检索结果-南通市图书馆

dna羟甲基化在小鼠胚胎干细胞中的研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物化学与生物物理进展 2011年第7期38卷 611-614页

作者：谭理复旦大学生物医学研究院表观遗传学实验室上海200032

简要总结dna羟甲基化在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESC)中的最新研究进展.dna甲基化(dnamethylation)影响染色质的结构与功能,在发育与疾病发生过程中具有重要作用.2009年Tahiliani等发现TET1可以催化甲基化胞嘧啶(5-m... 详细信息

简要总结dna羟甲基化在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESC)中的最新研究进展.dna甲基化(dnamethylation)影响染色质的结构与功能,在发育与疾病发生过程中具有重要作用.2009年Tahiliani等发现TET1可以催化甲基化胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)氧化为羟甲基化胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC).dna羟甲基化(dnahydroxymethylation)被认为是调节dna甲基化的一种重要方式,成为了表观遗传学的研究热点之一.

关键词：小鼠胚胎干细胞 dna羟甲基化 Tet1

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

dna羟甲基化测序技术

化学学报 2013年第1期71卷 26-35页

作者：赵超汪海林中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室北京100085

5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是继5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)之后发现的第六种碱基,已在多种哺乳动物组织和细胞中检出.与5mC相比,5hmC的含量更低,但5hmC也具有非常重要的生物学功能.已有的研究表明,5hmC参... 详细信息

5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是继5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)之后发现的第六种碱基,已在多种哺乳动物组织和细胞中检出.与5mC相比,5hmC的含量更低,但5hmC也具有非常重要的生物学功能.已有的研究表明,5hmC参与了染色体重新编程、基因表达的转录调控,并在dna去甲基化过程中发挥重要作用.另外,5hmC可能与特定肿瘤的发生密切相关,有可能成为肿瘤早期诊断的生物标志物.因此,发展可靠、灵敏和准确的5hmC检测技术至关重要.本综述针对dna羟甲基化的检测及测序技术进行了简要介绍.

关键词： dna羟甲基化 dna甲基化 dna测序技术

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

dna羟甲基化调控动脉粥样硬化的研究进展

遗传 2020年第7期42卷 632-640页

作者：胡颖楚胡豪畅林少沂陈晓敏浙江大学宁波医院心血管内科宁波315000 浙江大学医学院杭州310029

dna羟甲基化作为一种表观遗传学修饰,对基因的表达调控起到了重要作用。近年来,越来越多的研究发现在心血管疾病中可见5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine, 5hmC)和染色体10/11易位(ten-eleven translocation,TET)家族蛋白的异常改... 详细信息

dna羟甲基化作为一种表观遗传学修饰,对基因的表达调控起到了重要作用。近年来,越来越多的研究发现在心血管疾病中可见5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine, 5hmC)和染色体10/11易位(ten-eleven translocation,TET)家族蛋白的异常改变,提示这些心血管疾病与dna羟甲基化的调控密切相关。dna羟甲基化水平与动脉粥样硬化常见的危险因素如衰老、性别、高血压和吸烟存在一定关联,并且和动脉粥样硬化发生过程中所涉及的免疫炎症反应以及内皮细胞和血管平滑肌细胞的功能相关。本文综述了dna羟甲基化和TET家族蛋白对于动脉粥样硬化的作用机制及研究现状,以期为动脉粥样硬化的发生发展及诊断治疗提供表观遗传学方面的研究思路。

关键词： dna羟甲基化动脉粥样硬化 5hmC TET 表观遗传学

液相色谱-串联质谱法分析大鼠血液中基因组dna羟甲基化水平

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

质谱学报 2015年第3期36卷 249-254页

作者：陈光照杨柳青文娟葛苗苗张立坚蔡春广东医学院分析中心广东湛江524023 四川大学华西药学院四川成都610041

5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethyleytosine,5hmC）是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine,5mC）生成的,对哺乳动物的基因转录和表达发挥着重要的调控作用.本研究建立了血液样品中5hmC的液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）... 详细信息

5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethyleytosine,5hmC）是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine,5mC）生成的,对哺乳动物的基因转录和表达发挥着重要的调控作用.本研究建立了血液样品中5hmC的液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）测定方法,采用试剂盒法提取血液基因组dna,在甲酸环境下加热裂解,采用HILIC色谱柱分离,电喷雾电离和多反应监测模式定量.结果表明：5hmC在0.1～50 μg/L范围内线性关系良好,相关系数为0.999 4;高、中、低3个加标水平的平均回收率为95.87％,日内和日间的相对标准偏差分别为3.42％和4.12％;5hmC的检出限（LOD,S/N=3）为0.050 μg/L,定量限（LOQ,S/N=10）为0.100 μg/L.该方法准确、快速、稳定、灵敏,可用于血液样品全基因组中5-羟甲基胞嘧啶的检测分析.

关键词： 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC) 液相色谱-串联质谱(LC—MS/MS) dna羟甲基化血液大鼠

dna羟甲基化修饰在叶酸缺乏导致神经管畸形发生中的机制研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

DNA羟甲基化修饰在叶酸缺乏导致神经管畸形发生中的机制研究

作者：曾雨冰首都儿科研究所

学位级别：硕士

研究背景:神经管畸形(Neural tube defects,NTDs)是一类预后不良的中枢神经系统先天性出生缺陷,其病因复杂且机制尚不明确。神经管闭合(Neural tube closure,NTC)是一个精细协调的过程,受遗传和营养环境因素的影响。当NTC过程某一环节... 详细信息

研究背景:神经管畸形(Neural tube defects,NTDs)是一类预后不良的中枢神经系统先天性出生缺陷,其病因复杂且机制尚不明确。神经管闭合(Neural tube closure,NTC)是一个精细协调的过程,受遗传和营养环境因素的影响。当NTC过程某一环节出现异常,可导致NTDs的发生。因此,深入研究NTDs的发病机制有助于全面了解其致病因素,有效防治NTDs发生,对提高人口质量有重要作用。叶酸(Folate acid,FA)缺乏是引起NTDs发生的主要营养因素。叶酸的异常代谢可引起NTC发生异常诱发NTDs。叶酸转化成四氢叶酸作为甲基供体参与一碳单位的转移过程,调节dna甲基化(dna methylation)修饰。dna甲基化作为重要的表观遗传修饰,参与哺乳动物生命周期中发育、代谢等调节过程。dna甲基化主要由dna甲基转移酶(dna methyltransferase,DNMT)催化。在DNMT酶的作用下,基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶第5位碳原子共价结合一个甲基基团,形成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。dna羟甲基化(dna hydroxymethylation)修饰由10-11易位(Ten-eleven-translocation,TET)蛋白通过级联氧化反应促进5mC转化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC),并逐步转化为5-甲酰嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC),引起dna羟基化修饰发生。既往研究表明,人体中5hmC在不同组织的分布具有明显差异,在脑组织中5hmC含量最高,5hmC在中枢神经系统中参与多种重要调节。研究表明叶酸缺乏可引起细胞氧化还原反应增多,导致异常的dna羟甲基化发生。然而,在叶酸缺乏情况下,dna羟甲基化修饰对NTDs发生中的调控作用及分子机制目前尚未明确。研究目的:探究叶酸缺乏条件下dna羟甲基化修饰在NTDs发生发展中的作用机制,利用表观遗传学方法研究叶酸缺乏对NTDs的发病影响,推动NTDs领域发病机理的新认识,提供NTDs预防治疗和药物筛选的新靶标,也为同类出生发育缺陷疾病提供重要的参考价值。研究方法:1.构建叶酸缺乏的小鼠胚胎干细胞(Mouse embryonic stem cells,mESCs)模型,利用转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)筛选差异表达基因,通过基因功能注释(Gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析预测叶酸缺乏引起的功能变化。2.叶酸缺乏mESCs模型中,RT-qPCR检测dna羟甲基化酶和dna甲基化酶的转录水平变化。3.羟甲基化dna免疫沉淀测序(Hydroxymethylated dna immunoprecipitation sequencing,hMeDIP-seq)和甲基化dna免疫沉淀测序(Methylated dna immunoprecipitation sequencing,MeDIP-seq)检测叶酸缺乏mESCs模型中5hmC和5mC的富集情况,利用生物信息学技术筛选发生显著变化的NTDs相关通路及下游基因。4.染色质免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-seq)检测叶酸缺乏mESCs模型中组蛋白H3赖氨酸27位点乙酰化(Histone 3 lysine 27 acetylation,H3K27ac)的富集情况,采用生物信息学技术分析筛选出的NTDs相关基因在叶酸缺乏条件下H3K27ac富集水平变化。5.构建叶酸缺乏及叶酸回补mESCs模型,利用RT-qPCR和hMeDIP-qPCR检测NTDs相关基因的转录水平及dna羟甲基化修饰在NTDs相关基因中的富集变化。6.构建低叶酸喂养联合甲氨蝶呤(Methotrexate,MTX)诱导NTDs胎鼠模型,利用dna斑点杂交技术(dna dot blot)、免疫组化(Immunohistonchemistry,IHC)检测dna羟甲基化修饰、dna羟甲基化酶和dna甲基化酶的变化情况;利用RT-qPCR检测NTDs胎鼠模型中NTDs相关基因的转录水平变化。研究结果:***-seq结果显示,叶酸缺乏引起mESCs中基因发生显著差异变化,差异表达基因与氧代谢、细胞生长和发育、dna及组蛋白甲基化通路有关;RT-qPCR结果表明叶酸缺乏引起dna羟甲基化酶Tet1、Tet2和dna甲基化酶Dnmt1发生显著上调,dna羟甲基化酶

关键词：神经管畸形叶酸缺乏 dna羟甲基化 Shh信号通路 5hmC

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

dna羟甲基化检测方法的研究进展

化学研究 2023年第2期34卷 165-178页

作者：束永勇那立欣上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海健康医学院健康与公共卫生学院上海201318

5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)的羟基化形式,是一种重要的表观遗传修饰,它的形成与癌症、自身免疫性疾病以及糖尿病等疾病的发生有着密切关联。因此,构建5hmC检测方法对于疾病的... 详细信息

5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)是5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)的羟基化形式,是一种重要的表观遗传修饰,它的形成与癌症、自身免疫性疾病以及糖尿病等疾病的发生有着密切关联。因此,构建5hmC检测方法对于疾病的早期诊断和预后评价具有极其重要的意义。传统的检测方法主要薄层色谱法、免疫标记法和高效液相色谱法等,这类方法不但耗时长、成本高、灵敏度低且干扰因素多。近年来,随着对dna羟甲基化的不断深入研究,寻找快速、简便、经济的检测方法已成为该领域的研究热点。本文总结了5hmC新型检测方法的研究进展,包括新型测序策略、液相色谱-质谱联用、荧光标记法、电化学分析方法和光谱检测法,以期为今后5hmC的精准检测和实际应用提供有用的参考和指导。

关键词： dna羟甲基化 5-羟甲基胞嘧啶生物传感器检测方法研究进展

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

dna羟甲基化修饰与神经系统疾病

生命的化学 2016年第4期36卷 437-442页

作者：刘霞颜景斌上海交通大学附属儿童医院上海市儿童医院上海医学遗传研究所卫生部医学胚胎分子生物学重点实验室上海市胚胎与生殖工程重点实验室上海200040

dna羟甲基化修饰主要是指5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)在10-11易位(ten-eleven translocation,TET)蛋白家族的氧化作用下生成5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)。5hm C不仅能在去甲基化过程中起重要作用,而且还参与了基因的表达调控。5hm C的含量有着高度的组织特异性,且目前在中枢神经系统中也发现了高水平的5hm C。与神经系统疾病相关的基因中存在明显的5hm C水平的改变,暗示着dna羟甲基化修饰很可能在神经系统疾病的发生与发展过程中起了重要作用。

关键词： dna羟甲基化 5hmC 神经系统疾病

ADLI大鼠肝组织dna羟甲基化变化及其机制

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

山东医药 2017年第40期57卷 32-34页

作者：任琦孙淑丰李玉红朱凌妍牛琛冯福民华北理工大学公共卫生学院河北唐山063210

目的探讨抗结核药物性肝损伤(ADLI)形成过程中dna羟甲基化变化及其机制。方法选择SD大鼠96只,随机分为异烟肼组、对照组各48只。异烟肼组给予异烟肼55 mg/(kg·d)灌胃,对照组给予等体积蒸馏水灌胃。两组分别于灌胃3、7、10、14、21、28... 详细信息

目的探讨抗结核药物性肝损伤(ADLI)形成过程中dna羟甲基化变化及其机制。方法选择SD大鼠96只,随机分为异烟肼组、对照组各48只。异烟肼组给予异烟肼55 mg/(kg·d)灌胃,对照组给予等体积蒸馏水灌胃。两组分别于灌胃3、7、10、14、21、28天各随机取8只,麻醉后心脏取血,检测血浆ALT、AST;处死后留取肝组织,HE染色,观察肝组织病理变化;采用RT-PCR法检测肝组织谷胱甘肽S-转移酶P1(GSTP1)基因C、甲基胞嘧啶(5m C)、氧化成羟甲基胞嘧啶(5hm C)含量;采用ELISA法检测肝组织10-11易位蛋白1(TET1)蛋白表达,RT-PCR法检测TET1 mRNA表达。结果随着给药时间延长,异烟肼组肝损伤程度逐渐加重;其GSTP1基因C含量随着肝损伤程度加重呈下降趋势,而5m C含量先上升,至灌胃14天略有回落,随后继续上升;5hm C含量呈现下降趋势,至灌胃21天降至最低,灌胃28天时略有回升;而TET1蛋白水平及其mRNA表达与5hm C含量变化基本一致。结论 dna羟甲基化可能参与了ADLI的发生。

关键词：药物性肝损伤异烟肼 dna甲基化 dna羟甲基化谷胱甘肽S-转移酶P1 10-11易位蛋白

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

dna羟甲基化在恶性黑素瘤的进展

国际皮肤性病学杂志 2016年第2期42卷 122-124页

作者：王丹杨盛波黄进华中南大学湘雅三医院皮肤科长沙410013

dna羟甲基化指在TET蛋白酶家族催化下,将5甲基胞嘧啶氧化成5羟甲基胞嘧啶的过程,是dna主动去甲基化的关键中间步骤,主要通过动态调节dna甲基化水平,影响基因表达.dna羟甲基化过程可被TET蛋白、三羧酸循环相关酶、维生素C、微小RNA等多... 详细信息

dna羟甲基化指在TET蛋白酶家族催化下,将5甲基胞嘧啶氧化成5羟甲基胞嘧啶的过程,是dna主动去甲基化的关键中间步骤,主要通过动态调节dna甲基化水平,影响基因表达.dna羟甲基化过程可被TET蛋白、三羧酸循环相关酶、维生素C、微小RNA等多种因素调控.研究发现,和血液系统恶性肿瘤及多种实体肿瘤类似,恶性黑素瘤中同样存在5羟甲基胞嘧啶含量降低,dna羟甲基化调控因素异常等现象,提示dna羟甲基化可能与恶性黑素瘤的发生发展及预后等相关.

关键词：黑色素瘤 5-甲基胞嘧啶 dna甲基化异柠檬酸脱氢酶 dna羟甲基化