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genetic and Geographic Patterns of Duplicate dpl genes Causing genetic Incompatibility Within Rice:Implications for Multiple Domestication Events in Rice

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Rice science 2021年第1期28卷 58-68页

作者： Xu Xun Ge Song Zhang Fumin State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany Institute of BotanyChinese Academy of SciencesBeijing 100093China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

Strong genetic incompatibilities exist between two primary rice subspecies,indica and ***,the wild ancestors of rice,*** Sharma et Shastry and *** Griff.,are genetically *** this genetic incompatibility became established has not been clearly *** provide insights into the process,we analyzed a pair of hybrid sterility genes in rice,DOPPELGANGER 1(dpl1)and DOPPELGANGER 2(dpl2).Either of the two loci can have one defective allele(dpl1-and dpl2-).Hybrid pollen carrying both dpl1-and dpl2-alleles is *** explore the origination of dpl1-and dpl2-,we sequenced the dpl1 and dpl2 genes of 811 individual plants,including Oryza sativa(132),***(296)and ***(383).We then obtained 20 dpl1 and 34 dpl2 sequences of *** from online *** these sequences,we analyzed the genetic and geographic distribution patterns of dpl genes in modern rice and its wild *** with the ancestral populations,dpl1-and dpl2-showed reduced diversity but increased frequency in modern *** speculated that the diversity reduction was due to a historic genetic bottleneck,and the frequency had likely increased because the defective alleles were preferred following this artificial *** results indicated that standing variances in ancestral lines can lead to severe incompatibilities among *** analysis indicated that the dpl1-haplotype of rice emerged from an *** population in India,whereas the dpl2-haplotype emerged from *** in South ***,the evolutionary history of dpls conforms to the presumed multiple domestication events of modern rice.

关键词： rice dpl gene domestication genetic incompatibility phylogeography

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