数中,观察杂合度为0.269 6,多态信息含量为0.869 9,有效等位基因数为1.369 1;经χ2适合性检验,该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(Pdrb3基因外显子2的单倍型序列NJ系统发育树呈2支分化趋势。研究认为河西绒山羊drb3基因第2外显子具有丰富的遗传多态性;河西绒山羊drb3基因最初由2个等位基因突变分化成两大类等位基因。

关键词： drb3基因多态性 PCR-SSCP 河西绒山羊

天祝白牦牛和甘南牦牛drb3基因外显子2多态性研究

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中国畜牧兽医 2016年第3期43卷 746-753页

作者：沙日耐安天午俄广鑫韩建林中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 四川省草原科学研究院成都611731 西南大学重庆400716

试验通过对天祝白牦牛和甘南牦牛drb3基因外显子2部分CDS序列进行分析,获得其准确单倍型,通过直接测序与聚合酶链式扩增阻碍突变系统(ARMS)扩增法获得干净的单链,对高度杂合的双链进行分型。结果发现65个SNPs,1个密码子的插入缺失,获得3... 详细信息

试验通过对天祝白牦牛和甘南牦牛drb3基因外显子2部分CDS序列进行分析,获得其准确单倍型,通过直接测序与聚合酶链式扩增阻碍突变系统(ARMS)扩增法获得干净的单链,对高度杂合的双链进行分型。结果发现65个SNPs,1个密码子的插入缺失,获得30个单倍型,其中有7个单倍型是首次发现,应该是天祝白牦牛和甘南牦牛特有的单倍型。通过对已知牛属所有drb3基因外显子2单倍型与本研究发现的单倍型进行分析发现天祝白牦牛和甘南牦牛分享普通牛和瘤牛单倍型,可能有普通黄牛和瘤牛的遗传背景,且drb3基因外显子2的4、25、30、53、59、62、63、66、78氨基酸位点受到了正选择的影响,主要发生在天祝白牦牛群体里,这与天祝白牦牛长期选育白毛有一定的关系。

关键词：天祝白牦牛甘南牦牛 drb3基因外显子2 多态性

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奶牛drb3基因生物信息学分析

中国奶牛 2011年第2期 4-8页

作者：徐飞成述儒罗玉柱甘肃农业大学甘肃省草食动物生物技术重点实验室/动物科学技术学院兰州730070

利用生物基因组学数据库,对奶牛MHCⅡ区drb3基因进行生物信息学分析,以预测drb3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建drb3同源基因的系统进化树。结果表明,drb3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29... 详细信息

利用生物基因组学数据库,对奶牛MHCⅡ区drb3基因进行生物信息学分析,以预测drb3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建drb3同源基因的系统进化树。结果表明,drb3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29～30位的氨基酸之间。二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用。序列分析表明,drb3编码产物可能具有免疫应答、受体、胁迫应答、信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对奶牛免疫力和抗病性起关键作用。drb3编码产物氨基酸邻接系统树表明,奶牛drb3与绵羊、羚羊、塔尔羊、麝牛、亚洲水牛等物种drb3氨基酸距离较近,它们具有高度同源性。

关键词：主要组织相容性复合体 drb3基因生物信息学奶牛

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藏绵羊drb3基因第2外显子多态性分析

藏绵羊DRB3基因第2外显子多态性分析