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Characterization of major histocompatibility complex dra and DRB genes of the forest musk deer(Moschus berezovskii)

Chinese Science Bulletin 2013年第17期58卷 2191-2197页

作者： LI Ling ZHU Ying GE YunFa WAN QiuHong The Key Laboratory of Conservation Biology for Endangered Wildlife of the Ministry of Education and State Conservation Center for Gene Resources of Endangered Wildlife College of Life SciencesZhejiang University

The forest musk deer(Moschus berezovskii) is one of the most endangered species in *** the past decades,extensive hunting and poaching have pushed the forest musk deer to the edge of extinction,and conservation biologists are presently pursuing scientific management plans to rescue this *** major histocompatibility complex(MHC),a cluster of genes responsible for antigen presentation,is a highly polymorphic genomic region in vertebrates that has become a popular functional marker system for studying adaptive *** this study,we developed locus-specific genotyping primers for exon 2 fragments of one dra gene and one DRB locus of the forest musk deer using a suite of comprehensive methods that included universal primer amplification,genome walking,single-strand conformation polymorphism(SSCP),heteroduplex(HD) profiling,and sequence *** forest musk deer showed no more than two sequences per locus,confirming the specificity of our *** with these primers allowed us to identify two dra alleles and six DRB alleles in a captive breeding population of the Sichuan Musk Deer Breeding *** the dra locus,we found a slightly higher observed heterozygosity(N O =0.154) than expected(N E =0.143).In contrast,the DRB locus showed a significant heterozygote deficiency(N O =0.508;N E =0.761;Pdra and DRB loci,showing the presence of positive selection in the forest musk deer DR ***,generation of phylogenetic trees for the dra and DRB sequences of the forest musk deer and other ruminants revealed that the dra and DRB loci identified in this study had homologous relationships with the known ruminant dra and DRB *** on this analysis,and to facilitate future studies,we named these novel loci Mobe-dra and Mobe-DRB3.

关键词：主要组织相容性复合体 RB基因 dra 林麝单链构象多态性表征通用引物抗原呈递

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林麝MHC-dra基因分析及与反刍亚目dra基因比较

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四川动物 2014年第4期33卷 481-486页

作者：夏珊岳碧松四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室成都610064 成都师范学院化学与生命科学学院成都611130

MHC-dra基因仅在少部分物种如马、斑马、驴等具有多态性,dra基因在其他哺乳动物中多为低多态性。由于MHC-dra的低多态性,较少受到研究者重视,我们选取近缘物种牛的dra基因引物,对四川养麝研究所的217只林麝进行dra基因exon 2的序列扩增... 详细信息

MHC-dra基因仅在少部分物种如马、斑马、驴等具有多态性,dra基因在其他哺乳动物中多为低多态性。由于MHC-dra的低多态性,较少受到研究者重视,我们选取近缘物种牛的dra基因引物,对四川养麝研究所的217只林麝进行dra基因exon 2的序列扩增,得到2个林麝dra基因,片段长度为260 bp,这2个基因仅有一个核苷酸同义突变,没有氨基酸突变。我们将所获得的林麝dra基因与反刍亚目其他物种dra基因进行氨基酸比对发现,我们扩增的序列为林麝dra基因exon 2,编码MHCⅡ类分子的α1区域,而这段区域主要参与形成MHCⅡ类分子的多肽结合槽,根据Brown确定人类的抗原肽结合区位点,在参与比对的反刍亚目物种dra基因中,抗原位点11、22、72、76存在氨基酸变异,而在这些位点上林麝的dra基因没有变异,和大部分反刍亚目相同。同时我们发现大部分反刍亚目物种之间氨基酸突变的位点大都在非抗原结合位点。

关键词：林麝 MHC dra 反刍亚目

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针对固定码率(CBR)流媒体的动态替换算法(dra)

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计算机应用 2005年第5期25卷 1112-1115页

作者：马杰樊建平中国科学院计算技术研究所

流媒体代理服务器缓存是针对流媒体访问的一项技术,能有效的提高流媒体访问质量。缓存算法是缓存代理服务器的重要技术组成部分,包括缓存保存方式、替换算法及进入策略三个方面。文中将介绍一套针对固定码率(CBR)流媒体的缓存算法,在包... 详细信息

流媒体代理服务器缓存是针对流媒体访问的一项技术,能有效的提高流媒体访问质量。缓存算法是缓存代理服务器的重要技术组成部分,包括缓存保存方式、替换算法及进入策略三个方面。文中将介绍一套针对固定码率(CBR)流媒体的缓存算法,在包含码率分级保存方法的同时,使用了包含流媒体缓存基本特性的动态替换算法(dra,DynamicReplicationAlgorithm)。

关键词：流媒体缓存缓存代理服务器替换算法前缀缓存 CBR dra

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八眉猪dra基因编码区多态性及生物信息学分析

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华北农学报 2015年第4期30卷 66-71页

作者：刘丽霞张丽赵生国滚双宝西北民族大学生命科学与工程学院甘肃兰州730030 甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃兰州730070 甘肃省现代养猪工程技术研究中心甘肃兰州730070

为了探讨八眉猪dra基因的遗传特性及其在抗病育种和猪-人异种器官移植中的应用前景,采用克隆测序的方法对该基因编码区进行多态性分析,并利用生物信息学方法预测该基因编码氨基酸的理化特性和结构功能,同时对该基因进行同源性分析。结... 详细信息

为了探讨八眉猪dra基因的遗传特性及其在抗病育种和猪-人异种器官移植中的应用前景,采用克隆测序的方法对该基因编码区进行多态性分析,并利用生物信息学方法预测该基因编码氨基酸的理化特性和结构功能,同时对该基因进行同源性分析。结果显示,八眉猪dra基因编码252个氨基酸,编码区有5个核苷酸和2个氨基酸变异位点。dra基因编码产物是一种不稳定的不可溶蛋白,二级结构为混合型,无规则卷曲所占比例最高。蛋白质功能预测结果显示,dra基因免疫应答几率最高(4.405)。同源性分析发现,八眉猪dra氨基酸与其他猪种的相似度在98%以上,与人的相似度达到83%,在CD4分子结合部位与人类相应的dra仅存在1个氨基酸差异,具有在异种移植排斥反应中利用的潜力。研究结果为八眉猪的抗病分子育种和猪-人异种器官移植提供理论依据。

关键词：八眉猪 dra 基因编码区多态性生物信息学

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dra算法及其实时解码器设计

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电视技术 2009年第5期33卷 36-39页

作者：马文华曾庆煜广东外语外贸大学广东广州510630 广东省数字音频重点实验室广东广州510640

dra是一种新的音频编解码标准,其在每声道64Kbit/s时重建的音质达到ITU-R规定的"人耳不可识别损伤"的主观音质评定。研究了dra的编码与解码原理,在对解码算法进行了优化的基础上,设计并实现了基于PXA270平台的dra实时解码器。主观听音... 详细信息

dra是一种新的音频编解码标准,其在每声道64Kbit/s时重建的音质达到ITU-R规定的"人耳不可识别损伤"的主观音质评定。研究了dra的编码与解码原理,在对解码算法进行了优化的基础上,设计并实现了基于PXA270平台的dra实时解码器。主观听音测试结果表明,该解码器音质良好,满足实时解码应用的要求。

关键词： dra 音频解码器可变分辨率滤波熵编码修正离散余弦反变换

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普氏野马与两种新疆地方品种马的ELA-dra*exon2的多态性分析

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畜牧兽医学报 2011年第3期42卷 369-374页

作者：于丽娟恩特马克凌英会马月辉马合木提.哈力克新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆野马繁殖中心吉木萨尔831700 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

为了解普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-dra*exon2的多态性以及等位基因频率分布。本研究采用PCR-SSCP技术对普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-dra*exon2进行分型,并对不同等位基因进行核苷酸与氨基酸分析。结果显示:127匹马中共出现7... 详细信息

为了解普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-dra*exon2的多态性以及等位基因频率分布。本研究采用PCR-SSCP技术对普氏野马、哈萨克马与焉耆马的ELA-dra*exon2进行分型,并对不同等位基因进行核苷酸与氨基酸分析。结果显示:127匹马中共出现7种基因型,3种纯合子分别记为AA、BB、CC;4种杂合子分别记为AB、AC、BC、AD。AA基因型为哈萨克马与焉耆马的优势基因型,普氏野马以CC基因型为主。经χ2检验后,3种类型马的等位基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态。PIC值与He值分析表明,3种类型马均属于中度多态,且普氏野马的PIC值与He值比哈萨克马与焉耆马低。

关键词：普氏野马主要组织相容性复合体 dra SSCP

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dra音乐频道的技术设计

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电视技术 2011年第12期35卷 45-48页

作者：陈周烽广州珠江数码集团有限公司广东广州510010

dra是近年来兴起的国产音频技术,在声音的编码效率和还原效果上具有一定的优点。详细介绍了dra的算法,并依据广州有线dra自办音乐频道的设计与实现,介绍了这一新兴的音频编码技术在广电行业的应用。

关键词： dra 自适应时频分块技术视音频同步私有数据描述符

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dra技术在数字电视中的应用

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电视技术 2009年第1期33卷 18-20页

作者：朱勤伟广州市广播电视网络有限公司广东广州510010

简要介绍了我国自主研发的dra数字音频编解码技术,就dra在节目采集编辑制作和播出以及dra终端的实现提出了较为详细的技术方案。

关键词： dra 多声道数字音频编码数字电视

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犏牛主要组织相容性复合物dra基因(MHC-ClassⅡ-dra)的分子特征分析

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中国畜牧兽医 2012年第9期39卷 12-17页

作者：蒲兰屏席冬梅樊月园苏八七陈学礼李继中邓卫东南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南省怒江傈僳族自治州贡山独龙族怒族自治县农业和科学技术局云南贡山673500 云南省迪庆州畜牧兽医科技局云南香格里拉674400

为探索犏牛的抗病特性,本试验运用1对引物首次扩增出了犏牛dra基因的编码区全长,GenBank登录号为:JQ347519。通过NCBI开放阅读框寻找功能模块等生物信息学软件分析后结果表明,犏牛dra基因编码区全长762bp,编码253个氨基酸。对犏牛dra基... 详细信息

为探索犏牛的抗病特性,本试验运用1对引物首次扩增出了犏牛dra基因的编码区全长,GenBank登录号为:JQ347519。通过NCBI开放阅读框寻找功能模块等生物信息学软件分析后结果表明,犏牛dra基因编码区全长762bp,编码253个氨基酸。对犏牛dra基因编码产物进行了疏水性、信号肽、N-糖原区和二级结构预测,分析了犏牛dra基因与其他物种的同源性,与黄牛相比,犏牛dra基因表现出高度同源,同源性达到了99.0%。与MHC家族其他基因不同,dra基因在所有的动物尤其是反刍动物中表现出高度保守,包括肽结合部位(PBS)、N-糖原区、α1、α2区等功能部位都呈现出高度保守。

关键词：犏牛 MHC dra 抗病性

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贵州白山羊dra和DRB1基因的表达差异分析

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基因组学与应用生物学 2016年第8期35卷 1931-1934页

作者：黄兰徐伟封竣淇刘彬康建兵钱成蔡惠芬罗卫星贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室贵州大学动物科学学院贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025

本研究旨在利用实时荧光定量PCR技术检测贵州白山羊dra和DRB1基因在心、肝、肾以及免疫组织共9种动物组织中的相对表达差异。分析数据得到,贵州白山羊dra、DRB1基因在9种组织中均有表达,在脾组织中两个基因的表达量均明显高于其他组织,... 详细信息

本研究旨在利用实时荧光定量PCR技术检测贵州白山羊dra和DRB1基因在心、肝、肾以及免疫组织共9种动物组织中的相对表达差异。分析数据得到,贵州白山羊dra、DRB1基因在9种组织中均有表达,在脾组织中两个基因的表达量均明显高于其他组织,在心、肝、肾和颌下腺四中组织中dra和DRB1基因的表达量均明显低于其他组织,其中在心和肝两种组织中表达量最低。结果表明,在5种免疫组织中除颌下腺外,dra和DRB1基因的表达量都较高且都在脾脏组织中高表达。

关键词：贵州白山羊荧光定量PCR dra DRB1

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