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A new method of preparing fiber-optic dna biosensor and its array for gene detection

Science China(Life Sciences) 2001年第1期44卷 33-39页

作者：姜广奋陈润生阎宏欧阳颀 Institute of Biophysics Chinese Academy of Sciences Beijing China Department of Physics Peking University Beijing China

A new method of preparing fiber-optic dna biosensor and its arrayfor the simultaneous detection of multiple genes is described. The optical fibers were first treated with poly-l-lysine, and then were made into fiber-optic dna biosensors by adsorbing and immobilizing the oligonucleotide probe on its end. By assembling the fiber-optic dna biosensors in a bundle in which each fiber carried a different dna probe, the fiber-optic dna biosensor array was well prepared. Hybridization of fluorescent- labeled cdna of p53 gene, N-ras gene and Rb1 gene to the dna array was monitored by CCD camera. A good result was achieved.

关键词： fiber-optic dna biosensor dna array gene detection.

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Controlling dna Bundle Size and Spatial Arrangement in Selfassembled arrays on Superhydrophobic Surface

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Nano-Micro Letters 2015年第2期7卷 146-151页

作者： Gabriele Ciasca Massimiliano Papi Valentina Palmieri Michela Chiarpotto Simone Di Claudio Adele De Ninno Ennio Giovine Gaetano Campi Annamaria Gerardino Luca Businaro Marco De Spirito Istituto di Fisica Universitá Cattolica SC L.go Francesco Vito 100168 Rome Italy Istituto di Fotonica e Nanotecnologie-CNR Via Cineto Romano 42 00156 Rome Italy Institute of Crystallography-CNR Via Salaria Km 290016 Monterotondo Rome Italy

The use of superhydrophobic surfaces(SHSs) is now emerging as an attractive platform for the realization of one-dimensional(1D) nanostructures with potential applications in many nanotechnological and biotechnological *** this purpose, a strict control of the nanostructures size and their spatial arrangement is highly required. However, these parameters may be strongly dependent on the complex evaporation dynamics of the sessile droplet on the SHS. In this work, we investigated the effect of the evaporation dynamics on the size and the spatial arrangement of self-assembled 1D dna bundles. Our results reveal that different arrangements and bundle size distributions may occur depending on droplet evaporation stage. These results contribute to elucidate the formation mechanism of 1D nanostructures on SHSs.

关键词： Superhydrophobicity dna array Cassie state Wenzel state 1D nanostructures Self-assembly

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棉花逆境诱导均一化cdna文库构建及部分相关基因的分离和功能验证

棉花逆境诱导均一化cDNA文库构建及部分相关基因的分离和功能验证

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作者：徐士成华中农业大学

学位级别：硕士

植物在生长发育过程中,常常会遭受到各种不良环境因子的影响,包括极端温度(高、低温)、干旱、高盐、养分缺乏、病虫害等。逆境可引起植物体内的一系列的生理代谢反应,从而产生代谢和生长的可逆性抑制,严重时引起植株不可逆的伤害甚至死... 详细信息

植物在生长发育过程中,常常会遭受到各种不良环境因子的影响,包括极端温度(高、低温)、干旱、高盐、养分缺乏、病虫害等。逆境可引起植物体内的一系列的生理代谢反应,从而产生代谢和生长的可逆性抑制,严重时引起植株不可逆的伤害甚至死亡。由于各种逆境的复杂性,加上对逆境分子机理知之甚少,因此需要通过功能基因组方法,挖掘胁迫响应基因信息,揭示逆境信号传导途径,为逆境育种提供理论基础和指导。本实验中,我们构建了六个不同逆境处理的cdna文库,通过基因组饱和杂交的方法,构建了一个逆境条件下棉花均一化cdna文库。通过对文库的测序和生物信息学分析,我们获得了大量的与逆境胁迫相关的信息,通过对文库的筛选,分离到一批响应不同胁迫处理的基因,并对部分基因进行了克隆、分析和遗传转化。主要结果如下：1.构建了六个独立的海岛棉7124 cdna文库(高温、低温、干旱、高盐、黄萎病侵染、低磷低钾),然后利用基因组dna饱和杂交方法,构建平衡化cdna文库。此文库大部分片断为0.8 kb到1.6kb,平均长度为1.15kb。2.随机挑克隆测序,经过读取测序峰图,去载体,共得到6706条高质量EST序列,经过聚类拼接,得到高质量的单一序列3647条,其中包含638个contigs和3009个Singlets/on序列,单一序列所占的比例为58.5%,每个contig平均含EST4.2个,其中最多的含437个EST,其次是含58个EST, EST数目在5以下(含5个)contig共有561,占全部的contig数目的85%。3.对3647个单一序列分别同拟南芥核酸数据库、NCBI非冗余蛋白质数据库及TIGR棉花EST数据库,进行BLAST分析,分别有11%、15%,7%,完全没有找到与之匹配的任何序列(E

关键词：逆境均一化cdna文库 ESTs WRKY转录因子 dna array

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